预测肺腺癌患者对免疫疗法敏感性的生物标志物、应用和装置的制作方法

文档序号:28532192发布日期:2022-01-19 13:22阅读:来源:国知局

技术特征:
1.预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的生物标志物,其特征在于,包括突变型细胞分化调控基因,所述细胞分化调控基因选自zfhx3和ptprd基因中的至少一种,所述突变型是错义突变和/或无义突变。2.根据权利要求1所述的生物标志物在制备预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性或肿瘤突变负荷程度的试剂或试剂盒中的应用。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述突变型的突变位点包括以下位点中的至少一个:zfhx3基因的p.e858*、p.l3091i、p.c1144f、p.d3665v、p.g2893r、p.p1255s、p.q149*、p.l1315v、p.e510d、p.s2098l、p.t813s、p.a188s、p.s3601l、p.s3654l和p.g210c位点,以及ptprd基因的p.g1213e、p.e698q、p.f850l、p.r1674s、p.l984f、p.y1191c、p.s306*、p.e21q、p.p1525t、p.g1835a、p.s667l、p.p519t、p.t1100k、p.g1418w、p.g761c、p.d473v、p.a1413d、p.m1864k、p.e1639*、p.p1520t、p.e118k、p.s896l、p.p1839r、p.g1152v、p.t706k、p.y1386*、p.t376r、p.t1738s和p.d473y位点。4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述突变型的突变位点包括以下共突变位点中的至少一组:zfhx3基因的p.d3665v位点和ptprd基因的p.y1191c位点、zfhx3基因的p.g2893r位点和ptprd基因的p.e21q位点、zfhx3基因的p.p1255s位点和ptprd基因的p.p1525t位点、zfhx3基因的p.e510d位点和ptprd基因的p.a1413d位点、zfhx3基因的p.s2098l位点和ptprd基因的p.p1520t位点或zfhx3基因的p.s3601l位点和ptprd基因的p.t376r位点。5.根据权利要求2~4任一项所述的应用,其特征在于,所述免疫检查点包括pd-1、pd-l1或ctla4。6.根据权利要求2~4任一项所述的应用,其特征在于,所述试剂或试剂盒用于核酸水平或蛋白水平的检测。7.根据权利要求6所述的应用,所述试剂或试剂盒用于执行以下任一种方法:聚合酶链反应、变性梯度凝胶电泳、核酸测序法、核酸分型芯片检测、变性高效液相色谱法、原位杂交、高分辨率熔解法以及氨基酸测序法。8.根据权利要求2~4任一项所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括样品的处理试剂,所述样品的处理试剂包括样品裂解试剂、样品纯化试剂以及样品核酸提取试剂中的至少一种。9.一种用于预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的装置,其特征在于,包括:数据获取模块,用于获取受试者细胞分化调控基因的突变情况,所述细胞分化调控基因选自zfhx3和ptprd基因中的至少一种;输出预测模块,用于根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型,输出该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果。10.根据权利要求9所述的装置,其特征在于,所述根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型,输出该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果是,若zfhx3和ptprd基因中至少有一个基因存在错义突变或无义突变的目标位点,说明该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感,否则,则说明该受试者对免疫检查点抑
制剂疗法不敏感。11.一种计算机设备,其特征在于,具有处理器和存储器,所述存储器上存储有计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的全部步骤,所述步骤包括:获取受试者细胞分化调控基因的突变情况,所述细胞分化调控基因选自zfhx3和ptprd基因中的至少一种;根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型,输出受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果。12.一种计算机存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被执行时实现预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的全部步骤,所述步骤包括:获取受试者细胞分化调控基因的突变情况,所述细胞分化调控基因选自zfhx3和ptprd基因中的至少一种;根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型,输出受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果。

技术总结
本发明涉及一种预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的生物标志物,包括突变型细胞分化调控基因,该细胞分化调控基因选自ZFHX3和PTPRD基因中的至少一种,该突变型是错义突变和/或无义突变。该预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的生物标志物,与TMB值存在显著相关性,能够作为新的生物标志物预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法的敏感性,能够精准筛选免疫检查点抑制剂疗法的获益人群,节约检测成本。节约检测成本。节约检测成本。


技术研发人员:尤冬 张丽文 张昭 刘阳
受保护的技术使用者:上海至本医学检验所有限公司
技术研发日:2021.11.04
技术公布日:2022/1/18
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