基于高阶拓扑特征SM-miRNA关联预测方法及系统

文档序号:37278852发布日期:2024-03-12 21:15阅读:来源:国知局

技术特征:

1.基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,将观察图利用k-hop算法得到若干个k跳子图包括:

3.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,步骤二s包括:

4.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,步骤三具体包括:

5.根据权利要求4所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,节点级别、链接级别、图级别的特征公式为:

6.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,构建图为g(v,e,x),v和e分别是图g中节点和边的集合,x为节点特征,x的公式为:

7.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,图级别的特征是将g+和g-图级别返回概率之间的差异作为最终的图级别特征graphτ。

8.根据权利要求1所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法,其特征在于,最终特征列表通过交叉熵损失函数得到得分矩阵,利用得分矩阵得到预测分数。

9.基于高阶拓扑特征的小分子药物-mirna关联预测系统,其特征在于,包括:存储器,用于存储可由处理器执行的指令;处理器,用于执行指令以实现如权利要求1-8任一项所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法。

10.存储有计算机程序代码的计算机可读介质,其特征在于,计算机程序代码在由处理器执行时实现如权利要求1-8任一项所述的基于高阶拓扑特征sm-mirna关联预测方法。


技术总结
本发明涉及SM‑miRNA技术领域,尤其涉及基于高阶拓扑特征SM‑miRNA关联预测方法及系统,包括整合构建图;利用遮盖部分边得到观察图,利用K‑hop算法得到若干个K跳子图;使用图卷积提取目标链接节点的局部拓扑特征;利用图注意力机制将聚合节点特征刻画目标链接节点随机游走的轮廓,利用学习到的注意力系数构建转移矩阵;对每个K跳子图都作出链接存在与否的假设,构建转移矩阵;将若干批次子图的节点、链接、图级别的特征进行拼接,将聚合后的特征列表输入多层感知机中得到最终特征列表。本发明解决复杂网络方法无法对新的SM和miRNA进行预测以及神经网络没有充分考虑到网络拓扑对于生物分子关联的影响的问题。

技术研发人员:侯振杰,孙晓燕,陈严,姚海滨
受保护的技术使用者:常州大学
技术研发日:
技术公布日:2024/3/11
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