本发明属于微生物技术领域,具体涉及一株拮抗根腐的芽孢杆菌菌株。
背景技术:
根腐病是一种系统感染病害,是来蒙、大豆、小麦、番茄、棉花、草莓等植物的常见土传病害,在美国、加拿大、澳大利亚、中国等是一个日益突出的问题。植株由于根腐病,叶片变小,缺少光泽,枝条矮化,果实瘦小,或叶片变黄萎蔫,严重时植株逐渐枯死。根腐病的主要病原种群是尖孢镰刀菌fusariumoxysporum和腐皮镰刀菌fusariumsolani,防治的方法有化学试剂、真菌剂、生物防治、植物性治疗药物、优化施肥等,而采用生防菌控制根腐病是综合防治的一条重要措施。
多种真菌、细菌和一些放线菌都可应用于真菌病害的生物防治,拮抗性细菌有短短芽孢杆菌、绿叶假单胞菌、枯草芽孢杆菌等。细菌在植物生物防治中的应用研究已广泛开展,并取得良好的应用效果。但是,这些细菌对植物根腐病却没有很好的防治效果。
因此,筛选到防效好、适应性广的生防菌是植物根腐病生物防治工作面临的关键问题。
技术实现要素:
本发明的目的在于寻找专治根腐病的细菌,解决根腐病的生物防治问题。
为了实现以上目的,本发明的技术方案如下:
拮抗根腐的芽孢杆菌,所述的芽孢杆菌为枯草芽孢杆菌fjat-20265(bacillussubtilisfjat-20265),保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏编号cgmccno.14430,保藏日期为2017年7月17日,保藏地址为中国北京市中国科学院微生物研究所。
芽孢杆菌fjat-20265的菌落形态为:菌落较小、圆形、乳白色、表面光滑且湿润、隆起、边缘整齐、不透明。
芽孢杆菌fjat-20265对镰刀菌有较强的拮抗作用,包括尖孢镰刀菌fjat-30512、腐皮镰刀菌fjat-176和串珠镰刀菌fjat-165。
本发明的有益效果是:
(1)从高海拔地区的土壤中筛选到的芽孢杆菌fjat-20265,对根腐病主要病原菌镰刀菌具有很强的抑制效果,可专门用于防治根腐病。
(2)芽孢杆菌fjat-20265是根腐病主要病原菌的拮抗菌,是一种对环境友好、经济有效的防治病害的生防菌。它能产生具有较强抗逆性的内生孢子(芽胞),能耐盐、耐酸、耐高温且易于保存和运输,有利于快速实现商品化生产。
附图说明
图1芽孢杆菌fjat-20265的菌落形态
图2芽孢杆菌fjat-20265的16srrna序列鉴定结果的进化树
具体实施方式
下面结合附图和具体实施方式对本发明做进一步详细说明。
实施例1拮抗菌株的筛选
1.土样采集与芽孢杆菌分离纯化
从可可西里采集的草根土土壤样本风干,研磨后,制成土壤悬浊液,再经过无菌水适当稀释,涂布na平板;30℃培养72h,挑取单菌落,甘油保存,作为待测菌株。采用稀释涂板法分离纯化得到了63株菌株作为待测菌株。
2.尖孢镰刀菌生防菌株的筛选
(1)对峙法初筛
供试菌株番茄寄主尖孢镰刀菌fusariumoxysporumfjat-30512(保存在福建省农业科学院农业生物资源研究所),于牛肉膏蛋白胨培养基(na:牛肉膏3g,蛋白胨5g,葡糖糖10g,琼脂粉1.7%,ph7.2-7.4)平板上活化,30℃恒温培养48h。尖孢镰刀菌fjat-30512于马铃薯葡萄糖琼脂培养基(pda:马铃薯200.0g·l-1,蔗糖20.0g·l-1,琼脂17.5g·l-1)上活化,28℃恒温培养48h。将活化后的fjat-30512接种于pda平板上,28℃培养120h至菌丝长满整个平板,然后用直径7mm的打孔器在菌饼上打下小菌圈,置于pda平板的正中间,再在距离小菌圈外围22mm的地方划线接种供试菌株。28℃恒温培养120h,观察菌株对尖孢镰刀菌fjat-30512的抑制效果。
从可可西里土壤样品分离纯化得到的63株菌株,进行平板对峙法初筛获得了14株对尖孢镰刀真菌fjat-30512有拮抗作用的菌株,菌株编号为:fjat-19699、fjat-19700、fjat-19704、fjat-19708、fjat-19711、fjat-20239、fjat-20264、fjat-20265、fjat-20267、fjat-21720、fjat-21739、fjat-21888、fjat-21902、fjat-22554。
(2)抑菌圈法复筛
将初筛中对尖孢镰刀菌具有抑制作用的14株菌株进行抑菌圈法复筛。将供试菌株接种到na平板上,再把单菌落接到500μlna液体培养基中,170r·min-130℃恒温培养48h。将5ml尖孢镰刀菌fjat-30512的菌悬液(菌落密度4.0×108cfu·ml-1)与200ml50℃的pda半固体培养基混合后,倒入已制备好的pda固体培养基,制成含病原菌的双层平板;待培养基凝固后,用直径7mm的打孔器在平板上打孔,在孔内加入100μl供试菌株培养液,阴性对照为100μl无菌水,阳性对照为100μl潮霉素(质量浓度为5μg·ml-1),每个供试菌株重复3次,28℃恒温培养5d,用直径交叉法测量抑菌圈直径。这14株菌株的抑菌效果如表1所示。
表1芽孢杆菌对尖孢镰刀菌fjat-30512的抑菌作用
注:fjat-8784为对照菌株,保藏于瑞典哥德堡大学菌种保存中心(ccug),编号ccug163。
3.腐皮镰刀菌生防菌的筛选
将对尖孢镰刀菌fjat-30512具有明显抑制效果的菌株进行腐皮镰刀菌fjat-176的抑菌实验。将供试菌株番茄寄主腐皮镰刀菌fusariumsolanifjat-176(保存在福建省农业科学院农业生物资源研究所)接种到na平板上,再把单菌落接入到500μlna液体培养基中,170r·min-130℃恒温培养48h。将5ml腐皮镰刀菌fjat-176的菌悬液(菌落密度1.7×108cfu·ml-1)与200ml50℃的pda半固体培养基混合后,倒入已制备好的pda固体培养基,制成含病原菌的双层平板;待培养基凝固后,用直径7mm的打孔器在平板上打孔,在孔内加入100μl供试菌株培养液,阴性对照为100μl无菌水,阳性对照为100μl潮霉素(质量浓度为3μg·ml-1),每个供试菌株重复3次,28℃恒温培养5d,用直径交叉法测量抑菌圈直径。
选择对尖孢镰刀菌fjat-30512抑菌圈直径平均值>6mm的5株菌株进行腐皮镰刀菌fjat-176生防菌的筛选,结果见表2,其中fjat-19708和fjat-20265共2株菌株的抑菌效果较好,抑菌圈直径均大于9.9mm。
表2不同菌株对腐皮镰刀菌fjat-176的抑菌圈直径
4.串珠镰刀菌生防菌的筛选
将用腐皮镰刀菌筛选到的2株菌株接种到na平板上,再把单菌落接入到500μlna液体培养基(牛肉膏3g,蛋白胨5g,葡糖糖10g,ph7.2-7.4)中,30℃170r·min-1培养48h。
串珠镰刀菌fjat-165(保存在福建省农业科学院农业生物资源研究所)先在pda平板上活化,然后接入pda液体培养基中30℃170r·min-1培养48h。
在200ml的pda半固体培养基中加入5ml的fjat-165发酵液(菌落数为1.35×108cfu·ml-1)。于平板中倒入pda固体培养基,待固体培养基凝固后,再注入加有串珠镰刀菌fjat-165的半固体培养基,待凝固,制备成双层培养基,用7mm打孔器在培养基上打孔。以无菌水为阴性对照,潮霉素(浓度为3μg·ml-1)为阳性对照,分别取100μl滴入相应的孔中,置于30℃恒温培养箱中培养5d。用游标卡尺测量抑菌圈直径。
实验结果见表3,fjat-20265菌株的抑菌圈直径显著大于fjat-19708菌株的抑菌圈直径。说明fjat-20265菌株对串珠镰刀菌fjat-165具有较强的拮抗作用。
表3不同菌株对串珠镰刀菌fjat-165的抑菌圈直径
综上,以尖孢镰刀菌fjat-30512、腐皮镰刀菌fjat-176和串珠镰刀菌fjat-165作为致病菌,从可可西里土壤里筛选到了一株对镰刀菌具有较强抑制效果的菌株fjat-20265。
实施例2拮抗菌株的鉴定
1.形态特征
将芽孢杆菌fjat-20265于na平板上活化,48h后观察菌株的菌落形态、大小、颜色、透明度、突起和边缘情况。
菌株fjat-20265的菌落特征如图1所示,菌落较小、圆形、乳白色、表面光滑且湿润、隆起、边缘整齐、不透明。
2.16srrna基因序列分析
按细菌基因组提取试剂盒(generaybiotech#gk1071,上海捷瑞生物工程有限公司)操作步骤提取菌株fjat-20265的基因组dna,采用16srrna基因通用引物27f和1492r进行pcr扩增,pcr反应程序参照郑雪芳等的文献(郑雪芳,刘波,朱育菁,等.番茄青枯病生防芽孢杆菌的筛选与鉴定[j].中国生物防治学报,2016,32(5):657-665.),pcr产物送至上海博尚测序,应用ezbiocloud完成序列同源性比对,通过mega4.0.2软件分析序列和构建系统发育树。
将菌株fjat-20265的16srrna基因序列与ezbiocloud基因数据库比对,菌株fjat-20265与bacillussubtilis亲缘关系最近,16srrna基因同源性为99.37%,所以菌株fjat-20265应属于bacillussubtilis枯草芽孢杆菌。将同源性较高菌株的16srrna基因序列下载进行对比分析,构建系统发育树,采用neighbour-joining方法,bootstrap值为1000次时,形成的发育树如图2所示。构建的系统发育树中,菌株fjat-20265与bacillussubtilis聚在同一个分支。
以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利所做的均等变化与修饰,皆应属本发明的涵盖范围。