生物斑迹离体时间预测方法与流程

文档序号:35832049发布日期:2023-10-25 08:07阅读:来源:国知局

技术特征:

1.预测生物斑迹离体时间的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:对生物体已知离体时间的不同离体时间生物斑迹样本进行测序获得所述样本的基因序列数据和/或所述样本的微生物序列数据,对所述基因序列数据和/或所述微生物序列数据进行数据分析得到所述样本的数据分析结果;使用循环神经网络对所述已知离体时间和数据分析结果进行提取,获得对所述离体时间预测有效的样本基因特征变量和/或样本的微生物otus特征变量;使用pca从所述基因特征变量和或所述otus特征变量中筛选出对所述离体时间预测更有效的重要基因特征变量和/或重要otus特征变量,基于所述重要基因特征变和/或重要otus特征变量获得对离体时间预测有效的重要基因和/或重要otus;提取所述重要基因的序列数据和/或所述重要otus的丰度数据,基于所述重要基因的序列数据和/或所述重要otus的丰度数据,使用lightgbm模型训练获得预测生物斑迹离体时间的模型,使用所述模型预测待预测生物斑迹样本的离体时间。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述生物斑迹样本为唾液样本或血液样本。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述测序为16sdna v4区的扩增子测序或转录组测序;所述样本的数据分析结果为所述样本的微生物的otu相对丰度信息或所述样本的基因序列信息和基因表达fpkm信息。

4.根据权利要求1-3中任一权利要求所述的方法,其特征在于:所述预测生物斑迹离体时间的模型的获得基于深度学习计算平台paddlepaddle1.8.3和机器学习计算工具sklearn.0.24.2实现。

5.预测生物斑迹离体时间的装置,其特征在于:

6.根据权利要求5所述的装置,其特征在于:所述生物斑迹样本为唾液样本或血液样本。

7.根据权利要求5或6所述的装置,其特征在于:所述基因序列数据为转录组测序数据;所述微生物序列数据为16sdna v4区的扩增子测序数据;所述数据分析结果为所述样本的微生物的otu相对丰度信息或所述样本的基因序列信息和基因表达fpkm信息。

8.一种存储有计算机程序的计算机可读存储介质,所述计算机程序使计算机建立如权利要求1-4中任一权利要求所述的方法的步骤或所述计算机程序使计算机建立如权利要求5-7中任一权利要求所述装置的模块。

9.存储有计算机程序的计算机可读存储介质,所述计算机程序使计算机执行如权利要求1-4中任一权利要求所述的方法的步骤或所述计算机程序使计算机执行如权利要求5-7中任一权利要求所述装置的模块的步骤。


技术总结
本发明公开了生物斑迹离体时间预测方法。本发明基于深度学习和机器学习对生物斑迹的离体时间进行推断,主要通过循环神经网络和PCA模块从原始的不同离体时间生物体样本的数据中筛选出对离体时间预测有效的基因特征或微生物OTUs特征变量,通过高精度的lightGBM模型训练模块基于具有有效的基因特征或微生物OTUs特征变量的样本数据训练得到预测模型,通过该模型预测生物斑迹离体时间。实验证明,本发明所建立的方法对血液样本或唾液样本的离体预测,在模型适用时间范围内(血液样本0~168天;唾液样本0~150天),模型准确率、精确率、召回率和F1可达85%或90%以上,模型预测性能较好,符合事件处理实际需求。

技术研发人员:张瑾,杨雪莹,徐小玉,畅晶晶,郭柯利,杜猛,刘开会,朱典,秦叶
受保护的技术使用者:公安部物证鉴定中心
技术研发日:
技术公布日:2024/1/15
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