本专利申请要求于2015年12月11日提交的美国专利申请号62/266,080的优先权利益，所述美国专利申请的内容在此以引用的方式全文并入用于本文的全部目的。
背景技术：
核酸扩增技术用于扩增核酸或核酸的特定区域。扩增过程能够获取极少量的核酸样品，并且生成特定序列、其一部分或片段的拷贝。核酸扩增反应可用作临床实验室环境中的诊断工具。
技术实现要素：
本公开内容尤其提供了可用于核酸扩增的系统。本公开内容还提供了使用这种扩增系统的方法。
本公开内容的实施可用于广泛范围的应用，包括但不限于：克隆、疾病检测、疾病诊断、法医分析、遗传作图、遗传测试、核酸测序、组织分型等。
本公开内容涵盖核酸扩增反应对污染敏感的认识。本公开内容涵盖来自假核酸扩增的污染导致错误或误导性诊断或临床结果的认识。本公开内容涵盖来自例如扩增子的污染可由于可接近和/或不安全的核酸扩增反应容器而发生的认识。
本公开内容涵盖传统的核酸扩增反应容器容易意外地打开并且使操作者和/或环境暴露于例如扩增子、核酸扩增反应混合物和/或核酸扩增反应试剂的认识。
在一些实施例中，所提供的仪器和系统提供了扩增核酸的环境、容器。
在一些实施例中，用于基本上不可逆地密封核酸扩增反应容器的系统包括：基部，所述基部包括：基部的顶表面和基部的底表面，以及限定通道的在基部的顶表面中的开口，所述通道从基部的顶表面中的开口延伸到基部的底表面中的开口；核酸扩增反应容器，所述核酸扩增反应容器位于通道内且突出穿过基部的底表面中的开口，所述核酸扩增反应容器包括：用于保持核酸扩增反应混合物的对于基部的底表面远侧的接受器部分，核酸扩增反应容器的壁，所述壁包括内表面，其中所述核酸扩增反应容器的壁从核酸扩增反应容器的接受器部分朝向基部的底表面延伸，以及收集帽盖，所述收集帽盖包括：样品收集尖端，对于收集帽盖的样品收集尖端远侧的收集帽盖的顶部部分，以及在收集帽盖的样品收集尖端和收集帽盖的顶部部分之间的收集帽盖的外表面，其中当收集帽盖插入穿过通道并且进入核酸扩增反应容器内时，收集帽盖的外表面接触核酸扩增反应容器的壁的内表面，并且当密封时，收集帽盖的顶部部分在基部的顶表面中的开口下方凹陷，使得收集帽盖是无法接近的。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器可从基部的底表面去除。在一些实施例中，可去除的容器被固定到基部的底表面。
在一些实施例中，核酸扩增反应混合物保持在核酸扩增反应容器的接受器部分内。
在一些实施例中，基部包括多于一个通道，使得系统可用于基本上不可逆地密封多于一个核酸扩增反应容器。
在一些实施例中，基部包括覆盖基部的顶表面的盖。在一些实施例中，盖铰接地或滑动地连接到基部。
在一些实施例中，盖包括至少一个凹部或突起，使得当盖覆盖基部的顶表面时，至少一个凹部或突起与基部的顶表面中的开口对齐并且延伸到所述开口内。在一些实施例中，至少一个凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分，所述收集帽盖的顶部部分在基部的顶表面中的开口下方凹陷。
在一些实施例中，盖被锁定到基部。在一些实施例中，盖包括与基部接合的锁定销。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分是光学可接近的。
在一些实施例中，系统包括外壳，所述外壳包括：外壳的顶表面和外壳的底表面，其中外壳的顶表面包括适于接收基部的切口，因此当接收时，外壳包围基部的至少部分。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器可从基部的底表面去除，并且其中外壳在基部的底表面处接合核酸扩增反应容器。在一些实施例中，当基部由外壳接收时，外壳的底表面将可去除的容器固定到基部的底表面。
在一些实施例中，外壳的底表面包括切口，使得当基部由外壳接收时，核酸扩增反应容器的接受器部分是光学可接近的。在一些实施例中，外壳的底表面包括切口，使得当基部由外壳接收时，核酸扩增反应容器的接受器部分延伸到外壳的底表面下方。
在一些实施例中，外壳对于探询波长是光学透明的。
在一些实施例中，覆盖外壳的顶表面上的切口的盖。在一些实施例中，盖铰接地或滑动地连接到外壳或基部。
在一些实施例中，盖包括与基部的顶表面中的开口对齐的至少一个凹部或突起，使得当盖覆盖外壳的顶表面时，至少一个凹部或突起延伸到基部的顶表面中的开口内。在一些实施例中，至少一个凹部或突起延伸到基部的顶表面中的开口内，使得至少一个凹部或突起接触在基部的顶表面中的开口下方凹陷的收集帽盖的顶部部分。
在一些实施例中，盖覆盖外壳的顶表面上的切口，盖被锁定到外壳或基部。在一些实施例中，盖包括与外壳或基部接合的锁定销。在一些实施例中，外壳的顶表面的边缘升高，使得当盖覆盖外壳的顶表面上的切口时，盖在边缘下方陷入。
在一些实施例中，系统包括收集帽盖保持器，其中收集帽盖保持器包括筒体和轴。在一些实施例中，收集帽盖的顶部部分可去除地连接到筒体。在一些实施例中，筒体包括释放件，使得当释放件被致动时，筒体释放收集帽盖。
在一些实施例中，贮存帽盖覆盖核酸扩增反应容器。
在一些实施例中，基本上不可逆地密封核酸扩增反应容器的方法包括以下步骤：提供核酸扩增反应系统；将核酸扩增反应混合物加入核酸扩增反应容器的接受器部分；将收集帽盖的样品收集尖端插入基部的顶表面的开口内，穿过通道且进入核酸扩增反应容器内；使收集帽盖的外表面与核酸扩增反应容器的壁的内表面接触；并且使收集帽盖的顶部部分在基部的顶表面中的开口下方凹陷，由此将核酸扩增反应密封在核酸扩增反应容器中。在一些实施例中，核酸样品存在于收集帽盖的样品收集尖端上。
在一些实施例中，系统包括覆盖基部的顶表面的盖，其中在接触步骤之后，方法包括关闭盖的步骤。在一些实施例中，盖包括接触收集帽盖的顶部部分的至少一个凹部或突起，使得关闭盖的步骤包括将收集帽盖推入容器内。在一些实施例中，外壳的顶表面的边缘升高，使得关闭盖的步骤包括将盖在边缘下方陷入。
在一些实施例中，系统包括收集帽盖保持器，其中收集帽盖保持器包括筒体和轴，并且其中收集帽盖的顶部部分可去除地连接到筒体，并且其中筒体包括释放件，使得当释放件被致动时，筒体释放收集帽盖，方法包括致动释放件使得筒体释放收集帽盖的步骤。
在一些实施例中，使用核酸扩增反应容器收集且扩增核酸的方法包括以下步骤：获得核酸样品；使核酸样品与核酸扩增混合物在核酸扩增容器中接触；并且执行核酸样品的核酸扩增反应。
在一些实施例中，使用核酸扩增反应容器收集和扩增核酸的方法包括以下步骤：获得核酸样品，并且使收集帽盖的样品收集尖端与核酸扩增混合物接触，而没有任何介入步骤。
附图说明
通过结合附图参考以下说明，本公开的以上和其它目标、方面、特征以及优势将变得更加明显并且更好了解，在附图中：
图1显示了核酸扩增反应容器。图1在小图(a)处显示了用收集帽盖密封的核酸扩增反应容器。图1在小图(b)处显示了用贮存帽盖密封的核酸扩增反应容器。
图2显示了一些实施例的核酸扩增容器的密封件的放大视图。
图3显示了一些实施例的用于核酸扩增的系统。
图4显示了根据一些实施例的基部和多个开口以及多个通道的放大视图。
图5显示了一些实施例的用于核酸扩增的系统。
图6显示了一些实施例的收集帽盖保持器。
图7显示了一些实施例的收集帽盖保持器与用于核酸扩增的系统。
图8显示了一些实施例的用于核酸扩增的系统。
图9显示了一些实施例的用于核酸扩增的系统。
定义
在一些实施例中，所提供的仪器和/或方法的特征在于它们允许研究各种模拟生物环境中的细胞行为和/或允许高流通量分析细胞属性和/或反应和/或影响它们的因子的那些。为了使本公开内容更容易理解，下文首先定义了某些术语。以下术语和其他术语的附加定义在整个说明书中陈述。
在本申请中，除非上下文另外清楚地指出，否则术语“一个/一种(a)”可理解为意指“至少一个/一种”。如本申请中所使用，术语“或”可理解为意指“和/或”。如本申请中所使用，术语“包含(comprise)”和所述术语的变体，如“包含(comprising)”和“包含(comprises)，”并不打算排除其它添加剂、组分、整数或步骤。
如本申请中所使用，术语“约”和“大约”作为等效词语使用。在存在或不存在约/大约的情况下，本申请中所用的任何数值都意味着涵盖相关领域中普通技术人员所了解的任何正常波动。在某些实施例中，术语“大约”或“约”指在所述参考值的任一方向上(大于或小于)落入25％、20％、19％、18％、17％、16％、15％、14％、13％、12％、11％、10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2％、1％或更少内的一系列值，除非另有说明或从上下文另外显而易见(除非当这种数目超过可能值的100％时)。
“扩增(amplification)”或“扩增(amplify)”：如本文使用的，术语“扩增(amplification)”或“扩增(amplify)”指本领域已知用于从模板核酸复制靶序列，由此增加样品中的靶序列的拷贝数的方法。扩增可为指数或线性的。模板核酸可为dna或rna。以这种方式扩增的靶序列形成“扩增区”或“扩增子”。虽然下文所述的示例性方法涉及使用pcr的扩增，但本领域已知用于扩增靶核酸序列的许多其它方法(例如，等温法、滚环法等)。本领域技术人员应理解，可使用这些其它方法代替pcr法或连同pcr法一起使用。参见例如saiki,“amplificationofgenomicdna”inpcrprotocols,innis等人(1990).编辑academicpress,sandiego,calif.第13-20页；wharam等人(2001).nucleicacidsres.29(11):e54-e54；hafner等人(2001).biotechniques.30(4):852-6,858,860各处。适用于与本发明方法一起使用的进一步扩增方法包括例如逆转录pcr(rt-pcr)、连接酶链反应(lcr)、基于转录的扩增系统(tas)、基于核酸序列的扩增(nasba)反应、自持续序列复制(3sr)、链置换扩增(sda)反应、自返回dna扩增(boomerangdnaamplification)(bda)、q-β复制或基于等温核酸序列的扩增。
“对应于”：如本文使用的，术语“对应于”通常用于指定与适当的参考因子中存在的那个共享位置(例如在三维空间中或相对于另一个元件或部分)的目的因子中的结构元件或部分。例如，在一些实施例中，该术语用于指聚合物中残基的位置/同一性，例如多肽中的氨基酸残基或核酸中的核苷酸残基。本领域普通技术人员应了解，为了简化的目的，通常使用基于参考相关聚合物的规范编号系统来指定这种聚合物中的残基，使得第一聚合物中的残基“对应于”参考聚合物中第190位处的残基，例如实际上不必是第一聚合物中的第190个残基，而是对应于参考聚合物中第190位处发现的残基；本领域普通技术人员容易了解如何鉴定“对应”氨基酸，包括通过使用专门设计用于聚合物序列比较的一种或多种商购可得的算法。
“片段”：如本文所述的材料或实体的“片段”具有包括整体的不连续部分但缺少整体中发现的一个或多个部分的结构。在一些实施例中，片段由这样的不连续部分组成。在一些实施例中，片段由整体中发现的特征性结构元件或部分组成，或者包含整体中发现的特征性结构元件或部分。
“核酸”：如本文使用的，在其最广泛的意义上，指掺入或可掺入寡核苷酸链内的任何化合物和/或物质。在一些实施例中，核酸是通过或可通过磷酸二酯键掺入寡核苷酸链内的化合物和/或物质。如从上下文明确的，在一些实施例中，“核酸”指个别核酸残基(例如核苷酸和/或核苷)；在一些实施例中，“核酸”指包含个别核酸残基的寡核苷酸链。在一些实施例中，“核酸”是或包含rna；在一些实施例中，“核酸”是或包含dna。在一些实施例中，核酸是一种或多种天然核酸残基，包含一种或多种天然核酸残基，或者由一种或多种天然核酸残基组成。在一些实施例中，核酸是一种或多种核酸类似物，包含一种或多种核酸类似物，或者由一种或多种核酸类似物组成。在一些实施例中，核酸类似物与核酸的不同之处在于它不利用磷酸二酯主链。例如，在一些实施例中，核酸是一个或多个“肽核酸，”包含一个或多个“肽核酸，”或者由一个或多个“肽核酸”组成，所述“肽核酸”是本领域已知的，并且在主链中具有肽键代替磷酸二酯键，视为在本发明的范围内。可替代地或另外地，在一些实施例中，核酸具有一个或多个硫代磷酸酯和/或5'-n-亚磷酰胺键，而不是磷酸二酯键。在一些实施例中，核酸是一种或多种天然核苷(例如腺苷、胸苷、鸟苷、胞苷、尿苷、脱氧腺苷、脱氧胸苷、脱氧鸟苷和脱氧胞苷)，包含一种或多种天然核苷，或者由一种或多种天然核苷组成。一些实施例中，核酸是一种或多种核苷类似物(例如2-氨基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯并嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、c-5丙炔基-胞苷、c-5丙炔基尿苷、2-氨基腺苷、c5-溴尿苷、c5-氟尿苷、c5-碘尿苷、c5-丙炔基-尿苷、c5-丙炔基-胞苷、c5-甲基胞苷、2-氨基腺苷、7-脱氮腺苷、7-脱氮鸟苷、8-氧代腺苷、8-氧代鸟苷、0(6)-甲基鸟嘌呤、2-硫代胞苷、甲基化碱基、嵌入碱基及其组合)，包含一种或多种核苷类似物，或者由一种或多种核苷类似物组成。在一些实施例中，核酸包含一种或多种与天然核酸中的那些糖相比被修饰的糖(例如，2'-氟核糖、核糖、2'-脱氧核糖、阿拉伯糖和己糖)。在一些实施例中，核酸具有编码功能性基因产物(例如rna或蛋白质)的核苷酸序列。在一些实施例中，核酸包含一个或多个内含子。在一些实施例中，核酸通过以下方式中的一种或多种来制备：从天然来源分离，通过基于互补模板的聚合酶促合成(体内或体外)，在重组细胞或系统中复制，以及化学合成。在一些实施例中，核酸为至少3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、20、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500、5000或更多个残基长。在一些实施例中，核酸是单链的；在一些实施例中，核酸是双链的。在一些实施例中，核酸具有包含至少一个元件的核苷酸序列，所述元件编码多肽或者是编码多肽的序列的互补序列。在一些实施例中，核酸具有酶促活性。
“样品”：如本文使用的，术语“样品”通常指如本文所述得自或源自目的源的生物样品。在一些实施例中，目的源包括生物，例如动物或人。在一些实施例中，生物样品是或包含生物组织或流体。在一些实施例中，生物样品可为下述或包含下述：骨髓；血液；血细胞；腹水；组织或细针活组织检查样品；含细胞的体液；自由漂浮的核酸；痰；唾液；尿；脑脊髓液，腹膜液；胸膜液；粪便；淋巴；妇科流体；皮肤拭子；阴道拭子；口腔拭子；鼻拭子；洗涤液或灌洗液，如导管灌洗液或支气管肺泡灌洗液；抽吸物；刮屑；骨髓样本；组织活组织检查样本；手术样本；粪便，其它体液，分泌物和/或排泄物；和/或来自其的细胞等。在一些实施例中，生物样品是或包含从个体获得的细胞。在一些实施例中，所获得的细胞是或包括来自个体的细胞，样品由所述个体获得。在一些实施例中，样品是通过任何适当的手段从目的源直接获得的“初次样品”。例如，在一些实施例中，主要生物样品通过选自以下的方法获得：活组织检查(例如细针抽吸或组织活组织检查)、手术、体液(例如血液、淋巴、粪便等)的收集等。在一些实施例中，如从上下文将明确的，术语“样品”指通过加工初次样品(例如通过去除其一种或多种组分和/或通过向其加入一种或多种试剂)获得的制备物。例如，使用半渗透膜过滤。这样的“经加工的样品”可包括例如从样品中提取的核酸或蛋白质，或者通过使初次样品经受技术例如mrna的扩增或逆转录、某些组分的分离和/或纯化获得的核酸或蛋白质等。
“基本上”：如本文使用的，术语“基本上”和语法等价物指显示出目的特征或性质的总体或接近总体范围或程度的定性条件。本领域普通技术人员应了解，生物和化学现象如果有的话也很少达到完全和/或进行到完全或者实现或避免绝对结果。
具体实施方式
本公开内容尤其提供了可用于扩增核酸的系统。根据本公开内容的各种实施例在本文中得到详细描述。具体地，在一些实施例中，本公开内容描述了用于执行核酸扩增反应的系统和方法。本公开内容的实施可用于广泛范围的应用，包括但不限于：基础研究、临床医学开发、克隆、疾病检测、疾病诊断、法医分析、遗传作图、遗传测试、鉴定遗传突变、工业质量控制、核酸测序、组织分型等。
核酸扩增技术在复杂性和程序中不同，但以相同的一般原理操作。核酸扩增技术快速扩增核酸序列的特定区域、片段或一部分。
本领域技术人员应理解，本领域已知用于扩增核酸的多种方法。事实上，存在各种各样的核酸扩增技术，参见例如saiki,“amplificationofgenomicdna”inpcrprotocols,innis等人编辑academicpress,sandiego,calif.,13-20(1990)；还参见wharam等人29nucleicacidsres.11,e54-e54(2001)；还参见hafner等人,30biotechniques4,852-6；858,860各处(2001)。
在一些实施例中，适合于本公开内容的扩增方法包括例如自返回dna扩增(bda)、基于等温核酸序列的扩增、解旋酶依赖性扩增(hda)、连接酶链反应(lcr)、环介导的等温扩增、多重置换扩增、基于核酸序列的扩增(nasba)反应、聚合酶链反应(pcr)、q-β复制、逆转录pcr(rt-pcr)、滚环扩增(rca)、自持续序列复制(3sr)、链置换扩增(sda)反应、基于转录的扩增系统(tas)或其组合。
核酸扩增技术通常包括获得或收集遗传材料的样品。遗传材料与核酸扩增反应混合物接触。涉及扩增方法的核酸扩增反应混合物包括例如酶、引物、探针、缓冲液等。本领域技术人员应了解，这些组分和混合物可容易地从商业源获得，例如来自agilenttechnologies、bio-rad、biotools、invitrogen、newenglandbiolabs、qiagen、r&dsystems或sigma-aldrich，仅举几例。本领域技术人员还应了解定制混合物被和可被设计为解决特定或定制的需要。
作为例子，pcr是用于在模板核酸内准备特定靶序列的许多拷贝的一种技术。pcr可根据whelan等人，33j.clinicalmicrobiology,3,556-561(1995)中所述的方法执行。例如，pcr反应可由多个扩增循环组成，并且使用与靶序列的5'和3'末端杂交的一对引物来起始。扩增循环可包括起始变性，以及杂交、链伸长(或延伸)和链分离(变性)的通常至多50个循环。杂交和延伸步骤可合并成单个步骤。在pcr反应的每个循环中，引物之间的靶序列被复制。引物可与复制的dna扩增子以及原始模板dna杂交。拷贝的总数目随着时间/pcr循环数目而指数地增加。
扩增的靶序列或扩增子可通过各种众所周知的方法中的任一种来检测。例如，在一些实施例中，可使用电泳(例如，凝胶电泳或毛细管电泳)。还可使扩增子经受不同的检测方法，例如涉及变体序列的选择性检测的方法(例如，使用序列特异性探针检测单核苷酸多态性或snp)。在一些实施例中，实时检测扩增子。
灵敏度是核酸扩增的标志。灵敏度指样品如何有效地扩增。就核酸序列、片段或其一部分而言，核酸技术扩增样品中的任何事物和所有事物。这意指核酸技术可用于找到且扩增样品中可能仅以痕量存在的核酸。
扩增核酸的微小样品的能力还可意指有限的样品可因污染而受到损害无法使用。即，这些扩增技术非常容易受到来自操作者或环境中存在的核酸的污染，且特别是来自先前的所扩增样品的污染。这种污染是不希望有的，因为假核酸将生成假的、不正确的或不准确的测试结果。
扩增子携带污染是特别严重的问题。参见例如aslanzadeh,briefreview:preventingpctamplificationcarryovercontaminationinaclinicallaboratory,34annalsclinical&laboratoryscience4(2004)。
已开发了预扩增和扩增后技术，其限制了扩增子携带污染，并且减少了由于扩增产物携带污染的假的、不正确的或不准确的结果的可能性。实验室和临床设置已并入了减少污染的技术。这些技术包括化学障碍，例如用漂白剂清洗；机械障碍，例如实验室区域的物理分离；和/或灭菌技术，例如紫外线辐射以减少污染的影响。
这些技术在所有情况下都不是完全有效和/或不是有效的，特别是例如即时解决方案(pointofcaresolution)。一般地，即时测试是在患者处或患者附近执行的任何医学测试，例如在床边、医生办公室、诊所、药房或家中的测试。对即时测试的挑战包括例如测试设备、一次性使用、方法和样品的可靠控制。在这些背景下的操作者也更可能是患者护理人员而不是受过训练的操作者。
在即时测试的背景下，污染已阻碍或防止了核酸扩增检测技术的主流实施。如上所述，甚至在高度控制的临床实验室环境中，污染也可产生假的、不正确的或不准确的结果。在不受控制或控制得较不好的环境中的污染连同较少训练的操作者会加剧污染及其效应。此外，即时测试对操作者、医务人员、患者和环境造成来自意外暴露于遗传材料、扩增产物、试剂、混合物等的暴露风险。
本公开内容涵盖可用于各种临床、诊断、治疗等应用的核酸扩增技术生成大量扩增产物的认识。本公开内容涵盖下述认识：当这种大量的扩增产物从核酸扩增反应容器有意或无意地释放时，该释放导致操作者和污染位点周围的工作区域的污染。本公开内容涵盖污染导致由于外源核酸扩增的随后假阳性或假阴性结果的认识。本公开内容涵盖下述认识：由于污染，核酸扩增技术由于暴露于例如遗传材料、扩增产物、试剂、混合物等而对动物、生物和/或环境造成健康和安全风险。
用于核酸扩增的传统仪器、系统和方法可导致污染或受到污染，包括扩增子污染。传统技术包括用于减少污染的系统和工艺无法防止污染，并且不能有效地遏制污染，是昂贵且劳动密集的。此外，传统系统和技术无法直接转移到即时测试应用。
本公开内容提供了用于收集核酸、扩增核酸且执行核酸扩增测试的系统和方法。
核酸扩增系统
在一些实施例中，本公开内容提供了用于收集和扩增核酸的系统和方法。在一些实施例中，本公开内容提供了，一旦核酸扩增反应容器被密封，用于密封的帽盖或覆盖物就不容易接近和/或不容易去除。在一些实施例中，本公开内容提供了用于收集和扩增核酸的系统和方法，当与传统仪器和技术相比时，该系统和方法基本上减少和/或消除核酸扩增反应容器意外打开的情况。在一些实施例中，本公开内容提供了，当与传统仪器和技术相比时，基本上减少和/或消除核酸扩增反应容器外部的操作者或具有核酸扩增反应容器内容物(例如遗传材料、扩增产物、试剂和/或混合物等)的环境的意外暴露的情况。
核酸扩增反应容器
在一些实施例中，所提供的系统包括核酸扩增反应容器。在一些实施例中，核酸扩增反应在核酸扩增反应容器中执行。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器是或包含例如塑料、玻璃、天然聚合物、合成聚合物、金属或其组合。在一些实施例中，核酸扩增反应容器由不污染样品的任何材料制成。在一些实施例中，核酸扩增反应容器由适合于核酸扩增反应(例如核酸扩增反应混合物、化学试剂和/或热循环)的条件的任何材料制成。在一些实施例中，核酸扩增反应容器由聚丙烯制成。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器包括接受器、壁、唇缘和/或边缘。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分是光学透明的。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分对于探询波长是光学透明的。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分具有圆形底部。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分具有平坦底部。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分位于核酸扩增反应容器的底部处。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分的尺寸形成为包含一定体积。在预扩增的一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分含有例如样品、核酸扩增反应混合物和/或核酸扩增反应试剂。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分的尺寸形成为含有约小于1纳升至约1毫升的范围、约1nl至约10nl的范围、约1nl至约1μl的范围、约1μl至约1ml的范围、约1μl至约10μl的范围、约1nl至约1.5nl的范围、约2nl至约2.5nl的范围、约3nl至约3.5nl的范围、约4nl至约4.5nl的范围、约5nl至约5.5nl的范围、约6nl至约6.5nl的范围、约7nl至约7.5nl的范围、约8nl至约8.5nl的范围、约9nl至约9.5nl的范围、约10nl至约20nl的范围、约30nl至约40nl的范围、约50nl至约60nl的范围、约70nl至约80nl的范围、约90nl至约100nl的范围、约200nl至约300nl的范围、约400nl至约500nl的范围、约600nl至约700nl的范围、约800nl至约900nl的范围、约1μl至约10μl的范围、约20μl至约30μl的范围、约40μl至约50μl的范围、约60μl至约70μl的范围、约80μl至约90μl的范围、约100μl至约200μl的范围、约300μl至约400μl的范围、约500μl至约600μl的范围、约700μl至约800μl的范围、约900μl至约1ml的范围或更多。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分的尺寸形成为含有小于约1纳升至约1nl的范围、约1.5nl至约2nl的范围、约2.5nl至约3nl的范围、约3.5nl至约4nl的范围、约4.5nl至约5nl的范围、约5.5nl至约6nl的范围、约6.5nl至约7nl的范围、约7.5nl至约8nl的范围、约8.5nl至约9nl的范围、约9.5nl至约10nl的范围、约20nl至约30nl的范围、约40nl至约50nl的范围、约60nl至约70nl的范围、约80nl至约90nl的范围、约100nl至约200nl的范围、约300nl至约400nl的范围、约500nl至约600nl的范围、约700nl至约800nl的范围、约900nl至约1μl的范围、约10μl至约20μl的范围、约30μl至约40μl的范围、约50μl至约60μl的范围、约70μl至约80μl的范围、约90μl至约100μl的范围、约200μl至约300μl的范围、约400μl至约500μl的范围、约600μl至约700μl的范围、约800μl至约900μl的范围、约1ml的范围或更多。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器具有任何形状，例如矩形、正方形等。在一些实施例中，核酸扩增反应容器是管，例如eppendorf或eppendorf‘样式(style)’管。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的壁在核酸扩增反应容器的底部处从核酸扩增反应容器的接受器部分延伸。在一些实施例中，核酸扩增反应容器随着其远离容器延伸而向外逐渐变细。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的壁包括内表面。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的壁在顶部边缘处终止。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的壁在限定核酸扩增反应容器的开口的顶部边缘处终止。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部边缘与其壁的尺寸和形状大致相同。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部边缘具有与其壁不同的尺寸或形状。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部边缘包括唇缘。在一些实施例中，唇缘向外延伸。在一些实施例中，唇缘向外延伸，为操作者提供抓握的东西。
基部
在一些实施例中，所提供的系统包括基部。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器与基部配合。在一些实施例中，至少一个核酸扩增反应容器与基部配合。在一些实施例中，多于一个核酸扩增反应容器与基部配合。在一些实施例中，多重核酸扩增反应容器与基部配合。
在一些实施例中，基部是或包含例如塑料、玻璃、天然聚合物、合成聚合物、金属或其组合。在一些实施例中，基部由聚丙烯制成。
在一些实施例中，基部是光学透明的。在一些实施例中，基部对于探询波长是光学透明的。
在一些实施例中，基部具有一定形状。在一些实施例中，基部是环形、矩形、正方形、三角形或任何其它形状。在一些实施例中，基部是细长的。
在一些实施例中，基部包括顶表面和底表面。
在一些实施例中，基部的顶表面包括开口。在一些实施例中，基部的底表面包括开口。在一些实施例中，开口的形状与核酸扩增反应容器的形状类似。在一些实施例中，当核酸扩增反应容器是例如管或具有管状形状时，基部的顶表面上的开口具有管状或环形形状。在一些实施例中，基部的顶表面中的开口的尺寸形成为补足核酸扩增反应容器的外表面。
在一些实施例中，基部的顶表面中的开口限定从基部的顶表面延伸到基部的底表面的通道。在一些实施例中，通道是通孔。在一些实施例中，基部包括多于一个开口以及穿过基部的多于一个通道。在一些实施例中，基部包括多于一个开口和穿过基部的多于一个通道，那些开口和/或通道是互连和/或重叠的。在一些实施例中，基部包括多于一个开口和穿过基部的多于一个通道，那些开口和/或通道是彼此分开的。
在一些实施例中，当核酸扩增反应容器是例如管或具有管状或环形形状时，通道具有管状或圆柱状形状。在一些实施例中，通道至少足够大以允许核酸扩增反应容器通过其。在一些实施例中，通道至少足够大以允许核酸扩增反应容器的帽盖通过其。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部与在基部的底表面处的通道大致对齐。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部边缘或唇缘与在基部的底表面处的通道开口对齐。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的开口与在基部的底表面处的通道开口对齐。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器在基部的底部处附接。在一些实施例中，核酸扩增反应容器在基部的底部处可去除地附接。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部接触基部的底表面。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的顶部边缘和/或唇缘接触基部的底表面。在一些实施例中，基部的底表面被构造成捕获核酸扩增反应容器的顶部边缘和/或唇缘。在一些实施例中，核酸扩增反应容器滑动地或铰接地连接到基部的底表面。在一些实施例中，核酸扩增反应容器固定或锁定到基部的底表面。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器是基部的一部分。在一些实施例中，核酸扩增反应容器和基部是固体片。在一些实施例中，例如，基部在它形成时与核酸扩增反应容器一起模制。
收集帽盖和贮存帽盖
在一些实施例中，所提供的系统包括收集帽盖。
在一些实施例中，收集帽盖与核酸扩增反应容器配合。在一些实施例中，收集帽盖覆盖核酸扩增反应容器。在一些实施例中，收集帽盖密封核酸扩增反应容器。在一些实施例中，收集帽盖将核酸扩增反应容器与在其中的内容物一起密封。在一些实施例中，收集帽盖将核酸扩增反应混合物密封在核酸扩增反应容器中。在一些实施例中，收集帽盖将核酸扩增反应混合物和样品密封在核酸扩增反应容器中。
在一些实施例中，收集帽盖是或包含天然或合成聚合物，例如橡胶。在一些实施例中，收集帽盖是或包含天然材料，例如棉花。
在一些实施例中，收集帽盖的形状与核酸扩增反应容器的形状大致相同。在一些实施例中，收集帽盖的形状与核酸扩增反应容器的开口或核酸扩增反应容器的壁的形状大致相同。在一些实施例中，收集帽盖的形状与基部的通道的形状大致相同。在一些实施例中，收集帽盖的形状与在基部的顶表面上的开口的形状大致相同。
在一些实施例中，收集帽盖的尺寸形成为进入并且通过基部的顶表面中的开口。在一些实施例中，收集帽盖的尺寸形成为进入且通过通道。在一些实施例中，收集帽盖的尺寸形成为进入核酸扩增反应容器。
在一些实施例中，收集帽盖包括外表面。在一些实施例中，收集帽盖的外表面与核酸扩增反应容器的壁的内表面配合。在一些实施例中，收集帽盖的外表面用核酸扩增反应容器的壁的内表面密封。在一些实施例中，密封件是压缩密封件。在一些实施例中，密封件是摩擦密封件。在一些实施例中，当用收集帽盖密封时，核酸扩增反应的内容物包含在核酸扩增反应容器内。
在一些实施例中，通过使样品源与物理结构接触来收集样品。在一些实施例中，收集帽盖是用于样品收集的物理结构。
在一些实施例中，收集帽盖包括样品收集尖端。在一些实施例中，样品收集尖端与收集帽盖分开。在一些实施例中，样品收集尖端可去除地连接到收集帽盖。
在一些实施例中，样品收集尖端是与收集帽盖的顶部部分不同的材料。在一些实施例中，样品收集尖端是与收集帽盖的顶部部分相同的材料。在一些实施例中，当与样品源接触时收集样品的任何物理结构都可用作收集帽盖的样品收集尖端。在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端是或包含拭子，例如棉签。在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端包含吸收性材料，例如棉花。在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端是或包含塑料、天然聚合物或合成聚合物。
在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端的一部分形成为对应于核酸扩增反应容器的壁的内表面的形状。
在一些实施例中，收集帽盖收集样品。在一些实施例中。收集帽盖的样品收集尖端收集样品。在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端由于摩擦而收集核酸样品。在一些实施例中，通过接触和/或划过相关表面来收集核酸样品。
在一些实施例中，收集帽盖插入穿过基部中的开口。在一些实施例中，收集帽盖进入且通过基部中的通道。在一些实施例中，收集帽盖进入核酸扩增反应容器并且与核酸扩增反应容器配合。
在一些实施例中，将样品直接引入核酸扩增反应容器。
在一些实施例中，收集帽盖包括顶部部分。
在一些实施例中，当与核酸扩增反应容器配合时，收集帽盖的顶部部分在核酸扩增反应容器内凹陷，使得它是无法接近的。在一些实施例中，当与核酸扩增反应容器配合时，收集帽盖的顶部部分在通道内凹陷，使得它是无法接近的。在一些实施例中，当与核酸扩增反应容器配合时，收集帽盖的顶部部分在基部的顶表面下方和/或在核酸扩增反应容器的顶部边缘下方凹陷，使得它是无法接近的。在一些实施例中，当收集帽盖的顶部部分不能被抓握以将其从核酸扩增反应容器中去除时，它是无法接近的。
在一些实施例中，收集帽盖的顶部部分由保持器抓握。在一些实施例中，当收集帽盖与核酸扩增反应容器配合时，收集帽盖的顶部部分由保持器释放。在一些实施例中，保持器通过推动或弹出来释放收集帽盖。在一些实施例中，可使用能够保持收集帽盖的任何结构。
在一些实施例中，收集帽盖的顶部部分包括用于抓握的钩状物、柄状物或突起。在一些实施例中，保持器适于捕获例如钩状物、柄状物或突起。在一些实施例中，保持器被改造为释放收集帽盖。在一些实施例中，保持器可被致动以捕获和/或释放收集帽盖。
在一些实施例中，一旦插入，用于抓握的钩状物、柄状物或突起就无法用于从核酸扩增反应容器中去除收集帽盖。在一些实施例中，用于抓握的钩状物、柄状物或突起在它用于将收集帽盖插入核酸扩增反应容器内时脱开或损坏。在一些实施例中，用于抓握的钩状物、柄状物或突起在使用中脱开或损坏，使得一旦将收集帽盖密封在核酸扩增反应容器中，这种用于抓握的钩状物、柄状物或突起就无法用于去除或拆封。
在一些实施例中，系统包括贮存帽盖。在一些实施例中，贮存帽盖覆盖核酸扩增反应容器。在一些实施例中，贮存帽盖覆盖核酸扩增反应容器，使得内容物不漏出。在一些实施例中，贮存帽盖覆盖核酸反应容器以防止或限制污染物进入或落入核酸扩增反应容器内。
在一些实施例中，贮存帽盖可从核酸扩增反应容器去除。在一些实施例中，贮存帽盖可被重新插入核酸扩增反应容器内。在一些实施例中，贮存帽盖包括顶部部分。在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分在核酸扩增反应容器的顶部边缘上方延伸。在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分在基部的顶表面上方延伸。在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分在基部的顶表面上方延伸，使得它可被抓握。在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分在基部的顶表面上方延伸，使得一旦插入核酸扩增反应容器内，它就可容易地去除。
在一些实施例中，贮存帽盖包括用于抓握且从核酸扩增反应容器中去除贮存帽盖的钩状物、柄状物或突起。在一些实施例中，贮存帽盖包括外表面。在一些实施例中，当插入核酸扩增反应容器内时，贮存帽盖的外表面被暴露用于抓握且从核酸扩增反应容器中去除贮存帽盖。在一些实施例中，当插入核酸扩增反应容器内时，贮存帽盖的顶部部分的外表面被暴露用于抓握且从核酸扩增反应容器中去除贮存帽盖。在一些实施例中，在贮存帽盖的顶部部分上的外表面或者钩状物、柄状物或突起可用于将贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内。
在一些实施例中，当贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内时，不形成密封。在一些实施例中，当贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内并且贮存帽盖的外表面接触壁的内表面时，不形成密封。在一些实施例中，当贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内时，不形成基本上不可逆的密封。在一些实施例中，当贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内并且贮存帽盖的外表面接触壁的内表面时，不形成基本上不可逆的密封。
在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分比收集帽盖的顶部部分长。在一些实施例中，贮存帽盖的顶部部分比收集帽盖长，使得它在基部的表面中的开口上方可接近。在一些实施例中，当贮存帽盖插入核酸扩增反应容器内时，贮存帽盖的顶部部分延伸到基部的顶表面中的开口上方。
用于基部的盖
在一些实施例中，所提供的系统包括盖。
在一些实施例中，盖是或包含例如塑料、玻璃、天然聚合物、合成聚合物、金属或其组合。在一些实施例中，基部由聚丙烯制成。
在一些实施例中，盖接触基部的顶表面的至少一部分。在一些实施例中，盖覆盖基部的顶表面。在一些实施例中，盖的尺寸形成为覆盖基部的顶表面。在一些实施例中，盖的尺寸形成为覆盖基部的顶表面中的开口。在一些实施例中，盖覆盖基部的顶表面，使得凹陷的收集帽盖无法接近。
在一些实施例中，盖是平坦的。在一些实施例中，盖包括至少一个凹部或突起。在一些实施例中，凹部或突起与基部的顶表面中的开口对齐。在一些实施例中，凹部或突起的尺寸形成为配合在基部的顶表面上的开口内部。
在一些实施例中，盖铰接地连接到基部。在一些实施例中，盖滑动地连接到基部。
在一些实施例中，当盖在基部的顶表面上关闭时，凹部或突起进入基部的顶表面上的开口且进入基部的通道内。在一些实施例中，当盖和凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分。在一些实施例中，当盖关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分，使得收集帽盖不能移动。在一些实施例中，当盖关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分且压缩其。在一些实施例中，当盖关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分且压缩其，并且将收集帽盖推入凹陷且确保它完全位于核酸扩增反应容器中。
在一些实施例中，盖被锁定。在一些实施例中，盖包括接合基部的销。在一些实施例中，基部包括孔以接收从基部突出的销。
在一些实施例中，当贮存帽盖位于核酸扩增反应容器中时，盖不能关闭。
外壳
在一些实施例中，所提供的系统包括外壳。
在一些实施例中，外壳是或包含例如塑料、玻璃、天然聚合物、合成聚合物、金属或其组合。在一些实施例中，外壳由聚丙烯制成。在一些实施例中，外壳是光学透明的。
在一些实施例中，外壳适于围绕基部。在一些实施例中，外壳适于包围基部。在一些实施例中，外壳适于部分围绕基部。在一些实施例中，外壳的形状类似于基部。
在一些实施例中，外壳包括顶表面和底表面。
在一些实施例中，外壳的顶表面包括切口。在一些实施例中，切口是与基部的形状大致相同的形状。在一些实施例中，切口是与基部的底表面的直径大致相同的直径。在一些实施例中，切口是与基部的底表面的面积大致相同的面积。
在一些实施例中，切口适于接收基部，使得当接收时，外壳框住和/或围绕和/或包围基部。在一些实施例中，基部配合在外壳内。
在一些实施例中，外壳在基部的底部处接合核酸扩增反应容器。在一些实施例中，外壳将核酸扩增反应容器固定到基部的底部。在一些实施例中，外壳的底表面固定核酸扩增反应容器的接受器部分。
在一些实施例中，外壳的底表面包括切口。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分通过外壳的底表面中的切口。在一些实施例中，当核酸扩增反应容器的接受器部分通过外壳的底表面中的切口时，核酸扩增反应容器的唇缘接合外壳的底表面。在一些实施例中，当核酸扩增反应容器的接受器部分通过外壳的底表面中的切口时，外壳的底表面固定核酸扩增反应容器的唇缘。
在一些实施例中，位于外壳内的核酸扩增反应容器的接受器部分是光学可接近的。在一些实施例中，外壳的底表面包括切口。在一些实施例中，切口暴露核酸扩增反应容器的接受器部分。在一些实施例中，当基部由包括切口的外壳接收时，核酸扩增反应容器的接受器部分延伸到外壳的底表面下方。在一些实施例中，外壳对于探询波长是光学透明的。
用于外壳的盖
在一些实施例中，外壳包括盖。
在一些实施例中，盖接触外壳的顶表面。在一些实施例中，盖覆盖外壳的顶表面的至少一部分。在一些实施例中，盖的尺寸形成为覆盖外壳的顶表面。在一些实施例中，盖的尺寸形成为覆盖外壳的顶表面中的切口。在一些实施例中，盖覆盖外壳的顶表面上的切口。在一些实施例中，盖覆盖基部。在一些实施例中，盖覆盖基部的顶表面。在一些实施例中，盖覆盖外壳的顶表面，使得凹陷的收集帽盖无法接近。
在一些实施例中，盖铰接地连接到外壳的顶表面。在一些实施例中，盖滑动地连接到外壳的顶表面。
在一些实施例中，盖是平坦的。在一些实施例中，盖包括至少一个凹部或突起。在一些实施例中，凹部或突起与基部的顶表面中的开口对齐。在一些实施例中，凹部或突起的尺寸形成为配合在基部的顶表面上的开口内部。
在一些实施例中，当盖关闭时，它覆盖外壳的顶表面。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭时，盖覆盖在外壳的顶表面上的切口。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭时，凹部或突起进入基部的开口且进入通道内。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分，使得收集帽盖不能移动。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分且压缩其。在一些实施例中，当盖在外壳的顶表面上关闭并且凹部或突起进入基部的开口且进入通道内时，凹部或突起接触收集帽盖的顶部部分且压缩其，并且将收集帽盖推入凹陷且确保它完全位于核酸扩增反应容器中。
在一些实施例中，盖被锁定。在一些实施例中，盖包括接合基部的销。在一些实施例中，盖包括接合外壳的顶表面的销。在一些实施例中，基部包括用于接收销的孔。在一些实施例中，外壳的顶表面包括用于接收销的孔。
在一些实施例中，外壳的顶表面包括切口。在一些实施例中，当盖覆盖在外壳的顶表面上的切口时，盖在外壳的顶表面下方陷入。在一些实施例中，外壳的顶表面包括边缘。在一些实施例中，边缘升高，使得当盖覆盖外壳的顶表面时，盖在边缘下方陷入。在一些实施例中，当盖在边缘下方陷入时，它是无法接近的。
系统
在一些实施例中，本公开内容还提供了系统和/或试剂盒。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括核酸扩增反应容器和收集帽盖。在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括收集帽盖，例如，连同收集帽盖的样品收集尖端。
在一些实施例中，当收集帽盖插入核酸扩增反应容器内时，核酸扩增反应容器是基本上不可逆地密封的。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括基部，所述基部具有在基部的顶表面中的开口和在基部的底表面中的开口以及穿过其中的通道。在一些实施例中，形成包括核酸扩增反应容器的基部。在一些实施例中，基部和核酸扩增反应容器是系统和/或试剂盒的分开组件。
在一些实施例中，核酸扩增反应容器附接和/或可去除地附接到基部。在一些实施例中，当收集帽盖插入基部的顶表面中的开口内且进入核酸扩增反应容器内，使得收集帽盖的顶部部分在核酸扩增反应容器的顶部边缘和/或基部的顶表面下方凹陷时，核酸扩增反应容器是基本上不可逆地密封的。在一些实施例中，当凹陷时，收集帽盖的顶部部分是无法接近的。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括具有盖的基部。在一些实施例中，盖铰接地或滑动地连接到基部。在一些实施例中，盖覆盖基部。在一些实施例中，盖锁定到基部。在一些实施例中，当盖关闭时，包括用收集帽盖密封的核酸扩增反应容器的基部被锁定。在一些实施例中，锁定盖提供了另一层安全性，进一步降低了核酸反应扩增反应容器打开的可能性。在一些实施例中，盖包括凹部或突起。在一些实施例中，在盖上的凹部或突起进入通道以填充收集帽盖的顶部部分和盖之间的空隙。在一些实施例中，凹部或突起提供了另一层安全性，进一步降低了核酸反应扩增反应容器打开的可能性。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括外壳。在一些实施例中，外壳围绕基部。在一些实施例中，外壳具有顶表面和底表面。在一些实施例中，围绕基部的外壳具有在顶表面中的开口，允许接近基部的顶表面。在一些实施例中，围绕基部的外壳具有在底表面中的开口，允许用于核酸扩增反应容器的路径突出到基部和/或外壳的底表面下方。
在一些实施例中，当收集帽盖插入外壳的顶表面中的开口内，进入基部的顶表面中的开口内且进入核酸扩增反应容器内，使得收集帽盖的顶部部分在核酸扩增反应容器的顶部边缘和/或基部的顶表面和/或外壳的顶表面下方凹陷时，核酸扩增反应容器是基本上不可逆地密封的。在一些实施例中，当凹陷时，收集帽盖的顶部部分是无法接近的。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括具有盖的外壳。在一些实施例中，盖铰接地或滑动地连接到外壳。在一些实施例中，盖覆盖外壳。在一些实施例中，当盖锁定到外壳时。在一些实施例中，当盖关闭时，围绕包括用收集帽盖密封的核酸扩增反应容器的基部的外壳被锁定。在一些实施例中，锁定盖提供了另一层安全性，进一步降低了核酸反应扩增反应容器打开的可能性。在一些实施例中，盖包括凹部或突起。在一些实施例中，在盖上的凹部或突起进入通道以填充收集帽盖的顶部部分和盖之间的空隙。在一些实施例中，凹部或突起提供了另一层安全性，进一步降低了核酸反应扩增反应容器打开的可能性。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括贮存帽盖。在一些实施例中，贮存帽盖覆盖核酸扩增反应容器。在一些实施例中，当贮存帽盖位于核酸扩增反应容器中时，不能关闭外壳的盖。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包含核酸扩增混合物。在一些实施例中，系统和/或试剂盒包含位于核酸扩增反应容器的接受器部分内的核酸扩增混合物。在一些实施例中，核酸扩增反应容器的接受器部分是空的。在一些实施例中，系统和/或试剂盒包含位于一个或多个分开容器内的核酸扩增混合物。在一些实施例中，核酸扩增反应混合物存在于核酸扩增反应容器的接受器中。在一些实施例中，核酸扩增反应混合物贮存于分开的容器中，并且加入核酸扩增反应容器的接受器中。
在一些实施例中，收集帽盖由操作者用于获得核酸样品。在一些实施例中，操作者擦拭某个位置，使得收集帽盖的样品收集尖端接触核酸源。
在一些实施例中，操作者抓握收集帽盖的顶部部分，以手动地获得核酸样品。
在一些实施例中，当收集帽盖接触核酸扩增反应容器的内表面时，收集帽盖的样品收集尖端与位于核酸扩增反应容器的接受器部分内的核酸扩增混合物配合。在一些实施例中，当收集帽盖的样品收集尖端与位于核酸扩增反应容器的接受器部分内的核酸扩增混合物配合时，收集帽盖的顶部部分是无法接近的。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括保持器。在一些实施例中，保持器包括筒体和轴。在一些实施例中，保持器捕获收集帽盖。在一些实施例中，收集帽盖的顶部部分可去除地连接到筒体。在一些实施例中，保持器包括释放件。在一些实施例中，当被致动时，致动器从保持器释放收集帽盖。在一些实施例中，当释放时，核酸样品接触在接受器中保持的核酸扩增反应混合物。在一些实施例中，当释放时，收集帽盖的外表面用核酸扩增反应容器的壁的内表面密封。在一些实施例中，当释放时，收集帽盖的顶部部分在核酸扩增反应容器的顶部边缘、基部的顶表面和/或外壳的顶表面下方凹陷。在一些实施例中，当释放时，收集帽盖的顶部部分和核酸扩增反应容器的内容物是无法接近的。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括用于核酸扩增反应容器、基部、收集帽盖、贮存帽盖、外壳、用于基部的盖、用于外壳的盖、核酸扩增反应混合物和/或用于核酸扩增反应混合物的容器的包装。在一些实施例中，包装包裹每个组件。在一些实施例中，包装无菌地包裹每个组件。在一些实施例中，包装将每个组件连接到每个其它组件。在一些实施例中，包装将每个组件连续地连接到每个其它组件。
在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括热循环仪。在一些实施例中，系统和/或试剂盒包括检测器，例如荧光检测器。
方法
在一些实施例中，本公开内容提供了用于执行核酸扩增反应的方法。在一些实施例中，本公开内容提供了用于密封核酸扩增反应容器的方法。在一些实施例中，本公开内容提供了用于基本上不可逆地密封核酸扩增反应容器的方法。
在一些实施例中，基本上不可逆的密封意指将收集帽盖密封在核酸扩增反应容器内至它完全或几乎完全不可去除的程度。在一些实施例中，基本上不可逆地密封意指将收集帽盖密封在核酸扩增反应容器内，使得它在密封后不会意外地从容器中掉落。在一些实施例中，基本上不可逆地密封意指将收集帽盖密封在核酸扩增反应容器内，使得操作者需要特别地动作以将其从其核酸扩增反应容器中去除。
在一些实施例中，所提供的方法包括提供核酸扩增反应容器。在一些实施例中，所提供的方法包括提供含有核酸扩增反应混合物的核酸扩增反应容器。在一些实施例中，所提供的方法包括将核酸扩增反应混合物加入核酸扩增反应容器的接受器部分中。
在一些实施例中，方法包括将核酸扩增反应容器与基部配合。在一些实施例中，配合包括将核酸扩增反应容器的壁与基部的通道对齐。
在一些实施例中，方法包括获得样品。在一些实施例中，方法包括使用收集帽盖的样品收集尖端获得样品。
在一些实施例中，方法包括将收集帽盖插入穿过基部的通道且进入核酸扩增反应容器内。在一些实施例中，方法包括使收集帽盖的外表面与核酸扩增反应容器的内表面的壁接触。在一些实施例中，接触步骤密封核酸扩增反应容器。
在一些实施例中，方法包括使收集帽盖的顶部部分在基部的顶表面中的开口下方凹陷，使得收集帽盖是无法接近的。在一些实施例中，方法包括使收集帽盖的顶部部分在基部的通道内和在基部的顶表面下方凹陷，使得收集帽盖是无法接近的。在一些实施例中，当收集帽盖的顶部部分凹陷时，收集帽盖是无法接近的，使得操作者不能从核酸扩增反应容器中意外地去除收集帽盖。
在一些实施例中，方法包括关闭盖。在一些实施例中，关闭盖覆盖基部的顶表面中的开口。在一些实施例中，关闭盖覆盖基部的顶表面。在一些实施例中，关闭盖覆盖外壳的顶表面中的切口。在一些实施例中，当关闭时，存在于盖上且与基部的顶表面中的开口对齐的凹部或突起通过基部的顶表面中的开口且进入通道内，接触收集帽盖的顶部部分。在一些实施例中，当关闭时，存在于盖上且与基部的顶表面中的开口对齐的凹部或突起通过基部的顶表面中的开口且进入通道内，在收集帽盖的顶部部分上推动。在一些实施例中，当关闭时，存在于盖上且与基部的顶表面中的开口对齐的凹部或突起通过基部的顶表面中的开口且进入通道内，将收集帽盖推入核酸扩增反应容器内。
在一些实施例中，方法包括锁定盖。在一些实施例中，当锁定时，存在于盖上的销接合在外壳的顶表面或基部的顶表面上的孔。在一些实施例中，当在盖上的销接合外壳或基部时，盖不能打开。在一些实施例中，当盖关闭时，它下沉到外壳的顶表面的顶部边缘下方，使得它是无法接近的。
在一些实施例中，当收集样品时，使用用于保持收集帽盖的保持器。
在一些实施例中，当保持器用于插入收集帽盖时，方法包括在核酸扩增反应容器中释放收集帽盖。在一些实施例中，释放收集帽盖包括致动保持器，使得保持器释放收集帽盖的顶部部分。
在一些实施例中，方法包括获得包含核酸的样品。在一些实施例中，方法包括使核酸样品与核酸扩增混合物接触，而没有任何介入步骤。在一些实施例中，方法包括使核酸样品与核酸扩增混合物接触，而无需纯化样品中的核酸。
在一些实施例中，方法包括使核酸样品与核酸扩增反应混合物在核酸扩增反应容器中接触。在一些实施例中，方法包括执行核酸样品的核酸扩增反应。
在一些实施例中，直接接触而无需纯化的步骤包括并未经受纯化技术的核酸样品。在一些实施例中，直接接触而无需纯化的步骤包括并未经受纯化技术的核酸样品，所述纯化技术涉及用物理或化学方法使核酸与其它细胞组分分离。在一些实施例中，直接接触而无需纯化的步骤意指不执行去除按原始样品的非核酸组分的重量计的某个百分比的任何一个或多个步骤。在一些实施例中，在使样品与核酸扩增反应混合物接触之前，样品的非核酸组分的百分比大于或等于约1％、2％、3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、15％、20％或更多。
在一些实施例中，收集或获得的步骤可通过例如下述来实现：将核酸扩增混合物置于核酸扩增反应容器中，使用收集帽盖的样品收集尖端来收集样品，将收集帽盖立即插入核酸扩增反应容器内，使得收集帽盖的外表面与核酸扩增反应容器的壁的内表面接触，使得核酸扩增反应容器被密封，并且核酸样品接触核酸扩增混合物。
在一些实施例中，收集的样品在与核酸扩增反应混合物接触之前可经受介入步骤。在一些实施例中，例如，将核酸样品分成等分试样使得对于同一样品源可执行多于一次测试可能是有利的。在一些实施例中，样品可在不同于核酸扩增反应容器的容器中稀释(例如，通过将样品与缓冲液混合)，并且任选地在与核酸扩增反应容器中的核酸扩增混合物接触之前进行等分。本领域技术人员将认识到，其它类似的介入步骤可引入本公开内容的方法内，而不偏离范围。
范例
以下实例说明本发明的一些实施例和一些方面。相关领域的技术人员将清楚，可在不更改本发明的精神或范围的情况下作出各种修改、增加、替代等等，并且这种修改和变动涵盖在以下权利要求书中所限定的本发明的范围内。以下实例不以任何方式限制本发明。
实例1
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的核酸扩增反应容器。
参考图1，核酸扩增反应容器110显示于小图a和b中。图1在小图a处显示了具有收集帽盖140的核酸扩增反应容器110。图1在小图b处显示了具有贮存帽盖170的核酸扩增反应容器110。收集帽盖140具有比贮存帽盖170更短的长度。贮存帽盖170的较长长度可用于抓握和去除。在一些实施例中，收集帽盖140的较短长度是有用的，使得当插入核酸扩增反应容器110内时，它是无法接近的并且因此不会意外地从核酸扩增反应容器110中去除。收集帽盖140具有顶部部分160。收集帽盖160的顶部部分可被适配成使得它可由保持器(未示出)抓握和/或释放。收集帽盖140具有样品收集尖端150。收集帽盖150的样品收集尖端对于收集帽盖160的顶部部分为远侧。核酸扩增反应容器110具有接受器部分120。核酸扩增反应容器120的接受器部分适于保持核酸扩增反应混合物(未示出)。核酸扩增反应容器110具有壁130。核酸扩增反应容器130的壁从核酸扩增反应容器120的接受器部分延伸。核酸扩增反应容器130的壁延伸到在顶部边缘180处的唇缘。在一些实施例中，在核酸扩增反应容器110的顶部边缘180处的唇缘在与核酸扩增反应容器110正交的方向上向外突出。
实例2
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的核酸扩增反应容器，且特别是核酸扩增反应容器的密封件。
参考图2，显示了核酸扩增反应容器210。显示了核酸扩增反应容器210，其具有核酸扩增反应容器的接受器部分220和壁230。显示了插入核酸扩增反应容器210内的收集帽盖240。显示了延伸到核酸扩增反应容器的接受器部分220内的收集帽盖的样品收集尖端250。在一些实施例中，收集帽盖的样品收集尖端250接触核酸扩增反应混合物(未示出)。收集帽盖240的外表面260接触核酸扩增反应容器210的壁230的内表面270。在一些实施例中，这种接触形成压缩密封或摩擦密封，由此密封核酸扩增反应容器210。
实例3
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的用于核酸扩增反应的系统。
参考图3，显示了三个核酸扩增反应容器360。显示了对齐以与基部310配合的核酸扩增反应容器360。显示了具有开口340和通道350的基部310。显示了三个开口340和通道350。在一些实施例中，开口340是重叠的。在一些实施例中，开口340是分开的。显示了三个贮存帽盖320。显示了对齐以与贮存帽盖320配合的核酸扩增反应容器360。假想线330显示了贮存帽盖320、基部310和核酸扩增反应容器360的对齐。假想线330显示了穿过开口340和通道350的对齐。显示了外壳370。显示了在外壳370的顶表面380上的切口385。描绘基部310使得它可配合在外壳370的切口385内部。显示了盖375。显示了外壳390的底表面。
实例4
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的用于核酸扩增反应的系统。
参考图4，显示了用于核酸扩增反应的系统的对齐的放大。显示了核酸扩增反应容器470。显示了具有顶表面480和底表面490的基部410。显示了对齐以与基部的底表面490配合的核酸扩增反应容器的唇缘460。显示了具有开口440和穿过其中的通道450的基部的顶表面480。显示了对齐以与贮存帽盖420配合的核酸扩增反应容器470。假想线430显示了贮存帽盖420、基部410和核酸扩增反应容器470的对齐。假想线430显示了穿过开口440和通道450的对齐。
实例5
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的用于核酸扩增反应的系统。
参考图5，显示了外壳510。显示了外壳的顶表面560。显示了外壳的顶表面中的切口540。显示了在外壳510内接收的基部545。显示了铰接地连接到外壳510的盖520。显示了插入穿过基部545且进入三个核酸扩增反应容器590内的三个贮存帽盖530。贮存帽盖530显示为穿过基部的顶表面550中的基部的开口555。显示了穿过切口580从外壳的底表面570突出的核酸扩增反应容器590。
实例6
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例，用于核酸扩增反应的系统的收集帽盖的保持器。
参考图6，显示了保持器610。轴620显示在对于收集帽盖的样品收集尖端650远侧的一端处。筒体630介入在轴620和收集帽盖640之间。轴620和筒体630一起适于形成致动器(未示出)，所述致动器机械地抓握和/或释放收集帽盖640。本领域技术人员应了解用于调整保持器610和收集帽盖的机构。
实例7
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例，用于收集帽盖的保持器和用于核酸扩增反应的系统。
参考图7，显示了外壳730。显示了铰接地连接到外壳730的盖740。显示了如由外壳730接收的基部760。显示了保持器705。显示了轴710和筒体720。收集帽盖(未示出)在对于轴710远侧的一端处，并且插入穿过基部的顶表面中的开口795且穿过基部进入通道765内，并且与核酸扩增反应容器750配合。外壳730显示为将核酸扩增反应容器750固定到基部760的底表面。核酸扩增反应容器750在外壳的底表面785下方延伸。两个贮存帽盖770显示为与另外两个核酸扩增反应容器750配合。在一些实施例中，贮存帽盖770提供了用于核酸扩增反应容器和/或核酸扩增反应混合物的覆盖物。如所示，贮存帽盖770向上延伸并且在基部760上方且在外壳的顶表面780上方。在一些实施例中，贮存帽盖770是可接近的，使得操作者可去除贮存帽盖。如所示，贮存帽盖770在外壳的顶表面780上方延伸，由此防止盖740关闭。
实例8
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的用于核酸扩增反应的系统。
参考图8，显示了外壳830。显示了铰接地连接到外壳830的盖810。显示了具有锁定销815的盖810。显示了具有凹部或突起820的盖810。外壳830具有在外壳的顶表面860中的切口865。基部840的顶表面显示为由外壳830穿过切口865接收。显示了三个收集帽盖875。收集帽盖875显示为插入穿过基部的顶表面中的开口880且穿过基部进入通道890内，并且与核酸扩增反应容器870配合。外壳830显示为将核酸扩增反应容器870固定到基部840的顶表面。核酸扩增反应容器870在外壳的底表面850下方延伸。收集帽盖875，特别是收集帽盖的顶部部分显示为在开口880下方和在基部840的顶表面下方凹陷且进入基部的通道890内。在一些实施例中，收集帽盖875的顶部部分在基部840的顶表面下方凹陷。在一些实施例中，收集帽盖875的顶部部分在外壳的顶表面860下方凹陷，使得操作者不会意外地去除或松开收集帽盖。如所示，收集帽盖875的顶部部分在基部840的顶表面下方和在外壳的顶表面860下方凹陷，使得盖810可关闭。在一些实施例中，凹部或突起820与开口880对齐，使得凹部或突起820通过开口880，以将收集帽盖875的顶部部分保持就位。在一些实施例中，凹部或突起820与开口880对齐，使得凹部或突起820通过开口880，进入通道890内，并且接触收集帽盖875的顶部部分或在收集帽盖875的顶部部分上压缩，以确保收集帽盖875的顶部部分用其核酸扩增反应容器870密封。
实例9
本实例显示了根据本公开内容的一些实施例的用于核酸扩增反应的系统。
参考图9，显示了外壳920。显示了连接到外壳920的盖910。盖910显示为在外壳920上关闭。外壳920具有顶表面960。外壳的顶表面960具有切口940。如所示的盖910是关闭的，使得盖910在外壳的顶表面960的顶部边缘930下方陷入。显示了在外壳的底表面970下方突出的三个核酸扩增反应容器950。在一些实施例中，收集帽盖(未示出)在外壳的顶表面960和基部(未示出)下方凹陷，使得收集帽盖是无法接近的。在一些实施例中，当收集帽盖(未示出)是无法接近的时，操作者不会意外地将其去除。在一些实施例中，如所示，当收集帽盖(未示出)是无法接近的时，盖910可为关闭的。在一些实施例中，当盖910被关闭且在外壳的顶表面960下方陷入时，盖910是无法接近的并且不能打开。
其它实施例和等同物
虽然本公开内容已与各种实施例和实例结合进行描述，但不预期将它们限于这些实施例或实例。相反，如本领域技术人员应了解的，本公开内容涵盖了各种替代、修改和等价物。相应地，除非对此作出说明，否则描述、方法和图解不应理解为限于所述要素的次序。
尽管本公开内容已描述并且示出了某些实施例，但应理解，本公开内容并不限于这些特定实施例。相反，本公开内容包括有功能的和/或是特定实施例的等价物的所有实施例，以及已描述且示出的特征。相应地，例如，除非明确规定或上下文明确要求(例如否则就不可操作)，否则方法和图解不应该理解为限于步骤或要素的具体描述的顺序或安排。此外，特定实例和实施例的特征可以任何组合使用。本公开内容因此包括本文所述的相对各种实例和实施例的变化，如对于本领域技术人员显而易见的。