基于8-17DNAzyme原理的铅离子荧光检测方法及其应用

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基于8-17DNAzyme原理的铅离子荧光检测方法及其应用
【技术领域】
[0001]本发明涉及生物传感器检测重金属离子领域中基于8-17DNAZyme原理的铅离子荧光检测方法及其应用。
【背景技术】
[0002]铅污染具有毒性大、致毒剂量低、易累积、难降解、难治理等特点,因而是目前环境监测和治理的重点。《生活饮用水卫生标准》(GB5749-2006)严格限定饮用水中铅(Pb2+)离子浓度不能高于 0.01mg/L 等。同时 GB/T 4470-1998、GB/T 20380.1-2006、GB/T23362.4-2009等标准就分别规定了使用原子荧光光谱分析法(AFS)、原子吸收分光光度计法(AAS)和电感耦合等离子体质谱分析法(ICP-MS)作为痕量铅离子检测的标准方法。但是上述方法样品前处理方法复杂,仪器设备昂贵,检测费力、费时、成本高,此外样品必须经专业人员进行操作,难以实现快速的现场检测或对突发水污染事件做出快速响应。
[0003]现代分子生物学研究发现,在分子水平上某些重金属离子可与特异的基因序列发生作用,造成其空间结构发生改变,而这种结构和性能的关系为重金属离子的快速、特异识别提供了一条便捷的途径。脱氧核酶(DNAzyme)由一个碱基环和两条单链侧臂构成,是具有催化功能的单链DNA片段,它是利用体外分子进化技术(SELEX)合成的,具有很高的催化活性和结构识别能力,能将与其互补的DNA链或RNA链连接或切断。
[0004]2000年,美国伊利诺伊大学香槟分校的Lu教授等人筛选出对铅离子具有高亲和、特异结合的8-17DNAzyme,并设计出一种“turn on”模式的检测策略(即铅离子浓度与焚光强度成正比)快速检测水体中铅离子的浓度。具体方法为在8-17DNAzyme互补底物链(17DS)3’末端标记上了一个焚光基团,而在8_17DNAzyme的5’末端标记一个淬灭基团,当8-17DNAzyme与17DS杂交后,由于荧光基团与淬灭基团相邻,根据荧光共振能量转移(FRET)效应,将不产生荧光;而在铅离子存在下,水溶液中的8-17DNAzyme可对17DS链上的识别位点(一个RNA腺嘌呤)进行攻击,导致17DS断裂,从而使淬灭基团与荧光基团分离,产生荧光,并且荧光的强度与铅离子的浓度成正比。在该体系下Pb2+的线性检测范围为ΙΟηΜ到4mM,检出限远低于EPA(美国环境保护署)饮用水中铅离子含量标准,此外该体系中Pb2+表现出明显的特异性,较其它二价离子灵敏度高出至少80倍,但该体系需要在4°C下反应,严重限制了其应用。
[0005]中国发明专利申请CN 102031284 A (发明人是赵建龙等)利用EDC (1-乙基-3-(3- 二甲基氨基-丙基)碳化二亚胺)和NHS(N-羟基琥珀酰亚胺)方法,将3’端修饰_順2的8-17DNAzyme链固定在芯片表面,并设计开发了 “turn off”模式(即铅离子浓度与荧光强度成反比)的光学检测Pb2+的方法。他们首先使8-17DNAzyme链与标记有荧光基团的底物链杂化,接着引入Pb2+,在8-17DNAzyme作用下底物链断裂,荧光强度逐渐减弱。该方法耗时1小时,检出限可达InM,线性范围为ΙηΜ-10 μΜ,多次重复再生检测对于灵敏度基本无影响。
[0006]综上所述,上述研究还存着易产生假信号或者检测时间长的问题,并不能满足实际检测的需要。因此,研制针对铅离子(Pb2+)检测的快速、准确、灵敏的检测方法已成为防治铅离子(Pb2+)污染的迫切需求。

【发明内容】

[0007]本发明所要解决的技术问题是如何在室温(20-30°C )下快速、准确、灵敏的检测饮用水中铅离子(Pb2+)的含量。
[0008]为解决上述技术问题,本发明首先提供了一种铅离子的检测方法1。
[0009]本发明所提供的一种铅离子的检测方法1,利用Pb2+诱导脱氧核酶催化与其互补的底物链发生断裂的原理,在20-30°C使含有Pb2+的待测样品中的Pb 2+诱导名称为17EB的荧光淬灭基团标记脱氧核酶催化与所述17EB互补的名称为17SF的含有所述17EB识别位点的荧光基团标记的单链核酸发生断裂,得到名称为17SFF的含有荧光基团的所述17SF的断裂片段,将所述17SFF与表面固定了名称为17PS的探针的芯片进行杂交反应,检测反应后芯片的荧光强度,根据所述荧光强度确定所述待测样品中Pb2+的浓度;
[0010]所述17PS中的单链DNA由连接臂和名称为17SFFC的片段组成,所述17SFFC与所述17SFF互补,所述连接臂与所述17SFFC和所述17SFF均不互补。
[0011]为解决上述技术问题,本发明还提供了一种铅离子的检测方法2。
[0012]本发明所提供的一种铅离子的检测方法2,包括:
[0013]1)制备含有17EB-17SF的杂交液;所述17EB-17SF是由名称为17EB的荧光淬灭基团标记脱氧核酶和与所述17EB互补的名称为17SF的含有所述17EB识别位点的荧光基团标记的单链核酸制成的双链DNA,所述杂交液中不含游离状态的所述17SF ;
[0014]2)在20-30°C,将待测样品与所述含有17EB-17SF的杂交液混合,在Pb2+诱导下,所述17EB催化所述17SF发生断裂,得到含有名称为17SFF的含有荧光基团的所述17SF的断裂片段的反应液,将所述17SFF与表面固定了名称为17PS的探针的芯片进行杂交反应,检测反应后芯片的荧光强度,根据所述荧光强度确定所述待测样品中Pb2+的浓度;
[0015]所述17PS中的单链DNA由连接臂和名称为17SFFC的片段组成,所述17SFFC与所述17SFF互补,所述连接臂与所述17SFFC和所述17SFF均不互补。
[0016]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述连接臂可位于所述17PS的5’端,所述连接臂由6-10个碱基组成的脱氧核苷酸链(如6个胸腺嘧啶组成的脱氧核苷酸链)组成;所述17PS可进行氨基修饰。
[0017]上述检测方法1和上述检测方法2中,在Pb2+诱导下,所述17EB催化所述17SF断裂是由于Pb2+满足与所述脱氧核酶的作用条件,可以触发所述17EB对所述17SF的断裂反应,如在所述含有17EB-17SF的杂交液中,在20-30°C条件下Pb2+与所述17EB-17SF作用,导致所述17SF在腺苷酸位点(rA)处被断裂成两部分,得到名称为所述17SFF的含有荧光基团的所述17SF的断裂片段。
[0018]上述检测方法2中,所述待测样品与所述含有17EB-17SF的杂交液的体积比为
[0019]上述检测方法2中,所述含有17EB-17SF的杂交液由溶剂和溶质组成,所述溶剂为pH7.2-7.4,浓度可为10-50mM的Tris_HAc缓冲液,具体可为pH7.4,浓度为10mM的Tris-HAc缓冲液;所述溶质为所述17EB-17SF和NaN03,所述17EB-17SF在所述含有17EB-17SF的杂交液中的浓度可为20-50nM,具体可为30nM ;NaN03在所述含有17EB-17SF的杂交液中的浓度可为30-300mM,具体可为40mM。
[0020]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述脱氧核酶为8_17DNAzyme。
[0021]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述荧光淬灭基团在所述17EB中的位置和所述荧光基团在所述17SF中的位置满足所述17EB与所述17SF能形成所述17EB-17SF,如所述荧光淬灭基团连接在所述17EB的3’末端,所述荧光基团连接在所述17SF的5’末端。
[0022]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述荧光基团可为羧基荧光素FAM、花青素荧光染料Cy3、花青素荧光染料Cy5和花青素荧光染料Cy5.5中任一种,具体可为花青素荧光染料Cy3 ;所述荧光淬灭基团可为荧光淬灭基团BHQ1,荧光淬灭基团Dabcyl、荧光淬灭基团BHQ2和荧光淬灭基团BHQ3中任一种,具体可为荧光淬灭基团BHQ2 ;具体的,当所述荧光基团为羧基荧光素FAM时,所述荧光淬灭基团为荧光淬灭基团Dabcyl ;当所述荧光基团为花青素荧光染料Cy3时,所述荧光淬灭基团为荧光淬灭基团BHQ1或BHQ2 ;当所述荧光基团为花青素荧光染料Cy5时,所述荧光淬灭基团为荧光淬灭基团BHQ2 ;当所述荧光基团为花青素荧光染料Cy5.5时,所述荧光淬灭基团为荧光淬灭基团BHQ3。
[0023]上述检测方法1和检测方法2中,所述17EB的具体序列如下:5’ -ACAGACATCTCTTCTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGAGT-B-3’(其中 B 为荧光淬灭基团 BHQ2)。
[0024]上述检测方法1和检测方法2中,所述17SF的具体序列如下:5-F_ACTCACTATrAGGAAGAGATGTCTGT-3)(其中rA为腺嘌呤RNA ;F为荧光基团花青素荧光染料Cy3)。
[0025]上述检测方法1和检测方法2中,所述17PS的具体序列如下:5’ -NH2-TTTTTTATAGTGAGT-3’。
[0026]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述铅离子的检测方法为非疾病诊断治疗目的铅离子的检测方法。
[0027]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述待测样品可为环境样品,如水,所述水可为饮用水。
[0028]上述检测方法1和上述检测方法2中,所述荧光强度通过倏逝波检测仪器进行检测,所述倏逝波检测仪器具体可为中国专利ZL200610089497.4的中全光纤倏逝波生物传感器。
[0029]上述检测方法1和上述检测方法2在检测环境样品中铅离子含量中的应用也属于本发明保护的范围。
[0030]实验证明,本发明的检测方法可在室温(20_30°C )20分钟完成Pb2+的检测,对Pb2+的最低检测限为20nM。本发明的检测方法可在室温能够快速、准确地进行饮用水中铅离子(Pb2+)的检测,而且特异性强,不受其它金属离子的干扰,重复性好。本发明的检测方法具有特异性强、性能
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