金属β‑内酰胺酶的抑制肽及其应用的制作方法

文档序号:12103990阅读:316来源:国知局

本发明涉及一种金属β-内酰胺酶的三肽抑制剂,尤其涉及该肽在制备抗菌药物及预防、治疗耐药菌感染中的用途。



背景技术:

产生β-内酰胺酶是导致细菌尤其是革兰氏阴性菌耐药的重要机制之一,它们能水解β-内酰胺类抗生素的β-内酰胺环,导致抗生素失活。β-内酰胺酶可以分为丝氨酸β-内酰胺酶和金属β-内酰胺酶(MBLs)。根据氨基酸序列的同源性以及对金属Zn离子的依赖性,MBLs又进一步分为B1,B2和B3亚类。目前发现B1类有18个同源家族,B2类有3个同源家族,B3类有9个同源家族。由于金属β-内酰胺酶能够水解包括碳青霉稀类抗生素在内的几乎所有β-内酰胺类抗生素,而且目前没有有效的抑制剂上市,因此MBLs是目前临床上抗感染治疗的重大挑战,受到了广泛关注。

B1类MBLs中的IMP、VIM以及近几年流行的NDM型金属β-内酰胺酶临床检出率最高。2010年8月《柳叶刀-传染病》杂志上报道了在印度、巴基斯坦和英国共分离得到180株含有blaNDM-1质粒基因的细菌,实验发现,它们除了替加环素和多黏菌素以外,对其他所有抗生素都具有高度耐药性。不断进化的突变株使得临床治疗更加艰难,因此开发广谱MBLs抑制剂成为医学领域的一大挑战。



技术实现要素:

本发明以多药耐药细菌所产生的金属β-内酰胺酶为靶标,并针对该类酶催化水解抗生素的活性中心设计合成了一个三肽,本发明的三肽可联合抗生素治疗多药耐药细菌感染。

本发明的金属β-内酰胺酶三肽抑制剂为广谱金属β-内酰胺酶抑制肽,其特征在于长度为3个氨基酸,拓扑结构为线性,化学结构式为:

本发明所涉及的金属β-内酰胺酶三肽抑制剂用固相合成法制备,方法简单,技术成熟,产物质量容易控制,能满足大规模工业化生产的需要。

药效学试验证明本发明的三肽对典型的金属β-内酰胺酶,如NDM-1、IMP-1和VIM-2等,具有明显的抑制作用。

药效学试验证明本发明的三肽与β-内酰胺类抗生素具有良好的协同作用,能明显抑制耐药菌生产并且大幅度降低β-内酰胺类抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。所述的β-内酰胺类抗生素优选头孢呋辛钠。

本发明的三肽也可以和药学上可接受的盐结合,同样具有其药效。这些盐包括(但不局限于)与碱金属或碱土金属(如钠、钾、钙或镁)形成的盐。其他盐包括与如下无机酸形成的盐:如盐酸、硫酸、硝酸、磷酸,以及与有机酸形成的盐,而有机酸则指乙酸、草酸、丁二酸、酒石酸、甲磺酸和马来酸。药学上可接受的盐优选钠盐。

本发明公开了一种抗菌药物组合物,其中含有该三肽或其药学上可接受的盐及药学上可接受的载体。

上述药物组合物可以制成注射剂、片剂、注射用无菌粉末、粉剂、颗粒剂、胶囊剂、口服液、膏剂、霜剂等多种剂型。上述各种剂型均可以根据药学领域的常规方法制备。可以通过注射、口服、滴鼻、滴眼、物理或化学介导的方法导入肌肉、内皮、皮下、静脉、粘膜组织,或是被其他物质混合或包裹后导入肌体。

一般地,本发明的三肽使用剂量在0.001~10克/天,也可以根据疾病的情况偏离这个剂量范围。

下面是本发明的三肽的部分药效学试验及结果:

一、三肽对NDM-1型金属β-内酰胺酶抑制活性(IC50)的测定:

以头孢呋辛钠为报告底物,在274nm波长下测定NDM-1型金属β-内酰胺酶水解底物后吸光度的变化。测定缓冲液为50mM HEPES,250mM NaCl,2μM ZnCl2,pH=7.25,温度30℃。

(1)首先将金属β-内酰胺酶(终浓度10μM)于缓冲液中孵育5min,使得Zn2+充分占据活性中心;

(2)加入10μL不同浓度的三肽抑制剂,30℃孵育5min,使抑制剂与酶充分结合;

(3)将体系转入石英比色皿中,加入8μL头孢呋辛钠(终浓度160μM)的同时立即测定体系吸光度的变化,记录数据。

由于底物头孢呋辛钠被酶水解后其吸光度下降,因而通过测定吸光度的变化可以表征底物的水解程度。计算不同浓度的三肽抑制剂对NDM-1水解底物的抑制率,以三肽抑制剂的浓度对抑制率拟合曲线,计算得到本发明的三肽分子对NDM-1型金属酶的IC50值为86.46μM,表明其对NDM-1型金属酶有较好的抑制作用。

二、三肽抑制剂对IMP-1型金属β-内酰胺酶抑制活性(IC50)的测定:

以头孢呋辛钠为报告底物,在274nm波长下测定IMP-1型金属β-内酰胺酶水解底物后吸光度的变化。测定缓冲液为50mM HEPES,250mM NaCl,2μM ZnCl2,pH=7.25,温度30℃。具体操作步骤同实施例1。计算不同浓度的三肽抑制剂对IMP-1水解底物的抑制率,以三肽抑制剂的浓度对抑制率拟合曲线,计算得到三肽分子对IMP-1型金属酶的IC50值49.6μM,说明此三肽分子对IMP-1型金属酶有较好的抑制作用。

三、三肽分子与β-内酰胺类抗生素协同抗NDM-1型工程菌活性的测定:

为了能够安全进行协同抗菌实验,使用相对安全的基因工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1菌株作为耐药菌株,将E.coli BL21(DE3)/pET28a菌株作为阴性对照。采用二倍稀释法测定最小抑菌浓度(Minimum Inhibitory Concentration,MIC),通过MIC值的变化反映抑制肽与抗生素的协同抗菌作用。

具体方法如下:

将超低温冰箱中保存的工程菌菌株E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1以及对照菌株E.coli BL21(DE3)/pET28a分别接种于灭菌的Luria-Bertani(LB)固体培养基中,于37℃恒温培养箱中倒置培养12小时。用接种环挑取单菌落分别转接到灭菌的液体LB培养基中,于37℃,200rpm条件下震荡培养至对数生长期。用紫外分光光度计测定600nm波长处菌液的吸光度值(OD600),根据1OD=1×109CFU/mL的换算关系,分别将表达金属β-内酰胺酶的工程菌菌株以及对照菌株稀释至终浓度1×106CFU/mL。

对照组(1):E.coli BL21(DE3)/pET28a菌。在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的终浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液,混合均匀。

对照组(2):表达金属β-内酰胺酶的工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1。在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的终浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液,混合均匀。

对照组(3):表达金属β-内酰胺酶的工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1。在无菌96孔板中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为200μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组均使用能表达金属β-内酰胺酶的工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1。

实验组(1):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为200μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组(2):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为100μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组(3):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为50μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组(4):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为25μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组(5):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为12.5μM的三肽抑制剂,混合均匀。

实验组(6):在无菌96孔板中加入依次倍比稀释的浓度为512~2μg/mL的抗生素头孢呋辛钠,然后向各孔中加入终浓度1×106CFU/mL的菌液和终浓度为6.25μM的三肽抑制剂,混合均匀。

以上各组于37℃缓慢震荡培养16小时,测定波长为600nm处的吸光度值。检测不到细菌生长的孔中头孢呋辛钠的终浓度为最小抑菌浓度(MIC),三肽分子Phe-Cys-Pro对含有NDM-1的耐药菌株联合抑菌效果如表1所示。

表1三肽Phe-Cys-Pro与头孢呋辛钠协同抗NDM-1工程菌的测定结果

a-:三肽Phe-Cys-Pro本身无抗菌活性。

由表1结果可知,对照组(1)中头孢呋辛钠对敏感菌株E.coli BL21(DE3)具有良好的抑制作用(MIC<2μg/mL);对照组(2)为耐药菌株E.coli BL21(DE3)/pET28a-NDM-1,头孢呋辛钠几乎不能抑制该菌株的生长(MIC=256μg/mL),同时也证明了该菌株为耐药菌;对照组(3)中含有终浓度为200μM的Phe-Cys-Pro而不含抗生素,培养16小时后菌液十分浑浊,证明该三肽抑制剂本身无抗菌作用。

从实验组(1)~(6)的MIC可以看出,当Phe-Cys-Pro与抗生素头孢呋辛钠联合使用时,通过协同作用能明显提高头孢呋辛钠的抗菌活性,当三肽抑制剂浓度为200μM时,头孢呋辛钠的抗菌活性(MIC值)提高了16倍(256/16);当三肽抑制剂浓度为25μM时,头孢呋辛钠的抗菌活性(MIC值)提高了2倍(256/128)。

具体实施方式

实施例1

Phe-Cys-Pro的制备

1.称取2.0g MBHA(4-甲苯氢胺)树脂于洁净干燥的反应管中,加入适量DMF(二甲基甲酰胺),活化30min左右,然后称取Fmoc(芴甲氧羰酰基)保护的Phe 1mmol,DMAP(4二甲氨基吡啶)150mg,加98%的DIC(N,N’-二异丙基碳二亚胺)1ml到反应管中,DMF做溶剂反应3h。反应完毕用DMF洗4~6次,加入适量吡啶和乙酸酐,体积比为1∶1,反应30min。反应完毕用DMF洗4~6次。然后用20%的哌啶溶液脱掉氨基酸的Fmoc,脱两次共15min,10min+5min。再用DMF洗4次,甲醇洗2次,取出少量树脂用茚三酮检测试剂检测,检测为蓝色,即可进行下一步反应。

2.称取Fmoc保护的Cys 3mmol,HBTU(苯并三氮唑N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸酯)3mmol于反应管中,加入DIEA(N,N-二异丙基乙胺)0.5mL,反应40min,用DMF洗4~6次,取少量树脂用茚三酮检测试剂检测,显无色,然后加入20%的哌啶溶液脱Fmoc,10min+5min,然后用DMF洗4次,甲醇洗两次,取出少量树脂用茚三酮检测试剂检测,检测为蓝色,即可进行下一步反应。

3.称取Fmoc保护的C端氨基酸Pro 3mmol,HBTU 3mmol于反应管中,加入DIEA 0.5mL,反应40min,用DMF洗4~6次,取少量树脂用茚三酮检测试剂检测,显无色,然后加入20%的哌啶溶液脱Fmoc,10min+5min,然后用DMF洗4次,甲醇洗两次,取出少量树脂用茚三酮检测试剂检测,检测为蓝色。

4.最后用三氟乙酸切割液切割2h,反应液抽滤,得多肽的三氟乙酸溶液,用乙醚沉淀,离心,然后再用乙醚洗3~5次,得白色固体,经C18反相制备柱脱盐,冻干,取少量进行MS分析。HPLC测定三肽的纯度为95.56%,MS鉴定其分子量为365.10,与理论分子量365.45基本一致。

实施例2

含Phe-Cys-Pro抑制肽的抗菌药物组合物的制备(胶囊)

按照100个胶囊的用量,称取以上各辅料分别研细过筛后混合均匀,然后用等量递加法加入头孢呋辛钠和Phe-Cys-Pro,充分研磨,使其分散均匀,再过80目筛,然后灌制成胶囊。

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