一种基于SNP标记鉴定京农科728玉米杂交种纯度的方法与流程

文档序号:19790900发布日期:2020-01-24 14:16阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于鉴定京农科728玉米杂交种纯度的玉米snp分子标记组合,其特征在于,含有4个snp分子标记,所述4个snp分子标记的信息如下:

2.根据权利要求1所述的玉米snp分子标记组合,其特征在于,所述4个snp分子标记snpcp_1、snpcp_2、snpcp_3、snpcp_4分别通过4个特异性引物组依次扩增得到,所述特异性引物组含有2条上游引物,1条下游引物;所述4个特异性引物组含有的引物的核苷酸序列分别如seqidno.1-3,seqidno.4-6,seqidno.7-9,seqidno.10-12所示。

3.一种用于鉴定京农科728玉米杂交种纯度的特异性引物组合,含有4个特异性引物组,所述4个特异性引物组中,每组含有2条上游引物,1条下游引物;4个特异性引物组含有引物的核苷酸序列分别如seqidno.1-3,seqidno.4-6,seqidno.7-9,seqidno.10-12所示。

4.一种用于鉴定京农科728玉米自交苗、回交苗的特异性引物组合,其特征在于,含有3个特异性引物组,所述3个特异性引物组中,每组含有2条上游引物,1条下游引物;3个特异性引物组含有引物的核苷酸序列分别如seqidno.1-3,seqidno.7-9,seqidno.10-12所示。

5.一种用于鉴定玉米京农科728种子异形株的特异性引物组合,其特征在于,含有2条上游引物,1条下游引物;其核苷酸序列分别如seqidno.4-6所示。

6.权利要求1或2所述的玉米snp分子标记、或权利要求3-5任一所述的特异性引物组合在鉴定京农科728玉米种子纯度或杂交种纯度中的应用。

7.权利要求1或2所述的玉米snp分子标记、或权利要求3所述的特异性引物组合在鉴定京农科728玉米自交苗、回交苗和/或异型株中的应用。

8.权利要求1或2所述的玉米snp分子标记、或权利要求3-5任一所述的特异性引物组合在京农科728玉米鉴定中的应用。

9.权利要求1或2所述的玉米snp分子标记、或权利要求3-5任一所述的特异性引物组合在玉米分子标记辅助育种中的应用。

10.一种基于snp标记鉴定京农科728玉米杂交种子纯度的方法,其特征在于,采用权利要求3所述的特异性引物组合,以待测玉米种子样品的dna为模板,基于kasp技术进行pcr扩增,根据待测玉米种子样品在每对引物上的基因型数据,判定该单株是正常植株、自交苗、还是异型株,判断标准为:

根据判断结果结合双亲的基因型数据,确定自交苗种子数目和杂株种子数目,综合判定种子的纯度值。

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