本发明涉及一种立体选择性提高的菜豆环氧水解酶突变体及其应用,属于酶工程技术领域。
背景技术:
对映纯对氯环氧苯乙烷(pcso)与其水解产物对氯苯乙二醇(pcped)是多种手性药物与功能材料的重要中间体,如r型对氯环氧苯乙烷((r)-pcso)可以用于合成cb1拮抗剂;r型对氯苯乙二醇((r)-pcped)是nmda受体抑制剂——依利罗地的重要手性砌块。目前,一系列合成对映纯pcso与pcped的生物化学方法已经被报道。其中,suresh等人利用一类手性大环席夫碱类化合物催化对氯苯乙烯加氧合成(r)-pcso,其eep最高可达47%;karboune等人利用来自重组黑曲霉(aspergillusniger)的环氧化物水解酶(aneh)水解外消旋对氯环氧苯乙烷制备(r)-pcso,当转化率达到51%时,eep为87%并保留s型底物;manoj等人使用两种对映选择性互补的eh(steh与aneh)协同水解外消旋pcso合成(r)-pcso,eep达到93%。利用ehs催化制备(r)-pcso与(r)-pcped与席夫碱催化合成相比,具有eep高,来源清洁,更易分离等优势。
环氧化物水解酶(epoxidehydrolases,ehs,ec3.3.2.-)能够催化外消旋环氧化物的水解动力学拆分或对映归一性水解,保留单一构型环氧化物或转化为手性邻二醇。该反应的立体化学结果与酶对底物的立体选择性(包括对映选择性与对映归一性)紧密相关:具有对映选择性的ehs快速催化某一构型环氧化物的水解反应,得到相应的产物邻二醇以及保留另一构型环氧化物,即进行酶促动力学拆分。其中,ehs对外消旋环氧化物的对映选择率e决定环氧化物的对映体纯度。若继续反应,另一构型环氧化物也会被水解,即进行酶促对映归一性水解。底物完全转化时,区域选择性系数决定最终产物邻二醇的对映体纯度。环氧化物和邻二醇的对映体纯度通常用对映体过量值ee评价,分别表示为ees和eep。
ehs广泛存在于各生物体中,如真菌、细菌、古生菌、病毒、植物和哺乳动物等。迄今为止,ncbi数据库中收录的ehs基因序列已达数千个。pdb数据库中与ehs晶体结构相关的数据已达两百多条,根据其晶体结构与催化机理的不同,ehs分为三类:(1)α/β水解折叠ehs,例如有微生物来源的areh,植物来源的steh和动物来源的mmseh;(2)非α/β水解折叠ehs,例如来源于人的lta4h;(3)其他类型,例如来源于红串红球菌的leh。为了更好地将pveh1应用于对映纯的环氧化物与邻二醇的工业生产,对现有的ehs中进行结构和特性方面的优化显得十分必要。
技术实现要素:
为了更好地将pveh1应用于对映纯的环氧化物与邻二醇的工业生产,本发明利用定点突变获得了立体选择性提高的pveh1突变体。本发明采用全质粒pcr的方法对102位色氨酸进行单向定点突变,获得了立体选择性和催化活性同时提高的突变酶w102l,解决了立体选择性不能满足生产高对映纯环氧化物与邻二醇的需求,为拓宽pveh1的工业应用奠定了基础。
本发明的第一个目的是提供一种催化外消旋环氧化物的方法,所述方法是向含有外消旋环氧化物的体系中加入seqidno.1所示的环氧化物水解酶或表达seqidno.1所示的环氧化物水解酶的细胞。
在本发明的一种实施方式中,所述细胞包括真菌细胞或细菌细胞。
在本发明的一种实施方式中,所述细胞包括大肠杆菌、酵母或枯草芽孢杆菌。
在本发明的一种实施方式中,所述含有外消旋环氧化物的体系为溶液体系。
在本发明的一种实施方式中,所述外消旋环氧化物包括但不限于外消旋对氯环氧苯乙烷。
在本发明的一种实施方式中,所述方法是在ph为6~8的有机相中进行催化反应。
在本发明的一种实施方式中,所述有机相包括但不限于甲醇。
在本发明的一种实施方式中,所述方法是将seqidno.1所示的环氧化物水解酶表达至大肠杆菌中,培养菌体细胞,以200~280u/g底物的添加量加入所述细胞,催化外消旋对氯环氧苯乙烷生成r型对氯环氧苯乙烷及r型对氯苯乙二醇。
在本发明的一种实施方式中,所述方法是将seqidno.1所示的环氧化物水解酶表达至大肠杆菌中,培养菌体细胞,以235u/g底物的添加量加入所述细胞,催化外消旋对氯环氧苯乙烷生成r型对氯环氧苯乙烷及r型对氯苯乙二醇。
本发明还提供所述环氧化物水解酶在食品、医药领域水解外消旋环氧化物方面的应用。
在本发明的一种实施方式中,所述应用包括制备手性药物或功能材料。
本发明的有益效果:
本发明通过菜豆来源的环氧水解酶1(pveh1)的trp102进行单向定点突变,获得对映选择性与对映归一性(即立体选择性)提高的突变酶w102l。与野生型相比,w102l对外消旋对氯环氧苯乙烷rac-pcso的e值从2.6提高至25.5,这表明w102l对rac-pcso的对映选择性提高了9.8倍。同时,该突变体的稳定性没有发生变化,有利于酶在工业生产上的应用
附图说明
图1为pveh1w102l拆分pcso液相色谱分析以及ees与初始底物浓度关系;(a)为全细胞催化反应的液相色谱分析;(b)为ees与初始底物浓度关系;
图2为pveh1w102l全细胞动力学拆分rac-pcso进程曲线。
具体实施方式
突变体命名方式:
采用“原始氨基酸位置替换的氨基酸”来表示突变体。如w102l,表示位置102的氨基酸由亲本pveh1的trp替换成leu,位置的编号对应于亲本pveh1的氨基酸序列。
全细胞比活力和对映选择性测定:称取100mg重组菌湿菌体悬浮于1ml磷酸钠缓冲液(100mmol·l-1,ph=7.0)中,吸取200μl菌悬液(100mg·ml-1)加入到含750μl磷酸钠缓冲液的2mlep管中,25℃孵育5min后加入50μlrac-pcso(200mmol·l-1,溶剂为甲醇)至终浓度为10mmol·l-1,25℃、800r·min-1恒温震荡反应器中反应10min,取50μl样品用1ml乙酸乙酯萃取,有机相经无水硫酸镁干燥。样品分析采用高效液相色谱仪waterse2695、手性液相色谱柱和紫外检测器。rac-pcso高效液相色谱条件为:流动相为正己烷:异丙醇=80:20,柱温为30℃,流速为0.8ml·min-1,检测波长为220nm,手性液相色谱柱as-h(250mm×4.6mm×5μm)。(r)-对氯环氧苯基乙烷((r)-pcso):6.290min,(s)-p对氯环氧苯基乙烷((s)-pcso):7.062min,(r)-对氯苯基乙二醇((r)-pcped):7.977min,(s)-对氯苯基乙二醇((s)-pcped):9.059min。在上述测定条件下,酶活单位定义为每分钟消耗1μmol的pcso或rac-mcso所需的酶量定义为1个单位酶活(u)。全细胞比活力(u·g-1)计算如公式(1)所示,其中c全细胞催化rac-pcso或rac-mcso的转化率,c0为初始浓度,t为反应时间,v为反应体积,m为全细胞质量。
底物ees和产物eep的计算公式(2)和(3)所示,其中rs和ss分别代表(r)-pcso和(s)-pcso的峰面积,rp和sp表示(r)-pcped和(s)-pcped的峰面积[17]。酶的对映选择性通常用对映体比率(enantiomericratio,e)来评价,e值越高,则对映选择性越高,其计算公式如(4),其中c是转化率。
实施例1:突变质粒构建
利用高纯度质粒小提试剂盒pureplasmidminikit(购于康为试剂有限公司)从实验室保藏的e.colibl21(de3)/pet-28a-pveh1(叶慧华,胡蝶,李闯,等.新型菜豆环氧化物水解酶的异源表达及对映归一性催化特性[j].中国生物工程杂志,2016,36(10):21-27.169:41-54.)中提取质粒作为单向定点突变的模板,
所用的引物为w102l-f(5’-3’gttgcccatgatctcggagccctagta);w102l-r(tactagggctccgagatcatgggcaac)。
利用
实施例2:突变体酶的获取
将获得的突变酶表达载体接种(接种量为1%)于2ml含1%卡那霉素的lb培养基中,于37℃、220r·min-1培养过夜;取2ml培养液转接于100ml含1%卡那霉素的lb培养基中,培养至od600为0.6~0.8时,加入100μl的iptg(500mmol·l-1)至终浓度为0.5mmol·l-1,20℃下诱导10h后离心收集重组菌菌体。经测定,菌体的环氧化物水解酶对rac-pcso的酶活为27u/g菌体。
实施例3:全细胞催化初始底物浓度分析
在2mlep管中加入湿菌体菌悬液浓度为200mg·ml-1的pveh1w102l全细胞,底物初始浓度从0到300mmol·l-1的rac-pcso,缓冲液为磷酸钠缓冲液(ph=7.0,100mmol·l-1),反应体系为1ml,25℃、220r·min-1恒温摇床中反应12h后,取50μl样品用1ml乙酸乙酯萃取,有机相经无水硫酸镁干燥后hplc测定ees。
如图1(a)所示,利用pveh1w102l全细胞催化rac-pcso水解过程中未见明显的副产物生成,其中(s)-pcso被pveh1w102l优先催化水解为(r)-pcped。
采用终浓为200mg·ml-1的pveh1w102l分别拆分初始浓度从50到300mmol·l-1不等的rac-pcso,反应12h,结果如图1(b)。当底物初始浓度≤150mmol·l-1时,最终ees均可到达99%,这意味着经过24h反应后(s)-pcso基本被水解完全。而当底物初始浓度大于150mmol·l-1时,体系中的(s)-pcso不能被完全水解。
实施例4:全细胞催化反应进程
在2mlep管中加入湿菌体菌悬液浓度为200mg·ml-1的pveh1w102l全细胞,底物初始浓度为150mmol·l-1的rac-pcso,缓冲液为磷酸钠缓冲液(ph=7.0,100mmol·l-1),反应体系为1ml,25℃、220r·min-1恒温摇床中,反应不同时间取50μl样品用1ml乙酸乙酯萃取,有机相经无水硫酸镁干燥后使用hplc测定残余(r)-pcso和(s)-pcso的浓度、ees、eep和c绘制反应进程曲线。
通过对于pveh1w102l全细胞动力学拆分初始浓度为150mmol·l-1的rac-pcso定期取样监测(结果如图2),发现在pveh1w102l催化的rac-pcso水解开环反应中,产物(r)-pcped的eep可达到90%以上,符合利用生物催化法生产高对映纯(r)-pcped的工业要求;此外,反应过程中(s)-pcso的浓度从初始的75mmol·l-1经过4h的反应快速下降到了1.29mmol·l-1,仅为初始浓度的0.8%。此时(r)-pcso的产率为45.62%,(s)-pcso的保留率仅为0.8%,ees为96.30%,并且(r)-pcped产率达到了50.91%,eep为90.26%。
虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。
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