技术特征：
1.一种与母猪产仔均匀度相关的分子标记，其特征在于，该分子标记为snp分子标记，所述snp分子标记位于猪12号染色体54406034bp位置，所述猪12号染色体54406034bp位置为c>t突变的突变位点，猪参考基因组为sscrofa11.1。2.一种用于评价母猪产仔均匀度的分子标记序列，其特征在于，该分子标记序列为权利要求1所述突变位点的上下游100
±
20bp序列。3.根据权利要求2所述的分子标记序列，其特征在于，所述分子标记序列如下所示：5
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tagactgcagaaagttgagtataggtattgccacctctaggaaccacaaatacaatctgtacaaagatacatagcaaaaaacacagcagaaaaattaaaa（seq id no:1）-e-cgggttactctaaaagttcctctgtatgatcccatttatatgagagtctccaaaaaacaaaactacgctgatggagagcagctcggctggtggtcaccga-3
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（seq id no:2），其中，e为突变位点。4.一种用于评价母猪产仔均匀度的方法，其特征在于，该方法包括获取权利要求2-3中任一项所述分子标记序列的检测结果，当突变位点为t时，则判断母猪产仔初生重的变异系数低。5.权利要求1所述分子标记的获得方法，其特征在于，包括以下步骤：获取表型-系谱数据、snp分子标记：获取待测母猪的表型-系谱数据，计算得到仔猪均匀度数据，对所述待测母猪取样，提取dna，基因分型，获得覆盖全基因组的snp分子标记；质量控制：对所述覆盖全基因组的snp分子标记进行物理位置更新，除去预定的snp分子标记，根据预定质量控制标准，进行质量控制；均匀度分析：结合所述仔猪均匀度数据，对质量控制后的snp分子标记进行gwas分析，并分析不同基因型群体母猪产仔均匀度差异情况，获得与母猪产仔均匀度相关的分子标记。6.根据权利要求5所述的获得方法，其特征在于，所述获取表型-系谱数据、snp分子标记步骤中，采用ggp 50k snp芯片进行所述基因分型；所述质量控制步骤还包括：对质量控制后的缺失基因型，进行填充，根据预定质量控制标准，再次质量控制。7.根据权利要求6所述的获得方法，其特征在于，所述质量控制步骤中，所述物理位置更新根据猪参考基因组sscrofa11.1，采用ncbi基因组比对程序进行更新；所述质量控制标准为个体检出率≥90％、snp检出率≥90％且最小等位基因频率≥0.01。8.根据权利要求5所述的获得方法，其特征在于，所述均匀度分析步骤中，采用r统计环境下rmvp软件包的farmcpu模型进行gwas分析，采用方差分析和多重比较分析不同基因型群体母猪产仔均匀度差异情况。9.一种种猪的选育方法，其特征在于，按照权利要求4所述的方法进行检测，根据检测结果留用母猪或弃用母猪。10.根据权利要求9所述的选育方法，其特征在于，所述留用母猪的所述分子标记位置的基因型为tt。
技术总结
本发明涉及一种与母猪产仔均匀度相关的分子标记及其获得方法和应用，涉及猪遗传基因技术领域。该分子标记为SNP分子标记，所述SNP分子标记位于猪12号染色体54406034bp位置，所述猪12号染色体54406034bp位置为C>T突变的突变位点，猪参考基因组为Sscrofa11.1。该分子标记不同基因型母猪的产仔均匀度有极显著的差异，根据该分子标记选留母猪，能够降低母猪产仔初生重的变异系数，有利于改善仔猪均匀度，提高仔猪存活率。提高仔猪存活率。提高仔猪存活率。
技术研发人员：赵云翔 高广雄 李智丽 周玉 孙艳梅
受保护的技术使用者：佛山科学技术学院
技术研发日：2022.03.11
技术公布日：2022/4/8