1.一种用于训练计算机实现的学习方法以识别样本中的目标生物材料的方法,所述方法包括以下步骤:
访问多个训练图像,该训练图像通过包含目标生物材料和任选地非目标生物材料的一个或多个样本的光学显微术获得,
通过人类和/或计算机手段裁剪所述多个训练图像中的一个或多个,以便产生一个或多个裁剪图像,所述一个或多个裁剪图像中的每一个主要显示所述目标生物材料,
通过人类手段在有可能识别的所述一个或多个裁剪图像中的每一个中识别所述目标生物材料,
将识别标签与有可能识别的所述一个或多个裁剪图像中的每一个相关联,
将计算机实现的特征提取方法应用于每个标记的裁剪图像,
将计算机实现的学习方法应用于每个标记的裁剪图像,
其中,所述计算机实现的学习方法被配置成将生物材料的一个或多个提取的特征与目标生物材料相关联。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述多个训练图像中的一个或多个的所述裁剪包括:将所述目标生物材料与所述显微镜视野背景和/或非目标材料(如果存在)区分开;以及裁剪所述目标生物材料,使得所述图像主要或基本上仅包括目标生物材料。
3.根据权利要求2所述的方法,其中,所述目标生物材料与所述非目标材料的所述区分至少部分地通过计算机手段来实现。
4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述目标生物材料与所述非目标材料的所述区分通过人工辅助的计算机手段进行。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述人工辅助的计算机手段包括:将训练图像分成一系列帧,
通过人类手段识别在所述系列帧中的每一个中目标生物材料的存在或不存在,
将计算机实现的特征提取方法应用于所述系列帧中的每一个,以及
将计算机实现的学习方法应用于所述系列帧中的每一个,
其中,所述计算机实现的学习方法被配置成将一个或多个提取的特征与帧中目标生物材料的存在或不存在相关联。
6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述关联用于识别在多个帧中目标生物材料的存在或不存在,所述多个帧没有在所述人类辅助的计算机手段中使用,并且其中,在所述目标生物材料存在的情况下,在所述目标生物材料周围裁剪,使得所述图像主要或基本上仅包括目标生物材料。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中,裁剪图像和/或从所述裁剪图像提取的特征中的每一个被存储在与其相应的识别标签链接关联的数据库中。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中,所述目标生物材料是离散对象。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述离散对象是细胞器、细胞、单细胞生物体、多细胞生物体的解剖部分、多细胞生物体或生殖结构。
10.一种包括根据权利要求1至9中任一项所述的方法产生的多个裁剪图像的数据库,每个裁剪图像与其识别标签链接关联。
11.一种数据库,包括从训练图像中提取并根据权利要求1至9中任一项所述的方法产生的一个或一组特征,所述一个或一组特征与生物材料识别信息链接关联。
12.一种识别样本中的目标生物材料的方法,所述方法包括:
访问通过显微术获得的样本的测试图像,
将计算机实现的位置检测方法应用于所述测试图像,所述计算机实现的位置检测方法被配置成识别所述测试图像中潜在目标生物材料的位置,
将计算机实现的特征提取方法应用于所识别的所述位置,以提供一个或一组提取的特征,
将所述一个或一组提取的特征与存储在数据库中的一个或一组特征相匹配,所述数据库具有与生物材料身份信息链接关联的一个或一组特征。
13.根据权利要求12所述的方法,其中,所述计算机实现的位置检测方法包括将所述测试图像分成一系列区域以用于分析。
14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述区域彼此重叠。
15.根据权利要求12所述的方法,其中,所述计算机实现的位置检测方法包括所述目标生物材料的轮廓的考虑。
16.根据权利要求15所述的方法,其中,所述轮廓的尺寸被测量或估计。
17.根据权利要求12所述的方法,其中,所述计算机实现的位置检测方法包括使用近似于所述目标生物材料的形状的模板。
18.根据权利要求12至17中任一项所述的方法,其中,所述目标生物材料是离散对象。
19.根据权利要求18所述的方法,其中,所述离散对象是细胞器、细胞、单细胞生物体、多细胞生物体的解剖部分、多细胞生物体或生殖结构。
20.根据权利要求18或权利要求19中任一项所述的方法,包括对由所述计算机实现的位置检测方法识别的两个或更多个离散对象进行计数的计算机实现的方法。
21.根据权利要求12至20中任一项所述的方法,包括将级联或层级分类方法应用于所述测试图像,所述级联或层级分类方法包括第一一般分类步骤,随后是一个或多个特定分类步骤。
22.一种用于识别样本中的目标生物材料的系统,所述系统包括:
显微镜,其被配置成捕获样本的图像并将该图像作为电子图像文件输出,
与所述显微镜数据连通的处理器使能设备,所述处理器使能设备被配置成
(i)执行权利要求12至21中任一项所述的方法的一部分或全部,或
(ii)将所述电子图像文件或从所述电子图像文件提取的特征传输到远程处理器使能设备,所述远程处理器使能设备被配置成执行权利要求12至21中任一项所述的方法的一部分或全部。
23.根据权利要求22所述的系统,包括远程处理器使能设备,所述远程处理器使能设备被配置成执行根据权利要求12至21中任一项所述的方法的一部分或全部,所述远程处理器使能设备与所述处理器使能设备数据连通,所述处理器使能设备与所述显微镜数据连通。
24.根据权利要求23所述的系统,其中,与所述显微镜数据连通的所述处理器使能设备是移动设备。
25.一种处理器使能设备或处理器使能设备的网络,所述处理器使能设备或所述处理器使能设备的网络被配置成执行根据权利要求12至21中任一项所述的方法。