1.一种酮酰基-辅酶a合酶,其具有seqidno.119或与seqidno.119具有至少80%同一性,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基184对齐的氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸。
2.如权利要求1所述的酮酰基-辅酶a合酶,其包含以下特征i)至xliii)中的至少一种:
i)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基18对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基22对齐的氨基酸残基是甲硫氨酸;
iii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基30对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
iv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基38对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
v)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基39对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
vi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基51对齐的氨基酸残基是丙氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、天冬酰胺、脯氨酸、谷氨酰胺、精氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸或酪氨酸;
vii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基54对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
viii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基69对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
ix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基83对齐的氨基酸残基是天冬酰胺;
x)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基94对齐的氨基酸残基是苏氨酸、亮氨酸、谷氨酸或丙氨酸;
xi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基111对齐的氨基酸残基是半胱氨酸;
xii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基116对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基127对齐的氨基酸残基是苏氨酸;
xiv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基130对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基152对齐的氨基酸残基是半胱氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或苏氨酸;
xvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基154对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xvii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基178对齐的氨基酸残基是亮氨酸或苏氨酸;
xviii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基190对齐的氨基酸残基是苯丙氨酸或酪氨酸;
xix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基210对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
xx)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基223对齐的氨基酸残基是组氨酸;
xxi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基231对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
xxii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基232对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
xxiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基236对齐的氨基酸残基是亮氨酸或甲硫氨酸;
xxiv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基241对齐的氨基酸残基是脯氨酸;
xxv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基268对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基271对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
xxvii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基274对齐的氨基酸残基是谷氨酸;
xxviii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基278对齐的氨基酸残基是精氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、谷氨酰胺;
xxix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基280对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
xxx)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基282对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基296对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxxii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基302对齐的氨基酸残基是苏氨酸;
xxxiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基312对齐的氨基酸残基是天冬氨酸;
xxxiv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基313对齐的氨基酸残基是谷氨酸或甲硫氨酸;
xxxv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基315对齐的氨基酸残基是赖氨酸;
xxxvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基317对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxxvii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基322对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxviii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基328对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基329对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xl)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基344对齐的氨基酸残基是谷氨酸、天冬氨酸或天冬酰胺;
xli)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基356对齐的氨基酸残基是甘氨酸或丝氨酸;
xlii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基368对齐的氨基酸残基是精氨酸;并且
xliii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基370对齐的氨基酸残基是苏氨酸。
3.如权利要求1或2所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基184对齐的所述氨基酸残基是异亮氨酸。
4.如权利要求1-3中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其还包含以下特征中的至少一种:
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基268对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基296对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;并且
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基328对齐的所述氨基酸残基是甘氨酸。
5.如权利要求1-4中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基317对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
6.如权利要求2-5中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基30对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
7.如权利要求2-6中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基368对齐的所述氨基酸残基是精氨酸。
8.如任一前述权利要求所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基51对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、天冬酰胺、脯氨酸、谷氨酰胺、精氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸或酪氨酸。
9.如任一前述权利要求所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基51对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
10.如任一前述权利要求所述的3-酮酰基-辅酶a合酶,其中所述氨基酸序列选自由以下组成的组:seqidno.9、seqidno.10、seqidno.11、seqidno.12、seqidno.13、seqidno.14、seqidno.15、seqidno.16、seqidno.17、seqidno.18、seqidno.19、seqidno.20、seqidno.21、seqidno.22、seqidno.23、seqidno.24、seqidno.25、seqidno.26、seqidno.27、seqidno.28、seqidno.29、seqidno.30、seqidno.31、seqidno.32、seqidno.33、seqidno.34、seqidno.36、seqidno.37、seqidno.38、seqidno.39、seqidno.92、seqidno.93、seqidno.121-157中的任一个以及seqidno.172-204中的任一个。
11.一种酮酰基-辅酶a合酶,其具有seqidno.110或与seqidno.110具有至少80%同一性,所述酮酰基-辅酶a合酶包含特征i)-xiii)中的至少一种:
i)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基30对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基39对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
iii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基69对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
iv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基111对齐的氨基酸残基是半胱氨酸;
v)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基152对齐的氨基酸残基是半胱氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或苏氨酸;
vi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基178对齐的氨基酸残基是亮氨酸或苏氨酸;
vii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基184对齐的氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸;
viii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基268对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基271对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
x)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基278对齐的氨基酸残基是精氨酸、谷氨酸、天冬氨酸或谷氨酰胺;
xi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基296对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基317对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基328对齐的氨基酸残基是甘氨酸。
12.如权利要求11所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基184对齐的所述氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸。
13.如权利要求11所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基184对齐的所述氨基酸残基是异亮氨酸。
14.如权利要求11-13中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中:
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基268对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基296对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;并且
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基328对齐的所述氨基酸残基是甘氨酸。
15.如权利要求11-14中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基317对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
16.如权利要求12-15中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基30对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
17.如权利要求12-16中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.120的氨基酸残基368对齐的所述氨基酸残基是精氨酸。
18.一种酮酰基-辅酶a合酶,其具有seqidno.110或与seqidno.110具有至少80%同一性,所述酮酰基-辅酶a合酶在每种情况下包含特征i)–xiii)中的至少一种:
i)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基30对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基39对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
iii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基69对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
iv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基111对齐的氨基酸残基是半胱氨酸;
v)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基152对齐的氨基酸残基是半胱氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或苏氨酸;
vi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基178对齐的氨基酸残基是亮氨酸;
vii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基184对齐的氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸;
viii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基268对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基271对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
x)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基278对齐的氨基酸残基是精氨酸;
xi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基296对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基317对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基328对齐的氨基酸残基是甘氨酸。
19.如权利要求18所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基184对齐的所述氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸。
20.如权利要求18所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基184对齐的所述氨基酸残基是异亮氨酸。
21.如权利要求18-20中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中:
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基268对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基296对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸;并且
所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基328对齐的所述氨基酸残基是甘氨酸。
22.如权利要求18-21中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基317对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
23.如权利要求19-22中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基30对齐的所述氨基酸残基是丙氨酸。
24.如权利要求19-23中任一项所述的酮酰基-辅酶a合酶,其中所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.110的氨基酸残基368对齐的所述氨基酸残基是精氨酸。
25.一种酮酰基-辅酶a合酶,其具有seqidno.119或与seqidno.119具有至少80%同一性,所述酮酰基-辅酶a合酶包含以下特征i)至xxxvi)中的至少一种:
i)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基18对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
ii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基22对齐的氨基酸残基是甲硫氨酸;
iii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基30对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
iv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基38对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
v)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基39对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
vi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基51对齐的氨基酸残基是丙氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、天冬酰胺、脯氨酸、谷氨酰胺、精氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸或酪氨酸;
vii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基69对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
viii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基94对齐的氨基酸残基是苏氨酸、亮氨酸、谷氨酸或丙氨酸;
ix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基111对齐的氨基酸残基是半胱氨酸;
x)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基116对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基152对齐的氨基酸残基是半胱氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或苏氨酸;
xii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基154对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基178对齐的氨基酸残基是亮氨酸或苏氨酸;
viv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基184对齐的氨基酸残基是异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸或缬氨酸;
xv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基210对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
xvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基231对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
xvii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基232对齐的氨基酸残基是缬氨酸;
xviii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基236对齐的氨基酸残基是亮氨酸或甲硫氨酸;
xix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基241对齐的氨基酸残基是脯氨酸;
xx)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基268对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基271对齐的氨基酸残基是异亮氨酸;
xxii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基274对齐的氨基酸残基是谷氨酸;
xxiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基278对齐的氨基酸残基是精氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、谷氨酰胺;
xxiv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基282对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基296对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基302对齐的氨基酸残基是苏氨酸;
xxvii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基312对齐的氨基酸残基是天冬氨酸;
xxviii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基313对齐的氨基酸残基是谷氨酸或甲硫氨酸;
xxix)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基315对齐的氨基酸残基是赖氨酸;
xxx)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基317对齐的氨基酸残基是丙氨酸;
xxxi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基322对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基328对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxiii)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基329对齐的氨基酸残基是甘氨酸;
xxxiv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基344对齐的氨基酸残基是天冬氨酸或天冬酰胺;
xxxv)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基356对齐的氨基酸残基是甘氨酸或丝氨酸;并且
xxxvi)所述酮酰基-辅酶a合酶的与seqidno.119的氨基酸残基370对齐的氨基酸残基是苏氨酸。
26.一种酮酰基-辅酶a合酶,其如实施方案1-92中任一项中所描述。
27.一种3-酮酰基-辅酶a合酶基因,其编码如权利要求1-26中任一项所述的3-酮酰基-辅酶a合酶。
28.一种经遗传修饰的细胞,其包含如权利要求27所述的3-酮酰基-辅酶a合酶基因。
29.一种经遗传修饰的细胞,其包含编码如权利要求1-26中任一项所述的3-酮酰基-辅酶a合酶的异源核酸序列。
30.一种细胞,其产生如权利要求1-26中任一项所述的3-酮酰基-辅酶a合酶。
31.一种用于制备一种或多种具有直链烷基的化合物的方法,所述方法包括在发酵培养基中培养如权利要求28-30中任一项所述的经遗传修饰的细胞以及从所述发酵培养基中回收所述一种或多种具有直链烷基的化合物。
32.如权利要求28-30中任一项所述的经遗传修饰的细胞用于产生一种或多种具有直链烷基的化合物的用途,其中至少60重量%的所述一种或多种化合物在所述直链烷基中具有6至10个碳原子。