一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体及其构建方法和应用与流程

文档序号:16372612发布日期:2018-12-22 08:50阅读:328来源:国知局
一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体及其构建方法和应用与流程

本发明属于分子生物学领域,特别涉及一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体及其构建方法和应用。

背景技术

近年来我国杏鲍菇的工厂化栽培发展迅速,成为继金针菇之后发展最快的设施栽培食用菌品种。利用现代分子生物学技术改良杏鲍菇品种,获得产量高、生长周期短、抗杂菌能力强的菌株,是杏鲍菇遗传研究的重要课题。构建杏鲍菇的遗传转化系统首先要建立分子生物学工具,如抗性筛选标记和驱动外源基因表达的启动子等。

通常对基因进行点突变需要购买商业试剂盒,价格不菲而且操作繁琐。因此,引入突变位点的dna序列可以为构建萎锈灵抗性遗传转化载体提供基础。



技术实现要素:

本发明所要解决的技术问题是提供一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体及其构建方法和应用,解决了实现对基因进行点突变成本过高的问题。

本发明提供了一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体,将带有点突变的琥珀酸脱氢酶铁硫亚基的dna片段连入质粒载体,记为ptsdi。

本发明还提供了一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体的构建方法,包括:

(1)提取杏鲍菇单核菌丝全基因组dna,检测dna质量和浓度;

(2)在需要进行点突变的位置引入一对互补引物sdi2f和sdi1r;以提取的基因组dna为模板,利用正向引物sdi1f和反向引物sdi1r扩增第一部分的dna片段;以提取的基因组dna为模板,利用正向引物sdi2f和反向引物sdi2r扩增第二部分的dna片段;利用限制性内切酶mfei消化两部分dna片段,再采用t4连接酶将消化后的两部分dna片段连接成完整dna片段;

(3)将完整dna片段通过ta载体连接,导入pgem-teasy质粒载体中,获得转化载体ptsdi。

所述步骤(2)中的sdi1f的序列为:tcacgtcctcaataagcgctc;

sdi1r的序列为:acaattgaaaatggtgaggc;

sdi2f的序列为:gcctcaccattttcaattgt;

sdi2r的序列为:agcaccgcaagtgagaccaa。

上述引物为pcr扩增琥珀酸脱氢酶复合物的铁硫蛋白亚基的引物。

本发明还提供了一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体的应用,应用于携带外源基因进行杏鲍菇的遗传转化。

有益效果

本发明的转化载体可以用于转化杏鲍菇,使其获得对真菌杀菌剂萎锈灵的抗性;另外由于在构建的转化载体中留有插入外源基因片段的酶切位点,可以方便地插入感兴趣的外源基因,转化到杏鲍菇中进行遗传学研究,具有良好的应用前景。

附图说明

图1为用于构建转化载体ptsdi的引物位置;

图2为本发明转化载体ptsdi的示意图;

图3为利用pcr结合酶切鉴定杏鲍菇转化子的示意图。

具体实施方式

下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。此外应理解,在阅读了本发明讲授的内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。

实施例1

一、杏鲍菇萎锈灵抗性转化载体的构建:

(1)提取杏鲍菇单核菌丝全基因组dna,检测dna质量和浓度;

(2)在需要进行点突变的位置引入一对互补引物sdi2f和sdi1r(图1);以提取的基因组dna为模板,利用正向引物sdi1f和反向引物sdi1r扩增第一部分的dna片段(2251bp,如seqno.7所示);以提取的基因组dna为模板,利用正向引物sdi2f和反向引物sdi2r扩增第二部分的dna片段(339bp,如seqno.8所示);利用限制性内切酶mfei消化两部分dna片段,再采用t4连接酶将消化后的两部分dna片段连接成完整dna片段(2570bp,如seqno.9所示);

(3)将完整dna片段通过ta载体连接,导入pgem-teasy质粒载体中,获得转化载体ptsdi。

sdi1f的序列为:tcacgtcctcaataagcgctc;

sdi1r的序列为:acaattgaaaatggtgaggc;

sdi2f的序列为:gcctcaccattttcaattgt;

sdi2r的序列为:agcaccgcaagtgagaccaa。

二、外源基因的导入

(1)转化载体ptsdi在sdi基因的5’端和3’端都预留了限制性内切酶识别位点,可供导入外源基因使用。

(2)在转化载体ptsdi中sdi基因的5’端导入外源基因,可以选择三个酶切位点spei、sali和mlui中的任意两个加在外源基因pcr片段两侧,通过双酶切连接到转化载体ptsdi中。

(3)在转化载体ptsdi中sdi基因的3’端导入外源基因,可以利用酶切位点sacii和sphi加在外源基因pcr片段两侧,通过双酶切连接到转化载体ptsdi中。

三、转化子的鉴定:

杏鲍菇转化子的检测可以用pcr结合酶切鉴定:

1,ctab法提取杏鲍菇转化子全基因组dna。

2,琼脂糖电泳检测dna质量,nanodrop检测浓度。

3,以提取的基因组dna为模板,利用pcr引物capsf(gtacgttgtatcatcgtcgct)和capsr(tggacaagtgcgagagcctt)扩增198bp片段。

4,利用限制性内切酶mnli酶切pcr产物。

5,琼脂糖电泳检测酶切产物,如果转化载体成功插入到了基因组中,可以检测到pcr产物被酶切成为121bp和77bp的两个片段(图3)。

由此说明,将引物capsf和caspr的pcr扩增和限制性内切酶mnli的酶切鉴定结合起来,可以非常方便地鉴定杏鲍菇遗传转化后获得的阳性转化子。

sequencelisting

<110>上海市农业科学院

<120>一种杏鲍菇萎锈灵抗性筛选转化载体及其构建方法和应用

<130>1

<160>9

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>1

tcacgtcctcaataagcgctc21

<210>2

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>2

acaattgaaaatggtgaggc20

<210>3

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>3

gcctcaccattttcaattgt20

<210>4

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>4

agcaccgcaagtgagaccaa20

<210>5

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>5

gtacgttgtatcatcgtcgct21

<210>6

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>6

tggacaagtgcgagagcctt20

<210>7

<211>2251

<212>dna

<213>人工序列

<400>7

tcacgtcctcaataagcgctcgcgacaacgcggattcacatcctgcccccacatcactct60

ccaagaatctcttgttcaaaggtatcccgtatttgtaagtcaagccaacgtttattccat120

gatacatggctggccacattcatggtattctctccgtaaatagccatttaccacccatga180

cacgacatattcggactcctgccgcttgtgaaccgttcaactatgcaaatgctaatgcat240

ggcttctgagactgccaacgctgtttggagaaaccttctcaaaaacggctgctgaagacc300

taagccagcgctgcaccgacattttctcaacactcaatagaagttgcaactaggtcaaca360

aagttggcattcgatcgcctgtgactacaaattgattcggggggttcgacgatggacacc420

atgactgagctttggggtccgttacgacgagaacatccgaagtcccttcctcaactttca480

agggaatttcgaggcctcagagcgccgttgaactcaggtttccgagtgatacctcaattg540

ctttcccccttttctgatcagagtactcgaggtacagcttgggtacggcacatattctac600

cttgtatacctcactcataacgttccgaggagagtggcatcacacagcgcgctggcctaa660

aagtggtgtcaagttggaagggaagcgagtcggggtcattggaactggggccagcgccga720

gttcagatcatccaagaggcaggcaaattggcacaagagctcgtggtattacagcgtaca780

ccgaatctgacattccacccgcgacaacccacgcaagccaaagtgtcagaagttgtcgaa840

atgcagtggaatcatgctcacgaagaggccccgagtagtgaccctctcaagtaaacaagc900

atcgtcgatttcttaacacttctagttgctccgtccacgtgtatatataccttcgactga960

agagcatgattggcgcaaagattacgttctatcgctcttctctccttattttgataatcg1020

aaagccgcactactcagcgcagcagttctacatgtttttctaaaaatctaccgggtcacc1080

gctgacgcgctgacggccggtaagcttcaagctaaatttcaaaagttccaagtaacctgc1140

agtcccaatcgggcaattccgaagtgcgccggcatttaccgaagagtaacatgtgccctc1200

tgattggttcggatcgcgggggctcctttcccgctccgaattcacgcgacgggatcccgc1260

cgcatctctcctcttcaccgtcgtcgttgacgtccccgaaacacagaaatcaccgaatca1320

tgcaggcgctcacctccaggtcgttggctcgctcatcccgctcgattcgtgctttctcca1380

cctcatctggaaggtggcaggctgagcccctccagaagcccgttctccagaaagaattca1440

agatctatcgttgggtgagctgagacgcttgtatatccagatgtgttgctcacatcgcag1500

cccagaatccggatgaaccagccaagaagcctcatctccaatcgtacaccattgacttga1560

accagacgggccccatggtacgtacaattccaaggcgattgtctctatgctcacgggctc1620

gtagattctggacgctcttatcaagatcaagaacgaaatcgatcctacgctcacattccg1680

tcgttcgtgtagagaagggatttgcggctcgtgcgcgatgaatattgacggacagaacac1740

gttggcttgcctgtgccgaatcgaccgtaacgctagcaaggacagcaagatctacccttt1800

gccgcacagtatgacatgtctttcggctcctaatagcattggctgacggtcggttacagt1860

gtacatcgtgaaagacctcgtacccgacctcacgcttttctacaagcagtacaagtccat1920

caagccatacctgcagaacgacaatattcccgagagggagcacctccagtcgccagagga1980

ccgcaagaagttggacgggatgtatgaatgcatcctgtgcgcgtgctgcagcacatcgtg2040

ccccagctattggtggaaccaagatgagtatttgggaccggctgctttgatggccgcgta2100

taggtggattgcggattcacgagtacgttgtatcctcgtcgctccattcgctgaataagt2160

tgacgtttcgtaggatacatatggcgcacaacgcaaggagcacttccagaatgagatgag2220

tttgttccgctgcctcaccattttcaattgt2251

<210>8

<211>339

<212>dna

<213>人工序列

<400>8

gcctcaccattttcaattgtacgtcgctttcgccttgatatggattcgctattaaacata60

tcccttctcaaggctctcgcacttgtccaaagggcctcaaccctgcgaaagccatcgcag120

agatcaagctcgcgcttgctactgagtaaaccctagtcaacagtcacggatcaaaagcat180

caagtcagaggcagatatctttcctgtagcagttcgcagttctttccacttcatcgtatg240

gtgtccattgcaaacatctaatcatattcattctatcacatccacttgttcctgagccac300

tcttaaggtaggcatatccttggtctcacttgcggtgct339

<210>9

<211>2570

<212>dna

<213>人工序列

<400>9

tcacgtcctcaataagcgctcgcgacaacgcggattcacatcctgcccccacatcactct60

ccaagaatctcttgttcaaaggtatcccgtatttgtaagtcaagccaacgtttattccat120

gatacatggctggccacattcatggtattctctccgtaaatagccatttaccacccatga180

cacgacatattcggactcctgccgcttgtgaaccgttcaactatgcaaatgctaatgcat240

ggcttctgagactgccaacgctgtttggagaaaccttctcaaaaacggctgctgaagacc300

taagccagcgctgcaccgacattttctcaacactcaatagaagttgcaactaggtcaaca360

aagttggcattcgatcgcctgtgactacaaattgattcggggggttcgacgatggacacc420

atgactgagctttggggtccgttacgacgagaacatccgaagtcccttcctcaactttca480

agggaatttcgaggcctcagagcgccgttgaactcaggtttccgagtgatacctcaattg540

ctttcccccttttctgatcagagtactcgaggtacagcttgggtacggcacatattctac600

cttgtatacctcactcataacgttccgaggagagtggcatcacacagcgcgctggcctaa660

aagtggtgtcaagttggaagggaagcgagtcggggtcattggaactggggccagcgccga720

gttcagatcatccaagaggcaggcaaattggcacaagagctcgtggtattacagcgtaca780

ccgaatctgacattccacccgcgacaacccacgcaagccaaagtgtcagaagttgtcgaa840

atgcagtggaatcatgctcacgaagaggccccgagtagtgaccctctcaagtaaacaagc900

atcgtcgatttcttaacacttctagttgctccgtccacgtgtatatataccttcgactga960

agagcatgattggcgcaaagattacgttctatcgctcttctctccttattttgataatcg1020

aaagccgcactactcagcgcagcagttctacatgtttttctaaaaatctaccgggtcacc1080

gctgacgcgctgacggccggtaagcttcaagctaaatttcaaaagttccaagtaacctgc1140

agtcccaatcgggcaattccgaagtgcgccggcatttaccgaagagtaacatgtgccctc1200

tgattggttcggatcgcgggggctcctttcccgctccgaattcacgcgacgggatcccgc1260

cgcatctctcctcttcaccgtcgtcgttgacgtccccgaaacacagaaatcaccgaatca1320

tgcaggcgctcacctccaggtcgttggctcgctcatcccgctcgattcgtgctttctcca1380

cctcatctggaaggtggcaggctgagcccctccagaagcccgttctccagaaagaattca1440

agatctatcgttgggtgagctgagacgcttgtatatccagatgtgttgctcacatcgcag1500

cccagaatccggatgaaccagccaagaagcctcatctccaatcgtacaccattgacttga1560

accagacgggccccatggtacgtacaattccaaggcgattgtctctatgctcacgggctc1620

gtagattctggacgctcttatcaagatcaagaacgaaatcgatcctacgctcacattccg1680

tcgttcgtgtagagaagggatttgcggctcgtgcgcgatgaatattgacggacagaacac1740

gttggcttgcctgtgccgaatcgaccgtaacgctagcaaggacagcaagatctacccttt1800

gccgcacagtatgacatgtctttcggctcctaatagcattggctgacggtcggttacagt1860

gtacatcgtgaaagacctcgtacccgacctcacgcttttctacaagcagtacaagtccat1920

caagccatacctgcagaacgacaatattcccgagagggagcacctccagtcgccagagga1980

ccgcaagaagttggacgggatgtatgaatgcatcctgtgcgcgtgctgcagcacatcgtg2040

ccccagctattggtggaaccaagatgagtatttgggaccggctgctttgatggccgcgta2100

taggtggattgcggattcacgagtacgttgtatcctcgtcgctccattcgctgaataagt2160

tgacgtttcgtaggatacatatggcgcacaacgcaaggagcacttccagaatgagatgag2220

tttgttccgctgcctcaccattttcaattgtacgtcgctttcgccttgatatggattcgc2280

tattaaacatatcccttctcaaggctctcgcacttgtccaaagggcctcaaccctgcgaa2340

agccatcgcagagatcaagctcgcgcttgctactgagtaaaccctagtcaacagtcacgg2400

atcaaaagcatcaagtcagaggcagatatctttcctgtagcagttcgcagttctttccac2460

ttcatcgtatggtgtccattgcaaacatctaatcatattcattctatcacatccacttgt2520

tcctgagccactcttaaggtaggcatatccttggtctcacttgcggtgct2570

当前第1页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1