使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别的制作方法
【专利说明】使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别
[0001]相关申请案的交叉参考
[0002]本申请案主张2012年12月20日提出申请的序列号为61/740，369的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的内容以全文弓I用的方式并入本文中。
【背景技术】
[0003]介绍
[0004]依据串联质谱法或质谱/质谱法(MS/MS)识别化合物，光谱通常为模糊的。现有算法(点积算法、基于概率的算法等)给出表示所获取光谱与库光谱之间的相似度的分数。然而，要知晓何为良好的分数是困难的。换句话说，要知晓何种分数将可信地识别化合物是困难的。
[0005]一些化合物具有极少或不具有区分碎片，此导致不表示识别的可信度的分数。举例来说，不具有碎片的化合物将得到极高的符合率与纯度分数，但具有不良碎裂的许多其它化合物也将如此。这使得难以将误肯定与真命中区分开。
[0006]在其它情形中，中等丰富的碎裂图案具有来自共洗脱化合物的干扰，此不利地影响分数。这使得难以知晓何种分数适于可信地识别化合物。
[0007]历史上，最常对气相色谱-质谱联用(GC-MS)系统电子撞击(EI)源使用库搜索。这些系统及源具有极良好定义的能量，从而导致不同实验室当中且甚至跨越仪器模型的极可再现的光谱。针对液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)光谱，碎裂图案在很大程度上取决于所使用的碰撞能量(CE)且可在仪器之间稍微变化。这使得难以设置适当分数以跨越不同实验室识别化合物。
【发明内容】
[0008]揭示一种用于使用多个光谱进行化合物识别的系统，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。质谱仪分析样本。在每一分析循环内，所述质谱仪选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的所述强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述离子碎裂。产生随所述可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
[0009]处理器从所述质谱仪接收所述至少一个离子的所述多个所获取碎片离子光谱。所述处理器通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。已知化合物的所述数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含也随所述可变仪器参数而变化的多个已知碎片离子光谱。
[0010]揭示一种用于使用多个光谱进行化合物识别的方法，所述光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。使用处理器从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。
[0011]通过使用所述处理器将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。
[0012]揭示一种包含非暂时性及有形计算机可读存储媒体的计算机程序产品，所述计算机可读存储媒体的内容包含具有在处理器上执行以便执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的指令的程序，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。在各种实施例中，所述方法包含提供一系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括测量模块及分析模块。
[0013]所述测量模块使用所述测量模块从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。所述分析模块通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。
[0014]本文中陈述申请人的教示的这些特征及其它特征。
【附图说明】
[0015]所属领域的技术人员将理解，下文所描述的图式仅用于图解说明目的。所述图式并不打算以任何方式限制本发明教示的范围。
[0016]图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统的框图。
[0017]图2是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的系统的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
[0018]图3是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的示范性流程图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
[0019]图4是根据各种实施例的包含一或多个相异软件模块，执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的系统的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
[0020]在详细描述本发明教示的一或多项实施例之前，所属领域的技术人员将了解，本发明教示在其应用方面并不限于以下详细描述中所陈述或图式中所图解说明的构造细节、组件布置及步骤安排。此外，应理解，本文中所使用的措辞及术语是用于描述的目的且不应视为具限制性。
【具体实施方式】
[0021]计算机实施的系统
[0022]图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统100的框图。计算机系统100包含总线102或用于传递信息的其它通信机构，及与总线102耦合以用于处理信息的处理器104。计算机系统100还包含耦合到总线102以用于存储待由处理器104执行的指令的存储器106，所述存储器可为随机存取存储器(RAM)或其它动态存储装置。存储器106还可用于在待由处理器104执行的指令的执行期间存储临时变量或其它中间信息。计算机系统100进一步包含只读存储器(ROM) 108或耦合到总线102以用于存储用于处理器104的静态信息及指令的其它静态存储装置。存储装置110(例如磁盘或光盘)经提供且耦合到总线102以用于存储信息及指令。
[0023]计算机系统100可经由总线102耦合到显示器112 (例如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD))以向计算机用户显示信息。包含字母数字键及其它键的输入装置114耦合到总线102以用于将信息及命令选择传递到处理器104。另一类型的用户输入装置为用于将方向信息及命令选择传递到处理器104且用于控制显示器112上的光标移动的光标控制件116，例如鼠标、轨迹球或光标方向键。此输入装置通常具有在两个轴(第一轴(即，x)及第二轴(即，y))上的两个自由度，此允许所述装置规定在平面中的位置。
[0024]计算机系统100可执行本发明教示。依照本发明教示的特定实施方案，由计算机系统100响应于处理