一种Cap2结构5′帽子类似物及其制备方法和应用与流程

文档序号:26230770发布日期:2021-08-10 16:31阅读:104来源:国知局
一种Cap2结构5′帽子类似物及其制备方法和应用与流程
本申请是申请日为2020年08月20日、申请号为202010842263.2、发明名称为《一种新型cap2结构5′帽子类似物及其制备方法》的分案申请,申请人为深圳市瑞吉生物科技有限公司。本发明属于基因工程
技术领域
,尤其涉及一种cap2结构5′帽子类似物及其制备方法和应用。
背景技术
:翻译效率和免疫原性是mrna药物行使功能的两大关键因素。自体免疫蛋白如rig-i和ifit识别异常加帽的mrna,降低了外源mrna在细胞内的活性和半衰期,使得mrna药物在体内难以发挥作用。因此,优化mrna帽结构对于提高mrna的生物活性和降低免疫原性是至关重要的。目前在体外合成带帽的mrna有两种方法,第一种是mrna转录后使用牛痘病毒加帽酶对其进行加帽,产生带cap0或cap1的rna,这种加帽方法很高效,但是产量不稳定,价格也很昂贵。此外酶促加帽法不能产生cap2和m6am的帽子。第二种方法是转录过程中加入过量的帽结构类似物来进行加帽。截至目前,最常用的帽结构类似物是arca,使用arca可产生具有免疫原性的cap0,但是加帽效率只有70%。该方法的产量也比较低,每毫升转录反应体系最多制备1.5mgrna,转录产物具有很高的免疫原性。另一种叫做cleancap的新型共转录加帽的方法也被广泛采用。cleancap属于cap1,与arca使用二聚体(m7gpppg)启动t7转录不同,cleancap使用三聚体(m7gpppamg)启动t7转录。该方法的产量比较高,每毫升转录反应体系制备4mg加帽的rna,加帽效率可达90%,其转录产物的免疫原性低于arca。基于现有mrna合成体系中的帽结构类似物的加帽率低,单位合成体积内mrna产量低以及免疫原性高等缺点,从而研发了新型cap2帽结构类似物,既弥补了以上应用上的缺点,又大大提升了蛋白翻译效率。技术实现要素:有鉴于此,本发明的目的在于提供一种cap2结构5′帽子类似物及其制备方法和应用,本发明提供的cap2结构5′帽子类似物有更高的合成效率、更高的加帽效率、更低的免疫原性和更高的蛋白翻译效率。为了实现上述发明目的,本发明提供了以下技术方案:本发明提供了一种cap2结构5′帽子类似物,所述cap2结构5′帽子类似物的分子式选自以下任一种;m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu)。本发明还提供了上述技术方案所述的cap2结构5′帽子类似物的制备方法,包括以下步骤:1)将2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp分别溶解在无rna酶的水中,再分别与磷酸水解酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp;2)将所述步骤1)得到的2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp分别溶解在无rna酶水中,再分别与7-methylguanosine、7-methyl-3′-o-methylguanosine、鸟苷转移酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u);3)将所述步骤2)得到的m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)分别溶解在无rna酶水中,与t4rnaligase1混合后,再分别与2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp混合,再与2×t4rnaligasereactionbuffer混合后进行孵育,得到cap2结构5′帽子类似物。优选的,所述步骤1)2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp的摩尔与无rna酶的水的体积比均为1~30mmol:14μl。优选的,所述步骤1)无rna酶的水与磷酸水解酶、2×reactionbuffer的体积比为14:1:15。优选的,所述磷酸水解酶的酶活为50000u;所述2×reactionbuffer的组分包括:50mmtris-hcl、5mmkcl、1mmmgcl2、1mmdtt,ph值为8。优选的,所述步骤1)~3)孵育的温度分别为37℃,所述孵育的时间分别为1h。优选的,所述步骤2)无rna酶水与7-methylguanosine、7-methyl-3′-o-methylguanosine、鸟苷转移酶、2×reactionbuffer的体积比为11:10:10:1:22。优选的,所述步骤3)无rna酶水与t4rnaligase1、2×t4rnaligasereactionbuffer的体积比为11:1:22。优选的,所述2×t4rnaligasereactionbuffer的组分包括:60mmtris-hcl、20mmmgcl2、20mmdtt和2mmatp。优选的,所述t4rnaligase1的酶活为10000u。本发明还提供了上述技术方案所述的cap2结构5′帽子类似物在mrna合成中应用。本发明的有益效果:与现有帽结构类似物arca和cleancap相比,本发明中的32种cap2结构帽类似物具有更高的合成效率;与现有帽结构类似物arca和cleancap相比,本发明中的32种cap2结构帽类似物具有更高的加帽效率;与现有帽结构类似物arca和cleancap相比,本发明中的32种cap2结构帽类似物具有更低的免疫原性;与现有帽结构类似物arca和cleancap相比,本发明中的32种cap2结构帽类似物具有更高的蛋白翻译效率。附图说明图1为本发明所提供的帽结构类似物的结构通式;图2为本发明提供的32种cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效增加mrna的合成效率,在每毫升合成体系中,采用cap2帽结构类似物的合成产物(4~6mg)明显高于arca(1.5mg)和cleancap(3.8mg);图3为本发明提供的32种cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效增加mrna的加帽效率,在同等合成条件下,采用cap2帽结构类似物的合成产物95%被加帽,高于arca的70%和cleancap的90%;图4为本发明提供的的32种cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效降低免疫源性,采用cap2帽结构类似物的合成产物在细胞内的免疫原性仅为采用acra结构的相同mrna的9%-52%;图5为本发明提供的cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效提高蛋白翻译效率,编码荧光素酶(luc)的mrna分别采用arca、cleancap和cap2帽结构类似物进行加帽,对比三种mrna在小鼠体内的表达强度,可以发现采用cap2帽结构类似物的lucmrna表达强度最高。具体实施方式本发明提供了一种cap2结构5′帽子类似物,所述cap2结构5′帽子类似物的分子式选自以下任一种;m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu)。在本发明中,所述cap2结构5′帽子类似物共性是基于甲氧基修饰2′ome,对a\g\c\u以及m7g核苷进行甲氧基修饰2′omea或2′omeg或2′omec或2′omeu和3′-o-me-m7g。通过酶学反应形成cap2结构的帽子。本发明还提供了上述技术方案所述的cap2结构5′帽子类似物的制备方法,包括以下步骤:1)将2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp分别溶解在无rna酶的水中,再分别与磷酸水解酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp;2)将所述步骤1)得到的2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp分别溶解在无rna酶水中,再分别与7-methylguanosine、7-methyl-3′-o-methylguanosine、鸟苷转移酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u);3)将所述步骤2)得到的m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)分别溶解在无rna酶水中,与t4rnaligase1混合后,再分别与2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp混合,再与2×t4rnaligasereactionbuffer混合后进行孵育,得到cap2结构5′帽子类似物。本发明将2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp分别溶解在无rna酶的水中,再分别与磷酸水解酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp。在本发明中,所述2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp采用常规市售产品即可。在本发明中,所述2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp的摩尔与无rna酶的水的体积比优选均为1~30mmol:14μl,更优选为10mmol:14μl。本发明对所述2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp的来源没有特殊限定,采用市售产品或者采用常规方法制备即可。在本发明中,所述无rna酶的水与磷酸水解酶、2×reactionbuffer的体积比优选为14:1:15。在本发明中,所述磷酸水解酶的酶活优选为50000u;所述2×reactionbuffer的组分优选包括:50mmtris-hcl、5mmkcl、1mmmgcl2、1mmdtt,ph值为8。在本发明中,所述孵育的温度优选为37℃,所述孵育的时间优选为1h。在本发明中,所述2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp优选经过hplc纯化后再溶解在无rna酶水中。本发明将得到的2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp分别溶解在无rna酶水中,再分别与7-methylguanosine、7-methyl-3′-o-methylguanosine、鸟苷转移酶、2×reactionbuffer混合后进行孵育,得到m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)。在本发明中,所述无rna酶水与7-methylguanosine、7-methyl-3′-o-methylguanosine、鸟苷转移酶、2×reactionbuffer的体积比优选为11:10:10:1:22。在本发明中,所述鸟苷转移酶的酶活优选为50000u。在本发明中,所述2×reactionbuffer的组分优选包括:50mmtris-hcl、5mmkcl、1mmmgcl2、1mmdtt,ph值为8。本发明对所述7-methylguanosine和7-methyl-3′-o-methylguanosine的来源没有特殊限定,采用常规市售或者采用常规制备方法制备即可。在本发明中,所述孵育的温度优选为37℃,所述孵育的时间优选为1h。本发明将得到的m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)分别溶解在无rna酶水中,与t4rnaligase1混合后,再分别与2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp和2′-o-methyl-utp混合,再与2×t4rnaligasereactionbuffer混合后进行孵育,得到cap2结构5′帽子类似物。在本发明中,所述m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)和3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)优选进行hplc纯化后再溶解在无rna酶水中。在本发明中,所述无rna酶水与t4rnaligase1、2×t4rnaligasereactionbuffer的体积比优选为11:1:22。在本发明中,所述t4rna连接酶1的酶活优选为10000u。在本发明中,所述2×t4rnaligasereactionbuffer的组分优选包括:60mmtris-hcl、20mmmgcl2、20mmdtt和2mmatp。在本发明中,所述孵育的温度优选为37℃,孵育的时间优选为1h。本发明还提供了上述技术方案所述的cap2结构5′帽子类似物在mrna合成中应用。下面结合实施例对本发明提供的技术方案进行详细的说明,但是不能把它们理解为对本发明保护范围的限定。实施例11.将10mmol的2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp或者2′-o-methyl-utp分别溶解在无rna酶的水中,总体积为14μl。加入1μl(50000u)磷酸水解酶和15μl2×reactionbuffer(50mmtris-hcl;5mmkcl;1mmmgcl2;1mmdtt;ph8),37℃下孵育1h,得到2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp。2.对以上所得2′-o-methyl-adp、2′-o-methyl-gdp、2′-o-methyl-cdp和2′-o-methyl-udp分别进行进行hplc纯化并溶解在无rna酶水中,总体积为11μl。3.将10μl(10mmol)7-methylguanosine、10μl(10mmol)7-methyl-3′-o-methylguanosine和1μl(50000u)鸟苷转移酶加入到步骤2得到的溶液中,加入22μl2×reactionbuffer(50mmtris-hcl;5mmkcl;1mmmgcl2;1mmdtt;ph8),在37℃下孵育1h,得到m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)或3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea/g/c/u)。4.对步骤3所得的溶液进行hplc纯化并溶解在无rna酶水中备用,总体积为11μl。5.将10μl(10mmol)的2′-o-methyl-atp、2′-o-methyl-gtp、2′-o-methyl-ctp或者2′-o-methyl-utp分别与1μl(10000u)t4rna连接酶1(ssrnaligasenebm0437m)加入到步骤4所得溶液中,加入22μl2×t4rnaligasereactionbuffer(60mmtris-hcl(ph7.8at25℃),20mmmgcl2,20mmdttand2mmatp),在37℃下孵育1h,得到新型cap2结构5′帽子类似物,分子式如下:1、m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);2、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);3、m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);4、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);5、m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);6、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);7、m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);8、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);9、m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);10、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);11、m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);12、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);13、m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);14、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);15、m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);16、m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu);17、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeg);18、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeg);19、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeg);20、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeg);21、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omea);22、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omea);23、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omea);24、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omea);25、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omec);26、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omec);27、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omec);28、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omec);29、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omea)p(2′omeu);30、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeg)p(2′omeu);31、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omec)p(2′omeu);32、3′-o-me-m7g(5′)ppp(5′)(2′omeu)p(2′omeu)。实施例2实施例1制备的32种新型cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效增加mrna的合成效率(4-6mg/ml)。实验方法:1.合成mrna前,先用noti线性化质粒,4℃酶切过夜。2.dna模板抽提。3.体外转录合成mrna,分别使用arca、cleancap和本发明中32种cap2作为帽结构,反应体系如表1:表1反应体系组分用量t710xreactionbuffer2μlt7atpsolution(75mm)2μlt7ctpsolution(75mm)2μlt7gtpsolution(75mm)2μlt7utpsolution(75mm)2μl线性化质粒模板<8μlt7enzymemix2μlarca/cleancap/cap22μlnuclease-free水至20μl37℃反应6小时。turbodnase消化15分钟。4.使用licl溶液对转录产物进行纯化,计算反应得率。结果如表2、图2,使用arca帽结构时,每毫升转录反应体系最高可制备1.5mgmrna,使用cleancap时,每毫升转录反应体系最高可制备3.8mgmrna,使用本发明中的cap2时,每毫升转录反应体系最高可制备至4~6mgmrna。表21mlmrna合成反应体系所得的终产物质量(mg)arcacleancap12345671.53.84.54.95.84.74.45.15.389101112131415165.34.86.04.74.95.15.54.64.21718192021222324254.74.14.44.64.84.64.54.74.1262728293031324.64.74.85.35.34.54.3实施例3实施例1制备的32种新型cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效增加加帽效率(95-98%)。实验方法:将实施例1中的得到的不同帽结构的mrna分子进行酶切,可在液相色谱质谱分析实验中对加帽和未加帽的mrna分子比例进行测定。beads预处理:1、使用磁铁浓缩beads,吸去上清存储液,加入等体积的0.1mnaoh+0.05mnacl;2、吸去上清,用等体积0.1mnacl重悬beads,保持浓度不变;3、mrna与剪切标签退火,配置以下表3所示反应体系。表3反应体系10xrnasehreactionbuffer12μlrnasehprobe500pmolmrna100pmoltotal120μl梯度退火:95℃5min65℃2min55℃2min22℃hold4、剪切标签与beads结合beads经过15000g5min离心,去上清,加入120μl退火后的mrna和标签,室温孵育30min,期间轻轻震荡,确保充分结合;5、rnaseh剪切加入10μlrnaseh,37℃孵育3h。用磁石沉淀beads,弃上清。加入100μlwashingbuffer,充分混匀,磁石沉淀2min,弃上清。重复3次。diwater洗3次,6、rpph消化10unitsrpphinnebuffer2室温消化1小时7、diwater洗3次。8、洗脱吸去diwater,加入100μl预热至80℃的75%乙醇,温育3min,磁石沉淀3min,取上清,蒸发离心45min,至体积为10μl,重悬至50μl100medta/1%meoh,待lc-ms分析。9、lc-ms分析不同帽结构类似物合成的mrna加帽率。结果如表4和图3所示,使用arca帽结构时,转录产物加帽率最高为70%,使用cleancap时,转录产物加帽率最高为90%,使用本发明中的cap2时,转录产物加帽率最高可达95%。表4使用不同帽结构时mrna加帽率arcacleancap123456770%90%94.91%95.1%94.82%94.72%94.88%94.65%94.76%891011121314151694.79%94.73%94.93%95.2%94.86%94.77%94.82%94.83%94.84%17181920212223242594.91%94.98%95%94.42%94.55%94.83%94.65%94.72%94.8%2627282930313294.97%94.88%94.62%94.93%94.8%94.7%94.66%实施例4实施例1制备的32种新型cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效降低免疫源性。实验方法:采用rna免疫共沉淀的方法,将胞内免疫蛋白tlr3、tlr7、tlr8和rig-1与其结合的rna一起进行免疫沉淀,最后对这些mrna进行实时定量pcr鉴定,其相对丰度与其免疫原性呈正比关系。实验方法:1.细胞收集培养人pbmc细胞至106个/孔,使用lipofectamine2000将5μgarca、cleancap和cap2帽结构的mrna转染细胞。24h后通过胰蛋白酶消化收集细胞并在pbs中重悬细胞,离心,收集细胞。2.细胞固定和裂解在细胞中加入固定液,15min加入甘氨酸终止固定,离心收集细胞。加入裂解液重悬细胞,冰孵育30min,4℃,2400g离心10min,收集上清。3.rna免疫沉淀将tlr3、tlr7、tlr8和rig-1的抗体(2~10μg)加入上清液中(6~10mg),4℃轻柔搅动孵育2h。加入proteina/g磁珠(40μl),4℃轻柔搅动孵育1h。4.洗去未结合的物质2500rpm离心30s沉淀磁珠,移去上清液,在500μlrip缓冲液中重悬磁珠。rip缓冲液中重复清洗共三次,随后在pbs中清洗一次。5.对免疫沉淀后rbp上结合的rna进行纯化在trizolrna提取试剂(1ml)中重悬磁珠,分离共沉淀的rna。使用不含核酸酶的水(20μl)洗脱rna。6.将rna逆转录(rt)为cdna,并根据mrna序列设计引物进行定量pcr分析,mrna免疫原性与磁珠沉淀的mrna拷贝数成正比。结果如表5和图4,本发明中的cap2帽结构mrna免疫原性明显低于arca和cleancap帽结构的mrna免疫原性。表5使用不同帽结构时mrna的胞内免疫原性,所有结果为相对于arca的相对值;表5实验结果实施例5实施例1制备的新型cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效蛋白翻译效率。实验方法:将等量编码荧光素酶luciferase的mrna皮内注射于小鼠背部,24小时后尾静脉注射荧光素酶底物,发光强度与有效目的蛋白翻译率成比。实验结果如图5,本法明中的新型cap2帽结构类似物应用于mrna合成有效蛋白翻译效率明显高于arca和cleancap帽结构的蛋白翻译效率。以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本
技术领域
的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。当前第1页12
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