技术总结
本发明涉及一种利用SNP聚类和PAV变异进行亲本选择的基因组信息辅助育种方法。本发明的实质是借助基因组学和生物信息学方法，获得候选亲本的基因组测序信息，一方面通过序列比对获得高质量SNP数据集并计算候选亲本的遗传距离矩阵，借助聚类树判断候选亲本间的亲缘关系；另一方面，将Denovo组装的候选亲本contig定位到参考基因组，再根据物理位置获取候选亲本目标性状相关基因的PAV变异。结合PAV变异和基于SNP的亲缘关系信息，从大量候选亲本中筛选出亲本子集用于表型鉴定；最终结合亲本子集的表型鉴定结果确定入选育种亲本。该方法属于水稻分子育种领域，能够从大量的候选亲本中有效的缩小用于表型鉴定的材料范围，减少表型鉴定的工作量，提高育种工作效率。
技术研发人员：郑天清;黎志康;韦朝春;王文生;胡智强;余泓;王春超;傅彬英;赵秀琴;高用明;周永力;张帆
受保护的技术使用者：中国农业科学院作物科学研究所
文档号码：201610351525
技术研发日：2016.05.26
技术公布日：2016.11.30