7^抗性的QTL"指在椒类植物中赋予或增强针对Tsw抗性突破性毒株Ve427 EB的抗性 的遗传元件,例如,核酸(如基因组DNA)。在一个实施方案中,所述遗传元件可衍生自/可 获自野生种质PA2638的椒类植物。因此,在一个实施方案中,遗传元件可W通过将具有种 质PA2638的植株与另一个辣椒果实植物杂交获得(可获得)。如本文所用的"野生种质 PA2638"指从意大利的市场获得的野生种质。PA2638的种子的代表性样品已经由纽内姆公 司(Nunhems B. V.)在2012年2月23日在登录号NCIMB 41936下保藏。在一个实施方案 中,可W使用抗性测定法例如本文作为"Ve427EB抗性测定法"描述的测定法和/或分子标志 物测定法确定包含赋予Ve427?抗性的QTL的遗传元件在植物中的存在或不存在。在一个 实施方案中,包含赋予Ve427EB抗性的giL的遗传元件获自、可获自、衍生自、可衍生自、存在 于W登录号NCIMB 41817、NCIMB 41818或NCIMB 41936保藏的种子和从该些种子培育的植 物和/或其子代。因此,在一个实施方案中,包含赋予Ve427^抗性的giL的遗传元件源自、 获自、可获自、衍生自、可衍生自其种子W登录号NCIMB 41817、NCIMB 41818或NCIMB41936 保藏的植物与另一个椒类植物杂交。
[0036] "Ve427?抗性测定法"是一种测定法,它适合确定椒类植物对Tsw抗性突破性毒株 的抗性和/或包含赋予Ve427^抗性的QTL的遗传元件的存在。下文进一步示例性描述该 测定法。使用该种测定法,可W将植物、植物品系或品种划归为"抵抗"Tsw抗性突破性毒 株,如 Ve427EB。
[0037] "抗性"指相对于缺少有效(或有功能的)抗性基因的植株,在包含有效(或有功 能的)抗性基因的植株统计学显著地限制特定病原体(例如一个或多个TSWV毒株)的增 长和/或发育和/或W特定病原体(例如一个或多个TSWV毒株)感染后统计学显著地减 少疾病症状。抗性可W定性确定(将特定品系或品种的植株划分为'抗性'或'易感')和 /或抗性可W定量,例如在抗性测定法中,通过例如测量为病毒毒株感染后存活(存活% ) 或如果仅植株的一部分感染时显示基本上无全身症状的特定品系或品种植株的百分数。在 一个实施方案中,如果根据Tsw抗性突破性毒株感染或接种后不形成症状,特别地是不形 成全身症状(可W在TSWV抗性测定法中检验),将某个植物品系或品种定性为'抗性',例 如,如本文所述,将该植物品系或品种称为抵抗Tsw抗性突破性毒株。在一个实施方案中, 如果一个植物品系或品种显示基本上无全身症状,即如果用Tsw抗性突破性毒株感染或接 种后,植物的至少60%、优选地至少70%、75%、80%、85%、90%或更多(例如92%、93%、 94%、95%、98%、99%或100%)显示无全身症状(即在上端未接种的叶上无黄色斑驳), 则称该植物品系或品种抵抗Tsw抗性突破性毒株。技术人员将理解应当在相同测试条件下 测试每个品系或品种至少10个植株,12、15或20个或甚至更多植株W评价某品系或品种是 否具有抗性并且应当包括合适的对照植物。
[003引术语"等位基因"意指在特定基因座处某基因的一种或多种替代形式的任一个,全 部等位基因均设及特定基因座处的一个性状或特征。在生物的二倍体细胞中,给定基因的 等位基因位于染色体上的特定位置或基因座(locus)(复数形式;基因座(loci))处。一个 等位基因存在于成对同源染色体的每条染色体上。二倍体植物物种如椒可W在特定的基因 座处包含众多不同的等位基因。该些等位基因可w是基因的相同等位基因(纯合)或两个 不同的等位基因(杂合)。
[0039] "种植"或"栽种"指将巧苗(小植物)通过机器或手工播种(直接播种)或移栽 至田地中。
[0040] "营养繁殖"指植物从营养组织繁殖,例如通过体外繁殖法。体外繁殖法设及体外 细胞培养或组织培养和从体外培养物再生完整植株。因此可W通过体外培养和再生方法产 生原始植株的克隆(即遗传上相同的营养繁殖)。
[0041] 术语"基因座(locus)"(复数形式;基因座(loci))意指染色体上其中存在例如 基因或giL或分子标志物的一个特定位置或多个位置或一个位点或区域。相同染色体上基 因座之间的距离由交换的频率度量。两个基因座相隔越远,它们之间更有可能交换。相反, 如果两个基因座靠近在一起,则交换在它们之间较不可能出现。通常,1厘摩(cM)等于基因 座(例如标志物)之间的1%重组。
[00创术语"QTL"和"数量性状基因座"在本文中W本领域认可的意思使用。该些术语 指位于辣椒属特定染色体上与编码Ve427EB抗性的至少一个基因(或等位基因)相关的区 域或至少一个调节区,即控制参与Ve427?抗性的一个或多个基因表达的染色体区域。可W 例如将该基因的表型表现观察为病毒复制速率降低和/或观察为病毒穿过植物运动的速 率降低和/或其表型效应(例如基本上无全身症状形成)。Q化可W例如包含一个或多个 其产物赋予遗传抗性的基因。备选地,Q化可W例如包含其产物影响植物基因组中其他基 因座上基因的表达,因而赋予Ve427EB抗性的调节基因或序列。
[0043] 术语"天然遗传背景"在本文中用来指QTL的原始遗传背景,即其中最初发现QTL 的基因组和染色体。因此,PA2638(登录号NCIMB 41963)的基因组代表了包含本发明赋予 Ve427^抗性的giL的遗传元件的天然遗传背景。相反,设及将包含giL的dm区域(或渐 渗片段(introgression化agment))或其抗性赋予部分从PA2638的原始遗传背景转移(或 渐渗)至另一个辣椒属植物或物种的另一个遗传背景(例如转移到另一个基因组的染色体 上)的方法将导致该WL或其所述抗性赋予部分不处于其天然遗传背景中。如本文所用, 术语"连锁群"与染色体(物理实体)同义。
[0044] 术语"分子标志物"、"遗传标志物"或"DNA标志物"在本文中指通过各种方法检测 到W可视化核酸序列差异的多态性核酸序列。该类方法的例子是定义特定遗传位置和染色 体位置的限制性片段长度多态性(RFL巧标志物、扩增片段长度多态性(AFL巧标志物、单核 巧酸多态性(SNP)、插入、突变、微卫星标志物(SSR)、序列表征的扩增区域(SCAR)、切割的 扩增多态性序列(CAP巧标志物或同工酶标志物或所述标志物的组合。"与giL或者基因或 基因座连锁的分子标志物"因此指与包含QTL、基因或基因座的基因组DNA区域物理连接并 与包含QTL、基因或基因座的DNA区域共分离的标志物。标志物因此还可W定义渐渗区域。
[0045] "重组事件"指减数分裂的交换事件。
[0046] 术语"渐渗区域"或"渐渗的DNA区域"、"渐渗的性状"或"渐渗的基因"或"渐渗 的片段"指已通过育种方法如回交从一个植物基因组转移至另一个植物的基因组的染色体 区段。
[0047] "渐渗"在本文中指赋予特定性状或表型(例如针对TSWV毒株VE427EB的抗性)的 DNA区域(渐渗区域)从一个植物基因组通过种间杂交转移至相同物种或密切相关物种的 另一个植物基因组。具体而言,指该个DM区域从非栽培植物或从野生植物(缺少良好农艺 学特性)转移至栽培植物(具有良好农艺学特性)的基因组中。因此,在一个实施方案中, 所产生的椒类植物包含已经向其基因组中渐渗来自另一个植物基因组、特别地来自PA2638 的渐渗片段的栽培椒类植物的基因组。渐渗通常设及多个育种步骤如一个或多个杂交、自 交和/或回交,但是还可W设及标记物辅助选择、表型选择(例如抗性测定法)、双单倍体产 生、胚捶救等。
[0048] "回交"指将两个亲本之间杂交而产生的植株与亲本之一杂(回)交的育种方法。 回交中使用的亲本称作回归亲本。反复回交导致基因组变得越来越纯合,越来越相似于回 归亲本。回交可W用来将源自供体植物(例如野生种质)的性状引入另一个植物(例如栽 培植物或繁育系)中。
[0049] 术语"自交"指个体W自身花粉