一种基于动物模型三黄鸡选育系统及方法与流程

文档序号:35705369发布日期:2023-10-12 05:54阅读:50来源:国知局
一种基于动物模型三黄鸡选育系统及方法与流程

本发明涉及三黄鸡选育,具体涉及一种基于动物模型三黄鸡选育系统及方法。


背景技术:

1、三黄鸡选育系统通过基于遗传学理论和实践,利用动物模型来改良三黄鸡的遗传背景。系统可以通过选择具有优良基因组组合的个体作为育种对象,逐步提高三黄鸡种群的性状表现。这包括改善生长速度、肉质品质、产蛋性能等特征,以满足市场需求。三黄鸡选育系统建立了基于动物模型的数学模型,可以通过分析收集到的数据,预测不同基因型和环境条件下三黄鸡的性状表现。这使得育种工作者可以在育种过程中更准确地预测和评估不同个体的遗传潜力,指导选育策略的制定。

2、在三黄鸡选育系统中,pcr仪器起着关键的作用,pcr(聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,用于扩增目标dna序列,从而进行基因分析、遗传标记检测和基因型鉴定等。

3、pcr仪器通过控制温度的变化,使dna序列在反应体系中进行反复的变性、退火和延伸过程。这样,可以扩增目标dna序列至数以亿计的拷贝数量,从而获得足够的dna量进行后续的分析。pcr可以与特定的引物配对,从而在目标dna上产生特定的扩增产物。这些扩增产物可以作为遗传标记,用于检测目标基因的存在与否,以及其在种群中的频率分布。pcr可以用于检测和区分不同基因型的个体。通过设计特异性的引物,可以扩增出与不同基因型相关的dna片段,从而确定个体的基因型。pcr也可以用于检测和鉴定基因序列中的突变。通过比较目标基因序列与参考序列之间的差异,可以发现单核苷酸多态性(snp)或其他类型的突变。pcr常用于在进行dna测序之前,扩增和纯化需要测序的dna片段。通过pcr扩增,可以从复杂的dna样本中选择性地扩增目标片段,提高测序的特异性和灵敏度。

4、现有技术存在以下不足:然而,当pcr仪器的运行出现异常隐患时,选育的工作人员无法及时知晓,异常运行的pcr仪器可能导致扩增产物的质量下降,这将对基因分析的准确性和可靠性造成影响,可能导致结果的失真和误判,从而不利于对pcr仪器的高效使用。

5、在所述背景技术部分公开的上述信息仅用于加强对本公开的背景的理解,因此它可以包括不构成对本领域普通技术人员已知的现有技术的信息。


技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种基于动物模型三黄鸡选育系统及方法,本发明通过对pcr仪器的运行状态进行监测,及时提示选育人员发现pcr仪器可能存在的异常隐患问题,有效地防止pcr仪器运行异常导致扩增产物的质量下降,从而有效地防止对基因分析的准确性和可靠性造成影响导致结果的失真和误判,便于对pcr仪器的高效使用,以解决上述背景技术中的问题。

2、为了实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种基于动物模型三黄鸡选育系统,包括数据采集模块、隐患评估模块、隐患综合分析模块、比对模块以及预警模块;

3、数据采集模块,采集pcr仪器运行时的扩增产物信息和反应温度信息,采集后,将pcr仪器运行时的扩增产物信息和反应温度信息进行处理后传递至隐患评估模块;

4、隐患评估模块,将处理后的扩增产物信息和反应温度信息建立数据分析模型,生成隐患评估系数,并将隐患评估系数传递至隐患综合分析模块;

5、隐患综合分析模块,将pcr仪器运行时生成的若干个隐患评估系数建立分析集合,将分析集合内的隐患评估系数与预先设定的隐患评估系数参考阈值进行综合分析,生成预警指数,并将预警指数传递至比对模块;

6、比对模块,将分析集合内生成的预警指数与预先设定的预警指数参考阈值进行比对分析,生成隐患风险信号,并将隐患风险信号传递至预警模块,通过预警模块发出或者不发出预警提示。

7、优选的,扩增产物信息包括扩增产物异常隐匿指数,采集后,数据采集模块将扩增产物异常隐匿指数标定为ββyn,反应温度信息包括变性温度异常浮动指数,采集后,数据采集模块将变性温度异常浮动指数标定为γγwd。

8、优选的,扩增产物异常隐匿指数获取的逻辑如下:

9、a1、获取pcr仪器在t时间内不同批次的pcr反应扩增产物数量,并将pcr反应扩增产物数量标定为slx,x表示pcr仪器在t时间内不同批次的pcr反应扩增产物数量的编号,x=1、2、3、4、……、m,m为正整数;

10、a2、计算pcr仪器在t时间内不同批次的pcr反应扩增产物数量的标准差,并将pcr反应扩增产物数量标准差标定为q,则:

11、,

12、其中,为pcr仪器在t时间内不同批次的pcr反应扩增产物数量的平均值,获取的计算公式为:

13、a3、通过pcr仪器在t时间内不同批次的pcr反应扩增产物数量标准差计算扩增产物异常隐匿指数,计算的表达式为:

14、优选的,变性温度异常浮动指数获取的逻辑如下:

15、b1、获取pcr仪器在pcr变性阶段的最佳温度范围,并将最佳温度范围标定为

16、b2、获取pcr仪器在t时间内不同时刻的pcr变性阶段实际温度,并将pcr变性阶段实际温度标定为y表示pcr仪器在t时间内不同时刻的pcr变性阶段实际温度的编号,y=1、2、3、4、……、n,n为正整数;

17、b3、将不处于pcr变性阶段最佳温度范围之间的pcr变性阶段实际温度重新标定为h表示不处于最佳温度范围之间的pcr变性阶段实际温度的编号,h=1、2、3、4、……、n,n为正整数;

18、b4、通过获取的pcr变性阶段实际温度以及计算变性温度异常浮动指数,计算的表达式为:

19、优选的,隐患评估模块获取到扩增产物异常隐匿指数ββyn和变性温度异常浮动指数γγwd后,建立数据分析模型,生成隐患评估系数rj,依据的公式为:

20、,

21、式中,f1、f2分别为扩增产物异常隐匿指数ββyn、变性温度异常浮动指数γγwd的预设比例系数,且f1、f2均大于0。

22、优选的,隐患综合分析模块将pcr仪器运行时生成的若干个隐患评估系数建立分析集合,并将分析集合标定为k,则k={rj}={r1、r2、r3、…、ru},j表示分析集合内的隐患评估系数的编号,j=1、2、3、4、……、u,u为正整数。

23、优选的,将分析集合内大于隐患评估系数参考阈值的隐患评估系数筛出,并将筛出的隐患评估系数标定为rv,v表示分析集合内大于隐患评估系数参考阈值的隐患评估系数的编号,v=1、2、3、4、……、p,p为正整数;

24、计算预警指数xi,式中,r参考为隐患评估系数参考阈值。

25、优选的,比对模块将分析集合内生成的预警指数与预先设定的预警指数参考阈值进行比对分析,若预警指数大于等于预警指数参考阈值,则生成高隐患风险信号,并将信号传递至预警模块,通过预警模块发出预警提示,若预警指数小于预警指数参考阈值,则生成低隐患风险信号,并将信号传递至预警模块,不通过预警模块发出预警提示。

26、一种基于动物模型三黄鸡选育方法,包括以下步骤:

27、采集pcr仪器运行时的扩增产物信息和反应温度信息,采集后,将pcr仪器运行时的扩增产物信息和反应温度信息进行处理;

28、将处理后的扩增产物信息和反应温度信息建立数据分析模型,生成隐患评估系数;

29、将pcr仪器运行时生成的若干个隐患评估系数建立分析集合,将分析集合内的隐患评估系数与预先设定的隐患评估系数参考阈值进行综合分析,生成预警指数;

30、将分析集合内生成的预警指数与预先设定的预警指数参考阈值进行比对分析,生成隐患风险信号,对隐患风险信号发出或者不发出预警提示。

31、在上述技术方案中,本发明提供的技术效果和优点:

32、本发明通过对pcr仪器的运行状态进行监测,及时提示选育人员发现pcr仪器可能存在的异常隐患问题,有效地防止pcr仪器运行异常导致扩增产物的质量下降,从而有效地防止对基因分析的准确性和可靠性造成影响导致结果的失真和误判,便于对pcr仪器的高效使用;

33、本发明对pcr仪器运行状态监测生成的结果建立分析集合进行综合分析,而不是进行简单的单一分析,可提高数据分析的准确性,进而提高对pcr仪器运行状态监测的准确性,保障pcr仪器保持稳定高效的运行状态运行。

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