本发明涉及生物中,大豆转录因子gmburp272在植物耐盐性调控中的应用。
背景技术:
1、环境中物理、化学因素的变化,例如干旱、盐碱、冷害、冻害、水涝等胁迫因素是造成农作物严重减产的原因之一。美国在1939年-1978年的40年间,保险业对作物减产的赔付统计数据表明,由于盐害及干旱引起减产的赔付比例约占40.8%,高于涝(16.4%)、低温(13.8%)、冰雹(11.3%)和风(7.0%),更是远高于虫灾(4.5%)、病害(2.7%)和其他因素。因此,培育耐盐/旱性作物是种植业的主要目标之一。提高作物的耐盐/旱性,除了利用传统的育种方法,目前,分子遗传育种已经成为科技工作者所关注的领域之一。
2、植物中含burp结构域的蛋白家族(burp domain-containing protein)是植物特有的一类重要蛋白,burp结构域位于蛋白的c-端,按照结构,可分为4个亚家族。在植物中,此类蛋白参与了许多生物学过程,例如,一些器官的形成,应对病原菌入侵等等。
技术实现思路
1、本发明所要解决的技术问题是如何提高植物的耐盐性。
2、为解决上述技术问题,本发明首先提供了蛋白质或调控所述蛋白质活性或含量的物质的下述任一应用:
3、d1)调控植物耐盐性;
4、d2)制备调控植物耐盐性产品;
5、d3)培育耐盐性增强植物;
6、d4)制备培育耐盐性增强植物产品;
7、d5)植物育种;
8、所述蛋白质来源于大豆,其名称为gmburp272,为如下a1)、a2)或a3):
9、a1)氨基酸序列是序列2的蛋白质;
10、a2)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;
11、a3)在a1)或a2)的n端或/和c端连接标签得到的融合蛋白质。
12、为了使a1)中的蛋白质便于纯化,可在由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质的氨基末端或羧基末端连接上如下表所示的标签。
13、表:标签的序列
14、 标签 残基 序列 poly-arg 5-6(通常为5个) rrrrr poly-his 2-10(通常为6个) hhhhhh flag 8 dykddddk strep-tag ii 8 wshpqfek c-myc 10 eqkliseedl
15、上述a2)中的gmburp272蛋白质,为与序列2所示蛋白质的氨基酸序列具有75%或75%以上同一性且具有相同功能的蛋白质。所述具有75%或75%以上同一性为具有75%、具有80%、具有85%、具有90%、具有95%、具有96%、具有97%、具有98%或具有99%的同一性。
16、上述a2)中的gmburp272蛋白质可人工合成,也可先合成其编码基因,再进行生物表达得到。
17、上述a2)中的gmburp272蛋白质的编码基因可通过将序列1所示的dna序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子,和/或进行一个或几个碱基对的错义突变,和/或在其5′端和/或3′端连上上表所示的标签的编码序列得到。其中,序列1所示的dna分子编码序列2所示的gmburp272蛋白质。
18、上述应用中,所述物质可为下述b1)至b9)中的任一种:
19、b1)编码gmburp272的核酸分子;
20、b2)含有b1)所述核酸分子的表达盒;
21、b3)含有b1)所述核酸分子的重组载体、或含有b2)所述表达盒的重组载体;
22、b4)含有b1)所述核酸分子的重组微生物、或含有b2)所述表达盒的重组微生物、或含有b3)所述重组载体的重组微生物;
23、b5)含有b1)所述核酸分子的转基因植物细胞系、或含有b2)所述表达盒的转基因植物细胞系;
24、b6)含有b1)所述核酸分子的转基因植物组织、或含有b2)所述表达盒的转基因植物组织;
25、b7)含有b1)所述核酸分子的转基因植物器官、或含有b2)所述表达盒的转基因植物器官;
26、b8)降低gmburp272表达量的核酸分子;
27、b9)含有b8)所述核酸分子的表达盒、重组载体、重组微生物、转基因植物细胞系、转基因植物组织或转基因植物器官。
28、上述应用中,b1)所述核酸分子可为如下b11)或b12)或b13)或b14):
29、b11)编码序列是序列表中序列1的cdna分子或dna分子;
30、b12)序列表中序列1的cdna分子或dna分子;
31、b13)与b11)或b12)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且编码gmburp272的cdna分子或dna分子;
32、b14)在严格条件下与b11)或b12)或b13)限定的核苷酸序列杂交,且编码gmburp272的cdna分子或dna分子。
33、其中,所述核酸分子可以是dna,如cdna、基因组dna或重组dna;所述核酸分子也可以是rna,如mrna或hnrna等。
34、本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向进化和点突变的方法,对本发明的编码gmburp272蛋白质的核苷酸序列进行突变。那些经过人工修饰的,具有与本发明分离得到的gmburp272蛋白质的核苷酸序列75%或者更高同一性的核苷酸,只要编码gmburp272蛋白质且具有gmburp272蛋白质功能,均是衍生于本发明的核苷酸序列并且等同于本发明的序列。
35、这里使用的术语“同一性”指与天然核酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本发明的编码序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质的核苷酸序列具有75%或更高,或85%或更高,或90%或更高,或95%或更高同一性的核苷酸序列。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。
36、上述应用中,所述严格条件可为如下:50℃,在7%十二烷基硫酸钠(sds)、0.5mnapo4和1mm edta的混合溶液中杂交,在50℃,2×ssc,0.1%sds中漂洗;还可为:50℃,在7%sds、0.5m napo4和1mm edta的混合溶液中杂交,在50℃,1×ssc,0.1%sds中漂洗;还可为:50℃,在7%sds、0.5m napo4和1mm edta的混合溶液中杂交,在50℃,0.5×ssc,0.1%sds中漂洗;还可为:50℃,在7%sds、0.5m napo4和1mm edta的混合溶液中杂交,在50℃,0.1×ssc,0.1%sds中漂洗;还可为:50℃,在7%sds、0.5m napo4和1mm edta的混合溶液中杂交,在65℃,0.1×ssc,0.1%sds中漂洗;也可为:在6×ssc,0.5%sds的溶液中,在65℃下杂交,然后用2×ssc,0.1%sds和1×ssc,0.1%sds各洗膜一次;也可为:2×ssc,0.1%sds的溶液中,在68℃下杂交并洗膜2次,每次5min,又于0.5×ssc,0.1%sds的溶液中,在68℃下杂交并洗膜2次,每次15min;也可为:0.1×sspe(或0.1×ssc)、0.1%sds的溶液中,65℃条件下杂交并洗膜。
37、上述75%或75%以上同一性,可为80%、85%、90%或95%以上的同一性。
38、上述应用中,b2)所述的含有编码gmburp272蛋白质的核酸分子的表达盒(gmburp272基因表达盒),是指能够在宿主细胞中表达gmburp272蛋白质的dna,该dna不但可包括启动gmburp272基因转录的启动子,还可包括终止gmburp272基因转录的终止子。进一步,所述表达盒还可包括增强子序列。可用于本发明的启动子包括但不限于:组成型启动子,组织、器官和发育特异的启动子,和诱导型启动子。启动子的例子包括但不限于:花椰菜花叶病毒的组成型启动子35s;来自西红柿的创伤诱导型启动子,亮氨酸氨基肽酶("lap",chao等人(1999)plant physiol 120:979-992);来自烟草的化学诱导型启动子,发病机理相关1(pr1)(由水杨酸和bth(苯并噻二唑-7-硫代羟酸s-甲酯)诱导);西红柿蛋白酶抑制剂ii启动子(pin2)或lap启动子(均可用茉莉酮酸甲酯诱导);热休克启动子(美国专利5,187,267);四环素诱导型启动子(美国专利5,057,422);种子特异性启动子,如谷子种子特异性启动子pf128(cn101063139b(中国专利200710099169.7)),种子贮存蛋白质特异的启动子(例如,菜豆球蛋白、napin,oleosin和大豆beta conglycin的启动子(beachy等人(1985)embo j.4:3047-3053))。它们可单独使用或与其它的植物启动子结合使用。此处引用的所有参考文献均全文引用。合适的转录终止子包括但不限于:农杆菌胭脂碱合成酶终止子(nos终止子)、花椰菜花叶病毒camv 35s终止子、tml终止子、豌豆rbcs e9终止子和胭脂氨酸和章鱼氨酸合酶终止子(参见,例如:odell等人(i985)nature 313:810;rosenberg等人(1987)gene,56:125;guerineau等人(1991)mol.gen.genet,262:141;proudfoot(1991)cell,64:671;sanfacon等人genes dev.,5:141;mogen等人(1990)plant cell,2:1261;munroe等人(1990)gene,91:151;ballad等人(1989)nucleic acids res.17:7891;joshi等人(1987)nucleic acid res.,15:9627)。
39、可用现有的表达载体构建含有所述gmburp272基因表达盒的重组载体。所述植物表达载体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。如pahc25、pbin438、pcambia1302、pcambia2301、pcambia1301、pcambia1300、pbi121、pcambia1391-xa、psn1301或pcambia1391-xb(cambia公司)等。所述植物表达载体还可包含外源基因的3′端非翻译区域,即包含聚腺苷酸信号和任何其它参与mrna加工或基因表达的dna片段。所述聚腺苷酸信号可引导聚腺苷酸加入到mrna前体的3′端,如农杆菌冠瘿瘤诱导(ti)质粒基因(如胭脂碱合成酶基因nos)、植物基因(如大豆贮存蛋白基因)3′端转录的非翻译区均具有类似功能。使用本发明的基因构建植物表达载体时,还可使用增强子,包括翻译增强子或转录增强子,这些增强子区域可以是atg起始密码子或邻接区域起始密码子等,但必需与编码序列的阅读框相同,以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的,可以是天然的,也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选,可对所用植物表达载体进行加工,如加入可在植物中表达的编码可产生颜色变化的酶或发光化合物的基因(gus基因、萤光素酶基因等)、抗生素的标记基因(如赋予对卡那霉素和相关抗生素抗性的nptii基因,赋予对除草剂膦丝菌素抗性的bar基因,赋予对抗生素潮霉素抗性的hph基因,和赋予对氨甲喋呤抗性的dhfr基因,赋予对草甘磷抗性的epsps基因)或是抗化学试剂标记基因等(如抗除莠剂基因)、提供代谢甘露糖能力的甘露糖-6-磷酸异构酶基因。从转基因植物的安全性考虑,可不加任何选择性标记基因,直接以逆境筛选转化植株。
40、上述应用中,所述载体可为质粒、黏粒、噬菌体或病毒载体。所述质粒具体可为prokii载体或pzh01载体。
41、b3)所述重组载体具体可为prokii-gmburp272。所述prokii-gmburp272为将prokii载体的bamhi和kpni识别序列间的dna片段替换为序列表中序列1所示的gmburp272基因得到的重组载体,能表达序列表中序列2所示的gmburp272与nptⅱ所形成的融合蛋白。
42、b9)所述重组载体具体可为pzh01-gmburp272-rnai,pzh01-gmburp272-rnai为将序列1的第55位至284位所示的dna片段两次插入pzh01的多克隆位点间得到的重组载体,两次的插入片段方向相反。
43、上述应用中,所述转基因植物细胞系、转基因植物组织和转基因植物器官均不包括繁殖材料。
44、上述应用中,所述植物可为m1)或m2)或m3):
45、m1)双子叶植物或单子叶植物;
46、m2)豆科植物;
47、m3)大豆。
48、本发明还提供给了下述任一方法:
49、x1)培育耐盐性增强植物的方法,包括敲除受体植物中表达gmburp272的编码基因,或抑制受体植物中gmburp272编码基因的表达,或降低受体植物中gmburp272的含量,或降低受体植物中gmburp272的活性,得到耐盐性增强的目的植物;
50、x2)增强植物耐盐性的方法,包括敲除受体植物中表达gmburp272的编码基因,或抑制受体植物中gmburp272编码基因的表达,或降低受体植物中gmburp272的含量,或降低受体植物中gmburp272的活性,得到耐盐性增强的目的植物,实现植物耐盐性的增强。
51、上述方法中,x1)和x2)中抑制受体植物中gmburp272编码基因的表达可通过向所述受体植物导入抑制gmburp272编码基因的表达的核酸分子或表达所述核酸分子的重组载体实现。
52、上述方法中,所述编码基因可为b1)所述核酸分子。
53、上述方法中,其中所述gmburp272的编码基因可先进行如下修饰,再导入受体植物中,以达到更好的表达效果:
54、1)根据实际需要进行修饰和优化,以使基因高效表达;例如,可根据受体植物所偏爱的密码子,在保持本发明所述gmburp272的编码基因的氨基酸序列的同时改变其密码子以符合植物偏爱性;优化过程中,最好能使优化后的编码序列中保持一定的gc含量,以最好地实现植物中导入基因的高水平表达,其中gc含量可为35%、多于45%、多于50%或多于约60%;
55、2)修饰邻近起始甲硫氨酸的基因序列,以使翻译有效起始;例如,利用在植物中已知的有效的序列进行修饰;
56、3)与各种植物表达的启动子连接,以利于其在植物中的表达;所述启动子可包括组成型、诱导型、时序调节、发育调节、化学调节、组织优选和组织特异性启动子;启动子的选择将随着表达时间和空间需要而变化,而且也取决于靶物种;例如组织或器官的特异性表达启动子,根据需要受体在发育的什么时期而定;尽管证明了来源于双子叶植物的许多启动子在单子叶植物中是可起作用的,反之亦然,但是理想地,选择双子叶植物启动子用于双子叶植物中的表达,单子叶植物的启动子用于单子叶植物中的表达;
57、4)与适合的转录终止子连接,也可以提高本发明基因的表达效率;例如来源于camv的tml,来源于rbcs的e9;任何已知在植物中起作用的可得到的终止子都可以与本发明基因进行连接;
58、5)引入增强子序列,如内含子序列(例如来源于adhl和bronzel)和病毒前导序列(例如来源于tmv,mcmv和amv)。
59、所述gmburp272的编码基因可利用含有所述gmburp272的编码基因的重组载体导入受体植物。所述重组载体具体可为所述pcambia1301-gmburp272。
60、所述重组载体可通过使用ti质粒,ri质粒,植物病毒载体,直接dna转化,显微注射,电穿孔,农杆菌介导等常规生物方法导入植物细胞或组织,并将转化的植物组织培育成植株。被转化的植物宿主既可以是单子叶植物,也可以是双子叶植物。
61、为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选,可对所用植物表达载体进行加工,如加入可在植物中表达的编码产生颜色变化的酶或发光化合物的基因(gus基因、萤光素酶基因等)、具有抗性的抗生素标记物(庆大霉素标记物、卡那霉素标记物等)或是抗化学试剂标记基因(如抗除莠剂基因)等。从转基因植物的安全性考虑,可不加任何选择性标记基因,直接以干旱处理筛选转化植株。
62、所述目的植物理解为不仅包含gmburp272蛋白或其编码基因被改变的第一代植物,也包括其子代。对于所述目的植物,可以在该物种中繁殖该基因,也可用常规育种技术将该基因转移进入相同物种的其它品种,特别包括商业品种中。所述目的植物包括种子、愈伤组织、完整植株和细胞。
63、上述方法中,所述受体植物可为m1)或m2)或m3):
64、m1)双子叶植物或单子叶植物;
65、m2)豆科植物;
66、m3)大豆。
67、本发明还提供了增强植物耐盐性产品,所述产品含有gmburp272或所述调控所述蛋白质活性或含量的物质。
68、所述产品可以gmburp272或所述调控所述蛋白质活性或含量的物质为其活性成分,还可将gmburp272或所述调控所述蛋白质活性或含量的物质与具有相同功能的物质组合在一起作为其活性成分。
69、gmburp272或所述调控所述蛋白质活性或含量的物质,也属于本发明的保护范围。
70、本发明中,所述耐盐性具体可为植物对nacl模拟的高盐环境的耐性。所述nacl模拟的高盐环境可为nacl浓度为50mm-300mm(如100mm)的环境。
71、植物的耐盐性可通过植物的存活率、叶片萎蔫程度和/或叶片相对离子渗透率来体现。
72、本发明将转录因子gmburp272的编码基因转入受体大豆的毛状根中,得到转基因毛状根及转基因嵌合体,该转基因大豆毛状根与转空载体大豆毛状根相比,其耐盐性有显著提高。说明转录因子gmburp272及其编码基因可以调控植物耐盐性,对培育植物高耐盐性品种具有重要的理论和现实意义。