CD47抗体及其用于治疗癌症的用途的制作方法

文档序号:21603011发布日期:2020-07-24 16:56阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种特异性结合人类cd47的人源化抗体或其抗原结合片段,所述抗体或抗原结合片段包含轻链可变区和重链可变区,其中所述重链可变区包含选自seqidno:16、19、21和23的hcdr1;选自seqidno:17、20、22和24的hcdr2;以及seqidno:18的hcdr3;其中所述轻链可变区包含选自seqidno:31和34的lcdr1;选自seqidno:32和35的lcdr2;以及选自seqidno:33和36的lcdr3;其中所述重链可变区包含与选自seqidno:2、3、4、5、6、7和8的氨基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列;并且其中所述轻链可变区包含与选自seqidno:10、11、12、13、14和15的氨基酸序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列。

2.一种特异性结合人类cd47的人源化抗体或其抗原结合片段,所述抗体或抗原结合片段包含轻链可变区和重链可变区,其中所述重链可变区包含选自seqidno:16、19、21和23的hcdr1;选自seqidno:17、20、22和24的hcdr2;以及seqidno:18的hcdr3;其中所述轻链可变区包含选自seqidno:31和34的lcdr1;选自seqidno:32和35的lcdr2;以及选自seqidno:33和36的lcdr3;其中所述重链可变区包含:

a)以seqidno:88所列的人类ighv3-23/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h44、h49、h82、h89、h91和h94是供体残基;或

b)以seqidno:89所列的人类ighv3-48/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基;或

c)以seqidno:90所列的人类ighv3-66/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h29、h49和h82是供体残基;或

d)以seqidno:91所列的人类ighv3-74/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基;并且

其中所述轻链可变区包含:

c)以seqidno:92所列的人类igkv6-21/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l4、l21、l69和l85是供体残基;或

d)以seqidno:93所列的人类igkv1-27/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l21、l49和l69是供体残基。

3.如权利要求1或权利要求2所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重链可变区包含选自以下的hcdr1、hcdr2和hcdr3:seqidno:16、17和18;seqidno:19、20和18;seqidno:21、22和18;seqidno:16、20和18;以及seqidno:23、24和18。

4.如权利要求1至3中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含选自以下的lcdr1、lcdr2和lcdr3:seqidno:31、32和33;seqidno:31、32和36;以及seqidno:34、35和33。

5.如权利要求1至4中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段包含选自以下的hcdr1、hcdr2、hcdr3、lcdr1、lcdr2和lcdr3:seqidno:16、17、18、31、32和33;seqidno:16、17、18、34、35和33;seqidno:19、20、18、31、32和33;seqidno:19、20、18、34、35和33;seqidno:21、22、18、31、32和33;seqidno:21、22、18、34、35和33;seqidno:16、20、18、31、32和33;seqidno:16、20、18、34、35和33;seqidno:23、24、18、31、32和33;seqidno:23、24、18、34、35和33;seqidno:16、17、18、31、32和36;seqidno:19、20、18、31、32和36;seqidno:21、22、18、31、32和36;16、20、18、31、32和36;以及seqidno:23、24、18、31、32和36。

6.一种特异性结合人类cd47的人源化抗体或其抗原结合片段,所述抗体或抗原结合片段包含轻链可变区和重链可变区,其中所述重链可变区包含选自seqidno:25、28和29的hcdr1;选自seqidno:26和30的hcdr2;以及seqidno:27的hcdr3;并且其中所述轻链可变区包含选自seqidno:37和40的lcdr1;seqidno:38的lcdr2;以及选自seqidno:39和41的lcdr3;其中所述重链可变区包含与选自seqidno:2、3、4、5、6、7和8的氨基酸序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列;并且其中所述轻链可变区包含与选自seqidno:10、11、12、13、14和15的氨基酸序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列。

7.一种特异性结合人类cd47的人源化抗体或其抗原结合片段,所述抗体或抗原结合片段包含轻链可变区和重链可变区,其中所述重链可变区包含选自seqidno:25、28和29的hcdr1;选自seqidno:26和30的hcdr2;以及seqidno:27的hcdr3;并且其中所述轻链可变区包含选自seqidno:37和40的lcdr1;seqidno:38的lcdr2;以及选自seqidno:39和41的lcdr3;其中所述重链可变区包含:

a)以seqidno:88所列的人类ighv3-23/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h44、h49、h82、h89、h91和h94是供体残基;或

b)以seqidno:89所列的人类ighv3-48/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基;或

c)以seqidno:90所列的人类ighv3-66/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h29、h49和h82是供体残基;或

d)以seqidno:91所列的人类ighv3-74/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基;并且

其中所述轻链可变区包含:

c)以seqidno:92所列的人类igkv6-21/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l4、l21、l69和l85是供体残基;或

d)以seqidno:93所列的人类igkv1-27/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l21、l49和l69是供体残基。

8.如权利要求6或权利要求7所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重链可变区包含选自以下的hcdr1、hcdr2和hcdr3:seqidno:25、26和27;seqidno:28、26和27;seqidno:29、30和27;以及seqidno:29、26和27。

9.如权利要求6至8中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含选自以下的lcdr1、lcdr2和lcdr3:seqidno:37、38和39;seqidno:40、38和39;以及seqidno:37、38和41。

10.如权利要求6至9中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段包含选自以下的hcdr1、hcdr2、hcdr3、lcdr1、lcdr2和lcdr3:seqidno:25、26、27、37、38和39;seqidno:25、26、27、40、38和39;seqidno:25、26、27、37、38和41;seqidno:28、26、27、37、38和39;seqidno:28、26、27、40、38和39;seqidno:28、26、27、37、38和41;seqidno:29、30、27、37、38和39;seqidno:29、30、27、40、38和39;seqidno:29、30、27、37、38和41;seqidno:29、26、27、37、38和39;seqidno:29、26、27、40、38和39;以及seqidno:29、26、27、37、38和41。

11.如权利要求1至10中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重链可变区包含选自以下的氨基酸序列:seqidno:2、3、4、5、6、7和8。

12.如权利要求1至11中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含选自以下的氨基酸序列:seqidno:10、11、12、13、14和15。

13.如权利要求1至12中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重链可变区和轻链可变区包含seqidno:2和10;seqidno:3和11;seqidno:3和12;seqidno:3和13;seqidno:3和14;seqidno:4和11;seqidno:4和12;seqidno:4和13;seqidno:4和14;seqidno:5和11;seqidno:5和12;seqidno:5和13;seqidno:5和14;seqidno:6和11;seqidno:6和12;seqidno:6和13;seqidno:6和14;seqidno:7和11;seqidno:7和12;seqidno:7和13;seqidno:7和14;seqidno:8和11;seqidno:8和12;seqidno:8和13;seqidno:8和14;seqidno:3和15。

14.一种特异性结合人类cd47的人源化抗体或其抗原结合片段,所述抗体或抗原结合片段包含轻链可变区和重链可变区,其中所述重链可变区包含seqidno:16的hcdr1、seqidno:17的hcdr2和seqidno:18的hcdr3;并且其中所述轻链可变区包含seqidno:31的lcdr1、seqidno:32的lcdr2和seqidno:33的lcdr3;并且其中所述重链可变区包含与seqidno:3具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列并且所述轻链可变区包含与seqidno:13具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列;并且其中所述抗体相较于ab47具有减少的红血球凝集。

15.如权利要求14所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重链可变区包含seqidno:3的氨基酸序列并且所述轻链可变区包含seqidno:13的氨基酸序列。

16.如权利要求1至15中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述重量可变区包含:

a)以seqidno:88所列的人类ighv3-23/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h44、h49、h82、h89、h91和h94是供体残基;或

b)以seqidno:89所列的人类ighv3-48/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基;或

c)以seqidno:90所列的人类ighv3-66/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h29、h49和h82是供体残基;或

d)以seqidno:91所列的人类ighv3-74/hj4构架,其中根据kabat编号,构架位置h49是供体残基。

17.如权利要求16所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中根据kabat编号,h29是f,h44是r或g,h49是a,h82是m或i,h89是i或v,h91是f或y,并且h94是r。

18.如权利要求1至17中任一项所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含:

a)以seqidno:92所列的人类igkv6-21/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l4、l21、l69和l85是供体残基;或

b)以seqidno:93所列的人类igkv1-27/kj2构架,其中根据kabat编号,构架位置l21、l49和l69是供体残基。

19.如权利要求18所述的人源化抗体或其抗原结合片段,其中根据kabat编号,l4是m,l21是l,l49是k,l69是t或s,并且l85是v或t。

20.如权利要求1至19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段是igg1同型物。

21.如权利要求1至20中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段相较于其亲本抗体具有增强的抗体依赖型细胞毒性(adcc)。

22.如权利要求1至21中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段相较于其亲本抗体具有增强的抗体依赖型细胞吞噬作用(adcp)。

23.如权利要求1至22中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段相较于其亲本抗体具有增强的补体依赖型细胞毒性(cdc)。

24.如权利要求1至19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段是fab、fab'、f(ab')2、fv片段、双功能抗体、单链抗体、scfv片段或scfv-fc。

25.如权利要求1至24中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段在体外和/或体内诱导cd47表达细胞凋亡。

26.如权利要求1至25中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段相较于其亲本抗体具有减少的核心岩藻糖基化。

27.如权利要求1至26中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段经去岩藻糖基化。

28.如权利要求1至27中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段阻断cd47与sirpα之间的相互作用。

29.如权利要求1至28中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段相较于ab47具有减少的红血球凝集。

30.一种核酸序列,所述核酸序列编码如权利要求1至29中任一项所述的抗体或抗原结合片段。

31.一种表达载体,所述表达载体包含如权利要求29所述的核酸。

32.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含如权利要求30所述的核酸或如权利要求28所述的表达载体。

33.一种宿主细胞,所述宿主细胞表达如权利要求1至29中任一项所述的抗体或抗原结合片段。

34.一种生产如权利要求1至23中任一项所述的抗体或抗原结合片段的方法,所述方法包括培养如权利要求32或权利要求33所述的宿主细胞。

35.如权利要求34所述的方法,所述方法还包括分离所述抗体或其抗原结合片段。

36.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求1至29中任一项所述的抗cd47抗体或抗原结合片段。

37.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括:

a)将受试者鉴定为患有cd47表达癌症;以及

b)向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求1至29中任一项所述的抗cd47抗体或其抗原结合片段。

38.如权利要求37所述的方法,其中步骤a)包括:

i)分离癌组织;以及

ii)检测所分离的癌组织中的cd47。

39.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括:

a)将受试者鉴定为具有癌组织相对于非癌组织升高的巨噬细胞浸润水平;以及

b)向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求1至26中任一项所述的抗cd47抗体或其抗原结合片段。

40.如权利要求39所述的方法,其中步骤a)包括:

i)从所述受试者分离癌组织和周围非癌组织;

ii)检测所分离的癌组织和非癌组织中的巨噬细胞;以及

iii)比较所述癌组织相对于所述非癌组织中的染色量。

41.如权利要求40所述的方法,其中所述巨噬细胞染色是利用抗cd163抗体进行。

42.如权利要求36至41中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症是血液癌症或实体癌症。

43.如权利要求36至42中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自非霍奇金淋巴瘤、b淋巴母细胞性淋巴瘤、b细胞慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤、瑞特氏综合征、滤泡性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓纤维化、真性红血球增多症、皮肤t细胞淋巴瘤、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(mgus)、脊髓发育不良综合征(mds)、免疫母细胞性大细胞淋巴瘤、前体b淋巴母细胞性淋巴瘤、急性骨髓性白血病(aml)和间变性大细胞淋巴瘤。

44.如权利要求36至42中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自肺癌、胰脏癌、乳癌、肝癌、卵巢癌、睾丸癌、肾癌、膀胱癌、脊椎癌、脑癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、结肠直肠癌、肛门癌、子宫内膜癌、食管癌、胆囊癌、胃肠癌、胃癌、癌瘤、头颈癌、皮肤癌、黑色素瘤、前列腺癌、垂体癌、胃部癌、子宫癌、阴道癌和甲状腺癌。

45.如权利要求36至42中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自肺癌、肉瘤、结肠直肠癌、头颈癌、卵巢癌、胰脏癌、胃癌、黑色素瘤和乳癌。

46.如权利要求36至45中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段与选自以下一者或多者的免疫检查点分子的抑制剂组合施用:程序化细胞死亡蛋白1(pd-1)、程序化死亡配体1(pd-l1)、pd-l2、细胞毒性t淋巴细胞相关蛋白4(ctla-4)、t细胞免疫球蛋白和粘蛋白结构域3(tim-3)、淋巴细胞活化基因3(lag-3)、癌胚抗原相关细胞粘附分子1(ceacam-1)、ceacam-5、t细胞活化的v结构域ig抑制因子(vista)、b和t淋巴细胞衰减因子(btla)、具有ig和itim结构域的t细胞免疫受体(tigit)、白血球相关免疫球蛋白样受体1(lair1)、cd160、2b4或tgfr。

47.如权利要求36至46中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段与激动性抗cd40抗体组合施用。

48.如权利要求47所述的方法,其中所述激动性抗cd40抗体具有低的岩藻糖基化水平或经去岩藻糖基化。

49.如权利要求36至48中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段与抗体药物缀合物(adc)组合施用,其中所述adc的所述抗体特异性结合至癌细胞的细胞外表面上表达的蛋白质并且所述抗体缀合至包含细胞毒性剂的药物-连接子。

50.如权利要求49所述的方法,其中所述细胞毒性剂是奥瑞司他汀。

51.如权利要求50所述的方法,其中所述adc的所述抗体缀合至选自由vcmmae和mcmmaf组成的组的药物-连接子。

52.一种诱导cd47表达细胞凋亡的方法,所述方法包括使所述细胞与如权利要求1至29中任一项所述的抗体或其抗原结合片段接触。

53.如权利要求52所述的方法,其中所述细胞是在体外。

54.如权利要求52所述的方法,其中所述细胞是在体内。

55.一种经掩蔽的抗体,所述经掩蔽的抗体包含特异性结合至人类cd47蛋白的抗体或其抗原结合片段和至少一个掩蔽结构域,其中至少一个掩蔽结构域包含选自seqidno:44-55、75-86、94和95的氨基酸序列。

56.如权利要求55所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述至少一个掩蔽结构域减小所述抗体或抗原结合片段对人类cd47蛋白的结合亲和力。

57.如权利要求56所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述结合亲和力减小至少约100倍。

58.如权利要求56所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述结合亲和力减小约200倍与约1500倍之间。

59.如权利要求55至58中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述抗体或其抗原结合片段包含重链和轻链,其中所述重链连接至第一掩蔽结构域;或其中所述轻链连接至第二掩蔽结构域;或其中所述重链连接至第一掩蔽结构域并且所述轻链连接至第二掩蔽结构域。

60.如权利要求59所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域包含选自seqidno:44、46、48、50、52、54、75、77、79、81、83、85和94的氨基酸序列;并且所述第二掩蔽结构域包含选自seqidno:45、47、49、51、53、55、76、78、80、82、84、86和95的氨基酸序列。

61.如权利要求60所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域和所述第二掩蔽结构域是选自以下的一对掩蔽结构域:seqidno:44和45;seqidno:46和47;seqidno:48和49;seqidno:50和51;seqidno:52和53;seqidno:54和55;seqidno:75和76;seqidno:77和78;seqidno:79和80;seqidno:81和82;seqidno:83和84;seqidno:85和86;以及seqidno:94和95。

62.如权利要求59至61中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域连接至所述重链的n端并且所述第二掩蔽结构域连接至所述轻链的n端。

63.如权利要求59至62中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中每个掩蔽结构域包含可蛋白酶裂解的连接子并且经由所述可蛋白酶裂解的连接子连接至所述重链或轻链。

64.如权利要求63所述的经掩蔽的抗体,其中所述可蛋白酶裂解的连接子包含基质金属蛋白酶(mmp)裂解位点。

65.如权利要求64所述的经掩蔽的抗体,其中所述mmp裂解位点选自mmp2裂解位点、mmp7裂解位点、mmp9裂解位点和mmp13裂解位点。

66.如权利要求64或权利要求65所述的经掩蔽的抗体,其中在由mmp裂解之后,所述抗体或其抗原结合片段的所述重链和/或轻链包含所述mmp裂解位点的短氨基酸残基。

67.如权利要求66所述的经掩蔽的抗体,其中所述短氨基酸残基包含在所述抗体的n端的序列lrsg、sg或vr。

68.如权利要求55至67中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述抗体或其抗原结合片段是如权利要求1至29中任一项所述的抗体或其抗原结合片段。

69.如权利要求55至68中任一项所述的经掩蔽的抗体,所述经掩蔽的抗体包含连接至第一掩蔽结构域并且具有seqidno:42的氨基酸序列的重链和连接至第二掩蔽结构域并且具有seqidno:43的氨基酸序列的轻链。

70.一种经掩蔽的抗体,所述经掩蔽的抗体包含如权利要求1至29中任一项所述的抗体或其抗原结合片段和至少一个掩蔽结构域。

71.如权利要求70所述的经掩蔽的抗体,其中至少一个掩蔽结构域包含选自seqidno:44-55、75-86、94和95的氨基酸序列。

72.如权利要求70所述的经掩蔽的抗体,其中每个掩蔽结构域包含选自seqidno:44-55、75-86、94和95的氨基酸序列。

73.如权利要求70至72中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述至少一个掩蔽结构域减小所述抗体或抗原结合片段对人类cd47蛋白的结合亲和力。

74.如权利要求73所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述结合亲和力减小至少约100倍。

75.如权利要求73所述的经掩蔽的抗体,其中相较于无所述至少一个掩蔽结构域的所述抗体或其抗原结合片段,所述结合亲和力减小约200倍与约1500倍之间。

76.如权利要求70至75中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述抗体或其抗原结合片段包含重链和轻链,其中所述重链连接至第一掩蔽结构域;或其中所述轻链连接至第二掩蔽结构域;或其中所述重链连接至第一掩蔽结构域并且所述轻链连接至第二掩蔽结构域。

77.如权利要求76所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域包含选自seqidno:44、46、48、50、52、54、75、77、79、81、83、85和94的氨基酸序列;并且所述第二掩蔽结构域包含选自seqidno:45、47、49、51、53、55、76、78、80、82、84、86和95的氨基酸序列。

78.如权利要求77所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域和所述第二掩蔽结构域是选自以下的一对掩蔽结构域:seqidno:44和45;seqidno:46和47;seqidno:48和49;seqidno:50和51;seqidno:52和53;seqidno:54和55;seqidno:75和76;seqidno:77和78;seqidno:79和80;seqidno:81和82;seqidno:83和84;seqidno:85和86;以及seqidno:94和95。

79.如权利要求76至78中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述第一掩蔽结构域连接至所述重链的n端并且所述第二掩蔽结构域连接至所述轻链的n端。

80.如权利要求76至79中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中每个掩蔽结构域包含可蛋白酶裂解的连接子并且经由所述可蛋白酶裂解的连接子连接至所述重链或轻链。

81.如权利要求80所述的经掩蔽的抗体,其中所述可蛋白酶裂解的连接子包含基质金属蛋白酶(mmp)裂解位点。

82.如权利要求81所述的经掩蔽的抗体,其中所述mmp裂解位点选自mmp2裂解位点、mmp7裂解位点、mmp9裂解位点和mmp13裂解位点。

83.如权利要求81或权利要求82所述的经掩蔽的抗体,其中在由mmp裂解之后,所述抗体或其抗原结合片段的所述重链和/或轻链包含所述mmp裂解位点的短氨基酸残基。

84.如权利要求83所述的经掩蔽的抗体,其中所述短氨基酸残基包含在所述抗体的n端的序列lrsg、sg或vr。

85.一种核酸序列,所述核酸序列编码如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体。

86.一种表达载体,所述表达载体包含如权利要求85所述的核酸。

87.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含如权利要求86所述的核酸或如权利要求78所述的表达载体。

88.一种宿主细胞,所述宿主细胞表达如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体。

89.一种生产如权利要求49至76中任一项所述的经掩蔽的抗体的方法,所述方法包括培养如权利要求87或权利要求88所述的宿主细胞。

90.如权利要求89所述的方法,所述方法还包括分离所述经掩蔽的抗体。

91.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体。

92.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括以下步骤:

a)将受试者鉴定为具有癌症相对于周围非癌组织升高的mmp水平;以及

b)向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体,其中所述经掩蔽的抗体的每个掩蔽结构域包含可蛋白酶裂解的连接子并且其中所述可蛋白酶裂解的连接子包含基质金属蛋白酶(mmp)裂解位点。

93.如权利要求92所述的方法,其中所述mmp裂解位点选自mmp2裂解位点、mmp7裂解位点、mmp9裂解位点和mmp13裂解位点。

94.如权利要求92或权利要求93所述的方法,其中所述mmp选自由以下组成的组:mmp2、mmp7、mmp9和mmp13。

95.如权利要求92至94中任一项所述的方法,其中步骤a)包括:

i)从所述受试者分离癌组织和非癌组织;

ii)检测所分离的癌组织和非癌组织中的mmp;以及

iii)比较所述癌组织相对于所述非癌组织中的染色量。

96.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括:

a)将受试者鉴定为患有cd47表达癌症;以及

b)向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体。

97.如权利要求96所述的方法,其中步骤a)包括:

i)分离癌组织;以及

ii)检测所分离的癌组织中的cd47。

98.一种用于治疗受试者的cd47表达癌症的方法,所述方法包括:

a)将受试者鉴定为具有癌组织相对于非癌组织升高的巨噬细胞浸润水平;以及

b)向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求55至84中任一项所述的经掩蔽的抗体。

99.如权利要求98所述的方法,其中步骤a)包括:

i)从所述受试者分离癌组织和周围非癌组织;

ii)检测所分离的癌组织和非癌组织中的巨噬细胞;以及

iii)比较所述癌组织相对于所述非癌组织中的染色量。

100.如权利要求99所述的方法,其中所述巨噬细胞染色是利用抗cd163抗体进行。

101.如权利要求91至100中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症是血液癌症或实体癌症。

102.如权利要求91至101中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自非霍奇金淋巴瘤、b淋巴母细胞性淋巴瘤、b细胞慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤、瑞特氏综合征、滤泡性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓纤维化、真性红血球增多症、皮肤t细胞淋巴瘤、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(mgus)、脊髓发育不良综合征(mds)、免疫母细胞性大细胞淋巴瘤、前体b淋巴母细胞性淋巴瘤、急性骨髓性白血病(aml)和间变性大细胞淋巴瘤。

103.如权利要求91至101中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自肺癌、胰脏癌、乳癌、肝癌、卵巢癌、睾丸癌、肾癌、膀胱癌、脊椎癌、脑癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、结肠直肠癌、肛门癌、子宫内膜癌、食管癌、胆囊癌、胃肠癌、胃癌、肉瘤、头颈癌、黑色素瘤、皮肤癌、前列腺癌、垂体癌、胃部癌、子宫癌、阴道癌和甲状腺癌。

104.如权利要求91至101中任一项所述的方法,其中所述cd47表达癌症选自肺癌、肉瘤、结肠直肠癌、头颈癌、卵巢癌、胰脏癌、胃癌、黑色素瘤和乳癌。

105.如权利要求91至104中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体与选自以下一者或多者的免疫检查点分子的抑制剂组合施用:程序化细胞死亡蛋白1(pd-1)、程序化死亡配体1(pd-l1)、pd-l2、细胞毒性t淋巴细胞相关蛋白4(ctla-4)、t细胞免疫球蛋白和粘蛋白结构域3(tim-3)、淋巴细胞活化基因3(lag-3)、癌胚抗原相关细胞粘附分子1(ceacam-1)、ceacam-5、t细胞活化的v结构域ig抑制因子(vista)、b和t淋巴细胞衰减因子(btla)、具有ig和itim结构域的t细胞免疫受体(tigit)、白血球相关免疫球蛋白样受体1(lair1)、cd160、2b4或tgfr。

106.如权利要求91至105中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段与激动性抗cd40抗体组合施用。

107.如权利要求106所述的方法,其中所述激动性抗cd40抗体具有低的岩藻糖基化水平或经去岩藻糖基化。

108.如权利要求91至107中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段与抗体药物缀合物(adc)组合施用,其中所述adc的所述抗体特异性结合至癌细胞的细胞外表面上表达的蛋白质并且所述抗体缀合至包含细胞毒性剂的药物-连接子。

109.如权利要求108所述的方法,其中所述细胞毒性剂是奥瑞司他汀。

110.如权利要求109所述的方法,其中所述adc的所述抗体缀合至选自由vcmmae和mcmmaf组成的组的药物-连接子。

111.如权利要求91至110中任一项所述的方法,其中所述经掩蔽的抗体包括包含可蛋白酶裂解的连接子的至少一个掩蔽结构域,并且其中所述可蛋白酶裂解的连接子在肿瘤微环境中裂解。

112.如权利要求111所述的方法,其中所述可蛋白酶裂解的连接子在所述肿瘤微环境中裂解之后,所述掩蔽结构域从所述抗cd47抗体或其抗原结合片段释放。

113.如权利要求111或权利要求112所述的方法,其中所述可蛋白酶裂解的连接子包含氨基酸序列ipvslrsg(seqidno:73)或gplgvr(seqidno:57)。

114.如权利要求111至113中任一项所述的方法,其中所述可蛋白酶裂解的连接子包含mmp裂解位点。

115.如权利要求114所述的方法,其中所述mmp裂解位点选自由mmp2裂解位点、mmp7裂解位点、mmp9裂解位点和mmp13裂解位点组成的组。

116.如权利要求111至115中任一项所述的方法,其中在释放所述抗cd47抗体或其抗原结合片段之后,所述抗cd47抗体或其抗原结合片段具有可蛋白酶裂解的连接子的短氨基酸残基。

117.如权利要求116所述的方法,其中所述短氨基酸残基包含在所述抗体的n端的lrsg、sg或vr序列。

118.如权利要求111至117中任一项所述的方法,其中在所述肿瘤微环境中裂解之后,所释放的抗cd47抗体或其抗原结合片段以比所述经掩蔽的抗体对cd47的亲和力强至少约100倍的亲和力结合至cd47。

119.如权利要求111至117中任一项所述的方法,其中在所述肿瘤微环境中裂解之后,所释放的抗cd47抗体或其抗原结合片段以比所述经掩蔽的抗体对cd47的亲和力强200倍至1500倍的亲和力结合至cd47。

120.如权利要求36至51和91至119中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或其抗原结合片段或所述经掩蔽的抗体的抗cd47抗体或其抗原结合片段相较于其亲本抗cd47抗体在体外展现减少的血球凝集。

121.如权利要求120所述的方法,其中所述亲本抗体是ab47。

122.如权利要求36至51和91至121中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或经掩蔽的抗体的施用并不诱导所述受试者的血球凝集。

123.如权利要求36至51和91至122中任一项所述的方法,其中所述抗cd47抗体或经掩蔽的抗体在体外和/或体内诱导cd47表达细胞凋亡。

124.如权利要求123所述的方法,其中所述抗cd47抗体或经掩蔽的抗体在体内诱导cd47表达细胞凋亡。

125.如权利要求124所述的方法,其中所述cd47表达细胞是癌细胞。


技术总结
本发明提供了特异性结合至CD47的人源化抗体,包括经掩蔽的抗体。提供了使用抗CD47抗体(包括经掩蔽的抗体)以调节CD47表达细胞的活性(例如,抑制CD47表达细胞的增殖)的方法以及用于治疗与CD47表达细胞相关的一种或多种疾病或病症(例如癌症)的方法。

技术研发人员:S·加代;M·莱文古德;V·特朗;L·韦斯滕多夫;C·卡洛西诺;M·费尔道斯;C-L·劳
受保护的技术使用者:西雅图基因公司
技术研发日:2018.11.29
技术公布日:2020.07.24
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