样本的自动化处理方法及装置、样本的自动化处理系统与流程

文档序号:27139887发布日期:2021-10-30 00:22阅读:450来源:国知局
样本的自动化处理方法及装置、样本的自动化处理系统与流程

1.本发明涉及第二代建库测序技术领域,具体而言,涉及一种样本的自动化处理方法及装置、样本的自动化处理系统。


背景技术:

2.ngs流程(核酸提取、检测、全基因组建库测序(wgs)、全转录组建库测序(rnaseq)、全外显子组建库测序(wes)、库检、pooling)目前主要是以高素质专业技术人员手工操作完成或结合专业化的设备实现半自动生产模式。不同的上述产品需要不同的流程由人工参与完成,生产流程依托于人工排产,关键步骤及不同设备间切换需要人工干预决策,流程质控点的质量判定需要人工介入,整体行业内生产效率偏低。
3.因此,上述现有方案会存在以下缺陷:生产前需要由人完成流程的排产工作;现有技术为人工操作通量低、人工成本高;现有技术中存在繁杂的、高强度的人工操作,人工操作带来的直接问题是产品质量的参差不齐和人为失误的增加;此外现有技术的质控点均为人工完成,存在人为主观因素的影响。
4.针对上述相关技术中对于ngs产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的问题,目前尚未提出有效的解决方案。


技术实现要素:

5.本发明实施例提供了一种样本的自动化处理方法及装置、样本的自动化处理系统,以至少解决相关技术中对于ngs产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的技术问题。
6.根据本发明实施例的一个方面,提供了一种样本的自动化处理方法,包括:将放置有样本的耗材放置于生产系统;对所述耗材进行识别,以得到所述耗材的标识信息;基于所述标识信息选择目标生产方式,其中,所述目标生产方式为用于对所述样本进行处理的方式;基于所述目标生产方式对所述样本进行处理,得到处理结果;其中,基于所述目标生产方式对所述样本进行处理,包括:对待测对象进行样本提取,得到所述样本;将所述样本自动化样本管中;控制机械臂将所述自动化样本管放置于自动化扫描仪上执行识别操作,以确定所述样本与其位置对应;其中,该样本的自动化处理方法还包括:通过机械臂将所述样本移动至自动化开关盖机执行开盖操作;在确定所述样本所在耗材的盖子处于打开状态时,利用所述机械臂搬运所述样本所在耗材至自动化工作站上,以通过所述自动化工作站在所述耗材中添加裂解液;将添加有所述裂解液的样本移动至自动化孵育器,以进行温度控制裂解,得到预处理后的样本;将裂解后的样本转移至高速离心机进行离心之后转移所述耗材至自动化工作站进行核酸提取,以得到核酸样本。
7.可选地,所述方法还包括:在得到所述核酸样本后,生成检测单;将所述检测单发送至智能生产线,以利用所述智能生产线对所述核酸样本进行核酸检测。
8.可选地,将所述检测单发送至智能生产线,以利用所述智能生产线对所述核酸样
本进行核酸检测,包括:对所述核酸样本进行采样处理,得到目标样本;对所述目标样本进行离心扫码操作,得到扫码后的目标样本;判断所述目标样本是否符合建库条件,得到判断结果;在所述判断结果表示所述样本符合所述建库条件时,执行建库处理流程;在所述判断结果表示所述样本不符合所述建库条件时,重新获取样本。
9.可选地,执行样本建库处理流程包括:对符合所述建库条件的样本进行重新排序,并对重新排序后的样本进行合并;对合并处理后的样本进行整板取样记录板号,并对记录板号的样本执行自动化核酸片段化操作,得到片段化后的样本。
10.可选地,该样本的自动化处理方法还包括:对所述片段化后的样本添加磁珠,对添加磁珠的样本进行漂洗处理,向漂洗处理后的样本添加预定试剂,利用添加有所述预定试剂的样本输入至建库模块,得到所述样本对应的文库;对所述片段化后的样本进行纯化处理,并对纯化处理后的样本进行试剂配置末端修复、试剂配置接头连接处理以及纯化片段选择,并将处理后的样本输入至建库模块,得到所述样本对应的文库。
11.可选地,该样本的自动化处理方法还包括:对所述文库进行自动化检测。
12.可选地,该样本的自动化处理方法还包括:获取排机指令;基于所述排机指令控制样本库文库出库,并对所述样本库文库中的样本进行振荡离心处理;对所述振荡离心处理后的样本进行混合,对混合后的样本进行振荡离心处理。
13.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种样本的自动化处理装置,包括:放置单元,用于将放置有样本的耗材放置于生产系统;识别单元,用于对所述耗材进行识别,以得到所述耗材的标识信息;选择单元,用于基于所述标识信息选择目标生产方式,其中,所述目标生产方式为用于对所述样本进行处理的方式;处理单元,用于基于所述目标生产方式对所述样本进行处理,得到处理结果;其中,所述处理单元,包括:提取模块,用于对待测对象进行样本提取,得到所述样本;第一移动模块,用于将所述样本放置于自动化样本管中;控制模块,用于控制机械臂将所述自动化样本管放置于自动化扫描仪上执行识别操作,以确定所述样本与其位置对应;其中,该样本的自动化处理装置还包括:第二移动模块,用于通过机械臂将所述样本移动至自动化开关盖机执行开盖操作;添加模块,用于在确定所述样本所在耗材的盖子处于打开状态时,利用所述机械臂搬运所述样本所在耗材至自动化工作站上,以通过所述自动化工作站在所述耗材中添加裂解液;裂解模块,用于将添加有所述裂解液的样本移动至自动化孵育器,以进行温度控制裂解,得到预处理后的样本;转移模块,用于将裂解后的样本转移至高速离心机进行离心之后转移所述耗材至自动化工作站进行核酸提取,以得到核酸样本。
14.可选地,所述装置还包括:生成模块,用于在得到所述核酸样本后,生成检测单;检测模块,用于将所述检测单发送至智能生产线,以利用所述智能生产线对所述核酸样本进行核酸检测。
15.可选地,所述检测模块,包括:处理子模块,用于对所述核酸样本进行采样处理,得到目标样本;扫码子模块,用于对所述目标样本进行离心扫码操作,得到扫码后的目标样本;判断子模块,用于结果判断所述目标样本是否符合建库条件,得到判断结果;第一确定子模块,用于在所述判断结果表示所述样本符合所述建库条件时,执行建库处理流程;第二确定子模块,用于在所述判断结果表示所述样本不符合所述建库条件时,重新获取样本。
16.可选地,所述第一确定子模块包括:排序子模块,用于对符合所述建库条件的样本
进行重新排序,并对重新排序后的样本进行合并;片段化子模块,用于对合并处理后的样本进行整板取样记录板号,并对记录板号的样本执行自动化核酸片段化操作,得到片段化后的样本。
17.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:添加模块,用于对所述片段化后的样本添加磁珠,对添加磁珠的样本进行漂洗处理,向漂洗处理后的样本添加预定试剂,利用添加有所述预定试剂的样本输入至建库模块,得到所述样本对应的文库;纯化模块,用于对所述片段化后的样本进行纯化处理,并对纯化处理后的样本进行试剂配置末端修复、试剂配置接头连接处理以及纯化片段选择,并将处理后的样本输入至建库模块,得到所述样本对应的文库。
18.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:自动化检测模块,用于对所述文库进行自动化检测。
19.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:获取单元,用于获取排机指令;离心处理单元,用于基于所述排机指令控制样本库文库出库,并对所述样本库文库中的样本进行振荡离心处理;混合单元,用于对所述振荡离心处理后的样本进行混合,对混合后的样本进行振荡离心处理。
20.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种计算机可读的存储介质,所述计算机可读的存储介质包括存储的程序,其中,所述程序运行时执行上述任一项中所述的样本的自动化处理方法。
21.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种样本的自动化处理系统,包括存储器和处理器,所述存储器中存储有计算机程序,所述处理器被设置为通过所述计算机程序执行上述任一项中所述的样本的自动化处理方法。
22.在本发明实施例中,将放置有样本的耗材放置于生产系统;对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息;基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式;基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果。通过本发明实施例提供的样本的自动化处理方法,实现了对样本的自动化处理的目的,达到了提高样本处理效率的技术效果,进而解决了相关技术中对于ngs产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的技术问题。
附图说明
23.此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解,构成本技术的一部分,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。在附图中:图1是根据本发明实施例的样本的自动化处理方法的流程图;图2是根据本发明实施例的样本自动化提取的流程图;图3是根据本发明实施例的核酸检测的流程图;图4是根据本发明实施例的建库前样本处理的流程图;图5是根据本发明实施例的建库的流程图一;图6是根据本发明实施例的建库的流程图二;图7是根据本发明实施例的自动化文库检测的流程图;图8是根据本发明实施例的自动化文库混检的流程图;
图9是根据本发明实施例的样本的自动化处理装置的示意图。
具体实施方式
24.为了使本技术领域的人员更好地理解本发明方案,下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分的实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都应当属于本发明保护的范围。
25.需要说明的是,本发明的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象,而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换,以便这里描述的本发明的实施例能够以除了在这里图示或描述的那些以外的顺序实施。此外,术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形,意图在于覆盖不排他的包含,例如,包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元,而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
26.如背景技术提到的,现有的ngs测序流程主要依靠人工或人工结合专业化的设备实现半自动生产模式,这种方式不仅效率低下,而且人为因素导致的生产过程中的差异性较大。因而,为改善这一状况,在本技术尝试从全自动化的角度将ngs全流程的自动化程度提高。具体改进思路和操作如下:dna提取、检测、(wgs、rna和/或wes)建库、库检、混样(pooling)的流程目前主要是以手动和部分流程半自动相结合生产模式。通过对上述工艺流程重新梳理,形成一套全自动化生产架构。硬件上整合了包含移液工作站、机械臂、离心机、片段分析仪(aati)、荧光定量pcr仪、离心机、超微量移液(echo)等66个设备,软件上依托供应商提供的软件框架(momentum),编辑了一套可以用于wgs、wes和rnaseq产品从提取到混样、以及从核酸到混样等不同启动节点的全自动化生产流程,wgs、wes、rnaseq三种不同的建库产品及客户文库的库检混样流程可以在产线上同时进行,任意组合,实现每个环节全自动化运行。
27.具体地,可将样本装到带有编码的标准耗材上,手工放到生产系统上,软件进行自动识别和编号确认,根据编码类型自动识别启动一整套的生产流程,中间质控环节依托写好的判断逻辑自动生成并判定检测结果,每个步骤自动流转直到生产完成。依托于momentum这个软件生产排产功能,可以实现一次上样,按照批次生产,每天24小时不间断生产,可以实现每天高通量(1800个样本)的生产,节约大量的人员成本,并提升生产质量,大批量设备整合、多产品并行生产模式、产品长流程(wgs提取

poolling&wgs,wes,rnaseq核酸

pooling)自动化工艺整合、产品生产通量的大幅提升,是这条生产线创新的突破点。
28.简单而言,该生产流程分为三个功能模块,各功能模块通过传送轨道与机械臂实现物理串联的同时,结合模块化控制软件并联至中控系统,实现整条生产线的运行控制、结果判定和实时监控全流程智能化生产。
29.下面对该样本的自动化处理方法以及装置进行详细说明。
30.根据本发明实施例,提供了一种样本的自动化处理方法的方法实施例,需要说明的是,在附图的流程图示出的步骤可以在诸如一组计算机可执行指令的计算机系统中执
行,并且,虽然在流程图中示出了逻辑顺序,但是在某些情况下,可以以不同于此处的顺序执行所示出或描述的步骤。
31.图1是根据本发明实施例的样本的自动化处理方法的流程图,如图1所示,该样本的自动化处理方法包括如下步骤:步骤s102,将放置有样本的耗材放置于生产系统。
32.步骤s104,对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息。
33.步骤s106,基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式。
34.步骤s108,基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果。
35.在该实施例中,基于目标生产方式对样本进行处理,包括:对待测对象进行样本提取,得到样本;将样本放置于自动化样本管中;控制机械臂将自动化样本管放置于自动化扫描仪上执行识别操作,以确定样本与其位置对应。
36.此外,在本发明实施例,该样本的自动化处理方法还包括:通过机械臂将样本移动至自动化开关盖机执行开盖操作;在确定样本所在耗材的盖子处于打开状态时,利用机械臂搬运样本所在耗材至自动化工作站上,以通过自动化工作站在耗材中添加裂解液;将添加有裂解液的样本移动至自动化孵育器,以进行温度控制裂解,得到预处理后的样本;将裂解后的样本转移至高速离心机进行离心之后转移耗材至自动化工作站进行核酸提取,以得到核酸样本。
37.由上可知,在本发明实施例中,可以将放置有样本的耗材放置于生产系统;对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息;基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式;基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果,实现了对样本的自动化处理的目的,达到了提高样本处理效率的技术效果。
38.因此,通过本发明实施例提供的样本的自动化处理方法,解决了相关技术中对于ngs产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的技术问题。
39.图2是根据本发明实施例的样本自动化提取的流程图,如图2所示,可以自动化提取包含有动物、植物、微生物dna和rna提取功能,dna或者rna样本经过取样处理后,放入2.0ml自动化样本管中,95个自动化管子放到一个sbs标准板栽架上,人工进行线下研磨,从交互位进入自动化系统启动提取程序,首先,机械臂取sbs标准板到自动化扫描仪上进行底部二维码扫描,录入系统进行样本比对,确认位置和编码正确;之后机械臂搬运到自动化开关盖机上开盖,再转运到自动化工作站加相应裂解液(dna裂解液和rna裂解液);转运到自动化开关盖机关盖后转运动自动化孵育器上进行温度控制裂解。
40.作为一种可选的实施例,该样本的自动化处理方法还可以包括:在得到核酸样本后,生成检测单;将检测单发送至智能生产线,以利用智能生产线对核酸样本进行核酸检测。
41.其中,将检测单发送至智能生产线,以利用智能生产线对核酸样本进行核酸检测,包括:对核酸样本进行采样处理,得到目标样本;对目标样本进行离心扫码操作,得到扫码后的目标样本;判断目标样本是否符合建库条件,得到判断结果;在判断结果表示样本符合建库条件时,执行建库前处理流程;在判断结果表示样本不符合建库条件时,重新获取样本。
42.可选的,在该实施例中,可以利用片段分析仪对目标样本进行检测,以得到检测结果。
43.图3是根据本发明实施例的核酸检测的流程图,如图3所示,在得到核酸样本后,会生成派检测单;接着进行取样后离心扫码,并进行颜色检测,若符合要求则提取出dna或rna,反之则进行纯化处理。对于提取的rna或dna会分别凑板取样,接着进行自动化毛细管电泳检测。对于检测合格的则输入到软件中处理,对于有严重胶孔污染的,则可以进行样本纯化处理。对于软件判定不合格的,同样需要重新采样。具体地,对于总重量不足、浓度过低、体积超标的可以进行其他处理,例如,稀释、浓缩、合板等。
44.作为一种可选的实施例,执行样本建库处理流程包括:对符合建库条件的样本进行重新排序,并对重新排序后的样本进行合并;对合并处理后的样本进行整板取样记录板号,并对记录板号的样本执行自动化核酸片段化操作,得到片段化后的样本。
45.图4是根据本发明实施例的建库前样本处理的流程图,如图4所示,当接收到客户下单后,在确定需要建库的情况下,结合已检测核酸样本库进入建库池;接着对已均一化自提样本以及已均一化客户样本进行重排合并样品,接着整板取样记录板号以及单管打码标记;对于重排合并样本可以整板取样记录板号,接着对其进行片段化处理后,进行aati检测。对于单管打码标记的可以进行单管取样后手工核酸片段化。
46.作为一种可选的实施例,该样本的自动化处理方法还包括:对片段化后的样本添加磁珠,对添加磁珠的样本进行漂洗处理,向漂洗处理后的样本添加预定试剂,利用添加有预定试剂的样本输入至建库模块,得到样本对应的文库;对片段化后的样本进行纯化处理,并对纯化处理后的样本进行试剂配置末端修复、试剂配置接头连接处理以及纯化片段选择,并将处理后的样本输入至建库模块,得到样本对应的文库。
47.图5是根据本发明实施例的建库的流程图一,如图5所示,可以对整板样本加入磁珠后,进行漂洗,接着放至室温条件下结合,进行漂洗以及洗脱,再加入打断buffer,并加入一链以及二链试剂合成一链以及二链后,记录板号,接着输入至建库模块。
48.图6是根据本发明实施例的建库的流程图二,如图6所示,在进行样本纯化后,进行试剂配置末端修复、试剂配置接头连接以及纯化片段选择,并进行试剂配置pcr处理,在进行纯化和洗脱后,输入至库检模块。
49.作为一种可选的实施例,该样本的自动化处理方法还包括:对文库进行自动化检测。
50.图7是根据本发明实施例的自动化文库检测的流程图,如图7所示,对于客户自建库文库可以生成派库检单,接着进行酶标仪定量处理,若处理成功,则进行文库稀释,反之,反馈库检失败;对于稀释后的文库,可以转至1.2ml 96孔板,接着进行aati以及opcr处理,并分别进行加样、稀释处理;对于aati定性检测的,可直接加样并震荡混匀后开始检测,对于qpcr定量检测,首先进行样本进一步稀释,并同时配置qpcr mix,之后混合稀释后的样本和qpcr mix进行检测。在进行数据处理后,可以获取判定结果,并根据判定结果执行不同的操作。对于片段偏大/偏小的可以进行返回至客户或自身进行重新建库。对于接头污染/含小片段的,可以反馈客户或重新建库。对于qpcr偏高或偏低的可以进行稀释或浓缩后,重新进行库检。
51.作为一种可选的实施例,该样本的自动化处理方法还包括:获取排机指令;基于排
机指令控制样本库文库出库,并对样本库文库中的样本进行振荡离心处理;对振荡离心处理后的样本进行混合,对混合后的样本进行振荡离心处理。
52.图8是根据本发明实施例的自动化文库混检的流程图,如图8所示,可以在接收到排机指令后,执行样本库文库出库或暂存库文库出库,接着进行振荡离心,再进行小数据量或大数据量文库分别混合,在混合后振荡离心后上机。
53.需要说明的是,在本发明实施例中,采用“l”形布局设计,分为三个模块,分别对应模块1:提取&前处理模块(负责组织的核酸提取、建库取样、以及片段化前处理功能);模块2:核酸检测&建库前区模块(负责核酸qc、wgs、rnaseq建库的前区工作);模块3:建库后区库检模块(负责建库后区的文库出库纯化、库检判定、文库pooling工作)。
54.表1示出了wgs和rna两种类型产品运行时时,按照优化后的排产节奏(见下表时间),可实现单日内16板文库的建库和库检任务,其中这里的数据是通过对产线流程运行模拟情况得到的。
55.表1表2示出了样本的自动化处理系统累计运行72天,共完成3416个dna提取、2173个rna提取、28421个dna检测、5322个rna检测、4465个微生物提取、29889个wgs文库、16557个rnaseq、1253个wes个文库。本发明运行效果详见表2。通过与现有流程的合格率指标对比发现本发明运行的质量指标与现有流程无明显差异。
56.表2
由上可知,通过本发明实施例提供的样本的自动化处理方法,将现有多产品的分工生产整合到一起,实现多产品动态生产模式,从样本进入生产线到完成pooling的全流程,包含期间的质控点判定,用自动化设备和软件代替人工操作,提升产品的生产效率,缩小产品成产过程中的差异性,降低人工生产的失误率。有效克服了以下弊端:1)生产前需要由人完成流程的排产工作;2)现有技术为人工操作通量低、人工成本高;3)现有技术中存在繁杂的、高强度的人工操作,人工操作带来的直接问题是产品质量的参差不齐和人为失误的增加;4)此外现有技术的质控点均为人工完成,存在人为主观因素的影响。不仅人员效率提升,相同产能下对比手工半自动化操作可节省75%的人员,降低企业的用人成本;可以做到全程无人化、柔性化生产,减少人为操作因素对结果稳定性的影响。
57.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种样本的自动化处理装置,图9是根据本发明实施例的样本的自动化处理装置的示意图,如图9所示,该样本的自动化处理装置包括:放置单元91、识别单元93、选择单元95以及处理单元97。下面对该样本的自动化处理方法进行说明。
58.放置单元91,用于将放置有样本的耗材放置于生产系统。
59.识别单元93,用于对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息。
60.选择单元95,用于基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式。
61.处理单元97,用于基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果。
62.在该实施例中,处理单元,包括:提取模块,用于对待测对象进行样本提取,得到样本;第一移动模块,用于将样本放置于自动化样本管中;控制模块,用于控制机械臂将自动化样本管放置于自动化扫描仪上执行识别操作,以确定样本与其位置对应。
63.此外,该样本的自动化处理装置还包括:第二移动模块,用于通过机械臂将样本移动至自动化开关盖机执行开盖操作;添加模块,用于在确定样本所在耗材的盖子处于打开状态时,利用机械臂搬运所述样本所在耗材至自动化工作站上,以通过自动化工作站在耗材中添加裂解液;裂解模块,用于将添加有裂解液的样本移动至自动化孵育器,以进行温度控制裂解,得到预处理后的样本;将裂解后的样本转移至高速离心机进行离心之后转移耗材至自动化工作站进行核酸提取,以得到核酸样本。
64.此处需要说明的是,上述放置单元91、识别单元93、选择单元95以及处理单元97对应于实施例中的步骤s102至s108,上述模块与对应的步骤所实现的示例和应用场景相同,但不限于上述实施例所公开的内容。需要说明的是,上述模块作为装置的一部分可以在诸如一组计算机可执行指令的计算机系统中执行。
65.由上可知,在本技术发明实施例中,可以利用放置单元将放置有样本的耗材放置于生产系统;接着利用识别单元对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息;并利用选择单元基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式;以及利用处理单元基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果。通过本发明实施例提供的样本的自动化处理装置,实现了对样本的自动化处理的目的,达到了提高样本处理效率的技术效果,解决了相关技术中对于ngs产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的技术问题。
66.可选地,该装置还包括:生成模块,用于在得到核酸样本后,生成检测单;检测模块,用于将检测单发送至智能生产线,以利用智能生产线对核酸样本进行核酸检测。
67.可选地,检测模块,包括:处理子模块,用于对核酸样本进行采样处理,得到目标样本;扫码子模块,用于对目标样本进行离心扫码操作,得到扫码后的目标样本;判断子模块,用于判断目标样本是否符合建库条件,得到判断结果;第一确定子模块,用于在判断结果表示样本符合建库条件时,执行建库前处理流程;第二确定子模块,用于在判断结果表示样本不符合建库条件时,重新获取样本。
68.可选地,第一确定子模块包括:排序子模块,用于对符合建库条件的样本进行重新排序,并对重新排序后的样本进行合并;片段化子模块,用于对合并处理后的样本进行整板取样记录板号,并对记录板号的样本执行自动化核酸片段化操作,得到片段化后的样本。
69.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:添加模块,用于对片段化后的样本添加磁珠,对添加磁珠的样本进行漂洗处理,向漂洗处理后的样本添加预定试剂,利用添加有预定试剂的样本输入至建库模块,得到样本对应的文库;纯化模块,用于对片段化后的样本进行纯化处理,并对纯化处理后的样本进行试剂配置末端修复、试剂配置接头连接处理以及纯化片段选择,并将处理后的样本输入至建库模块,得到样本对应的文库。
70.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:自动化检测模块,用于对文库进行自动化检测。
71.可选地,该样本的自动化处理装置还包括:获取单元,用于获取排机指令;离心处理单元,用于基于排机指令控制样本库文库出库,并对样本库文库中的样本进行振荡离心处理;混合单元,用于对振荡离心处理后的样本进行混合,对混合后的样本进行振荡离心处理。
72.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种计算机可读的存储介质,计算机可读的存储介质包括存储的程序,其中,程序运行时执行上述任一项中的样本的自动化处理方法。
73.根据本发明实施例的另外一个方面,还提供了一种样本的自动化处理系统,包括存储器和处理器,存储器中存储有计算机程序,处理器被设置为通过计算机程序执行上述任一项中的样本的自动化处理方法。
74.上述本发明实施例序号仅仅为了描述,不代表实施例的优劣。
75.在本发明的上述实施例中,对各个实施例的描述都各有侧重,某个实施例中没有详述的部分,可以参见其他实施例的相关描述。
76.在本技术所提供的几个实施例中,应该理解到,所揭露的技术内容,可通过其它的方式实现。其中,以上所描述的装置实施例仅仅是示意性的,例如所述单元的划分,可以为
一种逻辑功能划分,实际实现时可以有另外的划分方式,例如多个单元或组件可以结合或者可以集成到另一个系统,或一些特征可以忽略,或不执行。另一点,所显示或讨论的相互之间的耦合或直接耦合或通信连接可以是通过一些接口,单元或模块的间接耦合或通信连接,可以是电性或其它的形式。
77.所述作为分离部件说明的单元可以是或者也可以不是物理上分开的,作为单元显示的部件可以是或者也可以不是物理单元,即可以位于一个地方,或者也可以分布到多个单元上。可以根据实际的需要选择其中的部分或者全部单元来实现本实施例方案的目的。
78.另外,在本发明各个实施例中的各功能单元可以集成在一个处理单元中,也可以是各个单元单独物理存在,也可以两个或两个以上单元集成在一个单元中。上述集成的单元既可以采用硬件的形式实现,也可以采用软件功能单元的形式实现。
79.所述集成的单元如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解,本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的全部或部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品存储在一个存储介质中,包括若干指令用以使得一台计算机设备(可为个人计算机、服务器或者网络设备等)执行本发明各个实施例所述方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括:u盘、只读存储器(rom,read

only memory)、随机存取存储器(ram,random access memory)、移动硬盘、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
80.以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
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