本发明涉及生物技术和医学诊断领域,用于诊断胃癌的甲基化生物标记物及其用途。
背景技术:
1、胃癌(gastric cancer,gc)是一种恶性肿瘤,也是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一。根据2020年全球癌症统计数据资料显示,胃癌的发病率和死亡率分别居第五位和第三位,男性发病率是女性的两倍。绝大多数胃癌属于腺癌,早期无明显症状,或出现上腹不适、嗳气等非特异性症状,常与胃炎、胃溃疡等胃慢性疾病症状相似,易被忽略。实施早期胃癌筛查能将患者5年生存率提升至90%以上。因此,对胃癌进行筛查、对发现的早期胃癌及时治疗是降低胃癌死亡率、延长患者生存时间的重要手段。由于我国人口基数大,医疗资源分布不均衡,现有的医疗条件尚不能支持胃镜普查,寻求高通量的、操作便捷的方案有助于筛查的普及,也适合我国国情。
2、dna甲基化发生在肿瘤的早期阶段,且具有组织特异性,是追踪早期肿瘤信号的最佳选择之一。通过寻找胃癌特异性的甲基化标志物,检测其甲基化程度可以有效区分癌/非癌,再联合其他筛查方法提高筛查的准确率。然而,迄今为止关于胃癌的甲基化分析报道十分有限。
3、本发明的目的是开发一种新的dna甲基化标志物及其检测方法,在早期,例如通过血液样本鉴别胃癌,辅助临床准确诊断和指导治疗。
技术实现思路
1、发明要解决的问题
2、为解决现有技术中存在的上述问题,本发明提供了一种用于诊断胃癌的甲基化生物标记物,利用dna甲基化生物标记物来进行早期的胃癌检测,实现胃癌针对多种样本,通过单个或多个甲基化标记物组合的高通量检测及精准预测的目的。
3、用于解决问题的方案
4、在本发明的第一方面中,提供了一种用于诊断胃癌的甲基化生物标记物,其中,所述的甲基化生物标记物包括表1中提供的编号1~编号1315的差异甲基化区域中的任一项或其任意组合。
5、在一些实施方案中,所述的甲基化生物标记物包括以下差异甲基化区域中的任一项或其任意组合:
6、chr9:126771377-126771459、chr7:87230188-87230189、 chr8:79428643-79428762、chr7:87229870-87229992、chr4:81951942-81952056、 chr8:79428666-79428762、chr5:158532472-158532473、 chr7:87230229-87230335、chr1:158150846-158150936、 chr1:158150828-158150894、chr7:87230172-87230270、 chr2:154335397-154335527、chr1:158150752-158150871、 chr4:166300043-166300144、chr2:154335350-154335456、 chr1:158150876-158150984、chr4:166299977-166300109、 chr4:166299973-166300082、chr4:81952454-81952579、 chr1:158150939-158151031、chr4:166300082-166300175、 chr2:154335293-154335397、chr19:51228353-51228475、 chr9:126771464-126771564、chr5:473846-473847、chr8:79428616-79428692、 chr5:475142-475226、chr8:41504206-41504314、chr3:152553708-152553836、 chr8:41504221-41504308、chr2:176994551-176994643、 chr4:81952210-81952336、chr20:2781338-2781445、chr7:87229811-87229900、 chr15:96895541-96895542、chr22:25961213-25961295、chr2:200329042-200329150、chr4:81952232-81952340、 chr3:152553244-152553359、chr5:473985-473986、chr10:18429766-18429879、 chr7:87229748-87229859、chr16:82661455-82661564、 chr3:152553289-152553393、chr4:81952181-81952305、chr5:474149-474234、chr22:25961295-25961383、chr5:473894-473895、chr5:473990-473991、 chr10:18429634-18429760、chr20:2781419-2781509、chr20:13201050-13201169、 chr20:2781520-2781648、chr2:177053350-177053442、 chr12:22487210-22487314、chr5:474034-474035、chr5:474049-474050、 chr12:22487135-22487230、chr12:22487138-22487231、 chr8:97506229-97506347、chr8:97506259-97506379、chr5:473977-473978、chr10:85955301-85955393、chr2:73147611-73147736、chr5:32714466-32714594、 chr11:117685585-117685703、chr20:13201015-13201114、 chr13:46961526-46961641、chr2:176994614-176994699、 chr5:32714408-32714525、chr5:474153-474276、chr5:474051-474052、 chr10:94822432-94822536、chr2:73147683-73147770、chr5:474089-474090、chr9:23822125-23822240、chr4:81952302-81952396、chr10:94822431-94822559、 chr5:474063-474064、chr5:474213-474214、chr2:176972012-176972141、 chr5:473948-473949、chr5:112073570-112073671、chr5:474111-474112、 chr5:112073352-112073434、chr3:138665243-138665321、chr5:474215-474216、 chr5:474110-474111、chr5:473899-473900、chr13:46961411-46961529、 chr10:94822487-94822575、chr9:23822006-23822117、chr5:474145-474146、 chr11:15094948-15095072、chr5:473942-473943、chr7:27196357-27196434、 chr11:15094952-15095069、chr5:473934-473935、chr5:474176-474177、 chr4:111544375-111544473、chr10:31607502-31607600、 chr2:73147740-73147852、chr5:474164-474165、chr10:90343288-90343407、 chr16:82661236-82661338、chr2:176972174-176972271、 chr10:31607440-31607441、chr5:474235-474321、chr5:474246-474247、chr4:155253994-155254080、chr5:474250-474251、chr4:48987977-48988095、 chr5:473839-473840、chr5:474127-474128、chr15:48010835-48010923、chr5:474254-474255、chr5:474252-474253、chr18:42259542-42259653、 chr5:474259-474260、chr18:42259507-42259584、chr18:42259559-42259560、 chr10:31607716-31607717、chr10:31607684-31607685和 chr10:31607698-31607699。
7、在一些具体的实施方案中,所述的差异甲基化区域至少包括: chr9:126771377-126771459、chr7:87230188-87230189和 chr8:79428643-79428762中的至少一种;
8、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr7:87229870-87229992和 chr4:81951942-81952056中的至少一种;
9、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr8:79428666-79428762和 chr5:158532472-158532473中的至少一种;
10、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr7:87230229-87230335、 chr1:158150846-158150936和chr1:158150828-158150894中的至少一种;
11、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr7:87230172-87230270、 chr2:154335397-154335527、chr1:158150752-158150871、 chr4:166300043-166300144、chr2:154335350-154335456、 chr1:158150876-158150984、chr4:166299977-166300109、 chr4:166299973-166300082、chr4:81952454-81952579和 chr1:158150939-158151031中的至少一种;
12、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr4:166300082-166300175、 chr2:154335293-154335397、chr19:51228353-51228475、 chr9:126771464-126771564、chr5:473846-473847、chr8:79428616-79428692、 chr5:475142-475226、chr8:41504206-41504314、chr3:152553708-152553836、 chr8:41504221-41504308、chr2:176994551-176994643、 chr4:81952210-81952336、chr20:2781338-2781445、chr7:87229811-87229900、chr15:96895541-96895542、chr22:25961213-25961295、 chr2:200329042-200329150、chr4:81952232-81952340、 chr3:152553244-152553359、chr5:473985-473986、chr10:18429766-18429879、 chr7:87229748-87229859、chr16:82661455-82661564、 chr3:152553289-152553393、chr4:81952181-81952305、chr5:474149-474234、chr22:25961295-25961383、chr5:473894-473895、chr5:473990-473991和 chr10:18429634-18429760中的至少一种;
13、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr20:2781419-2781509、 chr20:13201050-13201169、chr20:2781520-2781648、 chr2:177053350-177053442、chr12:22487210-22487314、chr5:474034-474035、 chr5:474049-474050、chr12:22487135-22487230、chr12:22487138-22487231、 chr8:97506229-97506347、chr8:97506259-97506379、chr5:473977-473978、 chr10:85955301-85955393、chr2:73147611-73147736、chr5:32714466-32714594、 chr11:117685585-117685703、chr20:13201015-13201114、chr13:46961526-46961641、chr2:176994614-176994699、 chr5:32714408-32714525、chr5:474153-474276、chr5:474051-474052、 chr10:94822432-94822536、chr2:73147683-73147770、chr5:474089-474090、 chr9:23822125-23822240、chr4:81952302-81952396、chr10:94822431-94822559、 chr5:474063-474064、chr5:474213-474214、chr2:176972012-176972141、 chr5:473948-473949、chr5:112073570-112073671、chr5:474111-474112、 chr5:112073352-112073434、chr3:138665243-138665321、chr5:474215-474216、chr5:474110-474111、chr5:473899-473900、chr13:46961411-46961529、 chr10:94822487-94822575、chr9:23822006-23822117、chr5:474145-474146、 chr11:15094948-15095072、chr5:473942-473943、chr7:27196357-27196434、 chr11:15094952-15095069、chr5:473934-473935、chr5:474176-474177和 chr4:111544375-111544473中的至少一种;
14、进一步地,所述的差异甲基化区域包括:chr9:126771377-126771459、chr7:87230188-87230189、chr8:79428643-79428762、chr7:87229870-87229992、 chr4:81951942-81952056、chr8:79428666-79428762、 chr5:158532472-158532473、chr7:87230229-87230335、 chr1:158150846-158150936、chr1:158150828-158150894、 chr7:87230172-87230270、chr2:154335397-154335527、 chr1:158150752-158150871、chr4:166300043-166300144、 chr2:154335350-154335456、chr1:158150876-158150984、 chr4:166299977-166300109、chr4:166299973-166300082、 chr4:81952454-81952579、chr1:158150939-158151031、 chr4:166300082-166300175、chr2:154335293-154335397、chr19:51228353-51228475、chr9:126771464-126771564、chr5:473846-473847、 chr8:79428616-79428692、chr5:475142-475226、chr8:41504206-41504314、 chr3:152553708-152553836、chr8:41504221-41504308、 chr2:176994551-176994643、chr4:81952210-81952336、chr20:2781338-2781445、 chr7:87229811-87229900、chr15:96895541-96895542、 chr22:25961213-25961295、chr2:200329042-200329150、 chr4:81952232-81952340、chr3:152553244-152553359、chr5:473985-473986、 chr10:18429766-18429879、chr7:87229748-87229859、 chr16:82661455-82661564、chr3:152553289-152553393、 chr4:81952181-81952305、chr5:474149-474234、chr22:25961295-25961383、chr5:473894-473895、chr5:473990-473991、chr10:18429634-18429760、 chr20:2781419-2781509、chr20:13201050-13201169、chr20:2781520-2781648、 chr2:177053350-177053442、chr12:22487210-22487314、chr5:474034-474035、 chr5:474049-474050、chr12:22487135-22487230、chr12:22487138-22487231、 chr8:97506229-97506347、chr8:97506259-97506379、chr5:473977-473978、 chr10:85955301-85955393、chr2:73147611-73147736、chr5:32714466-32714594、 chr11:117685585-117685703、chr20:13201015-13201114、chr13:46961526-46961641、chr2:176994614-176994699、 chr5:32714408-32714525、chr5:474153-474276、chr5:474051-474052、 chr10:94822432-94822536、chr2:73147683-73147770、chr5:474089-474090、 chr9:23822125-23822240、chr4:81952302-81952396、chr10:94822431-94822559、 chr5:474063-474064、chr5:474213-474214、chr2:176972012-176972141、 chr5:473948-473949、chr5:112073570-112073671、chr5:474111-474112、 chr5:112073352-112073434、chr3:138665243-138665321、chr5:474215-474216、chr5:474110-474111、chr5:473899-473900、chr13:46961411-46961529、 chr10:94822487-94822575、chr9:23822006-23822117、chr5:474145-474146、 chr11:15094948-15095072、chr5:473942-473943、chr7:27196357-27196434、 chr11:15094952-15095069、chr5:473934-473935、chr5:474176-474177、 chr4:111544375-111544473、chr10:31607502-31607600、 chr2:73147740-73147852、chr5:474164-474165、chr10:90343288-90343407、 chr16:82661236-82661338、chr2:176972174-176972271、 chr10:31607440-31607441、chr5:474235-474321、chr5:474246-474247、 chr4:155253994-155254080、chr5:474250-474251、chr4:48987977-48988095、 chr5:473839-473840、chr5:474127-474128、chr15:48010835-48010923、 chr5:474254-474255、chr5:474252-474253、chr18:42259542-42259653、 chr5:474259-474260、chr18:42259507-42259584、chr18:42259559-42259560、 chr10:31607716-31607717、chr10:31607684-31607685和 chr10:31607698-31607699。
15、在另一些实施方案中,所述的甲基化生物标记物包括以下的差异甲基化区域中的任一项或其任意组合:
16、chr10:11220099-11220195、chr8:97157323-97157411、 chr5:158532411-158532524、chr17:46673963-46674085、 chr8:99962608-99962690、chr6:133561660-133561777、 chr2:158300375-158300486、chr4:13524668-13524790、chr2:176993005-176993125、chr15:96895488-96895582、 chr2:177029417-177029542、chr5:134376437-134376563、 chr8:22562392-22562476、chr10:90343169-90343288、chr1:34629529-34629634、 chr3:186079213-186079340、chr8:24770918-24771026、 chr2:177030024-177030138、chr7:27253041-27253164、 chr4:144620969-144621093、chr7:27197574-27197659、 chr17:66596161-66596269、chr15:96887527-96887616、 chr5:112073352-112073434、chr6:133562758-133562876、 chr11:125037245-125037331、chr4:13526664-13526744、 chr8:72756454-72756552、chr7:87230172-87230267、 chr2:107502448-107502537、chr4:13532566-13532660、 chr9:91605730-91605817、chr8:99986820-99986928、chr16:11327091-11327204、 chr5:112073466-112073557、chr6:99280534-99280643、 chr10:85955209-85955302、chr11:46382989-46383076、 chr7:139333353-139333459、chr5:32714408-32714525、 chr12:115124959-115125066、chr6:5994950-5995048、chr8:99961208-99961337、 chr5:10565481-10565569、chr3:128211088-128211182、 chr10:121276092-121276212、chr8:10588846-10588971、chr8:687433-687513、 chr5:140871303-140871422、chr13:36049330-36049419、 chr16:72821517-72821645、chr17:29249695-29249773、 chr7:116963262-116963354、chr19:36909486-36909606、 chr3:179168761-179168844、chr8:72755877-72755999、chr7:1094830-1094913、 chr10:7452752-7452842、chr7:150038595-150038715、chr2:7571254-7571365、chr7:96651473-96651564、chr2:176972077-176972174、 chr5:172673058-172673162、chr2:213401682-213401784、 chr8:144105751-144105852、chr10:110225863-110225977、chr12:115109504-115109616、chr6:42738969-42739068、chr13:46960845-46960969、chr9:126771377-126771460、 chr13:88325299-88325385、chr2:89065168-89065266、chr6:40996088-40996182、 chr11:61544753-61544867、chr14:103512083-103512178、chr15:48010835-48010923、chr8:143532012-143532108、 chr10:28030376-28030474、chr5:92907914-92908009、chr7:27196280-27196357、 chr14:99697597-99697701、chr19:37957782-37957881、 chr16:11348779-11348867、chr10:94822406-94822486、 chr16:82661135-82661236、chr7:37487564-37487687、chr8:67344481-67344582、 chr8:13424254-13424371、chr19:36909674-36909751、chr4:74486190-74486275、 chr14:102247660-102247746、chr2:131797752-131797834、 chr8:79428608-79428697、chr2:193060312-193060424、 chr4:134070170-134070268、chr4:74486161-74486239、 chr19:51228325-51228428、chr19:37407275-37407386、 chr8:70984562-70984656、chr3:50378273-50378354、 chr4:154713805-154713923、chr2:73147607-73147684、chr10:7452785-7452907、 chr1:158150846-158150936、chr8:132052467-132052572、 chr3:138665165-138665243、chr4:154710033-154710130、chr5:475142-475226、 chr4:81952255-81952369、chr8:132054560-132054681、 chr6:73331132-73331242、chr8:41504204-41504318、chr8:54164382-54164463、 chr10:16562164-16562282、chr8:60032504-60032608、 chr11:107799859-107799937、chr2:154335350-154335456、 chr16:68771017-68771091、chr8:97506229-97506355、 chr6:117586965-117587072、chr12:22487545-22487638、 chr19:51228359-51228435、chr8:132053718-132053827、 chr3:142682404-142682503、chr10:134901632-134901734、 chr19:37288499-37288624、chr17:75369503-75369631、chr8:9764106-9764215、 chr13:47468096-47468221、chr7:50344120-50344207、chr7:93519920-93520045、chr7:37487917-37487991、chr7:87229748-87229837、chr3:38080883-38080970、 chr3:152553580-152553708、chr8:41166808-41166905、 chr8:26722887-26723016、chr12:95942293-95942403、chr7:50343859-50343987、 chr12:133464250-133464353、chr2:200328934-200329042、 chr20:2781338-2781445、chr8:106330655-106330756、 chr8:132052702-132052859、chr2:175201980-175202106、 chr1:4715257-4715345、chr22:25961207-25961295、chr16:31488314-31488398、 chr4:81952121-81952229、chr10:131265485-131265559、 chr13:46961257-46961370、chr22:24551833-24551960和 chr3:142839732-142839851。
17、在一些具体的实施方案中,所述的差异甲基化区域至少包括: chr22:24551833-24551960、chr3:142839732-142839851和 chr10:11220099-11220195中的至少一种;
18、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr8:97157323-97157411和 chr5:158532411-158532524中的至少一种;
19、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr17:46673963-46674085和 chr8:99962608-99962690中的至少一种;
20、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr6:133561660-133561777、 chr2:158300375-158300486和chr4:13524668-13524790中的至少一种;
21、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr2:176993005-176993125、 chr15:96895488-96895582、chr2:177029417-177029542、 chr5:134376437-134376563、chr8:22562392-22562476、 chr10:90343169-90343288、chr1:34629529-34629634、 chr3:186079213-186079340、chr8:24770918-24771026和 chr2:177030024-177030138中的至少一种;
22、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr7:27253041-27253164、 chr4:144620969-144621093、chr7:27197574-27197659、chr17:66596161-66596269、chr15:96887527-96887616、 chr5:112073352-112073434、chr6:133562758-133562876、chr11:125037245-125037331、chr4:13526664-13526744、 chr8:72756454-72756552、chr7:87230172-87230267、 chr2:107502448-107502537、chr4:13532566-13532660、 chr9:91605730-91605817、chr8:99986820-99986928、chr16:11327091-11327204、 chr5:112073466-112073557、chr6:99280534-99280643、 chr10:85955209-85955302、chr11:46382989-46383076、 chr7:139333353-139333459、chr5:32714408-32714525、 chr12:115124959-115125066、chr6:5994950-5995048、chr8:99961208-99961337、 chr5:10565481-10565569、chr3:128211088-128211182、 chr10:121276092-121276212、chr8:10588846-10588971和chr8:687433-687513 中的至少一种;
23、任选地,所述的差异甲基化区域还包括:chr5:140871303-140871422、 chr13:36049330-36049419、chr16:72821517-72821645、 chr17:29249695-29249773、chr7:116963262-116963354、 chr19:36909486-36909606、chr3:179168761-179168844、 chr8:72755877-72755999、chr7:1094830-1094913、chr10:7452752-7452842、 chr7:150038595-150038715、chr2:7571254-7571365、chr7:96651473-96651564、 chr2:176972077-176972174、chr5:172673058-172673162、 chr2:213401682-213401784、chr8:144105751-144105852、 chr10:110225863-110225977、chr12:115109504-115109616、 chr6:42738969-42739068、chr13:46960845-46960969、 chr9:126771377-126771460、chr13:88325299-88325385、 chr2:89065168-89065266、chr6:40996088-40996182、chr11:61544753-61544867、 chr14:103512083-103512178、chr15:48010835-48010923、 chr8:143532012-143532108、chr10:28030376-28030474、chr5:92907914-92908009、chr7:27196280-27196357、chr14:99697597-99697701、 chr19:37957782-37957881、chr16:11348779-11348867、 chr10:94822406-94822486、chr16:82661135-82661236、 chr7:37487564-37487687、chr8:67344481-67344582、chr8:13424254-13424371、 chr19:36909674-36909751、chr4:74486190-74486275、 chr14:102247660-102247746、chr2:131797752-131797834、 chr8:79428608-79428697、chr2:193060312-193060424、 chr4:134070170-134070268、chr4:74486161-74486239、 chr19:51228325-51228428和chr19:37407275-37407386中的至少一种;
24、进一步地,所述的差异甲基化区域包括:chr10:11220099-11220195、 chr8:97157323-97157411、chr5:158532411-158532524、 chr17:46673963-46674085、chr8:99962608-99962690、 chr6:133561660-133561777、chr2:158300375-158300486、 chr4:13524668-13524790、chr2:176993005-176993125、 chr15:96895488-96895582、chr2:177029417-177029542、 chr5:134376437-134376563、chr8:22562392-22562476、 chr10:90343169-90343288、chr1:34629529-34629634、 chr3:186079213-186079340、chr8:24770918-24771026、 chr2:177030024-177030138、chr7:27253041-27253164、 chr4:144620969-144621093、chr7:27197574-27197659、 chr17:66596161-66596269、chr15:96887527-96887616、 chr5:112073352-112073434、chr6:133562758-133562876、 chr11:125037245-125037331、chr4:13526664-13526744、 chr8:72756454-72756552、chr7:87230172-87230267、 chr2:107502448-107502537、chr4:13532566-13532660、 chr9:91605730-91605817、chr8:99986820-99986928、chr16:11327091-11327204、 chr5:112073466-112073557、chr6:99280534-99280643、chr10:85955209-85955302、chr11:46382989-46383076、 chr7:139333353-139333459、chr5:32714408-32714525、 chr12:115124959-115125066、chr6:5994950-5995048、chr8:99961208-99961337、 chr5:10565481-10565569、chr3:128211088-128211182、 chr10:121276092-121276212、chr8:10588846-10588971、chr8:687433-687513、 chr5:140871303-140871422、chr13:36049330-36049419、 chr16:72821517-72821645、chr17:29249695-29249773、 chr7:116963262-116963354、chr19:36909486-36909606、 chr3:179168761-179168844、chr8:72755877-72755999、chr7:1094830-1094913、 chr10:7452752-7452842、chr7:150038595-150038715、chr2:7571254-7571365、 chr7:96651473-96651564、chr2:176972077-176972174、 chr5:172673058-172673162、chr2:213401682-213401784、 chr8:144105751-144105852、chr10:110225863-110225977、 chr12:115109504-115109616、chr6:42738969-42739068、 chr13:46960845-46960969、chr9:126771377-126771460、 chr13:88325299-88325385、chr2:89065168-89065266、chr6:40996088-40996182、 chr11:61544753-61544867、chr14:103512083-103512178、 chr15:48010835-48010923、chr8:143532012-143532108、 chr10:28030376-28030474、chr5:92907914-92908009、chr7:27196280-27196357、 chr14:99697597-99697701、chr19:37957782-37957881、 chr16:11348779-11348867、chr10:94822406-94822486、 chr16:82661135-82661236、chr7:37487564-37487687、chr8:67344481-67344582、 chr8:13424254-13424371、chr19:36909674-36909751、chr4:74486190-74486275、 chr14:102247660-102247746、chr2:131797752-131797834、 chr8:79428608-79428697、chr2:193060312-193060424、 chr4:134070170-134070268、chr4:74486161-74486239、 chr19:51228325-51228428、chr19:37407275-37407386、chr8:70984562-70984656、chr3:50378273-50378354、 chr4:154713805-154713923、chr2:73147607-73147684、chr10:7452785-7452907、 chr1:158150846-158150936、chr8:132052467-132052572、 chr3:138665165-138665243、chr4:154710033-154710130、chr5:475142-475226、 chr4:81952255-81952369、chr8:132054560-132054681、 chr6:73331132-73331242、chr8:41504204-41504318、chr8:54164382-54164463、 chr10:16562164-16562282、chr8:60032504-60032608、 chr11:107799859-107799937、chr2:154335350-154335456、 chr16:68771017-68771091、chr8:97506229-97506355、 chr6:117586965-117587072、chr12:22487545-22487638、 chr19:51228359-51228435、chr8:132053718-132053827、 chr3:142682404-142682503、chr10:134901632-134901734、 chr19:37288499-37288624、chr17:75369503-75369631、chr8:9764106-9764215、 chr13:47468096-47468221、chr7:50344120-50344207、chr7:93519920-93520045、 chr7:37487917-37487991、chr7:87229748-87229837、chr3:38080883-38080970、 chr3:152553580-152553708、chr8:41166808-41166905、 chr8:26722887-26723016、chr12:95942293-95942403、chr7:50343859-50343987、 chr12:133464250-133464353、chr2:200328934-200329042、 chr20:2781338-2781445、chr8:106330655-106330756、 chr8:132052702-132052859、chr2:175201980-175202106、 chr1:4715257-4715345、chr22:25961207-25961295、chr16:31488314-31488398、 chr4:81952121-81952229、chr10:131265485-131265559、 chr13:46961257-46961370、chr22:24551833-24551960和 chr3:142839732-142839851。
25、在一些实施方案中,所述的胃癌为存在于受试者中的胃癌;任选地,所述的受试者为哺乳动物;优选地,所述的哺乳动物为人。
26、在一些实施方案中,所述胃癌选自i期、ii期、iii期或iv期的胃癌。
27、在一些实施方案中,所述胃癌选自低分化、中低分化、中分化、中高分化或高分化的胃癌。
28、在一些实施方案中,所述胃癌选自lauren分型中弥漫型、混合型或肠型的胃癌。
29、在一些实施方案中,待测样本中所述甲基化生物标记物的甲基化水平,与来自健康受试者或患有胃良性肿瘤受试者的样本中所述甲基化生物标记物的甲基化水平存在差异,则指示所述待测样本对应的受试者存在胃癌。
30、在本发明的第二方面中,提供了下述(i)~(ii)中任一用途:
31、(i)本发明第一方面中所述的甲基化生物标记物在制备用于诊断胃癌的试剂或试剂盒中的用途;
32、(ii)确定本发明第一方面中所述的甲基化生物标记物的甲基化水平的试剂在制备用于诊断胃癌的试剂或试剂盒中的用途。
33、在本发明的第三方面中,提供了一种用于诊断胃癌的试剂盒,其中,所述的试剂盒包含用于检测待测样本中本发明第一方面中所述的甲基化生物标记物的甲基化水平的试剂。
34、在一些实施方案中,所述的试剂为选自以下的检测甲基化水平的方法中所使用的试剂:荧光定量pcr、甲基化特异性pcr、数字pcr、dna甲基化芯片、靶向dna甲基化测序、全基因组甲基化测序、dna甲基化质谱中的一种或多种。
35、在一些实施方案中,所述的待测样本选自组织、全血、血浆、唾液、血清、尿液、尿液脱落细胞、尿沉渣、尿液上清中的一种或多种;优选地,所述的待测样本为组织、全血、血浆或血清。
36、在一些实施方案中,所述的待测样本来自受试者;任选地,所述的受试者是哺乳动物;优选地,所述的哺乳动物是人。
37、在本发明的第四方面中,提供了一种用于诊断胃癌的系统,其中,所述系统包括检测装置、计算装置和输出装置;
38、所述检测装置包括进样器和检测器,所述进样器用于采集来自受试者的样本,所述检测器用于检测所述样本中本发明第一方面中所述的甲基化生物标记物的甲基化水平;
39、所述计算装置包括存储器和处理器,所述存储器中存储有计算机程序,所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序,以实现如下判别:
40、所述样本中本发明第一方面中所述的甲基化生物标记物的甲基化水平不同于来自健康受试者和/或患有胃良性肿瘤的受试者的样本中测定的所述甲基化生物标记物的甲基化水平,则判别所述样本对应的受试者的存在胃癌。
41、发明的效果
42、本发明提供的甲基化生物标记物可以用于诊断胃癌,具有良好的敏感性、特异性及准确度。