本发明属于crispr/cas9系统的sgrna表达载体设计及应用领域,特别涉及利用酶切插入法构建多个靶位点序列sgrna表达载体,实现植物多基因编辑的方法。
背景技术:
2013年,成簇的规律间隔性短回文重复序列及相关核酸酶cas9被报道可用于基因的编辑。该系统经过几年的发展,迅速成为最火热的基因组编辑技术。对于四倍体的油菜、六倍体的小麦等多倍体作物来说,大多数基因存在多个拷贝,基于传统的正向或反向遗传学来解析其基因功能或进行性状改良具有很大的难度。因此,开发能够同时修饰多个位点的crispr/cas9基因编辑系统对于植物基因功能研究、品种改良等都具有十分重要的意义。
crispr/cas9表达系统进入生物体细胞内转录后,需要独立的靶向sgrna序列与cas9蛋白结合完成目标位点的编辑。目前,常用的crispr/cas9系统将含不同靶位点序列的sgrna表达盒和cas9表达盒整合到双元载体上同时表达,每一个靶位点sgrna表达盒由不同的启动子启动表达,导致针对同一基因多位点或多基因进行编辑的载体构建变得很复杂,在很大程度上限制了crispr/cas9系统同时进行多位点或者多个基因编辑的能力。真核生物中的trna前体(pre-trnas)在真核细胞中可被内源的rnasep和rnasez识别剪切去除5′和3′端的多余序列,且该识别剪切主要针对trna接纳茎,d-loop臂以及tψc-loop臂结构而非特定的trna前体序列。另外,trna所含的内部启动子元件boxaandb可以协助招募rna聚合酶iii复合体,使trna自身序列可以作为转录增强子而提升rna聚合酶poliii型启动子的表达水平。根据trna的上述剪接加工特点,可以将trna与sgrna序列融合,形成一个多顺反子基因,将两个或者更多的sgrna序列串联在同一表达载体上,利用内源trna加工系统生成大量的携带靶向序列的sgrna,引导cas9核酸酶对同一基因的多个位点或多个基因多个位点进行编辑,提高突变效率。另外,鉴于trna及其加工系统在所有生物中是相当保守的,用该系统表达sgrna序列进行靶向序列选择时,摆脱了针对不同的poliii型启动子对于靶向序列第一个碱基应为g碱基或者a碱基的限制,因此,基于该系统的使用,可大大拓宽目标位点序列的可选择范围。因此,基于trna-sgrna序列很快就在水稻、玉米、小麦等单子叶植物中被应用于基因编辑。
早先报道的trna-sgrna表达系统进行目标靶序列的组装是通过goldengate法进行,实现含目标靶序列的多个trna-sgrna表达序列的串联需要设计多条引物,进行多轮pcr才能完成多个靶位点的组装。另外,将目标靶序列连同trna-sgrna序列直接进行化学合成则大大增加了成本。目前,利用trna-sgrna/cas9系统进行多位点基因编辑尚未在双子叶植物中被报道。
技术实现要素:
本发明目的在于提供一种trna-sgrna表达序列,使针对多个目标靶序列的组装可以通过简单的酶切插入的方式逐步组装到trna-sgrna表达载体中,实现多位点的基因编辑;组装有不同目标靶序列的trna-sgrna表达序列单元重复插入cas9基因表达载体,可同步实现多个靶位点或者多基因的编辑;另外,针对不同性状的编辑需要,可灵活进行不同基因的组合编辑。
本发明的目的是通过以下措施实现的:
一种trna-sgrna表达序列,其特征在于:trna序列、typeii内切酶位点、sgrna序列依次排列为独立的转录单元,将4个所述转录单元串联排列,串联排列的4个转录单元中所述typeii内切酶依次分别为bbsi、bsai、bsmbi和bfuai。本发明将特定的typeii内切酶bbsi、bsai、bsmbi和bfuai的酶切位点引入到该trna-sgrna系统中,并通过特定的组合方式构成了一种新的trna-sgrna表达序列及载体,基于该表达序列载体,(1)可利用酶切法插入多个靶向序列,无需采用goldengate法进行多靶位点序列的组装时大量的引物合成和pcr扩增组装;(2)避免了直接化学合成包含多个靶位点序列在内的sgrna表达序列导致成本较高的问题;(3)该新的trna-sgrna表达序列及其载体中,在每一个sgrna序列与cas9蛋白结合的42bp柄状区域序列均延长10bp,同时将该区域序列中的一串胸腺嘧啶(t)第四个胸腺嘧啶碱基替换成胞嘧啶碱基(c),改造后的sgrna序列有利于基因编辑效率的提高;(4)利用该trna-sgrna序列表达载体与cas9基因共表达,可灵活进行单基因多位点或多目标基因定点敲除的组合,有利于农作物多基因调控性状的改良。
上述trna-sgrna表达序列,其特征在于:序列如seqidno.1所述。
将上述trna-sgrna表达序列的4个串联转录单元的上游连接rna聚合酶iii型启动子,如来自拟南芥的iii型启动子u6-26,u6-29,u6-1或u3-b启动子(或者来自其他植物的类似rna聚合酶iii型启动子)融合,可获得相应的trna-sgrna表达盒。如u6-26::trna-sgrna表达盒序列信息如seqidno.2所述。
上述序列中的u6-26启动子可分别置换为下述拟南芥的iii型启动子如u6-29,u6-1和u3-b等不同的启动子序列,例如启动子序列依次分别为seqidno.3-5。本发明中驱动trna-sgrna序列表达的启动子也包括除拟南芥外的其他植物的rna聚合酶iii型启动子。
上述trna-sgrna表达序列及表达盒的制备方法,包括以下步骤:
(1)人工合成可分别由如拟南芥的rna聚合酶iii型启动子u6-26,u6-29,u6-1和u3-b等不同的启动子驱动的trna-sgrna表达盒(合成的详细序列信息见前面所述)并克隆于常见的puc质粒、pbluescriptiisk质粒中。其中trna-sgrna结构重复序列中分别在合成时引入bbsi,bsai,bsmbi和bfuai内切酶识别位点,用于不同靶序列的插入,同时在trna-sgrna表达盒的5’端和3’端在合成时直接添加或另行通过pcr扩增的方式引入不同的酶切位点,满足插入cas9表达载体不同位置,实现trna-sgrna序列和cas9基因共表达以及进行多个trna-sgrna表达盒插入cas9表达载体,实现多基因组合编辑的目的。
(2)目标基因靶向序列组装入trna-sgrna表达盒
靶位点引物设计
根据目标基因待编辑的靶位点序列,按如下序列信息设计两条互补引物对:
引物1:5’-tgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnn-3’
引物2:5’-aaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-3’(n=a,t,c或g)
靶序列的组装
按如下所述程序分别将不同的靶序列逐次装载入trna-sgrna表达盒相应位点。如先组装靶向序列a到bbsi位点,获得含有第一个靶向序列的载体用bsai酶切后再组装第二个靶向序列b;获得的含有a、b靶向序列的载体再用bsmbi酶切后组装第三个靶向序列c;获得的含有a、b、c靶向序列的载体再用bfuai酶切后组装第四个靶向序列d,这样依次获得组装有4个不同靶向序列的trna-sgrna表达盒载体。而上述针对不同靶向位点组装的先后顺序可利用上述四个酶切位点随机进行,不局限于仅按上述顺序组装4个不同靶位点。
靶序列的组装方法:
按表1所示,将靶向位点互补引物对(引物1和引物2)加ddh2o轻微混匀后,95℃变性5min,放置室温1h以上。室温下复性后的引物对按1∶250比例稀释备用。
表1目标基因靶序列引物互补为dna双链体系
按表2所示酶切体系进行u6-26::trna-sgrna表达盒载体的酶切,琼脂糖凝胶电泳后在紫外灯下切下目的条带。
表2trna-sgrna表达盒载体酶切体系
按表3所示体系添加各成分,轻微混匀后,4℃过夜连接。
表3靶序列组装连接体系
将上述连接产物转化大肠杆菌dh5α感受态细胞,涂板后用表4所示的pcr体系筛选含插入靶序列的阳性克隆。其中上游的f引物分别为:
u6-26f:5′-cgttgaacaacggaaactcgacttg-3′(u6-26::trna-sgrna)
u6-29f:5′-ctgatagattgtatatccatgttt-3′(u6-29::trna-sgrna)
u6-1f:5′-ccgtgggagaaatctcaaaattcc-3′(u6-1::trna-sgrna)
u3-bf:5′-tttactttaaattttttcttatgc-3′(u3-b::trna-sgrna)
或其他植物rna聚合酶iii型启动子5′端上游序列。下游r引物则分别为插入靶位点的反向互补引物:5’-aaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-3’。筛选到的阳性克隆进行测序验证,确认靶向位点序列已经成功插入trna-sgrna表达序列相应位置中。
表4含目标靶序列克隆的pcr筛选体系
装载目标靶序列的trna-sgrna表达盒与cas9基因表达框的组装
将上述测序验证后的trna-sgrna含1-4个靶向序列的表达盒用表达盒两端的限制性酶切位点切下(如u6-26::trna-sgrna表达盒两端位点分别为bamhi和ecori位点)插入pcacas9载体(该载体能在植物细胞中表达cas9蛋白,且cas9基因表达框外序列含单一的hindiii,ecori,bamhi,xbai等酶切位点)用bamhi和ecori酶切后相应位置,获得同时表达含目标靶向序列的trna-sgrna序列以及cas9基因的载体。获得的这个共表达载体可继续装载含其他基因靶向序列的trna-sgrna表达盒,从而实现更多目标基因的编辑。
trna-sgrna序列和cas9基因共表达载体进行植物基因编辑
将含目标靶向位点的trna-sgrna序列和cas9基因共表达载体转化农杆菌eha105或者lba4404,利用农杆菌介导的遗传转化法将相应共表达载体导入目标植物细胞中获得转基因植株。获得的转基因植株利用ctab法提取植株总dna,在目标基因相应的靶位点上下游设计引物,用高保真pcr聚合酶进行扩增。转基因植株获得的pcr产物与相应野生植株pcr产物进行测序比对分析,确定靶基因是否发生片段缺失或者碱基突变,并计算相应的基因编辑效率。进一步对突变植株用高保真酶扩增目标区域片段,插入pbluescriptiisk质粒的ecorv位点。连接产物转化大肠杆菌后在涂布20μlx-ga1(50mg/ml)和20μliptg(0.1mol/l)的平板上进行蓝白斑筛选,挑白斑进行阳性克隆检测以及测序分析,统计靶基因碱基突变类型及频率。根据上述结果分析trna-sgrna序列中不同位置的靶向位点是否能够在植物中完成相应的基因编辑。
有益效果
1.利用本发明trna-sgrna表达序列和表达盒可以实现多靶位点、多基因组合编辑。本发明中单个trna-sgrna表达盒仅能插入4个靶向位点,但通过在cas9植物表达载体中串联trna-sgrna表达盒可以实现远超4个靶向位点的目的。(1)不同iii型启动子驱动的trna-sgrna表达盒串联。如u6-26::trna-sgrna/u6-29::trna-sgrna串联表达盒可以实现8个靶向位点的编辑;u6-26::trna-sgrna/u6-29::trna-sgrna/u6-1::trna-sgrna串联表达盒可以实现12个靶向位点的编辑;u6-26::trna-sgrna/u6-29::trna-sgrna/u6-1::trna-sgrna/u3-b::trna-sgrna串联表达盒可以实现高达16个靶向位点的编辑。(2)通过改变表达盒两端的酶切位点(如引入同尾酶bglii和bamhi酶切连接后两个酶识别位点缺失),可以实现相同启动子驱动的trna-sgrna表达盒的多次插入,如u6-26::trna-sgrna/u6-29::trna-sgrna/u6-1::sgrna-trna/u3-b::trna-sgrna/u6-26::trna-sgrna,该串联结构中含2个u6-26::trna-sgrna表达盒,可靶向30个位点,从而实现更多的靶向位点或多个基因的组合编辑。(3)由于本发明中针对目标基因的靶向位点的组装是在中间载体中完成,因此,在将其插入cas9表达载体时,可以根据拟研究目标性状,针对相应调控目标基因进行多个表达盒的串联组装,从而灵活实现不同目标基因编辑的自由组合,达到改良多基因调控性状的目的。
2.本发明提供的基于植物细胞内源trna加工系统的sgrna表达序列可用于单子叶植物以及双子叶植物的基因编辑,利用trna-sgrna/cas9系统进行多位点基因编辑尚未在双子叶植物中被报道。将sgrna序列和拟南芥gly-trna前体trna结构序列融合形成一个多顺反子的trna-sgrna结构序列,融合的多顺反子的trna-sgrna结构序列在rna聚合酶iii启动子的驱动下表达,表达产物能被诸如烟草、甘蓝等双子叶植物细胞内源rnasep和rnasez识别并剪切,生成大量的携带靶向序列的sgrna,引导cas9核酸酶对同一基因多个位点或多个基因多个位点进行编辑。相对已有的基于crispr/cas9系统的基因编辑技术,本发明提供了一套更为高效、简便、易操作的适用于植物的多位点、多基因编辑的技术方案,该方案对多基因调控性状的研究以及农作物多性状的改良有重要意义。基于基本的生物化学原理,推断该trna-sgrna结构序列还可用于昆虫如果蝇的基因编辑,应用范围广泛。
3.本发明trna-sgrna表达序列(盒)及其载体不仅具有高效的基因编辑效率,而且其靶向作用具有较高的特异性,可实现定点的点突变。
附图说明
图1实施例1甘蓝srk3基因靶位点c区域pcr产物测序
图2实施例1甘蓝srk3基因各靶位点突变统计
图3实施例1slg3基因的靶位点与srk3基因靶位点的序列比对
图4实施例1slg3基因靶位点1突变类型统计
图5实施例2pcacas-trna-pds-abc介导的烟草ntpds基因突变的表型
图6实施例3ms1基因靶位点c区域的pcr产物测序
图7实施例3ms1基因各靶位点单克隆测序统计
图8实施例3srk3基因靶位点c区域pcr产物测序
图9实施例3srk3基因各靶位点单克隆测序统计
具体实施方式
结合以下具体实施案例,进一步说明本发明。应理解,这些实施例不用于限制本发明的范围。本实施例中所用技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段,所使用材料均可由公司购进。
实施例1利用trna-sgrna序列表达实现甘蓝自交不亲和相关基因srk的突变
1、人工合成本发明所示u6-26::trna-sgrna表达盒序列。
2、根据甘蓝自交不亲和系f416的srk3单倍型基因序列以及crispr/cas9基因编辑系统对靶位点序列要求,选取srk3基因a、b、c、d四个目标靶位点,设计如下靶位点互补引物退火为双链dna片段。
(1)srk3基因靶位点a互补引物序列:
sgsrk-1f:5-tgcagtggcagagcttctcgccaa-3
sgsrk-1r:5-aaacttggcgagaagctctgccac-3
(2)srk3基因靶位点b互补引物序列:
sgsrk-2f:5-tgcaaaccctatatccaactccac-3
sgsrk-2r:5-aaacgtggagttggatatagggtt-3
(3)srk3基因靶位点c互补引物序列:
sgsrk-3f:5-tgcagtgggatctttagagtgcat-3
sgsrk-3r:5-aaacatgcactctaaagatcccac-3
(4)srk3基因靶位点d互补引物序列:
sgsrk-4f:5-tgcaggcaataatcttgtcctcct-3
sgsrk-4r:5-aaacaggaggacaagattattgcc-3
含合成的u6-26::trna-sgrna序列的载体用bbsi酶切,将退火后的srk3基因靶位点a双链dna片段插入u6-26::trna-sgrna中,获得含有靶位点a的表达盒trna-srk-a;trna-srk-a再用bsai酶切,将退火的srk3基因靶位点b双链dna片段插入trna-srk-a,获得含有靶位点a、b的表达框trna-srk-ab;随后依次将srk基因靶位点c、d双链dna片段组装到trna-srk-ab以及trna-srk-abc中,获得含有表达4个srk基因靶位点序列的trna-srk-abcd载体。
3、用bamhi和ecori酶切含有4个靶位点的trna-srk-abcd载体,将切下的trna-srk-abcd表达盒插入pcacas9载体bamhi和ecori切后的位点,获得同时表达trna-srk-abcd序列以及cas9基因的植物共表达载体。
4、将含trna-srk-abcd序列以及cas9基因共表达载体利用液氮冻融法转化农杆菌感受态eha105后转化甘蓝下胚轴,经过多轮筛选培养获得转基因甘蓝植株。
5、对获得的29株甘蓝转基因植株的靶位点序列区域pcr产物进行测序,与对应的野生型植株pcr产物序列比对,发现29株植株的srk基因在靶位点序列区域有突变发生,编辑效率达到100%(图1)。为进一步判断发生突变的具体类型,随机挑选3株植株,将靶位点区域的pcr产物序列插入pbluescriptiisk质粒ecorv位点,挑阳性克隆进行测序(每株单克隆测序不少于5个)分析(图2)。结果表明,trna-sgrna/cas9系统能够实现单基因的多位点进行编辑。
将4个srk3基因的靶位点与f416自交不亲和系中与srk3基因高度同源的slg3基因比对后发现:在slg3基因序列中有与srk3基因靶位点d完全相同的序列;和靶位点a有两个碱基的错配;和靶位点c有五个碱基的错配。因此,在slg3基因靶位点a、c存在脱靶风险(图3)。对获得的29株转基因植株的slg3目标区域测序分析,有潜在脱靶效应的靶位点a、c未发生脱靶效应,10株转基因植株在slg3基因靶位点d发生了突变,编辑效率为34.5%。对突变植株靶位点做单克隆测序突变频率达81.3%(图4)。本案例结果表明trna-sgrna表达序列对甘蓝基因的靶向作用具有较高特异性,同时可实现导入一个trna-sgrna表达序列进行多个同源基因的敲除。
实施例2利用trna-sgrna序列表达实现烟草pds基因的突变
1、人工合成本发明所示u6-26::trna-sgrna表达盒序列。
2、根据普通烟草pds基因序列以及crispr/cas9基因编辑对靶位点序列要求,选取pds基因a、b、c共3个目标靶位点,设计如下靶位点互补引物退火为双链dna片段。
(1)ntpds基因靶位点a互补引物序列:
sgntpds1f:5-tgcagccgttaatttgagagtcca-3
sgntpds1r:5-aaaccggactctcaaattaacggc-3
(2)ntpds基因靶位点b互补引物序列:
sgntpds2f:5-tgcagctgcatggaaagatgatga-3
sgntpds2r:5-aaactcatcatctttccatgcagc-3
(3)ntpds基因靶位点c互补引物序列:
sgntpds3f:5-tgcagaggcaagagatgtcctagg-3
sgntpds3r:5-aaaccctaggacatctcttgcctc-3
含合成的u6-26::trna-sgrna序列的载体用bbsi进行酶切,将退火后的ntpds基因靶位点a双链dna片段插入u6-26::trna-sgrna中,获得含有靶位点a的表达盒trna-pds-a;获得的trna-srk-a再用bsai酶切,将退火后的ntpds基因靶位点b双链dna片段插入,获得含有靶位点a、b的表达框trna-pds-ab;将退火后的ntpds基因靶位点c双链dna片段插入trna-pds-ab载体的bsmbi位点,获得含有表达3个ntpds基因靶位点序列的trna-sgrna-abc载体。
3、将含有ntpds基因靶位点的trna-sgrna-abc载体用bamhi和ecori酶切下表达盒插入到pcacas9载体bamhi和ecori切后的位点,获得同时表达针对烟草ntpds基因的trna-sgrna-abc序列以及cas9基因的植物共表达载体。
4、将含trna-sgrna-abc序列以及cas9基因共表达载体利用液氮冻融法转化农杆菌感受态eha105后转化烟草叶盘,经过多轮筛选培养获得转基因烟草植株。
八氢番茄红素脱氢酶(pds)基因编码植物类胡萝卜素合成关键酶,敲除该基因可使植物叶绿素合成受阻而出现白化现象,突变容易被发现,快速判断是否发生基因功能丧失(图5)。将转化叶盘数、出现白化芽的叶盘数、分化出的愈伤数、出现白化的愈伤数、愈伤中突变位点数作为参数进行统计(表5)。观察比较pcacas-trna-pds-abc介导的ntpds基因的叶盘突变率达到100%,获得的抗除草剂愈伤的突变率为94.2%。说明trna-sgrna/cas9系统能够高效的编辑烟草基因组。
表5pcacas-trna-pds-abc编辑烟草ntpds基因的统计
实施例3利用trna-sgrna序列表达实现甘蓝ms1基因以及srk基因的双突变
1、人工合成本发明所示u6-26::trna-sgrna表达盒序列。
2、根据甘蓝自交不亲和系f416的ms1基因(雄性不育相关基因)序列以及crispr/cas9基因编辑系统对目标靶位点序列要求,选取ms1基因中a、b、c、d四个目标靶位点,设计如下靶位点互补引物退火为双链dna片段。
(1)ms1基因靶位点a互补引物序列:
sgms1-1f:5-tgcagcctttctaaaactagaagg-3
sgms1-1r:5-aaacccttctagttttagaaaggc-3
(2)ms1基因靶位点b互补引物序列:
sgms1-2f:5-tgcagagtagcaaaaggagagccg-3
sgms1-2r:5-aaaccggctctccttttgctactc-3
(3)ms1基因靶位点c互补引物序列:
sgms1-3f:5-tgcagaggttaagagaggcttcga-3
sgms1-3r:5-aaactcgaagcctctcttaacctc-3
(4)ms1基因靶位点d互补引物序列:
sgms1-4f:5-tgcaaagttggtcctttcagctcg-3
sgms1-4r:5-aaaccgagctgaaaggaccaactt-3
合成的u6-26::trna-sgrna序列通过下述引物进行pcr扩增:u6-26fx:5’-cctctagattcgttgaacaacggaaactcgact-3’;trna-r1:5’-gaggatccattcgaagggacaaaaaaaaagcaccg-3’。在其pcr扩增产物两端分别导入xbai和bamhi位点,pcr产物插入pbluescriptiisk质粒的ecorv位点处,获得u6-26::trna-sgrna表达盒5’为xbai位点,3’为bamhi位点的载体。该载体用bbsi进行酶切,将退火后的ms1基因靶位点a双链dna片段插入u6-26::trna-sgrna中,获得含有靶位点a的表达盒trna-ms1-a;再用bsai酶切trna-ms1-a,将退火后的ms1基因靶位点b双链dna片段插入trna-ms1-a,获得含有靶位点a、b的表达框trna-ms1-ab;依次将ms1基因靶位点c、d双链dna片段组装到trna-ms1-ab以及trna-ms1-abc,获得含有表达4个ms1基因目标靶位点序列的trna-ms1-abcd载体。
3、将trna-ms1-abcd载体用xbai和bamhi切下含有ms1基因4个靶位点序列表达盒插入到案例1中含trna-srk-abcd序列、cas9基因共表达载体的xbai和bamhi切后位点,获得同时表达trna-ms1-abcd序列、trna-srk-abcd序列以及cas9基因的植物共表达载体。
4、将含trna-ms1-abcd序列、trna-srk-abcd序列以及cas9基因共表达载体利用液氮冻融法转化农杆菌感受态eha105后转化甘蓝下胚轴,经过多轮筛选培养获得转基因甘蓝植株。
5、首先对获得的18转基因植株的ms1基因的靶位点序列区域进行pcr扩增片段的测序,与野生型植株pcr产物序列比对发现,有5株转基因植株ms1基因的靶位点序列区域发生了突变,编辑效率达到27.8%(图6)。为了进一步判断发生突变的具体类型,pcr克隆5株植株靶位点区域序列,插入pbluescriptiisk质粒的ecorv位点处,挑选阳性克隆进行测序分析。
结果发现ms1基因在4个靶位点均有突变发生,其中有1个单株在两个靶位点同时发生了突变(图7)。另外,对ms1基因已经发生突变的5株植株中的srk3基因进行突变检测。首先设计引物对srk3基因4个靶位点区域序列进行扩增,扩增产物pcr测序后与从野生型植株获得的pcr产物序列进行比对,发现已经检测到ms1基因突变的5株转基因甘蓝植株中均发生了srk3基因的突变(图8)。进一步的克隆测序分析显示在srk3基因的4个位点均发生了碱基插入以及缺失等类型突变(图9)。其中在2个靶位点发生突变的有3株,3个靶位点发生突变的l株,4个靶位点均发生突变的1株。
上述结果显示,将多个trna-sgrna表达盒序列进行串联表达,可以在同一植株中实现多个基因的突变。
上述实施例为本发明的具体实施提供了参考,在本发明的基础上做出一些改进或修改,但不偏离本发明精神同样属于本发明要求保护的范围。
sequencelisting
<110>西南大学
<120>一种基于内源trna加工系统的多靶序列sgrna表达载体及其在植物基因编辑中的应用
<160>
<210>1
<211>757
<212>trna-sgrna表达序列
<213>artificial(人工序列)
<220>
<221>
<222>(1)..(77)
<223>拟南芥gly-trna序列
<222>(78)..(99)
<223>typeii内切酶bbsi
<222>(100)..(185)
<223>sgrna序列
<222>(186)..(262)
<223>拟南芥gly-trna序列
<222>(263)..(282)
<223>typeii内切酶bsai
<222>(283)..(368)
<223>sgrna序列
<222>(369)..(445)
<223>拟南芥gly-trna序列
<222>(446)..(465)
<223>typeii内切酶bsmbi
<222>(466)..(551)
<223>sgrna序列
<222>(552)..(628)
<223>拟南芥gly-trna序列
<222>(629)..(654)
<223>typeii内切酶bfuai
<222>(655)..(740)
<223>sgrna序列
<400>1
aacaaagcaccagtggtctagtggtagaatagtaccctgccacggtacagacccgggttc60
gattcccggctggtgcagggtcttcgttacagaagacctgtttcagagctatgctggaaa120
cagcatagcaagttgaaataaggctagtccgttatcaacttgaaaaagtggcaccgagtc180
ggtgcaacaaagcaccagtggtctagtggtagaatagtaccctgccacggtacagacccg240
ggttcgattcccggctggtgcaagagaccctgcagggtctctgtttcagagctatgctgg300
aaacagcatagcaagttgaaataaggctagtccgttatcaacttgaaaaagtggcaccga360
gtcggtgcaacaaagcaccagtggtctagtggtagaatagtaccctgccacggtacagac420
ccgggttcgattcccggctggtgcaagagacggttacacgtctctgtttcagagctatgc480
tggaaacagcatagcaagttgaaataaggctagtccgttatcaacttgaaaaagtggcac540
cgagtcggtgcaacaaagcaccagtggtctagtggtagaatagtaccctgccacggtaca600
gacccgggttcgattcccggctggtgcaaatcgcaggtgttacaacctgcattcgtttca660
gagctatgctggaaacagcatagcaagttgaaataaggctagtccgttatcaacttgaaa720
aagtggcaccgagtcggtgctttttttttgtcccttc757
<210>2
<211>1212
<212>trna-sgrna表达盒序列
<213>artificial(人工序列)
<220>
<221>
<222>(1)..(6)
<223>限制性内切酶识别位点
<222>(7)..(449)
<223>atu6-26启动子
<222>(1207)..(1212)
<223>限制性内切酶识别位点
<400>2
ggatcccgttgaacaacggaaactcgacttgccttccgcacaatacatcatttcttctta60
gctttttttcttcttcttcgttcatacagtttttttttgtttatcagcttacattttctt120
gaaccgtagctttcgttttcttctttttaactttccattcggagtttttgtatcttgttt180
catagtttgtcccaggattagaatgattaggcatcgaaccttcaagaatttgattgaata240
aaacatcttcattcttaagatatgaagataatcttcaaaaggcccctgggaatctgaaag300
aagagaagcaggcccatttatatgggaaagaacaatagtatttcttatataggcccattt360
aagttgaaaacaatcttcaaaagtcccacatcgcttagataagaaaacgaagctgagttt420
atatacagctagagtcgaagtagtgattgaacaaagcaccagtggtctagtggtagaata480
gtaccctgccacggtacagacccgggttcgattcccggctggtgcagggtcttcgttaca540
gaagacctgtttcagagctatgctggaaacagcatagcaagttgaaataaggctagtccg600
ttatcaacttgaaaaagtggcaccgagtcggtgcaacaaagcaccagtggtctagtggta660
gaatagtaccctgccacggtacagacccgggttcgattcccggctggtgcaagagaccct720
gcagggtctctgtttcagagctatgctggaaacagcatagcaagttgaaataaggctagt780
ccgttatcaacttgaaaaagtggcaccgagtcggtgcaacaaagcaccagtggtctagtg840
gtagaatagtaccctgccacggtacagacccgggttcgattcccggctggtgcaagagac900
ggttacacgtctctgtttcagagctatgctggaaacagcatagcaagttgaaataaggct960
agtccgttatcaacttgaaaaagtggcaccgagtcggtgcaacaaagcaccagtggtcta1020
gtggtagaatagtaccctgccacggtacagacccgggttcgattcccggctggtgcaaat1080
cgcaggtgttacaacctgcattcgtttcagagctatgctggaaacagcatagcaagttga1140
aataaggctagtccgttatcaacttgaaaaagtggcaccgagtcggtgctttttttttgt1200
cccttcgaattc1212
<210>3
<211>353
<212>u6-29启动子
<213>artificial(人工序列)
<400>3
ctgatagattgtatatccatgtttagttggattaaatatcaaagatctcttacagttagt60
ttcgttcttaatccaaactactgcagcctgacagacaaatgaggatgcaaacaattttaa120
agtttatctaacgctagctgttttgtttcttctctctggtgcaccaacgacggcgttttc180
tcaatcataaagaggcttgttttacttaaggccaataatgttgatggatcgaaagaagag240
ggcttttaataaacgagcccgtttaagctgtaaacgatgtcaaaaacatcccacatcgtt300
cagttgaaaatagaagctctgtttatatattggtagagtcgactaagagattg353
<210>4
<211>313
<212>u6-1启动子
<213>artificial(人工序列)
<400>4
ccgtgggagaaatctcaaaattccggcagaacaattttgaatctcgatccgtagaaacga60
gacggtcattgttttagttccaccacgattatatttgaaatttacgctgagtgtgagtga120
gacttgcataagaaaataaaatctttagttgggaaaaaattcaataatataaatgggctt180
gagaaggaagcgagggataggcctttttctaaaataggcccatttaagctattaacaatc240
ttcaaaagtaccacatcgcttaggtaaagaaagcagctgagtttatatatggttagagac300
gaagtagtgattg313
<210>5
<211>325
<212>u3-b启动子
<213>artificial(人工序列)
<400>5
tttactttaaattttttcttatgcagcctgtgatggataactgaatcaaacaaatggcgt60
ctgggtttaagaagatctgttttggctatgttggacgaaacaagtgaacttttaggatca120
acttcagtttatatatggagcttatatcgagcaataagataagtgggctttttatgtaat180
ttaatgggctatcgtccatagattcactaatacccatgcccagtacccatgtatgcgttt240
catataagctcctaatttctcccacatcgctcaaatctaaacaaatcttgttgtatatat300
aacactgagggagcaacattggtca325
<210>6
<211>527
<212>甘蓝srk3基因靶位点区域序列:>srk3
<213>artificial(人工序列)
<400>6
gacattgtccgacagaacctatgtatggattgccaacagagataaccctatatccaactc60
cactggaaccctcaaaatctcaggcaataatcttgtcctccttggtgactccaataaacc120
tgtttggtcgacgaatctaactagaagaagtgagagatctccagtggtggcagagcttct180
cgccaacggaaacttcgtgatgcgagactccaacaacaacgatgcaagtcaatttttatg240
gcaaagtttcgattaccctacagatactttgcttcctgacatgaaactgggttacgacct300
aaaaacagggctggacagattccttacatcatggagaagtttagatgatccgtcaagcgg360
gaatttctcgtacaggctcgaaacccgaaagtttcctgaattttatttaaggagtgggat420
ctttagagtgcatcggagtggtccatggaatggaatccgatttagtggcataccagatga480
ccaaaagttgagttacatggtttacaatttcacagataatagtgaag527
<210>7
<211>4543
<212>烟草ntpds基因靶位点区域序列:>ntpds
<213>artificial(人工序列)
<400>7
aaacagttgagtacttctttaatccttcctaattctttgtcaggggtatctttttgtggg60
taacggccaaaccaccacaaatttccagttcccacttttaactctttaacttcaattcaa120
ctagtttatttccttttgcttcctacaactataacatagtcttggtttcagaatccacaa180
cttgaaatacaactcctaggcggtttcattccgaggtaagaaatgattttgcttttcttt240
ggttacatcagctgaatgctttacttgagaaaagctttctctttttttcctttctttgat300
gtgtaccgcccgtttatgatcttggtatttgctcttttttgtactcgtccggactttaac360
ttgattttgtgggtgaagtattaaaacaagttttatatggactgtaaaagctagaatctt420
ttttacttttgcatataaatttgtataataaatgcttatgaacctgcatataaatttgta480
taataaatgcatatggccatttgaaaaagaaaaggaattccacatagtatttagattcac540
aagtgggacaatcttcttacactgaaatatctttatgtcaggcttaatttaccgctattt600
tgctcagtaaaatgccccaaattggacttgtttctgccgttaatttgagagtccaaggta660
attcagcttatctttggagctcgaggtcttcgttgggaactgaaagtcaagatggtcgct720
tgcaaaggaatttgttatgttttggtagtagcgactccatggggcataagttaaggattc780
gtactcccagtgccacgaccagaagattgacaaaggactttaatcctttaaaggtttgtt840
ttgaatgcgaaagtgtgatgatggatttatggtcattgaatttatgatcttgggcatata900
ttctctaaaataagagaagtatatcttgccattcaggtagtctgcattgattatccaaga960
ccagagctagacaatacagttaactatttggaggcggcgttattatcatcatcatttcgt1020
acttcctcacgcccaactaaaccattggagattgttattgctggtgcaggtgattttttc1080
cggtcatctatatttgtagtcttcatttctctttcttcggaaggaagatcattctattag1140
ttgtattatcactagaatatttacctgggcattcttttctgattaactgttttggaccgc1200
aaaattttaggttcttacttcttcgccattttgcaactaatcaacaagtcccagctgatt1260
agattaggagcggtttgaaaattcgtttgttttgatctatttttgccgtcactccattta1320
tatacatatctattctctcttatcatctgagccatgataagcaggtgaacgtgctgtcta1380
ttgggtggcatgtccaaaggatcattctgaaatattggaggctaatgaatcaatatcttg1440
tgcaagattgatctcactatacctataatcagagtacttagagttccaaaaatttcaaaa1500
ccaattgaaaagtcaaacgagttacatataggggttgcactcttctaaggcttgcaatct1560
gtgagaaaaagatgagaaggagatcttcatatttcatctttactagtctggaccactgac1620
cggttagcagttttcaacgtgttcttcaacttggcttgcaaaatactgtgccggtcattt1680
ctcttgtattgtcatcaactggttgattatctgagtacctaaagaaagaatgttatatgc1740
atgattcattctgctgtactataaaagatataataaagaatgctagccgaggtactacat1800
agccttttccaataaatagaagctgtaacatgattctaattcattttttttgcaatatca1860
ggtttgggtggtttgtctacagcaaaatatctggcagatgctggtcacaaaccgatattg1920
ctggaggcaagagatgtcctaggtggaaaggtgaagaagatccagtctttcctttaattt1980
tattcctttttcttttgtgtccttccctattgatagtcccttttcaggaaggcttctgtt2040
tgttttatttaaaatcatttttcatactctttaaacattcagttgctcaaacaattgcaa2100
gggtgttcactattcctattcntatatatatatctgtttttggaggaaattgatatgtcc2160
taaaattttccagctttactactaataaagttggttgtcgaaaaattatacagcatatta2220
ggtaaaagatatggaaagtatattattatcattctctattattttatgattcagtcaatt2280
ttacccgtcctgttgggtgtatttctcgtataaatacagtcttatctgtgagatgctatg2340
tgaattagctgttgttttcagtatagaacactatcttagtctgttttatcttactgaagc2400
agtcaccaagaatctagctgtataggctaaaatattgaattagcattaatctttatctgt2460
tctgcacctgaatacttatacctcccttttaggtagctgcatggaaagatgatgatggag2520
attggtatgagactgggttgcatatattctgtaagtttgactcctcaagaatgcgtactt2580
taatcttctaatacagtcatagcaatttctttcaagatcttttttgtccattaatcagat2640
agcaatccctgtttgtcttttgttttttgcaaataaccaatttttgtcagtcgatctgta2700
ttctgccttgcctctcttttttcatctgttaatttcgtatggtgactcatacaagttggt2760
gcatctcctttaagttggggcttacccaaatatgcagaacctgtttggagaactagggat2820
taacgatcgattgcagtggaaggaacattcaatgatatttgcgatgcctaacaagccagg2880
ggaattcagccgctttgattttcctgaagctcttcctgcgccattaaatggtaagtactt2940
aatcatgagtaaattttttcccttctgtattgaatattgattatgcaaacttccccagta3000
aggtatgaaattgattagtccattaatacctctggcgcattgctaacattaaaagaacat3060
aaaggttcattacgtcttgatcagaatttctgcatgtagctaaagtgattgagtgtatgt3120
acaaatttttacacattgcaagcataagccagttattgttatctcttattttcatttctc3180
tagctgtatctcttattctcatttctctatctatgtgttattacttctacaggaattttg3240
gccatactaaagaacaatgaaatgcttacatggcccgaaaaagtcaaatttgctattgga3300
ctcttgccagcaatgcttggagggcaatcttatgttgaagctcaagacggtttaagtgtt3360
aaggactggatgagaaagcaagtgcgtgatcattttatcttactcttttagctcataacc3420
ttgaagacatagttgacttgcaagttgttgatttaacatgttagaaatgtctacctgcct3480
ttccttttctaacaacatacatcttgcaaaactcatcagcagctatttgcttaattgctt3540
ttcagggtgtgcctgatagggtgacagatgaggtgttcattgccatgtcaaaggcactta3600
acttcataaaccctgacgagctttcgatgcagtgcattttgattgctttgaacagatttc3660
ttcaggttagaatcctgatccaccctcaaaacaaaaagagagaaagggatatagtcctac3720
caaagctgtaaatcatgtttgggacctgacatattggtgcaggaaacttatgagtgaact3780
tgtccactcagtttaacttttctgatatatttgaattatcaatttgcaggagaaacatgg3840
ttcaaaaatggcctttttagatggtaaccctcctgagagactttgcatgccgattgttga3900
acatattgagtcaaaaggtggccaagtcagactaaactcacgaataaaaaagattgagct3960
caatgaggatggaagtgtcaaatgttttatactgaataatggcagtacaattaaaggaga4020
tgcttttgtgtttgccactccaggtataatatccattatactagtatcgatgcttccagt4080
tttcacatttttaatatgaatttataaatttttgctggcttttgattatccgattagtgg4140
atatcttcaagcttcttttgcctgaagactggaaagagatcccatatttccaaaagttgg4200
agaagctagtgggagttcctgtgataaatgtccatatatggttagtgatgaaaattttac4260
ttgtcagtgtttgttcttcctctagcatatctatgtatgtgcgtgtaaatgtctatacgt4320
acataaacatgtagtcctctgtttttgtgttaacttccattgaatgaggaacttatggat4380
gtacgcttttccaaaactttgattggacacattgctttgtgttttcaactttgatgagca4440
gaactaccattgtttagctattagtggttgagattcctattgaaaagatttgtataaatt4500
taatttgcaggtttgacagaaaactgaagaacacatctgataa4543
<210>8
<211>1699
<212>甘蓝ms1基因靶位点区域序列:>boms1
<213>artificial(人工序列)
<400>8
atgtcgaatctgattcgaacagatcttccaaagaagaggaagagaggagaaagtacggtt60
tttaggctgaagactttcggagagacaggacatcccgctgagctgaaccagttgtctttt120
agagacaaccttgggaagcttcttgagtttggtcactttgagagctccggtctcatggga180
agttggtcctttcagctcgaggttcatcgtcacccaaatcctctatatgttcttctcttt240
gtcgtcgaagagcccatcgaagcctctcttaacctccgttgcaaccattgccaatatgtt300
ggtgacgtcatctccctctttctctccacttctctcattgtctatatatattttgcatat360
cgatatctatctatctatatgtgtgtgtgcatgctgatacatccataatatgatcaacga420
tcacaacgtaacaataaaaagacctgataagataatttagctcaccgagtaagcattttt480
cgttgcatatctatgaaaaatataacaagcggaaaaaaaaatgatatggtgatccaagag540
tgttggaggctcaacctcttttagaaggatgatagtttcattgattcaaatttcatatgt600
taattttaatatgttacatgtaataggtcaacaatatgtattatgcatttatttatggaa660
cattacaggttggggaaaccacatgatatgcaacaagaagtaccatttcgtgatcccctc720
aaaggaaacaatggccgcctttctaaaactagaaggaggaatcttggtttctcccgaaaa780
agaaagcctctcccatcttgtggaacttcaaggccatgtccttcacggctttttccactc840
caacggatttggtcacttgctctcaatcaatggcatcgagtccggttccgacttaaccgg900
tcatcaagtcatggagttgtgggatcgcctctgctctggtttaaaggccaggtatacgta960
ttaagattataattatcatcttttatatttgtatacgttgtgcaatgttcacgtgataca1020
tatcatatggtactaaaccattcagcagaattctatgacttgtcataaataataaagttt1080
ggatttttaaccatttaattcatggtagtcaagtgctttgaagattcaacacatggttga1140
gagcaatttcaaccatactagtaactttgttaactcaagaaaccaccactttatagaact1200
tgggacgaaattctggattttagtttcgaattatagatattattcgaattttctcttttg1260
cttttagttataaatttcacatattaggccattttattagaaatggtaacaattatttgt1320
atcttattatgttatggtatatatgttggatataggaaaatagggttgaacgatgcatcg1380
cacaagaaagggatggaactgaggctgctgcatggagtagcaaaaggagagccgtggttc1440
ggtcgttggggttaccggttcgggtcagggacatacggagtgactcaaaagatttacgag1500
aaggcacttgagtcggtccgcaacgtacccttgtgtttgcttaaccatcacctaaccagc1560
cttaaccgtgagactccaatcctcttgtcaaggtatcaaactttatccaccgagccattg1620
attactctcagtgatctcttcatgttcatgcttcatctccattcgcgtcttccaagagac1680
aactacatgaataactccc1699
<210>9
<211>13969
<212>pcacas9植物表达载体序列:>pcacas9
<213>artificial(人工序列)
<400>9
gaattcctcgagtacgtaggatccatttaaattctagaggcgcgccgatatcctctctta60
aggtagcgagctcttaattaatagggataacagggtaattaactataacggtcctaaggt120
agcgatggcaaacagctattatgggtattatgggtggttctttatgcggacactgacggc180
tttatgcctgcaggtcgcgagcgatcgcggtaccgcccgggcgtcgacaggcctgatcta240
gtaacatagatgacaccgcgcgcgataatttatcctagtttgcgcgctatattttgtttt300
ctatcgcgtattaaatgtataattgcgggactctaatcataaaaacccatctcataaata360
acgtcatgcattacatgttaattattacatgcttaacgtaattcaacagaaattatatga420
taatcatcgcaagaccggcaacaggattcaatcttaagaaactttattgccaaatgtttg480
aacgatctgcagtcacttcttcttcttagcctgtccagccttcttggtagcagctggtct540
cttatctcctccaagctgagaaagatcgattctggtctcgtaaagtccggtgatagactg600
gtggataagggtagcatcaagaacctccttggtagaggtgtatctttttctatcgatggt660
ggtatcgaagtacttgaaagcagctggagcaccaaggttggtaagggtgaaaaggtggat720
gatgttctcagcctgctctctgattggcttatctctgtgcttgttgtaagcagaaagaac780
cttatcaaggttagcatcagcaaggataactctcttagagaactcagagatttgctcgat840
gatctcatcaaggtagtgcttgtgctgctcaacgaaaagctgcttctgctcgttatcctc900
tggagatcccttcaacttctcgtagtgagaagcaaggtaaaggaagttaacgtacttaga960
tggaagagcaagctcgtttcccttctgaagctctccagcagaagcaagcattctctttct1020
tccgttctcaagctcgaaaagagagtactttggcaacttgatgataagatccttcttaac1080
ctccttgtatcccttagcctcaaggaaatcgattgggttcttctcgaaagaagaacgctc1140
catgatggtgattccaagaagctccttaacagacttcaacttcttagactttcccttctc1200
aaccttagcaacaacaagaacagagtaagcaacggttggagaatcgaatcctccgtactt1260
ctttgggtcccaatccttctttctagcgatcaacttatcagagtttctctttggaaggat1320
agactccttagagaatcctccggtctgaacctcggttttcttaacgatgttaacctgtgg1380
catagaaagaacctttctaacggtagcgaaatctcttcccttatcccaaacgatctctcc1440
ggtctctccgttggtctcgataagtggtctctttctgatctctccgttagcaagggtgat1500
ctcggtcttgaagaagttcatgatgttagagtagaagaagtacttagcggtagcctttcc1560
gatctcctgctcagacttagcgatcatctttctaacatcgtaaaccttgtaatctccgta1620
aacgaactcagactccaactttgggtacttcttgataagagcggttccaacaacagcgtt1680
aaggtaagcatcgtgagcgtggtggtagttgttgatctctctaaccttgtagaactggaa1740
atcctttctgaaatcagaaaccaacttagacttcaaggtgataaccttaacctctctgat1800
caacttatcgttctcatcgtacttggtgttcatacgagaatcaaggatctgagcaacgtg1860
cttggtgatctgtctggtctcaacaagctgtctcttgatgaatccagccttatcaagctc1920
agaaagtcctcctctctcagccttggtaaggttatcgaactttctctgggtgatcaactt1980
agcgttaagaagctgtctccagtagttcttcatcttcttaacaacctcctcagatggaac2040
gttatcagactttcctctgttcttatcagaacgggtaagaaccttgttatcgatagaatc2100
atccttcaagaaagactgtggaacgatgtgatcaacatcgtaatcagaaagtctgttgat2160
gtcaagctcctgatcaacgtacatatctcttccgttctgaaggtagtaaaggtacaactt2220
ctcgttctgaagctgggtgttctcaactgggtgctccttcaagatttgagatccaagctc2280
cttgattccctcctcgattctcttcattctctcacgagagttcttctgtcccttctgggt2340
ggtctggttctctctagccatctcgataacgatgttctctggcttgtgtctacccataac2400
cttaacaagctcatcaacaaccttaacggtctgaaggattcccttcttgatagctggaga2460
tccagcaaggttagcgatgtgctcgtgaagagaatctccctgtccagaaacctgagcctt2520
ctggatgtcctccttgaaggtaagagaatcatcgtggataagctgcatgaagtttctgtt2580
agcgaatccatcagacttcaagaaatcaaggatggtctttccagactgcttatctctgat2640
tccgttgatcaacttacgagaaagtctaccccatccggtgtatcttcttctcttcaactg2700
cttcataaccttatcatcgaaaaggtgagcgtaggtcttgagtctctcctcgatcatctc2760
tctatcctcgaaaagggtaagggtaagaacgatgtcctcaaggatgtcctcgttctcctc2820
gttatcaaggaaatccttatccttgatgatcttcaaaagatcgtggtaggttccaagaga2880
agcgttgaatctatcctcaactccagagatttcaacagaatcgaagcactcgatcttctt2940
gaagtaatcctccttcaactgcttaacggtaacctttctgttggtcttgaaaagaagatc3000
aacgatagccttcttctgctctccagaaaggaaagctggctttctcattccctcggtaac3060
gtacttaaccttggtaagctcgttgtaaacggtgaagtactcgtaaagaagagagtgctt3120
tggaagaaccttctcgtttggaaggttcttatcgaagttggtcattctctcgatgaaaga3180
ctgagcagaagctcccttatcaacaacctgcacatcaacaaattttggtcatatattaga3240
aaagttataaattaaaatatacacacttataaactacagaaaagcaattgctatatacta3300
cattcttttattttgaaaaaaatatttgaaatattatattactactaattaatgataatt3360
attatatatatatcaaaggtagaagcagaaacttacctcctcgaagttccaaggggtgat3420
ggtctcctcagactttctggtcatccaagcgaaacgagagtttcctctagcaagtggtcc3480
aacgtagtatgggattctgaaggtaaggatcttctcgatcttctctctgttatccttcaa3540
gaatgggtagaaatcctcctgtctacgaaggatagcgtgaagctctccaaggtggatctg3600
gtgtgggatagatccgttatcgaaggttctctgctttctaagaagatcctctctgttcaa3660
cttaacaagaagctcctcggttccatccatcttctcaaggattggcttgatgaacttgta3720
gaactcctcctgagaagctcctccatcgatgtatccagcgtatccgttcttagactgatc3780
gaagaagatttccttgtacttctctggaagctgctgtctaacaagagccttcaaaagggt3840
aagatcctggtggtgctcatcgtatctcttgatcatagaagcagaaagtggagccttggt3900
gatctcggtgttaactctaaggatgtcagaaagaaggatagcatcagaaaggttcttagc3960
agcaaggaaaagatcagcgtactgatctccgatctgagcaagaaggttatcaagatcatc4020
atcgtaggtatccttagaaagctgcaacttagcatcctcagcaagatcgaagttagactt4080
gaagtttggggtaagtccaagagaaagagcgataaggtttccgaaaagtccgttcttctt4140
ctctcctggaagctgagcgataaggttctcaagtctacgagacttagaaagtctagcaga4200
aaggatagccttagcatcaactccagaagcgttgattgggttctcctcgaaaagctggtt4260
gtaggtctgaacaagctggatgaacaacttatcaacatcagagttatctgggttaaggtc4320
tccctcgataaggaagtgtcctctgaacttgatcatgtgagcaagagcaaggtagataag4380
tctaagatcagccttatcggtagaatcaaccaacttctttctaaggtggtagatggttgg4440
gtacttctcgtggtaagcaacctcatcaacgatgtttccgaagattgggtgtctctcgtg4500
cttcttatcctcctcaacaaggaaagactcctcaagtctgtggaagaaagaatcatcaac4560
cttagccatctcgttagagaagatttcctgaaggtagcagattctgttctttcttctggt4620
gtatcttcttctagcggttctcttcaatctggtagcctcagcggtctctccagaatcgaa4680
aagaagagcaccgataaggttcttcttgatagagtgtctatcggtgtttccaagaacctt4740
gaacttcttagatggaaccttgtactcatcggtgataacagcccatccaacagagttggt4800
tccgatgtcaagtccgatagagtacttcttatcagcagctggaactccgtggattccaac4860
ctttctcttcttctttggagccatcttatcatcatcatccttgtaatccttatcatcatc4920
atccttgtaatccatggtggaagtatttgaaagaaaattaaaaataaaaagatctcctct4980
ccaaatgaaatgaacttccttatatagaggaagggtcttgcgaaggatagtgggattgtg5040
cgtcatcccttacgtcagtggagatatcacatcaatccacttgctttgaagacgtggttg5100
gaacgtcttctttttccacgatgctcctcgtgggtgggggtccatctttgggaccactgt5160
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caccttccttttccactatcttcacaataaagtgacagatagctgggcaatggaatccga5280
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