一种检测单碱基突变的方法及应用与流程

文档序号:18747723发布日期:2019-09-24 20:24阅读:664来源:国知局

本发明涉及基因检测技术领域,尤其涉及一种测单碱基突变的方法及应用。



背景技术:

基因是遗传的基本单元,携带有遗传信息的dna或rna序列,通过复制,把遗传信息传递给下一代,指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,现有技术中对基因检测时对dna的提取过程复杂,dna中可能含有少量的rna或蛋白质,从而使得对dna的提纯效果不佳,且对基因检测的效果不佳。



技术实现要素:

本发明提出了一种测单碱基突变的方法及应用,以解决上述背景技术中提出的问题。

本发明提出了一种检测单碱基突变的方法,包括如下步骤:

s1、dna的提取:提取少量的动物或植物组织,放入杀菌消毒后的试管中,向试管中加入裂解溶液,将试管放置在高速离心机上离心,时间控制在5-10分钟;

s2、dna的分离;

s3、dna的纯化:在s2完成后,向试管内加入60%-70%的乙醇溶液以及浓度为10%-20%的te溶液,并将试管放置在高速离心机内,高速离心3-5分钟,取试管内的下层溶液;

s4、dna的分析;

s5、nda的扩增:在dna的试液中加入crs引物,经过pcr扩增之后,其中“gccg”为hhal的酶切识别位点,从而使用crs-pcr引物扩增等位基因时,在pcr的产物中就能够就形成了可由hhal识别的酶切位点,酶切后每个等位基因的片段长度均不相等;

s6、dna的检测:具体包括如下步骤:

m1、双链dna分子采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,其由于迁移行为决定于其分子大小和电荷,不同长度的dna片段能够在聚丙烯酰胺凝胶基础上被区分开;

m2、加入了尿素和甲酰胺的混合溶液组成的变性剂梯度,从而能够把同样长度但序列不同的dna片段区分开来一个特定的dna片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域和解链行为一个几百个碱基对的dna片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成;

m3、当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度,该区域这一段连续的碱基对发生解链,浓度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链,直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链dna完全解链从而双链dna完全解链;

m4、不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,从而双链dna完全解链,如果不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,dna片段中每个碱基处的序列差异都能被区分开。

优选的,dna的分析具体包括如下步骤:

1)、取dna原液15μl稀释至3.0ml,用uv-1601型紫外分光光度计测定230nm、260nm以及280nm的吸光值,高质量的dna的要求:a260/a230小于2.0;同时a260/a280介于1.7到1.9之间;

2)、将dna原适液适当稀释后,用1xtae,0.8%琼脂糖凝胶2v/cm电泳1小时进行质量监测;

3)、向一定量的原适液的dna中加入限制性内切酶ecor1至4-5u/μg的dna,在温度37摄氏度的状态下保存24小时,用0.5xtbe,0.8%琼脂糖凝胶2.5v/cm电泳3小时进行检测。

优选的,s1中dna提取时加入的裂解溶液具体为0.1mol/l氯化钠溶液、10mol/l的tris-hci溶液以及1%sds溶液。

优选的,s1中dna提取时加入的裂解溶液的ph为8.0。

优选的,s2中的dna的分离具体包括向在完成操作s1后,向试管内加入苯酚-氯仿溶液、氯仿-异戊醇溶液、冰无水乙醇以及5mol/l的氯化钠溶液,并将试管再次放置在高速离心机上进行离心,当试管内的溶液出现白色絮状沉淀时,停止离心。

本发明还提出了一种检测单碱基突变的方法的用途,具体的用途如下:

f1、了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险:资料证实10%~15%的癌症与遗传有关,糖尿病、心脑血管疾病等多种疾病都与遗传因素有关;

f2、用于疾病的诊断:采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果;

f3、正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。

本发明提出的一种测单碱基突变的方法及应用,有益效果在于测单碱基突变的方法及应用对dna的提取便捷,同时dna的纯度能够有效的得到保障,且检测的效果明显,能够了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险,采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果,能够正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。

具体实施方式

下面结合具体实施例来对本发明做进一步说明。

实施例1

一种检测单碱基突变的方法,包括如下步骤:

s1、dna的提取:提取少量的动物或植物组织,放入杀菌消毒后的试管中,向试管中加入裂解溶液,将试管放置在高速离心机上离心,时间控制在5分钟,裂解溶液具体为0.1mol/l氯化钠溶液、10mol/l的tris-hci溶液以及1%sds溶液,裂解溶液的ph为8.0;

s2、dna的分离;具体包括向在完成操作s1后,向试管内加入苯酚-氯仿溶液、氯仿-异戊醇溶液、冰无水乙醇以及5mol/l的氯化钠溶液,并将试管再次放置在高速离心机上进行离心,当试管内的溶液出现白色絮状沉淀时,停止离心。

s3、dna的纯化:在s2完成后,向试管内加入60%的乙醇溶液以及浓度为10%的te溶液,并将试管放置在高速离心机内,高速离心3分钟,取试管内的下层溶液;

s4、dna的分析;具体包括如下步骤:

1)、取dna原液15μl稀释至3.0ml,用uv-1601型紫外分光光度计测定230nm、260nm以及280nm的吸光值,高质量的dna的要求:a260/a230为1.4;同时a260/a280为1.75;

2)、将dna原适液适当稀释后,用1xtae,0.8%琼脂糖凝胶2v/cm电泳1小时进行质量监测;

3)、向一定量的原适液的dna中加入限制性内切酶ecor1至4u/μg的dna,在温度37摄氏度的状态下保存24小时,用0.5xtbe,0.8%琼脂糖凝胶2.5v/cm电泳3小时进行检测。

s5、nda的扩增:在dna的试液中加入crs引物,经过pcr扩增之后,其中“gccg”为hhal的酶切识别位点,从而使用crs-pcr引物扩增等位基因时,在pcr的产物中就能够就形成了可由hhal识别的酶切位点,酶切后每个等位基因的片段长度均不相等;

s6、dna的检测:具体包括如下步骤:

m1、双链dna分子采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,其由于迁移行为决定于其分子大小和电荷,不同长度的dna片段能够在聚丙烯酰胺凝胶基础上被区分开;

m2、加入了尿素和甲酰胺的混合溶液组成的变性剂梯度,从而能够把同样长度但序列不同的dna片段区分开来一个特定的dna片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域和解链行为一个几百个碱基对的dna片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成;

m3、当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度,该区域这一段连续的碱基对发生解链,浓度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链,直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链dna完全解链从而双链dna完全解链;

m4、不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,从而双链dna完全解链,如果不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,dna片段中每个碱基处的序列差异都能被区分开。

本发明提出了一种检测单碱基突变的方法的用途,具体的用途如下:

f1、了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险:资料证实10%的癌症与遗传有关,糖尿病、心脑血管疾病等多种疾病都与遗传因素有关;

f2、用于疾病的诊断:采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果;

f3、正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。

实施例2

一种检测单碱基突变的方法,包括如下步骤:

s1、dna的提取:提取少量的动物或植物组织,放入杀菌消毒后的试管中,向试管中加入裂解溶液,将试管放置在高速离心机上离心,时间控制在8分钟,裂解溶液具体为0.1mol/l氯化钠溶液、10mol/l的tris-hci溶液以及1%sds溶液,裂解溶液的ph为8.0;

s2、dna的分离;具体包括向在完成操作s1后,向试管内加入苯酚-氯仿溶液、氯仿-异戊醇溶液、冰无水乙醇以及5mol/l的氯化钠溶液,并将试管再次放置在高速离心机上进行离心,当试管内的溶液出现白色絮状沉淀时,停止离心。

s3、dna的纯化:在s2完成后,向试管内加入65%的乙醇溶液以及浓度为15%的te溶液,并将试管放置在高速离心机内,高速离心4分钟,取试管内的下层溶液;

s4、dna的分析;具体包括如下步骤:

1)、取dna原液15μl稀释至3.0ml,用uv-1601型紫外分光光度计测定230nm、260nm以及280nm的吸光值,高质量的dna的要求:a260/a230为1.6;同时a260/a280介于1.8;

2)、将dna原适液适当稀释后,用1xtae,0.8%琼脂糖凝胶2v/cm电泳1小时进行质量监测;

3)、向一定量的原适液的dna中加入限制性内切酶ecor1至4.5u/μg的dna,在温度37摄氏度的状态下保存24小时,用0.5xtbe,0.8%琼脂糖凝胶2.5v/cm电泳3小时进行检测。

s5、nda的扩增:在dna的试液中加入crs引物,经过pcr扩增之后,其中“gccg”为hhal的酶切识别位点,从而使用crs-pcr引物扩增等位基因时,在pcr的产物中就能够就形成了可由hhal识别的酶切位点,酶切后每个等位基因的片段长度均不相等;

s6、dna的检测:具体包括如下步骤:

m1、双链dna分子采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,其由于迁移行为决定于其分子大小和电荷,不同长度的dna片段能够在聚丙烯酰胺凝胶基础上被区分开;

m2、加入了尿素和甲酰胺的混合溶液组成的变性剂梯度,从而能够把同样长度但序列不同的dna片段区分开来一个特定的dna片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域和解链行为一个几百个碱基对的dna片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成;

m3、当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度,该区域这一段连续的碱基对发生解链,浓度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链,直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链dna完全解链从而双链dna完全解链;

m4、不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,从而双链dna完全解链,如果不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,dna片段中每个碱基处的序列差异都能被区分开。

本发明提出了一种检测单碱基突变的方法的用途,具体的用途如下:

f1、了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险:资料证实13%的癌症与遗传有关,糖尿病、心脑血管疾病等多种疾病都与遗传因素有关;

f2、用于疾病的诊断:采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果;

f3、正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。

实施例3

一种检测单碱基突变的方法,包括如下步骤:

s1、dna的提取:提取少量的动物或植物组织,放入杀菌消毒后的试管中,向试管中加入裂解溶液,将试管放置在高速离心机上离心,时间控制在10分钟,裂解溶液具体为0.1mol/l氯化钠溶液、10mol/l的tris-hci溶液以及1%sds溶液,裂解溶液的ph为8.0;

s2、dna的分离;具体包括向在完成操作s1后,向试管内加入苯酚-氯仿溶液、氯仿-异戊醇溶液、冰无水乙醇以及5mol/l的氯化钠溶液,并将试管再次放置在高速离心机上进行离心,当试管内的溶液出现白色絮状沉淀时,停止离心。

s3、dna的纯化:在s2完成后,向试管内加入70%的乙醇溶液以及浓度为20%的te溶液,并将试管放置在高速离心机内,高速离心5分钟,取试管内的下层溶液;

s4、dna的分析;具体包括如下步骤:

1)、取dna原液15μl稀释至3.0ml,用uv-1601型紫外分光光度计测定230nm、260nm以及280nm的吸光值,高质量的dna的要求:a260/a230为1.9;同时a260/a280为1.85;

2)、将dna原适液适当稀释后,用1xtae,0.8%琼脂糖凝胶2v/cm电泳1小时进行质量监测;

3)、向一定量的原适液的dna中加入限制性内切酶ecor1至5u/μg的dna,在温度37摄氏度的状态下保存24小时,用0.5xtbe,0.8%琼脂糖凝胶2.5v/cm电泳3小时进行检测。

s5、nda的扩增:在dna的试液中加入crs引物,经过pcr扩增之后,其中“gccg”为hhal的酶切识别位点,从而使用crs-pcr引物扩增等位基因时,在pcr的产物中就能够就形成了可由hhal识别的酶切位点,酶切后每个等位基因的片段长度均不相等;

s6、dna的检测:具体包括如下步骤:

m1、双链dna分子采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,其由于迁移行为决定于其分子大小和电荷,不同长度的dna片段能够在聚丙烯酰胺凝胶基础上被区分开;

m2、加入了尿素和甲酰胺的混合溶液组成的变性剂梯度,从而能够把同样长度但序列不同的dna片段区分开来一个特定的dna片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域和解链行为一个几百个碱基对的dna片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成;

m3、当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度,该区域这一段连续的碱基对发生解链,浓度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链,直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链dna完全解链从而双链dna完全解链;

m4、不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,从而双链dna完全解链,如果不同dna片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,dna片段中每个碱基处的序列差异都能被区分开。

本发明提出了一种检测单碱基突变的方法的用途,具体的用途如下:

f1、了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险:资料证实15%的癌症与遗传有关,糖尿病、心脑血管疾病等多种疾病都与遗传因素有关;

f2、用于疾病的诊断:采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果;

f3、正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。

以上所述,仅为本发明较佳的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,根据本发明的技术方案及其发明构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本发明的保护范围之内。

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