1.一种分子标记辅助选择花生株型相关基因位点的分子标记方法,其特征在于:包括用于鉴别花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点的匍匐型和直立型等位变异的caps分子标记lba5b-caps,分子标记lba5b-caps匍匐型等位变异的核苷酸序列如seqidno:1所示,所述分子标记lba5b-caps直立型等位变异的核苷酸序列如seqidno:2所示;分子标记lba5b-caps的引物对为:上游引物序列如seqidno:3所示,下游引物序列如seqidno:4所示。
2.根据权利要求1所述的分子标记辅助选择花生株型相关基因位点的分子标记方法,其特征在于:还包括鉴别花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点两侧连锁的indel标记,包括上游indel标记pm15-id1对应的序列如seqidno:5所示,下游indel标记pm15-id2对应的序列如seqidno.6所示;
indel标记pm15-id1的引物对为:
上游pm15-id1-f:5`-gttgagggttagaatcgaaactg-3`如seqidno:7所示;
下游pm15-id1-r:5`-ggagaagaaggtcccaaaggtg-3`如seqidno:8所示;
indel标记pm15-id2的引物对为:
上游pm15-id2-f:5`-atccaaacctatcgaagctg-3`如seqidno:9所示;
下游pm15-id2-r:5`-aagagggagttgaaccgtaa-3`如seqidno:10所示。
3.权利要求1所述分子标记lba5b-caps在花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点分子标记辅助选择中的应用,其特征在于:以花生基因组dna为模板,利用分子标记lba5b-caps上下游引物进行pcr扩展,对扩增产物进行限制性内切酶scai的消化,之后通过琼脂糖电泳分离检测消化后的产物,如果pcr产物被切成两个小片段,则说明该个体存在lba5b增效等位变异基因位点,如果pcr产物不能被切开,则说明该个体不存在lba5b增效变异基因,而存在降低侧枝与主茎间角度的减效等位变异lba5b。
4.根据权利要求3所述的分子标记lba5b-caps在花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点分子标记辅助选择中的应用,其特征在于:pcr扩展反应为:pcr体系为25ul,其中2×taqmastermix(dyeplus)12.5ul,模板1ul,10um上下游引物各1ul,加水至25ul;pcr反应程序为dna95℃预变性5min;95℃变性30s,55℃退火15s,72℃延伸30s,循环35次;最后72℃延伸10min。
5.根据权利要求3所述的分子标记lba5b-caps在花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点分子标记辅助选择中的应用,其特征在于:限制性内切酶消化反应为:体系为25ul,其中pcr产物5ul,10×hbuffer2.5ul,scaⅰ1ul,加水至25ul,pcr仪37℃保温1h后加入2.5ul10×loadingbuffer终止反应。
6.根据权利要求3所述的分子标记lba5b-caps在花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点分子标记辅助选择中的应用,其特征在于:琼脂糖电泳检测方法为:利用加热或微波炉将1%的琼脂糖tae溶液融化后,制作水平电泳凝胶,再在凝胶中加入核酸燃料;将消化后的产物加入适量loadingbuffer后混匀加入上样孔中,在120v的电压下进行电泳。
7.权利要求2所述所述分子标记在花生侧枝角度、生长习性和株型相关基因位点分子标记辅助选择中的应用,其特征在于:用indel标记pm15-id1或pm15-id2的上下游引物扩增匍匐型花生(小红毛)与直立型花生(南阳花生)的杂交后代的基因组dna,对于indel标记pm15-id1如果能扩增出281bp则标志着匍匐型花生的增效等位变异位点的存在,否则扩增出293bp则标志着存在直立型花生的减效等位变异(见图3);对于indel标记pm15-id2如果能扩增出209bp的扩增片段,则标志着匍匐型花生的增效等位变异位点的存在,否则扩增出179bp则标志着存在直立型花生的减效等位变异。