血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术的制作方法

文档序号:9642372阅读:428来源:国知局
血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术的制作方法
【技术领域】
[0001]本发明属于医药生物发明技术领域,具体地说,涉及一种血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术。
【背景技术】
[0002]肺癌是发病率及死亡率最高的恶性肿瘤之一,其主要的病理类型为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)。放射治疗是肺癌的重要治疗手段,据统计,60% -70%的NSCLC患者在疾病的不同阶段需接受放射治疗。
[0003]但即使是根治性放疗也不能彻底消除肿瘤,常规分割放疗(convent1nalfract1nated rad1therapy, CFRT)两年复发率高达60%-70%,进一步提高肺癌放疗疗效是目前需迫切解决的问题。辐射抵抗严重影响放疗疗效,放疗前对患者辐射敏感程度进行评估,有助于制订最佳的放疗计划,提尚放疗疗效,但目如临床缺之敏感、有效的疗效预测指标。
[0004]微小RNA (mi croRNA,mi RNA)是一类保守的内源性非编码小RNA,在转录后水平调控靶基因的表达。在多种肿瘤的发生、发展过程中均起重要调控作用,最新研究发现,其与放化疗抵抗、肿瘤干细胞特性维持、上皮-间质转化(Epithelial-mesenchymaltransit1n, EMT)等生物学特征也密切相关。miRNA表达具有组织特异性,在血楽中可稳定表达,并可进行定量检测分析,因此血浆miRNA有望成为肺癌放疗疗效预测的新型指标。
[0005]相对而言,作为技术人员来说,开发一种血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术,设计合理,血浆miRNA可反映肿瘤细胞的生物学特性,检测血浆miRNA表达水平,从而预测肺癌放疗敏感性,具有快速、简洁、准确的优点,对肺癌放疗的临床应用具有重要的指导意义。

【发明内容】

[0006]为了克服现有技术的不足,本发明提供了一种血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术,设计合理,血浆miRNA可反映肿瘤细胞的生物学特性,检测血浆miRNA表达水平,从而预测肺癌放疗敏感性,具有快速、简洁、准确的优点。
[0007]为解决上述问题,本发明所采用的技术方案是:
[0008]血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术,特征在于:
[0009](1)、抽取肺癌患者放疗前外周血,提取血浆;
[0010](2)、分离纯化血浆总RNA ;
[0011](3)、以cel-miR-39-3p (cel-39)作为外参照,与miR-18a_5p反转录引物一起进行反转录;
[0012](4)、加入miR-18a-5p PCR引物进行10个循环的预扩增;
[0013](5)、加入cel-39引物与miR-18a_5p PCR引物,qPCR法检测肺癌患者血浆miR-18a_5p 水平;
[0014](6)、miRNA 判读标准:miR-18a-5p/cel-39>2.28。
[0015]作为一种优化的技术方案,步骤(2)分离纯化血浆总RNA的方法如下:
[0016]1)取 200 μ 1 血浆于 1.5ml EP 管中;
[0017]2)向EP管中加入1000 μ 1 QIAzol Lysis Reagent裂解液,旋转混匀;
[0018]3)室温下放置5min;
[0019]4)加入200 μ 1三氯甲烷,旋转混匀15s ;
[0020]5)室温下放置2-3min ;
[0021]6)4°C,12000g 离心 15min ;
[0022]7)将上清液(600 μ 1)转移到新1.5ml EP管中,加入900 μ 1无水乙醇;
[0023]8)将步骤 8 的混合液体 750 μ 1 加入 2ml RNeasy MinElute Spin Columns,室温lOOOOrpm离心15s,弃下层液体;
[0024]9)重复步骤8);
[0025]10)向 2ml RNeasy MinElute Spin Columns 中加入 700 μ 1 RWT buffer, lOOOOrpm离心15s,弃下层液体;
[0026]11)向 2ml RNeasy MinElute Spin Columns 中加入 500 μ 1 RPE buffer, lOOOOrpm离心15s,弃下层液体;
[0027]12)向 2ml RNeasy MinElute Spin Columns 中加入 500 μ 1 80% 无水乙醇,lOOOOrpm离心2min,弃下层液体;
[0028]13)将洗脱膜植入新2ml收集管,最高速度离心5min ;
[0029]14)将洗脱膜植入新1.5ml收集管中,加入20 μ 1无酶水,最高速度离心lmin ;
[0030]15)离心后,收集管中即为总RNA ;
[0031]16)使用超微量分光光度计测量提取的总RNA浓度。
[0032]作为一种优化的技术方案,步骤(3)反转录的方法是:
[0033]1)配置反转录液(20 μ 1):
[0034]5XPrimeScriptBuffer,4 μ 1 ;
[0035]PrimeScriptRT Enzyme Mix,1 μ 1 ;
[0036]miR-18a-5p 反转录引物(2 μ Μ),0.5 μ 1 ;
[0037]cel-39 反转录引物(2 μ Μ),0.5 μ 1 ;
[0038]cel-39standard(0.1 μ Μ),1 μ 1 ;
[0039]总RNA(lOOng),1 μ 1
[0040]无酶水,补足20 μ 1。
[0041]2)反应条件:
[0042]Stepl:42°C, 15min ;
[0043]Step2:85°C,5s。
[0044]步骤(4)预扩增方法是:
[0045]1)配制预扩增液(12.5 μ 1)
[0046]cDNA,1 μ 1 ;
[0047]miR-18a-5p 上游引物(10 μ Μ),0.5 μ 1 ;
[0048]miR-18a-5p 下游引物(10 μ Μ),0.5 μ 1 ;
[0049]2 X Taq PCR MasterMix,6.25 μ 1 ;
[0050]无酶水,4.25μ1;
[0051 ]2)反应条件(普通PCR仪)
[0052]Reps:94°C,3min ;
[0053]Reps:94°C,30s ;60°C,30s ;72°C, lmin ;lOcycles ;
[0054]Reps:72°C, 5min0
[0055]作为一种优化的技术方案,步骤(5) qPCR方法是:
[0056]1)配制PCR反应液(20 μ 1体系)
[0057]SYBRPremix Ex Taq II, 10 μ 1 ;
[0058]上游引物(10uM),0.5 μ 1 ;
[0059]下游引物(10uM),0.5 μ 1 ;
[0060]ROX II,0.4 μ 1 ;
[0061]预扩增液,2μ1;
[0062]无酶水,6.6 μ 1 ;
[0063]2)反应条件
[0064]Reps:95°C, 30s ;
[0065]Reps:95°C,5s ;60°C,34s ;40cycles。
[0066]作为一种优化的技术方案,步骤¢)中判读标准:miR-18a-5p/cel-39>2.28。
[0067]由于采用了上述技术方案,本发明该检测技术中miR-18a_5p的敏感性和特异性分别87%和95%。miR-18a-5p/cel-39>2.28的患者,给予较低放疗剂量(56-60Gy),miR-18a-5p/cel-39彡2.28的患者,给予较高放疗剂量(66_70Gy)。
[0068]本发明设计合理,血浆miR-18a_5p可反映肿瘤细胞的生物学特性,检测血浆miR-18a-5p水平,预测肺癌患者放疗敏感性,具有快速、简洁、准确的优点。
【具体实施方式】
[0069]实施例:
[0070]血浆miRNA水平指导非小细胞肺癌适宜放疗剂量的检测技术,总的方法如下:
[0071](1)、抽取肺癌患者放疗前外周血,提取血楽;
[0072](2)、分离纯化血浆总RNA ;
[0073](3)、以cel-miR-39 (cel-39)作为外参照,与miR-18a_5p反转录引物一起进行反转录;
[0074](4)、加入miR-18a-5p PCR引物进行10个循环的预扩增;
[0075](5)、加入cel-39引物与miR-18a_5p PCR引物,qPCR法检测肺癌患者血浆miR-18a_5p 水平;
[0076](6)、miRNA 检测标准:miR-18a-5p/cel-39>2.28。
[0077]具体来说,步骤(2)分离纯化血浆总RNA的方法是:
[0078]1)取 200 μ 1 血浆于 1.5ml EP 管中;
[0079]2)向EP管中加入1000 μ 1 QIAzol Lysis Reagent裂解液,旋转混勾;
[0080]3)室温下放置5min ;
[0081]4)加入200 μ 1三氯甲烷,旋转混匀15s ;
[0082]5)室温下放置2_3min ;
[0083]6) 4°C,12000g 离心 15min ;
[0084]7)将上清液(600 μ 1)转移到新1.5ml EP管中,加入900 μ 1无水乙醇;
[0085]8)将步骤 8 的混合液体 750 μ 1 加入 2ml RNeasy MinElute Spin Columns,室温lOOOOrpm离心15s,弃下层液体;
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