用于人乳头瘤病毒和性传播感染检测、鉴定和定量的方法和组合物与流程

文档序号:29949280发布日期:2022-05-07 17:31阅读:来源:国知局

技术特征:
1.筛查来自一个或多个受试者中每一个受试者的样品的方法,包括以下步骤:对于每份样品,在带条形码的通用引物存在的情况下,将多种靶特异性引物与来自所述样品的核酸杂交,以形成测试反应,其中至少一种靶特异性引物被配置为结合选自由以下组成的组的靶序列:高风险hpv-16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68a、68b、26、53、82;低风险hpv-6、11、40、42、43、44、55、61、81、83;以及沙眼衣原体(chlamydia trachomatis)、梅毒螺旋体(treponema pallidum)、生殖支原体(mycoplasma genitalium)、阴道毛滴虫(trichomonas vaginalis)、淋病奈瑟菌(neisseria gonorrhoeae)、单纯疱疹病毒1型(herpes simplex virus type 1)、单纯疱疹病毒2型(herpes simplex virus type 2)、人型支原体(mycoplasma hominis)、解脲脲原体(ureaplasma urealyticum)、细小脲原体(ureaplasma parvum)、水痘-带状疱疹病毒(varicellazoster virus)、杜克雷嗜血杆菌(haemophilus ducreyi)和性病性淋巴肉芽肿(lymphogranuloma venereum),使每个测试反应经受扩增条件以生成扩增子;对至少一部分由每份样品生成的所述扩增子进行珠净化,以形成富集的扩增子;和通过下一代测序对由每份样品形成的所述富集的扩增子进行测序。2.根据权利要求1所述的方法,其中每个带条形码的通用引物都包含:3'末端的通用引发部分;中间的条形码部分;和5'末端的通用引发部分。3.根据权利要求1的所述方法,其中每个靶特异性引物都包含针对靶核酸序列的特异性序列部分和通用引发部分。4.根据权利要求1所述的方法,其中从疑似患有或被诊断为患有至少一种性传播感染的受试者获得所述样品。5.根据权利要求1所述的方法,进一步包括在测序之前汇集来自每份样品的所述富集的扩增子的步骤。6.根据权利要求1所述的方法,进一步包括在对所述富集的扩增子测序后定量每份样品中的每一类型和种类的步骤。7.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试利用对每个个体具有独特序列的多态基因作为内部对照来监测交叉污染。8.筛查来自一个或多个受试者中每一个受试者的样品的方法,包括以下步骤:对于每份样品,在带条形码的通用引物存在的情况下,将多种靶特异性引物与来自所述样品的核酸杂交,以形成测试反应,其中至少一种靶特异性引物被配置为结合选自由以下组成的组的靶序列:高风险hpv-16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68a、68b、26、53、82;低风险hpv-6、11、40、42、43、44、55、61、81、83;以及沙眼衣原体、梅毒螺旋体、生殖支原体、阴道毛滴虫、淋病奈瑟菌、单纯疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒2型、人型支原体、解脲脲原体、细小脲原体、水痘-带状疱疹病毒、杜克雷嗜血杆菌和性病性淋巴肉芽肿,其中每个带条形码的引物都包含:3'末端的通用引发部分;中间的条形码部分;和
5'末端的通用引发部分;并且其中每个靶特异性引物都包含针对靶核酸序列的特异性序列部分和通用引发部分;使每个测试反应经受扩增条件以生成扩增子;对至少一部分由每份样品生成的所述扩增子进行珠净化,以形成富集的扩增子;和通过下一代测序对由每份样品形成的所述富集的扩增子进行测序。9.试剂盒,包含多重靶特异性引物,所述引物被配置为结合对以下具有特异性的靶序列:高风险hpv-16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68a、68b、26、53、82;低风险hpv-6、11、40、42、43、44、55、61、81、83;以及沙眼衣原体、梅毒螺旋体、生殖支原体、阴道毛滴虫、淋病奈瑟菌、单纯疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒2型、人型支原体、解脲脲原体、细小脲原体、水痘-带状疱疹病毒、杜克雷嗜血杆菌和性病性淋巴肉芽肿。

技术总结
本公开涉及用于在单一扩增反应中检测、鉴定和定量人乳头瘤病毒(HPV)和具有临床意义的性传播感染(STI)的组合物和方法。所公开的方法利用下一代测序(NGS)对扩增产物进行测序。本公开还涉及包含对多种HPV和STI靶标具有特异性的引物的试剂盒。异性的引物的试剂盒。异性的引物的试剂盒。


技术研发人员:C
受保护的技术使用者:章节诊断公司
技术研发日:2020.06.08
技术公布日:2022/5/6
当前第2页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1