本发明涉及分子生物学领域,特别涉及一种激活notch1信号通路的方法。
背景技术:
notch基因编码一类高度保守的细胞表面受体,它们调节从海胆到人等多种生物细胞的发育。notch信号影响细胞正常形态发生的多个过程,包括多能祖细胞的分化、细胞凋亡、细胞增殖及细胞边界的形成。
notch1是notch基因家族的成员,它由egf-like重复区和一个包含多种结构域的胞内段(nicd)组成(图1)。notch1蛋白经过三次剪切,可释放胞内段进入细胞质,再进入细胞核与转录因子csl结合,形成nicd/csl转录激活复合体,活化hes1等分化拮抗基因的转录。活化notch1以激活下游hes1等因子成为了相关研究包括抗癌药物研究中的一种手段。
直接将notch1基因的胞内段转入细胞表达,是激活notch1信号通路最直接的方法之一。但对具体区域的选取,对外源片段的转录、翻译以及蛋白产物的活性影响很大。目前尚未见相关的报道。
技术实现要素:
为了解决上述问题,本发明提供了一种扩增notch1基因部分片段的引物对,其中一条引物的序列包括如seqidno.1所示序列;其中另一条引物的序列包括如seqidno.2或4所示序列的反向互补序列。
进一步地,两条引物的序列分别还包括dna内切酶位点序列。
进一步地,所述酶切位点为:ecor1和hindiii的酶切位点。
前述的引物对中,其中至少1条引物的序列含有ha-tag序列。
更进一步地,其中一条引物的序列如seqidno.5所示;另一条引物的序列如seqidno.6或7所示。
本发明还提供了前述引物在激活notch1信号通路中的用途。
本发明还提供了一种激活notch1信号通路的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)使用权利要求1所述引物pcr扩增模板dna,得到pcr产物;
2)将前述pcr产物连接到载体中;
3)将载体转入动物或人类细胞;
所述模板dna是包含notch1胞内段序列的dna。
进一步地,步骤2)所述载体是pcmv-xl4载体。
进一步地,步骤3)所述细胞是人乙肝病毒感染的肝癌细胞。
本发明的引物可以扩增得到notch1基因的部分片段,该片段能在细胞内大量表达,且能对下游的hes1基因起到很好的激活作用。
本发明的方法能有效激活notch1信号通路,可以广泛应用于抗癌药物的研究中,比如:激活notch1信号通路构建恶性肿瘤模型。
显然,根据本发明的上述内容,按照本领域的普通技术知识和惯用手段,在不脱离本发明上述基本技术思想前提下,还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。
以下通过实施例形式的具体实施方式,对本发明的上述内容作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实施例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。
附图说明
图1是notch1基因的结构图。
图2是westernblot检测图。
图3是notch1mrna荧光定量统计图。
图4是hes1mrna荧光定量统计图。
具体实施方式
实施例nicd及nicd-δpest质粒转乙肝细胞
1.引物设计
1.1扩增区域选取
通过实验,选择了notch1基因的第5543-7930号碱基(nicd区)以及第5543-6961号(nicd-δpest区)碱基作为扩增区域。
1.2引物序列
nicd区和nicd-δpest区的正向引物相同,反向引物不同。
为了方便载体构建,在正向引物(forward)中加入ecor1酶切位点,在反向引物(reverse)中加入hindiii位点;为了方便后期检测是否成功插入,还在reverse中加入了ha-tag序列;另外,为了实现目的片段的高效、正确转录,还在forward中加入了转录起始序列kozac,在reverse中加入了att序列(在反向互补后为终止密码子taa)。引物的设计结构如下:
forward:taa(随机序列)gaattc(ecorlsite)gccgcc(kozacsequence:转录起始序列)atg(起始密码子)cggcggcagcatggccagctctggttc(靶序列,seqidno.1);
nicd-reverse的互补序列:atcgcccgcattccggaggccttcaag(靶序列,seqidno.2)tacccatacgatgttccagattacgct(ha-tag序列,seqidno.3)taa(终止密码子)aagctt(hindiiisite)att(随机序列);
nicd-δpest-reverse的互补序列:agtctccgtccgtgcccctcaaccac(靶序列,seqidno.4)tacccatacgatgttccagattacgct(ha-tag序列,seqidno.3)taa(终止密码子)aagctt(hindiiisite)att(随机序列)。
具体引物序列如表1所示。
表1引物信息
2.质粒构建
1)扩增
使用notch1intracellulardomain(nicd1)-pcw107-v5质粒(addgene,美国)作为模板,分别使用表1所述引物扩增第一节所述nicd区和nicd-δpest区序列。
2)连接载体
使用ecor1/hindiii双酶切的pcmv-xl4载体与前述扩增序列连接,获得pcmv-xl4-nicd-ha和pcmv-xl4-nicdδpest-ha质粒,分别简称nicd质粒和nicd-δpest质粒。
3.细胞实验
转染nicd及nicd-δpest质粒进入人乙肝病毒感染的肝癌细胞(hepg2.2.15.7和hepad38)后,提取细胞总蛋白和总rna,实施westernblot检测ha标记蛋白,实施qpcr实验检测notch1以及notch1靶基因hes1的mrna相对水平。
其中,对照组(control)为转入pcmv-xl4空载体的细胞。
4.结果
westernblot结果如图2所示,使用ha抗体的印迹实验得到了具有ha-tag的nicd以及nicd-δpest条带。
qpcr结果如图3和图4所示,转染nicd及nicd-δpest质粒进入乙肝细胞后后都成功升高notch1以及notch1靶基因hes1的mrna的表达,其中hes1的表达提高了约60%,表明notch1信号通路得到有效激活。
综上,本发明的引物可以扩增得到notch1基因的部分片段,该片段能在细胞内大量表达,且能对下游的hes1基因起到很好的激活作用。本发明的方法能有效激活notch1信号通路,在抗癌药物研究等notch1通路相关研究中具有良好的应用价值。
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<110>四川大学华西医院
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