本发明属于生物技术领域,具体涉及一种小疣刺参促排卵短肽及其编码基因与应用。
背景技术:
小疣刺参(stichopusmonotuberculatus)俗称“黄肉参”,是我国热带海参中具有代表性的高经济价值种类,不仅可食用,亦可作为化妆品和医药的原料。
小疣刺参的人工育苗近几年获得初步成功,主要是采用阴干流水法进行催产,该方法对小疣刺参雄参的催产效果较好,但采用该方法雌参的排卵比例较低,再加上小疣刺参排精排卵存在月相规律,即仅在每年阴历5-8月初一左右的一两天可催产成功,阻碍了小疣海参的产业化人工养殖。因此,迫切需要一种高效的小疣刺参催产方法。
棘皮动物ngiwyamide(ng小肽)最初是从仿刺参的放射状神经索和神经环中分离获得的,是一种结构上类似于脊椎动物ng肽的神经肽,它可诱导仿刺参的体壁和肠道肌肉收缩,刺激海星的管足活动和紫海胆的管足和食道收缩。由于注射ng小肽后会使仿刺参头部发生摆动,因此将其前体蛋白命名为cubifrin。研究发现,注射ng小肽,可以刺激仿刺参卵母细胞的发生和成熟。然而,目前尚无小疣刺参cubifrin基因序列及其衍生小肽的相关研究。
技术实现要素:
本发明的目的是提供一种小疣刺参促排卵短肽及其编码基因与应用。
为实现上述发明目的,本发明以本课题组构建的小疣刺参卵巢转录组文库中cubifrin基因的转录本序列为基础,通过rt-pcr扩增获得cubifrin基因的开放读码框(orf),其核苷酸序列如seqidno.1所示,其编码cubifrin前体蛋白的氨基酸序列如seqidno.2所示。该基因的前体蛋白包含5个ng小肽(ngiwy、ngfwy、ngiwy、ngiwy和nglwy)(图1),翻译后可加工形成3种衍生ng小肽:ngiwy、ngfwy和nglwy,其氨基酸序列如分别如seqidno.3、seqidno.4、seqidno.5所示。由于cubifrin基因的ng小肽可刺激海参卵母细胞的发生和成熟,因此,ngiwy、ngfwy和nglwy可作为刺激小疣刺参雌参排卵的短肽应用于小疣刺参人工育苗。
本发明还提供了一种重组表达载体,其含有上述的小疣刺参cubifrin基因,所述的小疣刺参cubifrin基因的核苷酸序列如seqidno.1所示。
本发明还提供了一种宿主细胞,其含有上述的重组表达载体。
本发明还提供了一种刺激小疣刺参雌参排卵的试剂,其包含有上述的衍生ng小肽中的ngiwy、ngfwy和/或nglwy。
与现有技术相比,本发明的优势在于:
本发明首次披露了小疣刺参cubifrin基因序列及其编码蛋白和衍生ng小肽的相关研究,发现小疣刺参cubifrin基因的前体蛋白包含5个ng小肽(ngiwy、ngfwy、ngiwy、ngiwy和nglwy),翻译后可加工形成3种衍生ng小肽:ngiwy、ngfwy和nglwy。与仿刺参、糙海参和玉足海参的cubifrin基因的ng小肽相比,ngfwy和nglwy为小疣刺参所特有。所述的ngiwy、ngfwy和nglwy可作为刺激小疣刺参雌参排卵的短肽应用于小疣刺参人工育苗。
附图说明
图1为小疣刺参cubifrin基因的核苷酸序列及其编码蛋白。
图2为四种海参cubifrin前体蛋白翻译后加工形成的衍生ng小肽序列比对。
图3为小疣刺参cubifrin前体蛋白3个衍生ng小肽对对小疣刺参排卵的影响。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案和有益技术效果更加清晰,以下结合实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解的是,本说明书中描述的实施例仅仅是为了解释本发明,并非为了限定本发明,实施例的参数、比例等可因地制宜做出选择而对结果并无实质性影响。实施例中除特殊说明外,均为本领域常规试剂和方法步骤。除非特别说明,以下实施例所用试剂和材料均为市购。
实施例1:小疣刺参cubifrin基因的cdna克隆及测序
1、小疣刺参卵巢总rna的提取及第一链cdna的合成
以小疣刺参卵巢组织为材料,采用trizol法(invitrogen)提取总rna。以总rna为模板,使用primescripttmrtkit(takara)进行反转录pcr,获得第一链cdna。
2、小疣刺参cubifrin基因的cdna克隆及ng小肽分析
2.1小疣刺参cubifrin基因的cdna克隆
2.1.1引物设计
以已构建的小疣刺参卵巢转录组文库中的cubifrin转录本序列为基础,设计上游引物(5’-atggcggtagaagcaaag-3’)和下游引物(5’-ttacatcacctcgtctgt-3’)。
2.1.2pcr扩增
以第一链cdna为模板,使用上述上游引物和下游引物进行pcr扩增。pcr反应体系为:rtaqmixture(takara)12.5μl,cdna模板1μl,上游引物1μl,下游引物1μl,灭菌水9.5μl,共25μl;pcr反应程序为:94℃3分钟预变性;30个循环:94℃15秒变性,56℃15秒复性,72℃1分钟延伸;72℃3分钟最后延伸。
2.1.3cubifrincdna扩增片段的克隆及测序
将2.1.2pcr扩增获得的产物(cubifrincdna扩增片段)在1.5%琼脂糖凝胶上进行电泳,使用琼脂糖凝胶回收试剂盒(天根生物)对琼脂糖凝胶电泳中的目的条带进行回收,使用pmd18-tligationkit(takara)对cubifrincdna扩增片段进行ta克隆。使用热休克法用上述连接产物转化大肠杆菌dh5α感受态细胞,通过蓝白斑筛选获得阳性克隆,扩大培养并提取质粒进行测序。
结果显示,小疣刺参的cubifrin基因的开放读码框(orf)为723bp,其核苷酸序列如seqidno.1所示;编码240个氨基酸(图1),氨基酸序列如seqidno.2所示。
2.2小疣刺参cubifrin基因的ng小肽分析
对小疣刺参cubifrin基因的氨基酸序列进行分析,结果显示,小疣刺参cubifrin基因的前体蛋白包含5个ng小肽(ngiwy、ngfwy、ngiwy、ngiwy和nglwy)(图1),通过neuropredsoftware(http://stagbeetle.animal.uiuc.edu/cgi-bin/neuropred.py)预测,cubifrin基因翻译后可加工形成3种衍生ng小肽:ngiwy、ngfwy和nglwy,其氨基酸序列分别如seqidno.3、seqidno.4、seqidno.5所示。与仿刺参、糙海参和玉足海参的cubifrin基因的ng小肽相比,ngfwy和nglwy为小疣刺参所特有(图2)。
3.小疣刺参cubifrin3个衍生ng小肽对小疣刺参雌参排卵作用的影响实验
小疣刺参cubifrin3个衍生ng小肽ngiwy、ngfwy和nglwy由上海生工公司合成,并溶解于0.9%生理盐水。将150头小疣刺参随机分为5组(30头海参/组),即对照组、阴干流水法处理组、ngiwy注射组、ngfwy注射组和nglwy注射组,其中3个ng小肽组的注射量均为6.5ng/g体重,而对照组和阴干流水法处理组均注射0.9%生理盐水。采用1ml常规注射器,将100μl生理盐水或ng小肽穿过体表,注射到海参体腔中。注射后将海参放置于1m3海水缸,观察48小时,统计排卵个体数量。如图3所示,不催产、阴干流水法、ngiwy注射、ngfwy注射和nglwy注射组小疣海参排卵比例分别为0%、3.3%、13.3%、26.7%和10%(图3)。结果表明,注射ngiwy、ngfwy、nglwy均能刺激小疣刺参排卵,可作为刺激小疣刺参雌参排卵的短肽应用于小疣刺参人工育苗。
以上仅是本发明的优选实施方式,应当指出的是,上述优选实施方式不应视为对本发明的限制,本发明的保护范围应当以权利要求所限定的范围为准。对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明的精神和范围内,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110>中国科学院南海海洋研究所
<120>小疣刺参促排卵短肽及其编码基因与应用
<160>5
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>723
<212>dna
<213>小疣刺参(stichopusmonotuberculatus)
<400>1
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<213>小疣刺参(stichopusmonotuberculatus)
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