用PD-1轴结合拮抗剂和RNA疫苗诱导新表位特异性T细胞的方法与流程

文档序号:35287353发布日期:2023-09-01 09:02阅读:34来源:国知局
用PD-1轴结合拮抗剂和RNA疫苗诱导新表位特异性T细胞的方法与流程

本公开涉及在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性免疫应答的方法。以ascii文本文件提交序列表以下提交的ascii文本文件的内容全文以引用方式并入本文:序列表的计算机可读格式(crf)(文件名:146392050140seqlist.txt,记录日期:2021年1月22日,大小:41kb)。


背景技术:

1、调节免疫抑制性途径是近来癌症治疗的重大突破。靶向细胞毒性t淋巴细胞抗原4(ctla-4,yervoy/伊匹单抗(ipilimumab))、程序性细胞死亡蛋白1(pd-1,opdivo/纳武单抗(nivolumab)或keytruda/派姆单抗(pembrolizumab))和pd-l1(阿特珠单抗(atezolizumab))的检查点阻断抗体已经在多种肿瘤适应症患者中展现出可接受的毒性、有希望的临床应答、持久的疾病控制和改善的存活。但是,仅少数患者对免疫检查点阻断(icb)疗法产生持续缓解,其余患者表现出原发性或继发性耐药性。

2、典型地,肿瘤携带大量体细胞突变。继而,含有突变的肽的表达可能被适应性免疫系统识别为非自身新表位。识别到非自身抗原后,细胞毒性t细胞将触发免疫应答,导致显示非自身新表位的细胞凋亡。因此,正在开发和研究靶向免疫原性表位以活化免疫系统的治疗性疫苗以用于癌症治疗。但是,迄今为止,治疗性疫苗虽然很有前景,但过去一直未能达到预期。潜在原因之一是癌症特异性t细胞在长期暴露于癌症细胞期间变得功能耗竭。

3、因此,可能需要采用两种或更多种靶向癌症免疫治疗(cit)剂(例如一种检查点抑制剂和一种靶向免疫原性表位的治疗性疫苗)的联合治疗方案,以充分发挥宿主免疫系统的抗肿瘤潜力。

4、因此,本领域需要诱导宿主免疫系统的抗肿瘤免疫应答的改进方法。

5、本文所引用的所有参考文献,包括专利申请、专利公开和uniprotkb/swiss-prot登录号通过引用整体并入本文,如同个别参考文献各自特定地和个别地指示为通过引用并入一样。


技术实现思路

1、本文提供了涉及用于治疗癌症的pd-1轴结合拮抗剂(例如,抗pd1或抗pd-l1抗体)和rna疫苗的方法、试剂盒和用途。

2、在一方面,本文提供了一种在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法,其包括向该个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自该个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后获得自该个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。在一些实施例中,外周血样品包含约5%或约6%的对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的cd8+t细胞。在一些实施例中,利用离体elispot或mhc多聚体分析来检测外周血样品中的新表位特异性cd8+t细胞。在一些实施例中,与施用rna疫苗之前相比,向个体施用rna疫苗导致对该个体的外周血中的新表位特异性cd4+t细胞的诱导,其中新表位特异性cd4+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。在一些实施例中,利用离体elispot分析来检测获得自个体的外周血样品中的新表位特异性cd4+t细胞。在一些实施例中,与施用rna疫苗之前相比,向多个个体施用rna疫苗导致在所述多个个体中的至少约70%的个体的外周血中诱导新表位特异性cd4+或cd8+t细胞,其中新表位特异性cd4+或cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来评定对新表位特异性cd4+或cd8+t细胞的诱导。在一些实施例中,与施用rna疫苗之前的一种或多种炎症性细胞因子的水平相比,向个体施用rna疫苗导致该个体的外周血中的所述一种或多种炎症性细胞因子的水平升高。在一些实施例中,在施用rna疫苗后约4小时至约6小时之间,个体的外周血中存在所述一种或多种炎症性细胞因子的水平的升高。在一些实施例中,所述一种或多种炎症性细胞因子选自ifnγ、ifnα、il-12或il-6。

3、在另一方面,本文提供了一种在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法,其包括向该个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自该个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后获得自该个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。

4、在另一方面,本文提供了一种在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法,其包括向该个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自该个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

5、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,新表位特异性cd8+t细胞具有记忆表型。在一些实施例中,具有记忆表型的新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。在一些实施例中,效应记忆t细胞(tem)为cd45ro阳性和ccr7阴性。在一些实施例中,新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

6、在一些实施例中,个体患有具有低至中等突变负荷的肿瘤。在一些实施例中,个体具有低肿瘤负荷。

7、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,肿瘤具有低或阴性pd-l1表达。在一些实施例中,获得自肿瘤的样品中的少于5%的肿瘤细胞表达pd-l1。在一些实施例中,获得自肿瘤的样品中的少于5%的免疫细胞表达pd-l1。在一些实施例中,使用免疫组织化学确定获得自肿瘤的样品中表达pd-l1的肿瘤细胞或免疫细胞的百分比。

8、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

9、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,个体患有局部晚期或转移性实体瘤或者具有一种或多种转移性复发。在一些实施例中,肿瘤为非小细胞肺癌(nsclc)、膀胱、肾、头颈部、肉瘤、乳腺、黑素瘤、前列腺、卵巢、胃、肝、尿路上皮、结肠、肾脏、子宫颈、梅克尔细胞癌(mcc)、子宫内膜、软组织肉瘤、食管、食管胃交界部、骨肉瘤、甲状腺或结直肠肿瘤。在一些实施例中,乳腺肿瘤为三阴性乳腺癌(tnbc)肿瘤。

10、在一些实施例中,肿瘤为尿路上皮肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约10%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为肾肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约22%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为黑素瘤肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约30%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为tnbc肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约4%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为nsclc肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约10%的个体中的客观缓解。

11、在一些实施例中,肿瘤为之前未接受过检查点抑制剂治疗的尿路上皮肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约10%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为之前未接受过检查点抑制剂治疗的肾肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约22%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为之前未接受过检查点抑制剂治疗的黑素瘤肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约30%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为之前未接受过检查点抑制剂治疗的tnbc肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约4%的个体中的客观缓解。在一些实施例中,肿瘤为之前未接受过检查点抑制剂治疗的nsclc肿瘤,并且向多个个体施用rna疫苗导致所述多个个体中至少约10%的个体中的客观缓解。

12、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,在施用rna疫苗之前,个体已经接受过一种或多种癌症疗法或3种与5种之间的癌症疗法的治疗。在一些实施例中,在施用rna疫苗之前,个体已经接受过检查点抑制剂疗法的治疗。在一些实施例中,在施用rna疫苗之前,个体尚未接受过检查点抑制剂疗法的治疗。在一些实施例中,在施用rna疫苗之前,个体已经接受过约1种至约17种之间或约1种至约9种之间的在先全身性癌症疗法的治疗。

13、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码10至20个由存在于肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的新表位。

14、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗被配制在脂质体复合物纳米颗粒或脂质体中。在一些实施例中,脂质体复合物纳米颗粒或脂质体包含一种或多种脂质,所述一种或多种脂质形成包封rna疫苗的rna的多层结构。在一些实施例中,所述一种或多种脂质包含至少一种阳离子脂质和至少一种辅助脂质。在一些实施例中,所述一种或多种脂质包含(r)-n,n,n-三甲基-2,3-二油酰氧基-1-丙铵氯化物(dotma)和1,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺(dope)。在一些实施例中,在生理ph,脂质体的正电荷与负电荷的总电荷比为1.3:2(0.65)。

15、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。在一些实施例中,rna疫苗静脉内施用于个体。

16、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗以7天或1周的间隔施用于个体。在一些实施例中,rna疫苗以14天或2周的间隔施用于个体。在一些实施例中,rna疫苗施用于个体达12周或84天。

17、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗以四个21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第4周期的第1天施用于个体。

18、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体。在一些实施例中,本文提供的方法进一步包括在第13周期的第1天并且在之后每24周或168天施用rna疫苗。在一些实施例中,rna疫苗的施用持续直至个体发生疾病进展为止。

19、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体。在一些实施例中,本文提供的方法进一步包括在第13周期的第1天并且在之后每24周或168天施用rna疫苗。在一些实施例中,rna疫苗的施用持续直至个体发生疾病进展为止。

20、在一些实施例中,rna疫苗在诱导期和该诱导期之后的维持期施用于个体,其中rna疫苗在诱导期期间以1周或2周的间隔施用于个体,并且其中rna疫苗在维持期期间以24周的间隔施用于个体。在一些实施例中,rna疫苗在诱导期和该诱导期之后的维持期施用于个体,其中rna疫苗在诱导期期间以7天或14天的间隔施用于个体,并且其中rna疫苗在维持期期间以168天的间隔施用于个体。在一些实施例中,rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗在诱导期期间以四个21天周期施用于个体,其中在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第4周期的第1天施用于个体;并且其中在维持期期间,rna疫苗在第5周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。在一些实施例中,诱导期包括施用至多9次rna疫苗。

21、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。在一些实施例中,诱导期包括施用至多9次rna疫苗。在一些实施例中,维持期持续直至个体发生疾病进展为止。

22、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。在一些实施例中,诱导期包括6剂rna疫苗。在一些实施例中,维持期持续直至个体发生疾病进展为止。

23、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗包含rna分子,该rna分子在5'→3'方向上包含:(1)5'帽;(2)5'非翻译区(utr);(3)编码分泌性信号肽的多核苷酸序列;(4)编码由存在于肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位的多核苷酸序列;(5)编码主要组织相容性复合物(mhc)分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分的多核苷酸序列;(6)3'utr,其包含:(a)分裂的氨基末端增强子(aes)mrna的3′非翻译区或其片段;和(b)线粒体编码的12s rna的非编码rna或其片段;以及(7)poly(a)序列。在一些实施例中,rna分子进一步包含编码氨基酸接头的多核苷酸序列;其中编码氨基酸接头的多核苷酸序列与一个或多个新表位中的第一个形成第一接头-新表位模块;并且其中在5'→3'方向上,形成第一接头-新表位模块的多核苷酸序列在编码分泌性信号肽的多核苷酸序列与编码mhc分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分的多核苷酸序列之间。在一些实施例中,氨基酸接头包含序列ggsggggsgg(seq id no:39)。在一些实施例中,编码氨基酸接头的多核苷酸序列包含序列ggcggcucuggaggaggcggcuccggaggc(seq id no:37)。

24、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna分子在5'→3'方向上进一步包含:至少第二接头-表位模块,其中所述至少第二接头-表位模块包含编码氨基酸接头的多核苷酸序列和编码新表位的多核苷酸序列;其中在5'→3'方向上,形成第二接头-新表位模块的多核苷酸序列在编码第一接头-新表位模块的新表位的多核苷酸序列与编码mhc分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分的多核苷酸序列之间;并且其中第一接头-表位模块的新表位不同于第二接头-表位模块的新表位。在一些实施例中,rna分子包含5个接头-表位模块,并且其中5个接头-表位模块各自编码不同的新表位。在一些实施例中,rna分子包含10个接头-表位模块,并且其中10个接头-表位模块各自编码不同的新表位。在一些实施例中,rna分子包含20个接头-表位模块,并且其中20个接头-表位模块各自编码不同的新表位。

25、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna分子进一步包含编码氨基酸接头的第二多核苷酸序列,其中编码氨基酸接头的第二多核苷酸序列在编码3'方向上最远的新表位的多核苷酸序列与编码mhc分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分的多核苷酸序列之间。

26、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,5'帽包含以下结构的d1非对映异构体:

27、

28、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,5'utr包含序列uucuucugguccccacagacucagagagaacccgccacc(seq id no:23)。在一些实施例中,5′utr包含序列ggcgaacuaguauucuu cugguccccacagacucagagagaacccgccacc(seq id no:21)。

29、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,分泌性信号肽包含氨基酸序列mrvmaprtlilllsgalaltetwags(seq id no:27)。在一些实施例中,编码分泌性信号肽的多核苷酸序列包含序列augagagugauggcccccagaacccugauccugcugcugucuggcg cccuggcccugacagagacaugggccggaagc(seq id no:25)。

30、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,mhc分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分包含氨基酸序列ivgivaglavlavvvigav vatvmcrrkssggkggsysqaassdsaqgsdvslta(seq id no:30)。在一些实施例中,编码mhc分子的跨膜和胞质结构域的至少一部分的多核苷酸序列包含序列aucgugggaauuguggcaggacuggcagugcuggccgugguggugaucggagccgugguggcuaccgugaugugcagacggaaguccagcggaggcaagggcggcagcuacagccaggccgccagcucugauagcgcccagggcagcgacgugucacugacagcc(seq id no:28)。

31、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,aes mrna的3′非翻译区包含序列cugguacugcaugcacgcaaugcuagcugcccc uuucccguccuggguaccccgagucucccccgaccucgggucccagg uaugcucccaccuccaccugccccacucaccaccucugcuaguucca gacaccucc(seq idno:33)。在一些实施例中,线粒体编码的12s rna的非编码rna包含序列caagcacgcagcaaugcagcucaaaacgcuuagccuagccacacccccacgggaaacagcagugauuaaccuuuagcaauaaacgaaaguuuaacuaagcuauacuaaccccaggguuggucaauuucgugccagccacaccg(seq id no:35)。在一些实施例中,3′utr包含序列cucgagcugguacugcaugcacgcaaugcuagcugccccuuucccguccuggguaccccgagucucccccgaccucgggucccagguaugcucccaccuccaccugccccacucaccaccucugcuaguuccagacaccucccaagcacgcagcaaugcagcucaaaacgcuuagccuagccacacccccacgggaaacagcagugauuaaccuuuagcaauaaacgaaaguuuaacuaagcuauacuaaccccaggguuggucaauuucgugccagccacaccgagaccugguccagagucgcuagccgcgucgcu(seq id no:31)。在一些实施例中,poly(a)序列包含120个腺嘌呤核苷酸。

32、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,rna疫苗包含rna分子,该rna分子在5'→3'方向上包含:多核苷酸序列ggcgaa cuaguauucuucugguccccacagacucagagagaacccgccacca ugagagugauggcccccagaacccugauccugcugcugucuggcgcccuggcccugacagagacaugggccggaagc(seq id no:19);编码由存在于肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位的多核苷酸序列;以及多核苷酸序列aucgugggaauuguggcaggacu ggcagugcuggccgugguggugaucggagccgugguggcuaccgugaugugcagacggaaguccagcggaggcaagggcggcagcuacagccaggccgccagcucugauagcgcccagggcagcgacgugucacugacagccuaguaacucgagcugguacugcaugcacgcaaugcuagcugccccuuucccguccuggguaccccgagucucccccgaccucgggucccagguaugcucccaccuccaccugccccacucaccaccucugcuaguuccagacaccucccaagcacgcagcaaugcagcucaaaacgcuuagccuagccacacccccacgggaaacagcagugauuaaccuuuagcaauaaacgaaaguuuaacuaagcuauacuaaccccaggguuggucaauuucgugccagccacaccgagaccugguccagagucgcuagccgcgucgcu(seq id no:20)。

33、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,本文提供的方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

34、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,pd-1轴结合拮抗剂为pd-1结合拮抗剂。在一些实施例中,pd-1结合拮抗剂是抗pd-1抗体。在一些实施例中,抗pd-1抗体为纳武单抗或派姆单抗。

35、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,pd-1轴结合拮抗剂为pd-l1结合拮抗剂。在一些实施例中,pd-l1结合拮抗剂是抗pd-l1抗体。在一些实施例中,抗pd-l1抗体为阿维单抗或德瓦鲁单抗。在一些实施例中,抗pd-l1抗体包含:(a)重链可变区(vh),该重链可变区包含:hvr-h1,其包含gftfsdswih(seq id no:1)的氨基酸序列;hvr-2,其包含awispyggstyyadsvkg(seq id no:2)的氨基酸序列;和hvr-3,其包含氨基酸rhwpggfdy(seq id no:3);以及(b)轻链可变区(vl),该轻链可变区包含:hvr-l1,其包含rasqdvstava(seq id no:4)的氨基酸序列;hvr-l2,其包含sasflys(seq id no:5)的氨基酸序列;和hvr-l3,其包含qqylyhpat(seq id no:6)的氨基酸序列。在一些实施例中,抗pd-l1抗体包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),该重链可变区包含seq id no:7的氨基酸序列,该轻链可变区包含seq id no:8的氨基酸序列。在一些实施例中,抗pd-l1抗体为阿特珠单抗。

36、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,pd-1轴结合拮抗剂静脉内施用于个体。在一些实施例中,抗pd-l1抗体以约1200mg的剂量施用于个体。在一些实施例中,pd-1轴结合拮抗剂以21天或3周的间隔施用于个体。

37、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,并且其中阿特珠单抗以21天周期施用于个体,其中阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用。在一些实施例中,本文提供的方法进一步包括在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用阿特珠单抗。在一些实施例中,阿特珠单抗的施用持续直至个体发生疾病进展为止。

38、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,并且阿特珠单抗在诱导期期间和该诱导期后的维持期期间以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用;并且其中,在诱导期后的维持期期间,阿特珠单抗在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用。在一些实施例中,维持期持续直至个体发生疾病进展为止。

39、在一些实施例中,其可与前述实施例中的任一者组合,个体为人。

40、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。在一些实施例中,该方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

41、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。在一些实施例中,该方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

42、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。在一些实施例中,该方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

43、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。

44、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞。

45、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,并且其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

46、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来检测外周血样品中的新表位特异性cd8+t细胞。

47、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中外周血样品包含约5%或约6%的对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的cd8+t细胞。

48、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向个体施用rna疫苗导致在该个体中的外周血中诱导新表位特异性cd4+细胞,其中新表位特异性cd4+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

49、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中向多个个体施用rna疫苗导致在所述多个个体中的至少约70%的个体的外周血中诱导新表位特异性cd4+或cd8+t细胞,其中新表位特异性cd4+或cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来评定对新表位特异性cd4+或cd8+t细胞的诱导。

50、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前的一种或多种炎症性细胞因子的水平相比,向个体施用rna疫苗导致该个体的外周血中的所述一种或多种炎症性细胞因子的水平升高。在一些实施例中,所述一种或多种炎症性细胞因子选自ifnγ、ifnα、il-12或il-6。

51、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

52、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

53、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

54、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

55、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天以及之后每24周或168天施用于个体。

56、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

57、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

58、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

59、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

60、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

61、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天以及之后每24周或168天施用于个体。

62、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

63、在前述方面中的任一者的一些实施例中,该方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

64、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来检测外周血样品中的新表位特异性cd8+t细胞。

65、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中外周血样品包含约5%或约6%的对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的cd8+t细胞。

66、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致在该个体中的外周血中诱导新表位特异性cd4+细胞,其中新表位特异性cd4+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

67、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向多个个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致在所述多个个体中的至少约70%的个体的外周血中诱导新表位特异性cd4+或cd8+t细胞,其中新表位特异性cd4+或cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来评定对新表位特异性cd4+或cd8+t细胞的诱导。

68、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前的一种或多种炎症性细胞因子的水平相比,向个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致该个体的外周血中的所述一种或多种炎症性细胞因子的水平升高。在一些实施例中,所述一种或多种炎症性细胞因子选自ifnγ、ifnα、il-12或il-6。

69、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

70、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

71、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

72、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天或3周的间隔以约1200mg的剂量施用于个体,并且其中rna疫苗以21天周期以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

73、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每24周或168天施用于个体。

74、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中约1%至约6%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗在诱导期期间和该诱导期后的维持期期间以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中,在诱导期期间,阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且其中,在诱导期后的维持期期间,阿特珠单抗在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

75、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

76、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

77、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

78、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天或3周的间隔以约1200mg的剂量施用于个体,并且其中rna疫苗以21天周期以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

79、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每24周或168天施用于个体。

80、在另一方面,本文提供了一种用于在个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞向肿瘤的运输的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后运输至肿瘤的新表位特异性cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗在诱导期期间和该诱导期后的维持期期间以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中,在诱导期期间,阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且其中,在诱导期后的维持期期间,阿特珠单抗在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

81、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来检测外周血样品中的新表位特异性cd8+t细胞。

82、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向个体施用rna疫苗导致在该个体中的外周血中诱导新表位特异性cd4+细胞,其中新表位特异性cd4+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

83、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中向多个个体施用rna疫苗导致在所述多个个体中的至少约70%的个体的外周血中诱导新表位特异性cd4+或cd8+t细胞,其中新表位特异性cd4+或cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来评定对新表位特异性cd4+或cd8+t细胞的诱导。

84、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前的一种或多种炎症性细胞因子的水平相比,向个体施用rna疫苗导致该个体的外周血中的所述一种或多种炎症性细胞因子的水平升高。在一些实施例中,所述一种或多种炎症性细胞因子选自ifnγ、ifnα、il-12或il-6。

85、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

86、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

87、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

88、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

89、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体,其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天以及之后每24周或168天施用于个体。

90、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的rna疫苗,所述方法包括向个体施用有效量的rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

91、在前述方面中的任一者的一些实施例中,该方法进一步包括向个体施用pd-1轴结合拮抗剂。

92、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来检测外周血样品中的新表位特异性cd8+t细胞。

93、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致在该个体中的外周血中诱导新表位特异性cd4+细胞,其中新表位特异性cd4+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性。

94、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前相比,向多个个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致在所述多个个体中的至少约70%的个体的外周血中诱导新表位特异性cd4+或cd8+t细胞,其中新表位特异性cd4+或cd8+t细胞对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性,并且其中利用离体elispot或mhc多聚体分析来评定对新表位特异性cd4+或cd8+t细胞的诱导。

95、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中与施用rna疫苗之前的一种或多种炎症性细胞因子的水平相比,向个体施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗导致该个体的外周血中的所述一种或多种炎症性细胞因子的水平升高。在一些实施例中,所述一种或多种炎症性细胞因子选自ifnγ、ifnα、il-12或il-6。

96、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为效应记忆t细胞(tem)。

97、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中新表位特异性cd8+t细胞为pd-1+。

98、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,并且其中pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗的施用导致个体中的完全缓解(cr)或部分缓解(pr)。

99、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天或3周的间隔以约1200mg的剂量施用于个体,并且其中rna疫苗以21天周期以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体。

100、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且任选地在第13周期的第1天并且在之后每24周或168天施用于个体。

101、在另一方面,本文提供了一种用于在患有肿瘤的个体中诱导新表位特异性cd8+t细胞的方法中使用的pd-1轴结合拮抗剂,所述方法包括向个体施用有效量的pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗,其中rna疫苗包含一种或多种多核苷酸,所述一种或多种多核苷酸编码由存在于获得自个体的肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变产生的一个或多个新表位,其中在施用pd-1轴结合拮抗剂和rna疫苗后获得自个体的外周血样品中至少约1%的cd8+t细胞为对由rna疫苗的一种或多种多核苷酸编码的新表位中的至少一者具有特异性的新表位特异性cd8+t细胞,其中pd-1轴结合拮抗剂为阿特珠单抗,其中阿特珠单抗在诱导期期间和该诱导期后的维持期期间以21天周期以约1200mg的剂量施用于个体,其中,在诱导期期间,阿特珠单抗在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11和12周期中的每个周期的第1天施用,并且其中,在诱导期后的维持期期间,阿特珠单抗在第13周期的第1天并且在之后每3周或21天施用;并且其中rna疫苗以约15μg、约25μg、约38μg、约50μg、约75μg或约100μg的剂量施用于个体,其中rna疫苗在诱导期和该诱导期后的维持期施用于个体,其中rna疫苗以21天周期施用于个体;其中,在诱导期期间,rna疫苗在第1周期的第1天、第8天和第15天;第2周期的第1天、第8天和第15天;第3周期的第1天和第15天;以及第7周期的第1天施用于个体;并且其中,在维持期期间,rna疫苗在第13周期的第1天施用于个体并且在之后每24周或168天施用一次。

102、应了解,本文所描述的各种实施例的一种、一些或所有特性可组合形成本发明的其它实施例。本发明的这些和其它方面对于本领域技术人员将变得显而易见。通过下面的详细描述进一步描述本发明的这些和其它实施例。

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