一种FISH室荧光计数系统的制作方法

文档序号:22317499发布日期:2020-09-23 01:46阅读:290来源:国知局
一种FISH室荧光计数系统的制作方法

本发明涉及计数系统技术领域,具体为一种fish室荧光计数系统。



背景技术:

fish即为荧光原位杂交技术(fluorescenceinsituhybridization),是利用荧光标记的特异核酸探针与细胞内相应的靶dna分子或rna分子杂交,用以标记细胞或细胞器,接着通过在荧光显微镜或共聚焦激光扫描仪下观察荧光信号,通过统计的方式来确定被标记的细胞或细胞器的分布、定位等相关信息。

但实验人员在fish室每天进行荧光信号计数时,需要一人操作手动荧光显微镜,而操作荧光显微镜的个人需保持观察状态无法进行数据记录,故需要占用另一位人员进行记录,两者配合进行人工数据统计,这一过程耗时且因协同问题易出错,而且科室人员总体效率下降一半,这些弊端在标本量大的情况下凸显的更为明显。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供一种fish室荧光计数系统,以解决上述背景技术中提出的问题。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:

一种fish室荧光计数系统,所述fish室荧光计数系统包括声音输入设备、语音识别系统、计数系统、音频输出模块和数据处理系统,所述声音输入设备输出音频信号连接语音识别系统,所述语音识别系统输出数组连接计数系统,所述计数系统通过无线通信连接音频输出模块,所述计数系统输出基础数据连接数据处理系统。

进一步的,一种fish室荧光计数系统所得到的语音识别系统,所述语音识别系统包括信号接口模块、hht环节和cnn环节。

进一步的,一种fish室荧光计数系统所得到的语音识别系统,所述音频信号通过信号接口连接hht环节中的emd分解模块,所述emd分解模块的终止准则是imf残波被分解至单调,所述emd分解模块的分解分量输出至黄变换模块,所述黄变换模块输出时频谱图,所述时频谱图连接cnn环节的特征标记层,所述特征标记层提取rgb序列输出至卷积层,所述卷积层通过训练权值的加权输出至池化层,所述池化层通过训练权值加权取最值,所述池化层和积层通过若干次迭代输出分类结果。

进一步的,一种fish室荧光计数系统所得到的计数系统,所述计数系统包括缓冲区、执行区和gui界面。

进一步的,一种fish室荧光计数系统,所述fish室荧光计数系统的运作流程至少包括以下步骤:

一、声音输入设备采集音频信号并输入至语音识别系统;

二、语音识别系统将处理音频信号得到的特征值数组输入计数系统;

三、特征值数组进入计数系统后进入缓存区,缓存区的数据进一步进入执行区并处理成基础数据;

四、执行区通过计数规则设置模块设置计数规则,对可读数据进行进一步判断,若是符合计数规则,则基础数据输入gui界面显示,若是不符合计数规则,则输出输出警报信号,警报信号从执行区输出至三个方向,一方面输出至gui界面使得gui界面变红提示,并通过无线通信输出至音频输出模块发出警报提示语,另一方面输出至缓存区关闭缓存区输送特征值信号至执行区;

五、执行区输出基础数据还送至数据处理系统,数据处理系统按照数据格式设置设置的格式转化基础数据至结构化数据,最终输出结构化数据并同步储存。

进一步的,所述gui界面左上角设有界面logo,所述gui界面中间设为数显区域,所述数显区域右下角设有数显刷新按钮。

本发明的优点在于:本设计下,该系统使用计数系统进行记录,可以节省了原本一半工作人员,提升了实验室人员一倍的工作效率,且由于单人即可完成荧光观察和统计,个人的实验条件更为自由;且设定好数据统计公式,当计数完成的同时,记录同时完成,计数系统同时自动完成数据汇总统计,代替了人工的繁杂工作,利用正则表达式排除无关字符的干扰、提取有效数字,vbs脚本语言将读入的数据转换并保存为csv文件格式,方便后续的数据统计汇总,整个过程实现智能操作,不易出错。

附图说明

图1为本发明中的整体系统的结构图;

图2为本发明中的语音识别系统的拓扑图;

图3为本发明中的计数系统的结构图;

图4为本发明中的gui界面设计图。

图中:1、声音输入设备;2、语音识别系统;21、信号接口模块;22、hht环节;221、emd分解模块;222、黄变换模块;23、cnn环节;231、卷积层;232、池化层;3、计数系统;31、缓存区;32、执行区;33、gui界面;331、界面logo;332、数显区域;333、数显刷新按钮;4、音频输出模块;5、数据处理系统。

具体实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。

在本发明的描述中,需要理解的是,术语“中心”、“纵向”、“横向”、“长度”、“宽度”、“厚度”、“上”、“下”、“前”、“后”、“左”、“右”、“竖直”、“水平”、“顶”、“底”、“内”、“外”、“顺时针”、“逆时针”等指示的方位或位置关系为基于附图所示的方位或位置关系,仅是为了便于描述本发明和简化描述,而不是指示或暗示所指的设备或元件必须具有特定的方位、以特定的方位构造和操作,因此不能理解为对本发明的限制。

此外,术语“第一”、“第二”仅用于描述目的,而不能理解为指示或暗示相对重要性或者隐含指明所指示的技术特征的数量。由此,限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括一个或者更多个该特征。在本发明的描述中,“多个”的含义是两个或两个以上,除非另有明确具体的限定。

请参阅图1-4,本发明提供一种技术方案:

一种fish室荧光计数系统,fish室荧光计数系统包括声音输入设备1、语音识别系统2、计数系统3、音频输出模块4和数据处理系统5,声音输入设备1输出音频信号连接语音识别系统2,语音识别系统2输出数组连接计数系统3,计数系统3通过无线通信连接音频输出模块4,计数系统3输出基础数据连接数据处理系统5。

值得说明的是,本实施例下使用的声音输入设备1为凯浮蛙h813电脑桌面麦克风;使用的音频输出模块4为金河田(goldenfield)m18蓝牙版电脑音箱。以上选型对应的设备属于现有技术,这里不再赘述。

一种fish室荧光计数系统所得到的语音识别系统2,语音识别系统2包括信号接口模块21、hht环节22和cnn环节23。

值得注意的是,语音识别系统2所将音频信号转化的结果为一稀疏特征值,需经过计数系统3的处理后得到具有可读性的基础数据。

一种fish室荧光计数系统所得到的语音识别系统2,音频信号通过信号接口21连接hht环节22中的emd分解模块221,emd分解模块221的终止准则是imf残波被分解至单调,emd分解模块221的分解分量输出至黄变换模块222,黄变换模块222输出时频谱图,时频谱图连接cnn环节23的特征标记层,特征标记层提取rgb序列输出至卷积层231,卷积层231通过训练权值的加权输出至池化层232,池化层232通过训练权值加权取最值,池化层232和积层231通过若干次迭代输出分类结果。

进一步的,本设计下的语音识别系统2的工作原理是:emd分解模块221将时域音频信号分解为若干个imf分量,对imf分量取黄变换得到一张包含音频信号时间信息和频率信息的时频谱能量图,这个过程被称为黄-希尔伯特变换(hht);对hht得到的时频谱能量图进行卷积神经网络的训练;训练分卷积和池化两个过程,通过多次迭代,得到训练的权值用以构建神经网络架构;训练好的神经网络即可直接用于分类以后每次输入的音频信号对应的输出特征值。

请参阅图1和图3,一种fish室荧光计数系统所得到的计数系统3,计数系统3包括缓冲区31、执行区32和gui界面33。

具体的,缓冲区31用于提取的特征值缓存,对系统具有一定的预留作用,如掉电缓存作用,这也是语音识别系统2不直接转化为可读的基础数据的原因,系统遵从“即用即取”的设计原则,提升系统的响应速度,减少内存损耗。执行区32具有数据转换,接入外部设定和逻辑判断的作用。gui界面33用于实时数显。

一种fish室荧光计数系统,fish室荧光计数系统的运作流程至少包括以下步骤:

一、声音输入设备1采集音频信号并输入至语音识别系统2;

二、语音识别系统2将处理音频信号得到的特征值数组输入计数系统3;

三、特征值数组进入计数系统3后进入缓存区31,缓存区31的数据进一步进入执行区32并处理成基础数据;

四、执行区32通过计数规则设置模块设置计数规则,对可读数据进行进一步判断,若是符合计数规则,则基础数据输入gui界面33显示,若是不符合计数规则,则输出输出警报信号,警报信号从执行区32输出至三个方向,一方面输出至gui界面33使得gui界面33变红提示,并通过无线通信输出至音频输出模块4发出警报提示语,另一方面输出至缓存区31关闭缓存区31输送特征值信号至执行区;

五、执行区32输出基础数据还送至数据处理系统5,数据处理系统5按照数据格式设置设置的格式转化基础数据至结构化数据,最终输出结构化数据并同步储存。

进一步的,执行区32并处理成基础数据可使用稀疏算法。数据处理系统5每次处理基础数据至结构化数据会同步更新系统的运行日志,方便系统错误时的检查和数据的信息标注。

gui界面33左上角设有界面logo331,gui界面33中间设为数显区域332,数显区域332右下角设有数显刷新按钮333。

具体的,程序以英文状态的冒号字符作为分隔符计数,即输入一个英文状态的冒号计数加一,如图4的示例所述。

尽管已经示出和描述了本发明的实施例,对于本领域的普通技术人员而言,可以理解在不脱离本发明的原理和精神的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型,本发明的范围由所附权利要求及其等同物限定。

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