一种哈茨木霉菌基因敲除方法与流程

文档序号:14657806发布日期:2018-06-12 07:30阅读:来源:国知局
技术特征:

1.一种哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于包括:(1)构建敲除基因片段;(2)PEG-CaCl2原生质体转化;(3)菌落PCR筛选阳性突变子;

其中,构建敲除基因片段包括以下步骤:

以木霉基因组DNA为模板,分别PCR扩增目标基因约1200bp的5’和3’端同源臂,以引物Hyg-F和Hyg-R扩增潮霉素抗性基因,Hyg-F与扩增5’同源臂的反向引物设置16bp的重叠区域;Hyg-R与扩增3’同源臂的正向引物设置16bp的重叠区域;BamH1酶切载体pUC19,利用一步法无缝克隆试剂盒对5’端同源臂、潮霉素抗性基因、3’端同源臂和pUC19线性载体进行体外重组并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,用5’同源臂的上游引物5F和3’同源臂的下游引物3R扩增敲除片段验证阳性克隆;引物5F和3R进行PCR扩展大量制备敲除片段,纯化敲除片段使敲除片段浓度达到500ng/μL。

2.根据权利要求1所述的哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于所述的PEG-CaCl2原生质体转化包括:制备哈茨木霉原生质体;将哈茨木霉原生质体悬浮液、纯化敲除片段、PEG溶液;用枪头混匀;加PEG溶液,轻轻混匀,常温下放置;加溶液B,轻轻混匀;将混合液涂布在覆盖层析纸的含1M蔗糖PDA平板上,层析纸预先剪成条形;28℃避光培养24h;将条形层析纸片转到含抗生素的PDA平板上,28℃,避光培养30-36h,待条形层析纸边缘长出菌落后,挑取菌落,转接至新鲜的抗生素平板上,培养2天;其中所述的溶液B配方为:1Msorbitol,50mM CaCl2,10mM TrisHCl,pH 7.5;所述的PEG溶液配方为:25%PEG6000,50mM CaCl2、10mM TrisHCl,pH 7.5。

3.根据权利要求2所述的哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于所述的PEG-CaCl2原生质体转化包括:制备哈茨木霉原生质体;冰上放置15mL离心管,分别加200μL哈茨木霉原生质体悬浮液、10μL纯化敲除片段、50μL PEG溶液;用枪头混匀,冰上放置20min;加2mL PEG溶液,轻轻混匀,常温下放置5min;加2mL溶液B,轻轻混匀;将2mL混合液涂布在覆盖层析纸的含1M蔗糖PDA平板上,层析纸预先剪成条形;28℃避光培养24h;将条形层析纸片转到含抗生素的PDA平板上,28℃,避光培养36h,待条形层析纸边缘长出菌落后,挑取菌落,转接至新鲜的抗生素平板上,培养2天。

4.根据权利要求2或3所述的哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于所述的制备原生质体的方法为:接种哈慈木霉于PDA平板,28℃培养10天后,产生大量新鲜分生孢子;用10mL生理盐水洗涤菌丝表面,经玻璃绒过滤,去除菌丝体,得到孢子悬液;在玻璃纸覆盖的PDA平板上,取200μL孢子悬液涂布,28℃,避光培养16-20h直至孢子萌发;取玻璃纸,用溶解酶溶液洗涤玻璃纸,收集萌发的孢子;28℃,100rpm培养萌发的孢子悬液90 min;预冷离心机和转子,准备装有玻璃绒的离心管;90min后,萌发的孢子悬液经装有玻璃绒的离心管过滤,除去菌丝,用溶液A冲洗,终悬液体积控制在20-30mL;4℃、2000rpm离心10min,去上清;加20mL溶液A,再次离心,去上清;加1mL溶液B,冰上得到原生质体;用血球板观察、计数,稀释原生质体至108个/mL;所述的溶液A配方为:1.2M sorbitol,0.1M KH2PO4,pH 5.6;所述的溶液B配方为:1Msorbitol,50mM CaCl2,10mM TrisHCl,pH 7.5;所述的溶解酶溶液的配方为:0.15g溶解酶溶于20mL溶液A,0.2μm滤膜过滤除菌;所述的生理盐水为0.8-0.9%NaCl加0.05%Tween。

5.根据权利要求1所述的哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于所述的菌落PCR筛选阳性突变子包括直接刮取少量哈次木霉菌丝体,裂解后离心,利用菌落PCR试剂盒共同筛选阳性突变转化子;其中使用的引物1以5’端同源臂的上游序列设置正向引物,潮霉素基因序列设置反向引物,跨5’端同源序列扩增片段;引物2以潮霉素基因序列设置正向引物,3’端下游序列设置反向引物,跨3’端同源序列扩增片段。

6.根据权利要求5所述的哈茨木霉基因敲除方法,其特征在于在获得阳性敲除突变子后,光照培养至产孢子,再通过单孢分离纯化突变子。

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