本发明属于医疗保健信息学领域,筛查急性高原病易感人群的计算机装置和计算机可读存储介质。
背景技术:
1、急性高原病(acute mountain sickness,ams)是指平原人群从平原急进高原时(一般海拔>3000m),或从高原急进海拔更高地区时出现的一系列非特异性临床表现,包括头痛、头晕、心悸、呕吐、腹泻、食欲缺乏、失眠等。ams通常在到达目的地4-12h后发生,可持续一周左右,损害人体健康,严重影响紧急工作开展。ams进一步恶化可发展为高原脑水肿,增加死亡风险。
2、ams病理过程复杂,发病机制尚不明确,危险因素包括血压、肺功能、血管内皮功能、心理应激因素等。近年来,越来越多的研究结果显示,ams存在个体遗传易感倾向。基因组研究已经发现多个单核苷酸多态性位点与ams发病风险相关,提示易感基因多态性位点可作为ams的一类重要分子标志物,从而为疾病的预防、诊断、病情严重程度评估及治疗策略提供更多的医学检测依据。
技术实现思路
1、本发明所要解决的技术问题是如何筛查急性高原病易感个体或如何预测受试者对急性高原病的易感性。
2、本发明的目的是提供筛查急性高原病易感人群的计算机装置和计算机可读存储介质。
3、本发明提供了一种计算机装置,其包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,其特征在于:所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤:
4、s1、数据接收:接收受试者snp rs10801528位点是否携带等位基因g的信息,得到样本数据;
5、s2、结果输出:基于所述样本数据从计算机输出结果信息,所述结果信息为受试者是否为急性高原病易感个体。
6、基于所述样本数据从计算机输出结果信息的逻辑判断规则为:如果受试者snprs10801528位点携带等位基因g,受试者为急性高原病易感个体;如果受试者snprs10801528位点不携带等位基因g,受试者为非急性高原病易感个体。
7、本发明还提供了一种计算机程序产品,包括计算机程序,其特征在于:该计算机程序被处理器执行时实现以上所述的步骤s1和步骤s2。
8、本发明还提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于:该计算机程序被处理器执行时实现以上所述的步骤s1和步骤s2。
9、本发明还提供了一种装置,所述装置为用于筛查急性高原病易感个体的装置,其特征在于:所述装置包括如下模块:
10、m1、数据接收模块:用于接收受试者snp rs10801528位点是否携带等位基因g的信息,得到样本数据;
11、m2、结果输出模块:用于基于所述样本数据从计算机输出结果信息,所述结果信息为受试者是否为急性高原病易感个体。
12、基于所述样本数据从计算机输出结果信息的逻辑判断规则为:如果受试者snprs10801528位点携带等位基因g,受试者为急性高原病易感个体;如果受试者snprs10801528位点不携带等位基因g,受试者为非急性高原病易感个体。
13、本发明还提供了用于筛查急性高原病易感个体的方法,其特征在于:
14、所述方法包括如下步骤:
15、接收受试者snp rs10801528位点是否携带等位基因g的信息,得到样本数据;
16、基于所述样本数据从计算机输出结果信息,所述结果信息为受试者是否为急性高原病易感个体。
17、基于所述样本数据从计算机输出结果信息的逻辑判断规则为:如果受试者snprs10801528位点携带等位基因g,受试者为急性高原病易感个体;如果受试者snprs10801528位点不携带等位基因g,受试者为非急性高原病易感个体。
18、本发明还提供了一种装置,所述装置为用于比较受试者急性高原病易感性的装置,其特征在于:所述装置包括如下模块:
19、m3、数据接收模块:用于接收受试者snp rs10801528位点是否携带等位基因g的信息,得到样本数据;
20、m4、结果输出模块:用于基于所述样本数据从计算机输出结果信息,所述结果信息为snp rs10801528位点携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性高于所述结果信息为snp rs10801528位点不携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性。
21、本发明还提供了用于比较受试者急性高原病易感性的方法,其特征在于:
22、所述方法包括如下步骤:
23、接收受试者snp rs10801528位点是否携带等位基因g的信息,得到样本数据;
24、基于所述样本数据从计算机输出结果信息,所述结果信息为snp rs10801528位点携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性高于所述结果信息为snp rs10801528位点不携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性。
25、具体的,所述受试者为两个以上的人。
26、本发明还提供了引物组或引物对在制备产品中的应用。本发明还提供了产品,其包括引物组或引物对。所述产品的功能为用于筛查急性高原病易感个体或用于比较受试者急性高原病易感性。所述引物组由三条引物组成,分别为seq id no:1所示的单链dna分子、seq id no:2所示的单链dna分子、seq id no:3所示的单链dna分子。所述引物对由两条引物组成,分别为seq id no:4所示的单链dna分子、seq id no:5所示的单链dna分子。如果受试者snp rs10801528位点携带等位基因g,受试者为急性高原病易感个体;如果受试者snprs10801528位点不携带等位基因g,受试者为非急性高原病易感个体。snp rs10801528位点携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性高于所述结果信息为snp rs10801528位点不携带等位基因g的受试者的急性高原病易感性。
27、具体的,基于snp rs10801528,所述受试者的基因型为gg或者ga或者aa。
28、snp rs10801528位于人基因组dna中,位置对应于seq id no:6中第301位核苷酸,用r表示。r表示g或a。
29、以上任一所述受试者可为中国人。
30、以上任一所述受试者可为中国汉族人。
31、以上任一所述受试者可为中国汉族男性。
32、以上任一所述受试者可为平原地区的中国人。
33、以上任一所述受试者可为平原地区的中国汉族人。
34、以上任一所述受试者可为平原地区的中国汉族男性。
35、以上任一所述受试者可为由平原地区到达高原地区的中国人。
36、以上任一所述受试者可为由平原地区到达高原地区的中国汉族人。
37、以上任一所述受试者可为由平原地区到达高原地区的中国汉族男性。
38、以上任一所述受试者可为由平原地区预计去高原地区的中国人。
39、以上任一所述受试者可为由平原地区预计去高原地区的中国汉族人。
40、以上任一所述受试者可为由平原地区预计去高原地区的中国汉族男性。
41、以上任一所述高原地区可为青藏高原地区。
42、以上任一所述高原地区可为青藏高原的拉萨地区。
43、以上任一所述高原地区可为青藏高原的阿里地区、炉霍地区、甘孜地区、康定地区或新都桥地区。
44、本发明的发明人发现,基于snp rs10801528,携带等位基因g的受试者为急性高原病易感个体,携带等位基因g的受试者发生ams的风险高于不携带等位基因g的受试者。在实施例3和实施例4中,本发明分别以不同人群样本为例,示例性的展示了急性高原病患者群体以及正常人群体中的基因型分布频率数据。在上述发现的基础上,本发明的发明人开发了上述计算机装置和计算机可读存储介质。
45、本发明提供的计算机装置和计算机可读存储介质可用于避免或减少急性高原病的发生。