1.一种被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,包含:
基因修饰的益生菌肠细菌,表达至少一种异源抑制性多核苷酸,所述异源抑制性多核苷酸被配置为抑制选自下列的白斑综合症病毒中至少一种必需基因的表达:vp28基因、vpl9基因或wsv477基因,并且其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是双链rna多核苷酸(dsrna)分子。
2.如权利要求1所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述基因修饰的益生菌肠细菌包括基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
3.如权利要求2所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌包括rnaseiii缺陷型基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
4.如权利要求3所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中被配置为抑制白斑综合症病毒中至少一种必需基因的表达的所述至少一种异源抑制性多核苷酸选自这样的编码所述异源抑制性多核苷酸的dna序列,所述编码所述异源抑制性多核苷酸的dna序列选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3、或者与seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3具有约75%同源性的序列。
5.如权利要求4所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述虾包括在水产养殖环境中饲养的虾。
6.如权利要求5所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸的所述基因修饰的益生菌肠细菌通过垂直传播传播给虾后代。
7.如权利要求6所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,进一步包括下列步骤:向在水产养殖环境中饲养的所述虾体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述异源抑制性多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起白斑综合症病毒中所述必需基因的下调,并且进一步导致由wssv导致的死亡率降低约1%至50%。
8.一种被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,包含:
基因修饰的益生菌肠细菌,表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna),并且其中所述基因修饰的益生菌肠细菌被配置为是虾的益生菌。
9.如权利要求8所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述基因修饰的益生菌肠细菌包括基因修饰的枯草芽孢杆菌。
10.如权利要求9所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述基因修饰的枯草芽孢杆菌包括rnaseiii缺陷型基因修饰的枯草芽孢杆菌。
11.如权利要求10所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述白斑综合症病毒中的必需基因包括选自vp28基因、vpl9基因或wsv477基因的白斑综合症病毒中的必需基因。
12.如权利要求11所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的所述至少一种异源抑制性多核苷酸包括选自下列的至少一种异源抑制性多核苷酸:与seqidno.1具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;与seqidno.2具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;和/或与seqidno.3具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸。
13.如权利要求12所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中所述虾包括在水产养殖环境中饲养的虾。
14.如权利要求13所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,其中表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸的所述基因修饰的益生菌肠细菌通过垂直传播传播给虾后代。
15.如权利要求14所述的被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,进一步包括下列步骤:向在水产养殖环境中饲养的所述虾体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述异源抑制性多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起白斑综合症病毒中所述必需基因的下调,并且当向在水产养殖环境中的虾给予治疗有效量时,导致由在水产养殖种群中饲养的虾中的wssv导致的死亡率降低约1%至50%。
16.一种被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,包含:
基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌,表达选自seqidno.1的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向被鉴定为seqidno.10的白斑综合症病毒中的wsv477基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna),并且其中向虾给予治疗有效量的所述基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌导致由于白斑综合症病毒引起的死亡率降低。
17.一种被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,包含:
基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌,表达选自seqidno.2的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向被鉴定为seqidno.8的白斑综合症病毒中的vp28基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna),并且其中向虾给予治疗有效量的所述基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌导致由于白斑综合症病毒引起的死亡率降低。
18.一种被配置用于虾中白斑综合症病毒的生物防治的基因修饰的益生菌,包含:
基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌,表达选自seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向被鉴定为seqidno.8的白斑综合症病毒中的vpl9基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna),并且其中向虾给予治疗有效量的所述基因修饰的rnaseiii缺陷型益生菌导致由于白斑综合症病毒引起的死亡率降低。
19.一种用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,包含:
用于具有基因修饰的益生菌的水生生物的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna)。
20.如权利要求19所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中所述基因修饰的益生菌包括基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
21.如权利要求20所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中所述基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌包括rnaseiii缺陷型基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
22.如权利要求21所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中所述白斑综合症病毒中的必需基因包括选自vp28基因、vpl9基因或wsv477基因的白斑综合症病毒中的必需基因。
23.如权利要求22所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的所述至少一种异源抑制性多核苷酸包括选自下列的至少一种异源抑制性多核苷酸:与seqidno.1具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;与seqidno.2具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;和/或与seqidno.3具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸。
24.如权利要求23所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中所述水生生物包括虾。
25.如权利要求24所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中所述虾包括在水产养殖环境中饲养的虾。
26.如权利要求25所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,其中表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸的所述基因修饰的益生菌通过垂直传播传播给虾后代。
27.如权利要求26所述的用于白斑综合症的生物防治的水生生物可吸收化合物,并且进一步包括下列步骤:向在水产养殖环境中饲养的所述虾体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述异源抑制性多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起白斑综合症病毒中所述必需基因的下调,并且进一步给予治疗有效量所述处理的饲料导致由在水产养殖种群中饲养的虾中的wssv导致的死亡率降低约1%至50%。
28.一种用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,包含:
用于具有基因修饰的益生菌肠细菌的虾的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌肠细菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna)。
29.如权利要求28所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中所述基因修饰的益生菌肠细菌包括基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
30.如权利要求29所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中所述枯草芽孢杆菌包括rnaseiii缺陷型基因修饰的益生菌枯草芽孢杆菌。
31.如权利要求30所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中所述白斑综合症病毒中的必需基因包括选自vp28基因、vpl9基因或wsv477基因的白斑综合症病毒中的必需基因。
32.如权利要求31所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的所述至少一种异源抑制性多核苷酸包括选自下列的至少一种异源抑制性多核苷酸:与seqidno.1具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;与seqidno.2具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸;和/或与seqidno.3具有至少75%同源性的至少一种异源抑制性多核苷酸。
33.如权利要求32所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中所述虾包括在水产养殖环境中饲养的虾。
34.如权利要求33所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,其中表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸的所述基因修饰的益生菌肠细菌通过垂直传播传递给所述虾后代。
35.如权利要求34所述的用于白斑综合症的生物防治的虾可吸收化合物,并且进一步包括下列步骤:向在水产养殖环境中饲养的所述虾体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述异源抑制性多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起白斑综合症病毒中所述必需基因的下调,并且进一步导致由在水产养殖种群中饲养的所述虾中的wssv导致的死亡率降低约1%至50%。
36.一种接种水生生物的方法,包括以下步骤:
产生用于具有基因修饰的益生菌肠细菌的水生生物的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌肠细菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna);和
将有效量的具有基因修饰的益生菌肠细菌的所述处理的饲料引入对白斑综合症病毒(wssv)敏感的水生生物。
37.一种治疗水生生物中白斑综合症的方法,包括以下步骤:
产生用于具有基因修饰的益生菌肠细菌的水生生物的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌肠细菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna);和
将有效量的具有基因修饰的益生菌肠细菌的所述处理的饲料引入感染白斑综合症病毒(wssv)的水生生物。
38.一种在水产养殖环境中接种白斑综合症的方法,包括:
产生用于具有基因修饰的益生菌肠细菌的水生生物的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌肠细菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna);和
将有效量的具有基因修饰的益生菌肠细菌的所述处理的饲料引入具有对白斑综合症病毒(wssv)敏感的水生生物种群的水产养殖环境。
39.一种在水产养殖环境中治疗白斑综合症的方法,包括:
产生用于具有基因修饰的益生菌肠细菌的水生生物的处理的饲料,所述基因修饰的益生菌肠细菌表达选自seqidno.1、seqidno.2和/或seqidno.3的至少一种异源抑制性多核苷酸,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向白斑综合症病毒中的必需基因的双链rna多核苷酸分子(dsrna);
将有效量的具有基因修饰的益生菌肠细菌的所述处理的饲料引入具有感染白斑综合症病毒(wssv)的水生生物种群的水产养殖环境。
40.多核苷酸,被鉴定为seqidno.1或与seqidno.1具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.10的wsv477基因表达的dsrna。
41.多核苷酸,被鉴定为seqidno.2或与seqidno.2具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.8的vp28基因表达的dsrna。
42.多核苷酸,被鉴定为seqidno.3或与seqidno.3具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.6的vpl9基因表达的dsrna。
43.基因修饰的益生菌肠细菌,表达seqidno.1或与seqidno.1具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.10的wsv477基因表达的dsrna。
44.基因修饰的益生菌肠细菌,表达seqidno.2或与seqidno.2具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.8的vp28基因表达的dsrna。
45.基因修饰的益生菌肠细菌,表达seqidno.3或与seqidno.3具有约75%同源性的序列,其表达形成抑制白斑综合症病毒中被鉴定为seqidno.6的vpl9基因表达的dsrna。
46.一种控制病原体的方法,包括以下步骤:
将基因修饰的肠道细菌引入宿主,该宿主表达针对病原体中的必需基因的异源dsrna多核苷酸,其中所述基因修饰的肠道细菌被配置为定殖所述宿主;
表达所述异源dsrna多核苷酸;和
通过dsrna诱导的rna干扰机制来抑制所述必需基因表达。
47.如权利要求46所述的控制病原体的方法,其中所述基因修饰的肠道细菌包括rnaseiii缺陷型基因修饰的肠道细菌。
48.如权利要求47所述的控制病原体的方法,其中所述rnaseiii缺陷型基因修饰的肠道细菌包括选自下列的rnaseiii缺陷型基因修饰的肠道细菌:rnaseiii缺陷型基因修饰的酸微菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的放线菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的alphaprotcobactcria;rnaseiii缺陷型基因修饰的厌氧蝇菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的bacilli;rnaseiii缺陷型基因修饰的bactcroidia;rnaseiii缺陷型基因修饰的β-变形菌;梭菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的δ-变形菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的epsilonproteobacteria;rnaseiii缺陷型基因修饰的黄杆菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的fusobactcria;rnaseiii缺陷型基因修饰的γ-变形菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的柔膜菌;rnaseiii缺陷型基因修饰的opitutac;rnaseiii缺陷型基因修饰的oscillatoriophycideae;rnaseiii缺陷型基因修饰的phycisphaerae;rnaseiii缺陷型基因修饰的planctomycetia;rnaseiii缺陷型基因修饰的rubrobactcria;rnaseiii缺陷型基因修饰的sphingobactcriia;rnaseiii缺陷型基因修饰的集球藻;rnaseiii缺陷型基因修饰的thermomicrohia;和rnaseiii缺陷型基因修饰的疣微菌。
49.如权利要求48所述的控制病原体的方法,其中所述宿主包括表4-6中鉴定的一种或多种有机体。
50.如权利要求48所述的控制病原体的方法,其中所述宿主包括一种或多种水生生物。
51.如权利要求50所述的控制病原体的方法,其中所述一种或多种水生生物包括在水产养殖环境中饲养的虾。
52.如权利要求49所述的控制病原体的方法,其中所述病原体包括表4-6中鉴定的一种或多种病原体。
53.如权利要求52所述的控制病原体的方法,其中所述病原体中的必需基因包括选自下列的一种或多种病原体基因:病原毒力基因、病原外壳蛋白基因、病原菌代谢活性基因、病原体感染途径基因、病原体能量产生基因、病原体复制基因、病原体侵袭因子基因、病原体粘附因子基因、病原体内毒素基因、病原体外毒素基因、病原菌亲核基因、病原体宿主转换基因和病原体多核苷酸复制基因。
54.如权利要求46所述的控制病原体的方法,其中所述将基因修饰的肠道细菌引入宿主的步骤包括将治疗有效量的基因修饰的肠道细菌引入宿主的步骤。
55.如权利要求54所述的控制病原体的方法,其中所述将治疗有效量的基因修饰的肠道细菌引入宿主的步骤包括通过处理的饲料将治疗有效量的基因修饰的肠道细菌体内引入宿主。
56.如权利要求46所述的控制病原体的方法,其中所述针对病原体中的必需基因的异源dsrna多核苷酸包括针对病原体中必需基因的保守区域的异源dsrna多核苷酸。
57.一种生物防治水生生物中病原体的方法,包括以下步骤:
基因修饰的益生菌,被配置为定殖表达至少一种异源抑制性多核苷酸的宿主水生生物的肠道,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向病原体中的必需基因的双链rna多核苷酸(dsrna)分子;和
向所述宿主水生生物体内给予有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述抑制性rna多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起所述必需病原体基因的下调。
58.如权利要求57所述的生物防治水生生物中病原体的方法,其中所述基因修饰的益生菌包括rnaseiii缺陷型肠道细菌。
59.如权利要求58所述的生物防治水生生物中病原体的方法,其中所述rnaseiii缺陷型肠道细菌包括选自下列的细菌:酸微菌;放线菌;alphaprotcobactcria;厌氧蝇菌;bacilli;bactcroidia;β-变形菌;梭菌;δ-变形菌;epsilonproteobacteria;黄杆菌;fusobactcria;γ-变形菌;柔膜菌;opitutac;oscillatoriophycideae;phycisphaerae;planctomycetia;rubrobactcria;sphingobactcriia;集球藻;thermomicrohia;和疣微菌。
60.如权利要求57所述的生物防治水生生物中病原体的方法,其中所述宿主水生生物包括虾。
61.如权利要求60所述的生物防治水生生物中病原体的方法,其中所述必需病原体基因包括选自下列的一种或多种必需病原体基因:来自白斑综合症病毒(wssv)的一种或多种必需病原体基因;来自传染性皮下及造血组织坏死病毒(ihhnv)的一种或多种必需病原体基因;来自黄头病毒(yhv)的一种或多种必需病原体基因;来自挑拉综合征病毒(tsv)的一种或多种必需病原体基因;和来自肌肉坏死病毒(imnv)的一种或多种必需病原体基因。
62.如权利要求61所述的生物防治水生生物中病原体的方法,其中所述向所述宿主水生生物体内给予有效量的基因修饰的益生菌的步骤包括通过处理的饲料向虾体内给予治疗有效量的基因修饰的肠道细菌。
63.一种控制病原体的系统,包括以下步骤:
基因修饰的益生菌,被配置为定殖是rnase缺陷型并且进一步表达至少一种异源抑制性多核苷酸的宿主有机体的肠道,其中所述至少一种异源抑制性多核苷酸是靶向病原体中的必需基因的双链rna多核苷酸(dsrna);和
向所述宿主有机体体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌,使得被配置为下调至少一种必需病原体基因的表达的所述抑制性rna多核苷酸诱导rna干扰机制,从而引起所述必需病原体基因的下调。
64.如权利要求63所述的控制病原体的系统,其中所述基因修饰的益生菌包括rnaseiii缺陷型益生菌。
65.如权利要求64所述的控制病原体的系统,其中所述基因修饰的益生菌肠细菌包括选自下列的细菌:酸微菌;放线菌;alphaprotcobactcria;厌氧蝇菌;bacilli;bactcroidia;β-变形菌;梭菌;δ-变形菌;epsilonproteobacteria;黄杆菌;fusobactcria;γ-变形菌;柔膜菌;opitutac;oscillatoriophycideae;phycisphaerae;planctomycetia;rubrobactcria;sphingobactcriia;集球藻;thermomicrohia;和疣微菌。
66.如权利要求65所述的控制病原体的系统,其中所述宿主有机体包括表4-6中鉴定的一种或多种有机体。
67.如权利要求65所述的控制病原体的系统,其中所述宿主有机体包括水生生物。
68.如权利要求67所述的控制病原体的系统,其中所述水生生物包括虾。
69.如权利要求66所述的控制病原体的系统,其中所述病原体包括表4-6中鉴定的一种或多种病原体。
70.如权利要求69所述的控制病原体的系统,其中所述必需基因包括选自下列的一种或多种必需病原体基因:病原毒力基因、病原外壳蛋白基因、病原菌代谢活性基因、病原体感染途径基因、病原体能量产生基因、病原体复制基因、病原体侵袭因子基因、病原体粘附因子、病原体内毒素基因、病原体外毒素基因、病原菌亲核基因、病原体宿主转换基因和病原体多核苷酸复制基因。
71.如权利要求63所述的控制病原体的系统,其中所述向所述宿主有机体体内给予治疗有效量的所述基因修饰的益生菌的步骤包括向宿主给予治疗有效量的基因修饰的益生菌的步骤。
72.如权利要求71所述的控制病原体的系统,其中所述向宿主给予治疗有效量的基因修饰的益生菌的步骤包括通过处理的饲料向宿主体内给予治疗有效量的基因修饰的益生菌。
73.如权利要求63所述的控制病原体的系统,其中所述针对病原体中的必需基因的异源dsrna多核苷酸包括针对病原体中必需基因的保守区域的异源dsrna多核苷酸。