一种冰草染色体端部特异的串联重复序列及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种冰草染色体端部特异的串联重复序列及 其应用。
【背景技术】
[0002] DNA重复序列是大多数植物基因组的主要组成部分。它可以分为两类：串联重复 序列和分散重复序列。串联重复序列是高等植物基因组的主要成分，并且分布在染色体的 特定区域，例如着丝粒、端粒、异染色质区等。一些串联排列基因被认为是可以提供大量具 有重要生理和生物功能的蛋白质或RNA产物。串联重复序列的变化可以用来研究植物基因 组的演化，并可判断演化趋势。
[0003] 染色体的鉴定在分析基因组关系上是一个重要的环节。而荧光原位杂交（FISH) 技术在鉴别染色体方面具有独特的优势，它可以快速，清楚的将染色体区分开。并且随着探 针的不断开发，越来越多的基因组染色体可以通过FISH的方法来区别。例如小麦的21对 染色体就可以通过pAsl和pHvG38来鉴定；玉米的10对染色体同样可以用FISH的方法来 区分。而黑麦染色体1R-7R仅用pScll9.2就可以很好的区分开。冰草在这方面就落后了， 虽然有对以礼草属中的P基因组用pAsl和pHvG39进行过研究但是效果并不理想，所以对 冰草染色体鉴定方面的研究还停留在核型分析上。
[0004] 综上所述，正是由于串联重复序列在植物演化中的意义，以及其在染色体识别上 的重要作用，急需在冰草属中开发这样的串联重复序列。
【发明内容】
[0005] 本发明的目的是提供一种冰草染色体端部特异的串联重复序列及其应用。
[0006] 本发明提供的冰草染色体端部特异的串联重复序列（分子标记，命名为特异DNA 分子），为序列表的序列1所示的DNA分子。
[0007] 本发明还保护所述特异DNA分子在鉴定待测植物材料的基因组中是否含有来源 于冰草染色体端部的遗传物质中的应用。
[0008] 本发明还保护一种检测待测植物材料的基因组中是否含有来源于冰草染色体端 部的遗传物质的方法，包括如下步骤：采用所述DNA特异分子作为探针，对待测植物材料进 行荧光原位杂交，如果具有荧光信号、待测植物材料的基因组中含有来源于冰草染色体端 部的遗传物质，如果不具有荧光信号、待测植物材料的基因组中可能不含有来源于冰草染 色体端部的遗传物质。
[0009] 以上任一所述待测植物可为冰草Z559、冰草Z1842、小麦Fukuho、小麦-冰草6P短 臂端体系、小麦-冰草6P二体附加系4844-12、小麦-冰草附加系5043、小麦-冰草附加系 5038、小麦-冰草附加系II-30-5或小麦-冰草附加系5114。
[0010] 本发明还保护序列表的序列1所示的DNA分子作为鉴别冰草染色体的探针的应 用。
[0011] 本发明还保护序列表的序列1所示的DNA分子作为逆转座子的应用。
[0012] 本发明的意义如下：（l)pAcTRTl的获得使冰草的染色体的识别更容易、准确，填 补了冰草染色体鉴定上无理想探针可用的空缺；（2)pAcTRTl可以对小麦背景下冰草染色 体端部的P染色质进行检测。
【附图说明】
[0013] 图1为小麦-冰草6P二体附加系4844-12的FISH结果。
[0014] 图2为冰草Z1842的FISH结果。
[0015] 图3为冰草Z1842两个不同单株染色体鉴别的FISH结果。
[0016] 图4为小麦-冰草附加系5043的FISH结果。
[0017] 图5为小麦-冰草附加系5038的FISH结果。
[0018] 图6为小麦-冰草附加系II-30-5的FISH结果。
[0019] 图7为小麦-冰草附加系5114的FISH结果。
[0020] 图8为小麦Fukuho的FISH结果。
[0021] 图9为冰草Z1842的FISH结果。
【具体实施方式】
[0022] 以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验 方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自 常规生化试剂商店购买得到的。
[0023] 冰草Z559(四倍体，4n = 28):中国农业科学院作物科学研究所作物种质资源保 护与研究中心（Wu, J.，X. Yang, H. Wang, H. Li, L. Li, X. Li, et al. 2006. The introgression of chromosome 6P specifying for increased numbers of florets and kernels from Agropyron cristatum into wheat. Theoretical and Applied Geneticsll4:13-20.)〇
[0024] 冰草Z1842(二倍体，2n = 14，P基因组）：中国农业科学院作物科学研究所作物种 质资源保护与研究中心。
[0025] 小麦Fukuho (普通小麦，六倍体，6n = 42, ABD基因组）：中国农业科学院作物科学 研究所作物种质资源保护与研究中心（Wu, M.，J. Zhang, J. Wang, X. Yang, A. Gao, X. Zhang, et al. 2010. Cloning and characterization of repetitive sequences and development of SCAR markers specific for the P genome of Agropyron cristatum. Euphytica 172:363-372.)〇
[0026] 小麦-冰草6P二体附加系4844-12 (具有42小麦条染色体+1对冰草6P染色体）： 中国农业科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心（Wu，J.，X. Yang，H. Wang，H. Li, L. Li, X. Li, et al. 2006. The introgression of chromosome 6P specifying for increased numbers of florets and kernels from Agropyron cristatum into wheat. Theoretical and Applied Genetics 114:13-20·)。
[0027] 小麦-冰草6P短臂端体系（具有42条小麦染色体+1对冰草6P染色体短臂）： 中国农业科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心。
[0028] 小麦-冰草附加系5038 (具有42条小麦染色体+1对冰草P染色体）：中国农业 科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心（Wu，Μ.，J. Zhang，J. Wang，X. Yang，A. Gao,