本发明属于蛋白质技术领域,具体涉及一种牡丹类2s白蛋白及其提取方法和应用。
背景技术:
牡丹为芍药科(paeoniaceae)芍药属(paeonia)落叶灌木,广泛分布于河南、山东、安徽、四川、浙江等地,牡丹全身是宝,其根皮、花、叶、种子等均可被应用。牡丹籽是牡丹的种子,是一味常用中药材,牡丹籽含有芍药苷等多种活性成分,具有抗菌、消炎、镇静、镇痛、降血糖、抗过敏及免疫调节等多种药理作用。牡丹籽含油量丰富,2011年3月国家卫生部批准凤丹和紫斑牡丹籽油为新资源食品,我国油用牡丹种植面积急剧扩大,牡丹籽产量逐年提高,油脂提取后产生大量的牡丹籽粕,牡丹籽粕蛋白含量约25%。目前这些牡丹籽粕主要作为饲料原料或食用菌培养基基料,综合开发利用水平较低。
2s白蛋白是广泛分布于双子叶植物中的水溶性种子贮藏蛋白,富含精氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺和半胱氨酸的。通常,2s白蛋白的分子质量在12~15kda之间,这些分子主要是由两条多肽链组成,较短的肽链分子量在3~5kda之间,较长的肽链分子量在8~10kda之间。尽管2s白蛋白在亚基结构和合成上存在差异,但它们被认为是结构上同源的紧密球状蛋白,大多数2s白蛋白具有8个保守的半胱氨酸残基骨架(cxncxnccxncxcxncxnc),形成了4个二硫键,包括2个链间二硫键和2个链内二硫键,使得这些蛋白质的结构非常稳定和紧密。除了保守的半胱氨酸外,2s白蛋白的氨基酸序列的同源性在植物内部和植物之间相对较低。体外研究发现,2s白蛋白家族成员具有多种功能,如翻译抑制、抗菌、消化酶抑制剂和植物防御功能等。除了具有生化活性外,2s白蛋白已被用作生物活性肽合成的载体,并通过增加必需氨基酸的含量来改善粮食作物的营养特性。
技术实现要素:
本发明的目的是提供一种牡丹类2s白蛋白,以及该蛋白的提取方法,并为该蛋白提供一种新的应用。
针对上述目的,本发明提供的牡丹类2s白蛋白的氨基酸序列如seqidno.1所示,其提取方法由下述步骤组成:
1、脱脂处理
将牡丹籽或牡丹籽粕粉碎成粉后,以料液比为1:4~1:6g/ml加入正己烷进行脱脂,得到牡丹籽脱脂粉或牡丹籽粕脱脂粉。
2、pbs缓冲液浸提
按料液比为1:6~1:16g/ml,向步骤1所得牡丹籽脱脂粉或牡丹籽粕脱脂粉中加入0.01~0.02mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液,在0~4℃下提取10~14h,提取完后匀浆60~180s,离心分离取上清液,得到蛋白提取液。
3、硫酸铵法分步沉淀粗蛋白
向步骤2所得蛋白提取液中添加硫酸铵至饱和度为20%,0~4℃下静止1.5~2h,然后离心分离取上清液;向上清液中继续添加硫酸铵至饱和度为40%,0~4℃下静止1.5~2h,然后离心分离取上清液;再向上清液中继续添加硫酸铵至饱和度为60%,0~4℃下静止1.5~2h,离心分离弃去上清液,获得粗蛋白。
4、粗蛋白透析除盐
将步骤3中所得粗蛋白用0.01~0.04mol/lph6.5~7.5的pbs缓冲液在0~4℃下透析除盐后真空冷冻干燥。
5、deae阴离子交换层析
将步骤4中冷冻干燥后的蛋白用0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液溶解后,用0.45μm滤膜过滤,然后用deae阴离子交换色谱柱纯化,纯化条件为:先以3~4倍柱体积的0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液平衡色谱柱,然后进行梯度洗脱,流动相a为0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液,流动相b为含有0.5~1.0mol/lnacl的0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液,洗脱梯度选择a:b由100:0到85:15到0:100,收集a:b=85:15的洗脱液,用3000~3500da超滤管脱盐浓缩,真空冷冻干燥,得到牡丹类2s白蛋白。
上述步骤2中,优选按料液比为1:8~1:10g/ml,向步骤1所得牡丹籽脱脂粉或牡丹籽粕脱脂粉中加入0.015mol/lph7.0的pbs缓冲液,在4℃下提取12h,提取完后匀浆80~140s,离心分离取上清液,得到蛋白提取液。
上述步骤4中,优选将步骤3中所得粗蛋白用0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液溶解,移入分子量为3000~3500da的透析袋,在0.01~0.04mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液中透析12~24h,透析温度为0~4℃,透析过程中换缓冲液3~4次;然后将透析除盐后的蛋白真空冷冻干燥。
上述步骤5中,优选将步骤4中冷冻干燥后的蛋白用0.01~0.02mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液溶解后,用0.45μm滤膜过滤,然后用deae阴离子交换色谱柱纯化,纯化条件为:先以3~4倍柱体积的0.01~0.02mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液平衡色谱柱,然后进行梯度洗脱,流动相a为0.01~0.02mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液,流动相b为含有0.8~1.0mol/lnacl的0.01~0.02mol/lph7.0~7.5的pbs缓冲液,洗脱梯度选择a:b由100:0到85:15到0:100,收集a:b=85:15的洗脱液,用3000~3500da超滤管脱盐浓缩,真空冷冻干燥。
本发明牡丹类2s白蛋白具有一定的抗氧化活性,可作为抗氧化剂应用。
本发明基于硫酸铵盐析、离心、透析、deae阴离子交换色谱分离纯化出了一种高纯度的牡丹类2s白蛋白(ps-2s-alb)。再通过sds-page电泳初步测定其分子量和纯度;同时采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-ms)进一步确定其分子量;以及采用denovosequencing对目标蛋白进行从头测序,采用多重酶解,具体酶切顺序依次为胰蛋白酶酶、糜蛋白酶、葡萄球菌蛋白酶和蛋白内切酶,同时采用高分辨质谱检测(obitrapfusionlumos),利用不同酶切肽段之间的互补性实现蛋白分子100%全序列的拼接。经数据库检索匹配发现该蛋白与2s白蛋白家族具有较高的同源性(27%~32%),而且与2s白蛋白家族成员的8个保守半胱氨酸完全匹配。
本发明相对现在技术的有益效果是:
1、本发明采用温和的条件提取蛋白,操作过程不经过蛋白变性,保持了蛋白本身良好的活性。
2、本发明采用简单的层析技术分离纯化、工艺简单,纯化得到的牡丹类2s白蛋白纯度很高,可以达到95%以上。
3、本发明牡丹类2s白蛋白具有一定的抗氧化活性,对dpph自由基、羟自由基、abts自由基均具有一定的清除能力,其清除能力随浓度的增加而加大,并且对羟基自由基的清除能力要明显强于相同浓度的抗坏血酸。
附图说明
图1是实施例1中粗蛋白和deae阴离子交换层析纯化得到的各洗脱液的sds-page电泳图,其中m是mark分子量范围(10~180kda),1是透析除盐后的粗蛋白;2是a:b=100:0洗脱峰,3是a:b=85:15洗脱峰,4是a:b=0:100洗脱峰。
图2是牡丹类2s白蛋白的质谱图。
图3是牡丹类2s白蛋白的总离子流色谱图。
图4是qqqqcaqqvqrqdlalceqflnqdhqqq肽段的ms/ms图谱。
图5是eqflnqdhqqqlrlrs肽段的ms/ms图谱。
图6是skggnqqqaeel肽段的ms/ms图谱。
图7是gqccqqlsqlrdhgcrcaalsqlvryqve肽段的ms/ms图谱。
图8是aeqlpvmcqvgqacelgl肽段的ms/ms图谱。
图9是lglga肽段的ms/ms图谱。
图10是牡丹类2s白蛋白与2s白蛋白家族序列匹配结果。
图11是牡丹类2s白蛋白对dpph自由基清除率。
图12是牡丹类2s白蛋白对羟基自由基清除率。
图13是牡丹类2s白蛋白对abts自由基清除率。
图14是牡丹类2s白蛋白对frap还原力。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明做进一步详细说明,但本发明的保护范围不仅限于这些实施例。
实施例1
1、脱脂处理
将牡丹籽粕用高速粉碎机粉碎成粉后,以料液比为1g:5ml加入正己烷进行脱脂,搅拌30min后抽滤,重复两次,合并滤液,减压蒸馏回收正己烷,将得到的牡丹籽粕脱脂粉于25℃干燥。
2、pbs缓冲液浸提
取20g牡丹籽粕脱脂粉,加入160ml0.015mol/lph值为7.0的pbs缓冲液,在4℃下提取12h,提取完后用高速匀浆机匀浆120s,然后以4000r/min离心30min后取上清液,得到蛋白提取液,其中蛋白的提取率为38.57%。
3、硫酸铵法分步沉淀粗蛋白
向步骤2所得蛋白提取液中添加硫酸铵至饱和度为20%,4℃下静止2h,然后以12000r/min离心20min取上清液;向上清液中继续添加硫酸铵至饱和度为40%,4℃下静止2h,以12000r/min离心20min取上清液;向上清液中继续添加硫酸铵至饱和度为60%,4℃下静止2h,以12000r/min离心20min,弃去上清液,获得粗蛋白。
4、粗蛋白透析除盐
将步骤3中所得粗蛋白用0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液溶解,移入分子量为3000da的透析袋,在0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液中透析24h,透析温度为4℃,透析过程中每隔8h更换缓冲液1次,共更换缓冲液3次。然后将透析除盐后的蛋白真空冷冻干燥。
5、deae阴离子交换层析
将步骤4中冷冻干燥后的蛋白用0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液溶解后,用0.45μm滤膜过滤;然后用deae阴离子交换色谱柱纯化,纯化条件为:先以3~4倍柱体积的0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液平衡色谱柱,然后进行梯度洗脱,流动相a为0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液,流动相b为含有0.8mol/lnacl的0.02mol/lph7.0的pbs缓冲液,洗脱梯度选择a:b由100:0到85:15到0:100,分别收集各洗脱液用sds-page电泳检验,结果如图1所示。由图1可得,a:b=85:15部分蛋白纯度很高,可以达到95%以上。将a:b=85:15的洗脱液用3000da超滤管脱盐浓缩,真空冷冻干燥,得到目标蛋白0.86g。
将图1中泳道3的目标蛋白条带挖点,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-ms)测定其分子量,测定条件为:电喷雾离子源esi正离子模式poshivemode,加速电压为20.00kv,质量扫描范围为10~60kda;分辨率~20000,测得目标蛋白的分子量为12.75kda,结果如图2。
为了得到12.75kda蛋白质的分子信息采用lc-ms-ms方法进行质谱鉴定,具体测定方法如下:
(1)酶解
使用胰蛋白酶酶解目标蛋白的胶条,然后将酶解液溶于样品溶解液(含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液)中溶解,充分振荡涡旋,13200rpm,4℃离心10min,取15ml上清转移到上样管中,进行质谱分析。
(2)lc-ms-ms分析
色谱条件为:选用毛细管高效液相色谱仪,流动相a:含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液,流动相b:含0.1vol%甲酸和80vol%乙腈的水溶液,流速:300nl/min;梯度洗脱条件为:0→1min,6%b;2→8min,9%b;9→24min,14%b;25→60min,30%b;61→75min,40%b;76→78min,95%b。
质谱条件为:正离子模式;参考质荷比为350-1800mz;分辨率为70000。质谱采集数据生成raw文件,使用xcalibur打开,可以得到总离子流色谱图如图3,从图中可看出,整个样品经过液相色谱的高效分离后,在质谱中鉴定到的蛋白数量与丰度较大。将质谱原始文件使用maxquant(1.6.2.10)检索uniprot数据库,对比blast,鉴定结果如表1所示,uniprot数据库检索发现得分最高的是牡丹库的热休克蛋白,分子量为71.253kda,但是覆盖率太低只有4%,而且分子量与目标蛋白相差太大,结果不匹配。而与热休克蛋白得分一样的是牡丹库中的聚泛素蛋白,分子量为18.588kda,覆盖率为19.3%,但是丰度为0,所以这一匹配结果也不可信。通过搜库在数据库中未匹配到可信的蛋白,在数据库中还未被收录,因此对目标蛋白近一步从头测序鉴定。
表2蛋白lc-ms/ms鉴定
将目标蛋白采用多重酶解处理,酶解处理后的肽段进行液相色谱分离(rplc)和高分辨质谱检测(obitrapfusionlumos),利用蛋白序列分析软件peaksmassspectrometrysoftware进行数据分析,通过从头测序法分析重叠多肽,从分析得到的多肽中自动组装蛋白序列,实现蛋白分子100%全序列的拼接。具体方法如下:
(1)多重酶解
胶粒脱色:将目标蛋白条带切成1mm3的胶粒,分别装入1.5mlep管中。以乙腈和50mmol/l碳酸氢铵水溶液体积比为1:1的混合溶液作为脱色液脱色,脱色10~30min后吸出脱色液,重复此操作至胶粒无色。
胶粒脱水:向无色胶粒中加入100μl乙腈,放置30min,待胶粒呈白色团状,弃去乙腈,室温放置干燥。
还原烷基化:按照100μl/管向脱水后的胶粒中加入10mmol/ldtt于56℃水浴中还原1h,吸出dtt弃去。按照100μl/管加入55mmol/liaa,暗处室温反应1h,吸出iaa弃去,用脱色液洗一遍,吸出脱色液弃去,加入100μl乙腈,放置30min,待胶粒呈白色团状,弃去乙腈,室温放置干燥。
胰蛋白酶(trypsin)酶切:按照10μl/管的量向还原烷基化后的胶粒中加入15ng/μl胰蛋白酶溶液(用25mmol/l碳酸氢铵水溶液稀释),放入4℃冰箱孵育40min,取出后每管补加10μl25mmol/l碳酸氢铵水溶液,密封置于37℃水浴中酶切16h。然后按照100μl/管向ep管中加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液),37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥。肽段用样品溶解液(含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液)溶解,充分振荡涡旋,13200rpm,4℃离心10min,上清转移到上样管中,进行质谱分析。
糜蛋白酶酶切(chymotrypin):按照10μl/管的量向胰蛋白酶酶切后的ep管中加入25ng/μl的糜蛋白酶溶液(用100mmol/lph8.0的tris-hcl缓冲液稀释),放入4℃冰箱孵育40min,取出后每管补加10μl100mmol/lph8.0的tris-hcl缓冲液,密封置于37℃水浴中酶切16h。然后按照100μl/管向ep管中加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液),37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥。肽段用样品溶解液(含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液)溶解,充分振荡涡旋,13200rpm,4℃离心10min,上清转移到上样管中,进行质谱分析。
胰蛋白酶(trypsin)+葡萄球菌蛋白酶(glu-c)+糜蛋白酶(chymotrypin)酶切:按照10μl/管的量向糜蛋白酶酶切后的ep管中加入15ng/μl的胰蛋白酶溶液(用25mmol/l碳酸氢铵水溶液稀释)胰蛋白酶溶液,放入4℃冰箱孵育40min,取出后每管补加10μl25mmol/l碳酸氢铵水溶液,密封置于37℃水浴中酶切16h。按照100μl/管向ep管中加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液),37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥。将酶切产物重新溶解于50mmol/l碳酸氢铵水溶液中,按照葡萄球菌蛋白酶与底物质量比为1:40加入葡萄球菌蛋白酶,37℃酶切4小时,继续按质量比1:40加入葡萄球菌蛋白酶,37℃酶切反应16h,再按照100μl/管向ep管中加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液)37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥。按照10μl/管的量加入25ng/μl的糜蛋白酶溶液(用100mmol/lph8.0的tris-hcl缓冲液稀释),放入4℃冰箱孵育40min,取出后每管补加10μl100mmol/lph8.0的tris-hcl缓冲液,密封置于37℃水浴中酶切16h。再按照100μl/管向ep管中加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液)37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥,肽段用样品溶解液(含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液)溶解,充分振荡涡旋,13200rpm,4℃离心10min,上清转移到上样管中,进行质谱分析。
蛋白内切酶(asp-n)酶切:按照10μl/管的量加入浓度为15ng/μl的asp-n酶(用25mmol/l碳酸氢铵水溶液稀释),放入4℃冰箱孵育40min,取出后每管补加10μl25mmol/l碳酸氢铵水溶液,密封置于37℃水浴中酶切16h。然后按100μl/管加提取液(三氟乙酸与乙腈、水体积比为5:50:45的混合溶液),37℃水浴1h后,超声5min,离心5min,将提取液移入另一新ep管中,重复提取一次,将提取液合并,真空离心干燥。肽段用样品溶解液(含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液)溶解,充分振荡涡旋,13200rpm,4℃离心10min,上清转移到上样管中,进行质谱分析。
随机碎裂:在样品中加入50μl100mmol/l碳酸氢铵水溶液,加入dtt溶液使其终浓度为10mmol/l,于56℃水浴中还原1h;然后加入iaa溶液使其终浓度为50mmol/l,避光反应40min。使用物理方法进行随机碎裂,使用自填脱盐柱脱盐后,于45℃真空干燥。
(2)液质联用检测
酶解处理后的肽段进行液相色谱分离(rplc)和高分辨质谱检测(obitrapfusionlumos)。
采用ultimate3000毛细管高效液相色谱仪,thermoscientific电喷雾-组合型离子阱orbitrap质谱仪;所得肽段以高效液相色谱仪梯度洗脱,流动相a:含0.1vol%甲酸和2vol%乙腈的水溶液,流动相b:含0.1vol%甲酸和80vol%乙腈的水溶液,流速:300nl/min,梯度洗脱条件为:0→1min,6%b;2→8min,9%b,9→24min,14%b;25→60min,30%b;61→75min,40%b;76→78min,95%b。
质谱检测条件为:正离子模式;一级质谱参数:分辨率为70000,agctarget容纳离子数为3×106,参考质荷比为350-1800mz;二级质谱参数:分辨率为75000,agctarget容纳离子数为1×106,nce/steppednce:27。
(3)数据分析
利用蛋白序列分析软件peaksmassspectrometrysoftware进行数据分析,通过从头测序法分析重叠多肽,将一级、二级谱图用peaks软件进行denovo解析,利用不同酶切肽段之间的互补性实现蛋白分子100%全序列的拼接,其氨基酸序列如序列表seqidno.1所示。各肽段经二级质谱(ms/ms)分析后,均得到主要碎片离子(bn或yn)基本齐全的ms/ms图谱。质谱检测到的七个肽段的ms/ms及其解析结果如图4~9所示。将蛋白全序列在ncbi数据库中检索分析,发现该蛋白与2s白蛋白家族具有较高的同源性,序列匹配结果如图10所示。因此命名目标蛋白为牡丹类2s白蛋白(ps-2s-alb)。
实施例2
本实施例中,用牡丹籽替换实施例1中的牡丹籽粕,其他步骤与实施例1相同,得到目标蛋白牡丹类2s白蛋白(ps-2s-alb)0.98g,纯度95%以上。
实施例3实施例1提取的牡丹类2s白蛋白的抗氧化活性
本实施例采用清除dpph能力、清除羟自由基能力、清除abts自由基能力及frap还原能力四种方法对纯化的牡丹类2s白蛋白进行体外抗氧化活性评价,并同时与阳性对照抗坏血酸的活性大小进行比较。
(1)dpph自由基清除能力测定
取一系列浓度的蛋白水溶液3.0ml,加入3.0ml100μmol/l的dpph-乙醇溶液,室温下避光反应30min,在517nm处测反应混合液的吸光度值a;用蒸馏水代替蛋白样品,相同条件下测吸光度值a0;用乙醇溶液代替dpph,相同条件下测定的吸光度值b。并用抗坏血酸(vc)作阳性对照,每个试样做三组平行。自由基清除率(dpph.sc)计算如下:
(2)羟基自由基清除能力测定
取一系列浓度的蛋白水溶液2.0ml,加入0.6ml6mmol/lh2o2水溶液、0.6ml6mmol/lfeso4水溶液、0.6ml6mmol/l水杨酸水溶液和4.2ml蒸馏水,摇匀,37℃下反应30min,在510nm下测吸光值,a0为不加蛋白样品的空白对照的吸光值,a为样品的吸光值,b为不加显色剂h2o2时的值。抗坏血酸(vc)作阳性对照,每个试样做三组平行。羟基自由基清除率(oh.sc)计算公式如下:
(3)abts自由基清除能力测定
将7.4mmol/labts水溶液与2.6mmol/lk2s2o8水溶液等体积混合避光反应12h,用1.0mmol/lph7.4pbs缓冲液稀释50倍,使a734nm=0.7±0.02。先加入200μl不同浓度的蛋白水溶液,再加入4.8mlbts,混匀室温避光10min后,在734nm出测其紫外吸收a1,蒸馏水做空白对照测a0。抗坏血酸(vc)作阳性对照,每个试样做三组平行。abts自由基清除率计算公式如下:
(4)frap还原力测定
测定原理为:fe3+-tptz可被样品还原为fe2+-tptz形式并呈现出明显的蓝色,于593nm处有最大吸收,吸光值越大,则样品还原力越强。将0.2mol/l醋酸钠缓冲溶液(5.1g醋酸钠溶解于20ml冰醋酸后用水稀释定容至250ml配制而成)、10mmol/ltptz溶液(31.233mgtptz样品用40mmol/l盐酸溶液定容至10ml配制而成)、20mmol/lfecl3水溶液按体积比为10:1:1混合制成tptz工作液。取不同浓度蛋白水溶液2ml再加3mltptz工作液后混匀37℃反应10min,在593nm处测吸光度a。
上述测试结果如图11~14所示。由图可见,在一定的浓度范围内,牡丹类2s白蛋白具有一定的抗氧化活性,对dpph自由基、羟自由基、abts自由基均具有一定的清除能力,其清除能力随浓度的增加而加大,并且对羟基自由基的清除能力要明显强于相同浓度的抗坏血酸。
序列表
<110>西北大学
<120>一种牡丹类2s白蛋白及其提取方法和应用
<141>2020-03-16
<160>1
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>112
<212>prt
<213>paeoniasuffruticosa
<400>1
glyglyglyglycysalaglyglyvalglyalaglyalaleualaleu
151015
cysglyglyproleualaglyalahisglyglyglyleualaleuala
202530
serleuglyglyalaglyglyglyalaglyglyleuglyglycyscys
354045
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65707580
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100105110