ODC基因的缺失在获得浓香型水稻中的应用

文档序号:37224073发布日期:2024-03-05 15:25阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述方法包括:下调水稻的鸟氨酸脱羧酶的表达或活性,所述鸟氨酸脱羧酶的核苷酸序列如seq id no:25所示。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的下调水稻的鸟氨酸脱羧酶的表达或活性的方法包括:在水稻的基因组中敲除或沉默odc基因;或下调odc基因转录、多肽表达或多肽活性的下调剂转入水稻中,或采用odc缺失的水稻品种与香味型水稻品种进行杂交。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述的下调剂为特异性干扰odc基因表达的干扰分子,所述的干扰分子为抑制或沉默odc基因或其转录本的dsrna、反义核酸、小干扰rna、微小rna、sgrna,或能表达或形成所述dsrna、反义核酸、小干扰rna、微小rna的构建物。

4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,下调后的水稻的odc基因的核苷酸序列如seq id no.1或seq id no.3所示,下调后的水稻的鸟氨酸脱羧酶的氨基酸序列如seq idno.2或seq id no.4所示。

5.基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述方法为设计用于编辑odc基因的sgrna识别位点的靶序列,将其构建crispr/cas9-odc基因编辑载体,将该载体转化水稻获得浓香型水稻。

6.根据权利要求5所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述的sgrna识别位点的靶序列为seq id no.5或seq id no.6所示。

7.根据权利要求6所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,所述crispr/cas9-odc基因编辑载体的构建方法如下:

8.根据权利要求6所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述方法包括将权利要求7中所获得的含有目的条带的crispr/cas9基因编辑载体转入农杆菌eha105中,转化水稻,获得t0代转基因植株,以扩增引物对3对t0代转基因植株进行扩增并测序鉴定获得odc缺失突变的植株。

9.根据权利要求8所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述扩增引物对3为seq id no.17和seq id no.18所示。

10.根据权利要求8所述的利用crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述方法还包括将含有odc基因突变的t0代转基因植株,自交后的t1代植株的t-dna载体的剔除,所述t-dna载体包括潮霉素磷酸转移酶基因hpt、核酸酶基因cas9和sgrna编码基因。

11.根据权利要求10所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述t-dna载体的剔除通过对含有odc基因突变的t1代植株的hpt基因、cas9基因和sgrna编码基因同时检测,重复多次,筛选得到不携带这三个基因的t1代单株即为目标植株。

12.根据权利要求11所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,hpt基因表达盒检测方法通过以odc基因突变的 t1代植株的基因组dna为模板,以引物35s-ntf1和引物hyg-tr2进行pcr扩增,同时,cas9基因表达盒检测方法通过以odc基因突变的t1代植株的基因组dna为模板,以引物ubi-f1-new和引物cl-r2-new进行pcr扩增,同时,sgrna编码基因检测方法通过以odc基因突变的t1代植株的基因组dna为模板,以引物odc-f2和引物odc-r3进行pcr扩增,当均未同时检测到hpt基因、cas9基因和sgrna编码基因,表明成功剔除了t-dna。

13.根据权利要求12所述的基于crispr/cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,其特征在于,所述引物35s-ntf1:所述引物35s-ntf1如seq id no.19所示,引物hyg-tr2如seq idno.20所示,所述引物ubi-f1-new如seq id no.21所示,引物 cl-r2-new如 seq id no.22所述,引物 odc-f2如seq id no.17所示,引物odc-r3如seq id no.18所示。

14.鉴定odc缺失的分子标记,所述分子标记为odc-m1f和/或odc-m1r,odc-m1f的碱基序列如seq id no.23所示,所述odc-m1r的碱基序列如seq id no.24所示。

15.权利要求14所述的鉴定odc缺失的分子标记在鉴定浓香型水稻品种中的应用。

16.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述采用odc缺失的水稻品种与香味型水稻品种进行杂交的方法中,所述odc缺失的水稻品种为odc基因编辑植株,所述香味型水稻品种为badh2缺失的水稻品种。


技术总结
本发明公开了ODC基因的缺失在获得浓香型水稻中的应用,开发了快速鉴定ODC缺失的分子标记。本发明还公开了通过CRISPR/Cas9技术快速获得浓香型水稻的方法,基于ODC的序列特征,设计靶序列,构建CRISPR/Cas9基因编辑载体,转化没有香味的水稻,对基因编辑材料编辑位点的鉴定和cas9的PCR检测,获得了没有cas9的香味水稻。本发明ODC基因的缺失水稻,相较于野生型水稻,香味物质2‑AP含量提高了1倍。本发明通过将ODC缺失的品种与常规Badh2缺失的香味水稻进行杂交,可以获得浓香型水稻材料。本发明具有简单便捷、快速高效的获得香味水稻,对水稻香味品质改良育种具有指导意义。

技术研发人员:王金彦,张保龙,李阳,凌溪铁,郭冬姝
受保护的技术使用者:江苏省农业科学院
技术研发日:
技术公布日:2024/3/4
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