一种基因拼接方法、装置、电子设备和存储介质与流程

1.本发明涉及基因拼接技术领域，尤其涉及一种基因拼接方法、装置、电子设备和存储介质。


背景技术：

2.基因拼接就是利用基因测序技术所获取的较短基因序列,通过基于重叠部分的拼接，从而获取具有研究意义的较长的脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid，dna)分子序列。基因拼接在“智慧医疗”时代将存在越来越多的应用场景，因此基因拼接效率及准确度将成为“智慧医疗”所要研究的重要课题。
3.目前，现有技术中，对于基因的拼接主要基于重叠-排列-生成一致序列(overlap-layout-consensus，olc)图模型的基因组组装算法和基于欧拉超路算法两种。通过欧拉超路算法拆分基因序列时，存在拼接过程中丢失基因序列长链的拼接信息的问题，同时在拆分过程中产生大量的短序列，造成存储量大的问题，影响拼接效率。


技术实现要素：

4.本发明提供了一种基因拼接方法、装置、电子设备和存储介质，解决了基因拼接过程中出现基因序列丢失的问题，提高了基因拼接的效率和准确率。
5.根据本发明的一方面，本发明实施例提供了一种基因拼接方法，该方法包括：获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列；分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列；根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息；根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。
6.可选的，第一基因序列采用位存储的方式存储。
7.可选的，多个基因子序列采用哈希表的形式存储；基因子序列包括基因数据和基因编码，相邻基因子序列的基因编码相差1、相邻基因子序列的基因数据部分重叠。
8.可选的，根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息，包括：将所有基因子序列输入图构建器中，确定当前基因子序列，其中，图构建器是基于分布式计算框架生成的；根据当前基因子序列的基因数据，确定前置基因子序列和后置基因子序列；对当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列进行路径相容性检测，确定是否来自同一第一基因序列；若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列来自同一第一基因序列，则根据当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列分别对应的基因编码进行排序并拼接，确定该第一基因序列对应的基因图信息。
9.可选的，根据当前基因子序列的基因数据，确定前置基因子序列和后置基因子序列，包括：根据当前基因子序列的基因数据，确定当前基因子序列的前置节点和后置节点；以最新确定的一个前置节点为第一种子节点，确定第一种子节点的前置节点，直至第一种子节点没有前置节点为止，其中，前置基因子序列包括所有前置节点；以最新确定的一个后
置节点为第二种子节点，确定第二种子节点的后置节点，直至第二种子节点没有后置节点为止，其中，后置基因子序列包括所有后置节点。
10.可选的，根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列，包括：根据基因序列构建器和基因图信息，确定每个基因子序列的编号基因数组；对编号基因数组进行转换，确定第二基因序列。
11.可选的，在对第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列后，还包括：存储第一基因序列与基因子序列的对应关系。
12.根据本发明的另一方面，本发明实施例还提供了一种基因拼接装置，该装置包括：集合获取模块，用于获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列；序列拆分模块，用于分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列；信息确定模块，用于根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息；序列确定模块，用于根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。
13.根据本发明的另一方面，本发明实施例还提供了一种电子设备，该电子设备包括：至少一个处理器；以及与至少一个处理器通信连接的存储器；其中，存储器存储有可被至少一个处理器执行的计算机程序，计算机程序被至少一个处理器执行，以使至少一个处理器能够执行本发明任一实施例的基因拼接方法。
14.根据本发明的另一方面，本发明实施例还提供了一种计算机可读存储介质，计算机可读存储介质存储有计算机指令，计算机指令用于使处理器执行时实现本发明任一实施例的基因拼接方法。
15.本发明实施例的技术方案，通过获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列；分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列；根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息；根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。在上述实施例的基础上，通过对第一基因序列进行截断拆分，然后采用图构建器进行图拼接，根据拼接后的基因图信息确定第二基因序列，解决了基因拼接过程中出现基因序列丢失的问题，提高了基因拼接的效率，实现了准确的基因序列的拼接。
16.应当理解，本部分所描述的内容并非旨在标识本发明的实施例的关键或重要特征，也不用于限制本发明的范围。本发明的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
附图说明
17.为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
18.图1是本发明实施例一中提供的一种基因拼接方法的一个流程图；
19.图2是本发明实施例二中提供的一种基因拼接方法的一个流程图；
20.图3是本发明实施例三中提供的一种基因拼接装置的结构示意图；
21.图4是本发明实施例四中提供的一种电子设备的结构示意图。
具体实施方式
22.为了使本技术领域的人员更好地理解本发明方案，下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分的实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本发明保护的范围。
23.需要说明的是，本发明的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象，而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换，以便这里描述的本发明的实施例能够以除了在这里图示或描述的那些以外的顺序实施。此外，术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形，意图在于覆盖不排他的包含，例如，包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元，而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
24.实施例一
25.图1是本发明实施例一中提供的一种基因拼接方法的一个流程图，本实施例可适用于基因的拼接情况，该方法可以由基因拼接装置来执行，该基因拼接装置可以采用硬件和/或软件的形式实现，在一个具体的实施例中，该基因拼接装置可配置于电子设备中。如图1所示，本发明实施例的方法具体包括如下步骤：
26.s110、获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列。
27.其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列，第一基因序列是指一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的生物基因的片段，且记录着生物体的一串信息，控制着生物的遗传、进化、产生、衰老等阶段，对于第一基因序列采用位存储的方式存储。
28.具体的，获取基因序列集合的方法可以为：获取至少一个第一基因序列，将至少一个第一基因序列存储至基因序列集合，读取基因序列集合即可获得基因序列集合中的所有第一基因序列。
29.s120、分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列。
30.其中，基因子序列为对第一基因序列进行截断拆分后的短基因序列，基因子序列的长度比第一基因序列的长度短。
31.具体的，在获取到基因序列集合后，将基因序列集合中的每一个第一基因序列通过拆分器的截断器中的欧拉超路算法对第一基因序列进行截断拆分，将第一基因序列拆分成k长度的且碱基重叠数量为n的基因子序列，每个基因子序列之间有一个碱基重叠(碱基重叠可以进行设置)，最终将每一个一个基因序列拆分成多个基因子序列。
32.示例性的，若k为4，碱基重叠为1，其中一个第一基因序列为attgaca，通过拆分器的截断器中的欧拉超路算法对第一基因序列attgaca进行截断拆分，确定多个基因子序列分别为attg、ttga、tgac、gaca。
33.在上述实施例的基础上，可选的，在对第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列后，存储第一基因序列与基因子序列的对应关系。
34.具体的，在对第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列后，对第一基因序列与基因子序列的对应关系进行缓存，即确定基因子序列所属的第一基因序列，这样设置
的好处在于，保证拆分后的基因子序列与第一基因序列对应，提升拼接的效率。
35.在上述实施例的基础上，可选的，多个基因子序列采用哈希表的形式存储；基因子序列包括基因数据和基因编码，相邻基因子序列的基因编码相差1、相邻基因子序列的基因数据部分重叠。
36.其中，哈希表是根据关键码值而直接访问在记忆体存储位置的数据结构，加快查找速度；基因数据为基因子序列对应的基因信息，基因编码为对第一基因序列拆分后的基因子序列进行编号，每个基因子序列都有一个基因编码，且相邻基因子序列的基因编码相差1、相邻基因子序列的基因数据部分重叠。
37.具体的，通过采用哈希表的形式对多个基因子序列进行存储，这样设置的好处在于，降低基因数据的时间复杂度，大大节约了后续图拼接的时间。基因子序列包括基因数据和基因编码，相邻基因子序列的基因编码相差1,对于基因子序列进行编码，当从第一基因序列上拆分一个基因子序列就对其进行编码，这样可以通过编码对基因子序列进行保存，方便对无能症的第一基因序列的保存。
38.示例性的，在拆分第一基因序列时，对拆分所得基因子序列进行编号，编号的方式采用累加的方式，也就是说在串行拆分第一基因序列之前，记录一个基因编码w，w的初始值为0。每拆分得到一个基因子序列，就为其基因编码为w，然后对w进行加1的操作。这样，每一个得到的基因子序列都有一个独一无二的编码，即使存在两个基因子序列的值相同，但只要不是同一个基因子序列，他们的编码就不会重复。这样处理结束后，在同一个第一基因序列中，相邻基因子序列的编码相差1，可以通过编码来简单的找到任何一个基因子序列的前后邻接基因子序列，由于所有基因子序列都可以这样做，所以第一基因序列信息就被完整的保存下来。
39.进一步的，为了保证一个第一基因序列的第一个基因子序列与不会被默认分配到上一条第一基因序列的最后一个基因子序列作为前驱，需记录标识第一基因序列的首尾基因子序列：对于第一基因序列的第一个基因子序列，在得到其基因编码之后(假设为w)，令w＝w*10+1；对于第一基因序列的最后一个基因子序列，在得到其基因编码之后(假设为w)，令w＝w*10+2；对于第一基因序列的其他基因子序列，在得到其基因编码之后(假设为w)，令w＝w*10。在后续处理过程中，对基因子序列进行除10取余操作，便可以得到该基因子序列的位置信息：如果取余结果为1，则是第一基因序列的第一条基因子序列；如果取余结果为2，则是第一基因序列的最后一条基因子序列；如果取余结果为0，则是第一基因序列的中间基因子序列。通过上述方式对基因子序列所属第一基因序列信息的保留，在不额外消耗储存空间的条件下，保存了基因子序列所属第一基因序列信息。
40.s130、根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息。
41.其中，图构建器是基于分布式极端框架，对拆分的基因子序列进行图的并行构建。
42.具体的，在确定每个第一基因序列拆分后的基因子序列后，将每个第一基因序列拆分后的基因子序列输入图构建器中，若每一个基因子序列的碱基为a，则取每一个基因子序列的a-1个碱基，若第一个基因子序列中的后b-1个碱基与第二个基因子序列中的前b-1个碱基重叠，则在要构建的基因图信息中加入一个碱基，该碱基拥有一条入边为第一个基因子序列，该碱基拥有一条出边为第二个基因子序列，以此类推对所有的基因子序列进行
处理，确定每个第一基因序列拆分后的所有基因组序列对应的基因图信息。
43.示例性的，若第一基因序列为gaatcgt，通过对第一基因序列gaatcgt进行截断拆分，确定多个基因子序列分别为gaat、aatc、atcg、tcgt。然后对多个基因子序列gaat、aatc、atcg、tcgt进行图构建，确定第一基因序列为gaatcgt拆分后的多个基因子序列gaat、aatc、atcg、tcgt对应的基因图信息为(gaa)-gaat-(aat)-aatc-(atc)-atcg-(tcg)-tcgt-(cgt)。
44.s140、根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。
45.其中，基因序列构建器可以对基因图信息进行读取，将基因图序列转换成基因数组，第二基因序列为对第一基因序列进行拆分拼接后的基因序列。
46.具体的，在确定基因图信息后，将基因图信息转换成一串以基因子序列编码为内容的基因数组，通过基因子序列的基因编码和基因数据的对应关系将基因子序列的基因编号翻译为基因子序列的二进制值，然后对二进制值进行翻译，确定基因子序列的字符串，从而根据第一基因序列拆分后所有基因子序列的字符串确定第二基因序列。
47.本发明实施例的技术方案，通过获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列；分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列；根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息；根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。在上述实施例的基础上，通过对第一基因序列进行截断拆分，然后采用图构建器进行图拼接，根据拼接后的基因图信息确定第二基因序列，解决了基因拼接过程中出现基因序列丢失的问题，提高了基因拼接的效率，实现了准确的基因序列的拼接。
48.实施例二
49.图2是本发明实施例二中提供的一种基因拼接方法的一个流程图，本实施例可适用于基因的拼接情况，该方法可以由基因拼接装置来执行，该基因拼接装置可以采用硬件和/或软件的形式实现，在一个具体的实施例中，该基因拼接装置可配置于电子设备中。在上述实施例的基础上，对于根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息；根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列进一步优化，如图2所示，该方法具体包括如下步骤：
50.s210、获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列。
51.具体的，获取基因序列集合的方法可以为：获取至少一个第一基因序列，将至少一个第一基因序列存储至基因序列集合，读取基因序列集合即可获得基因序列集合中的所有第一基因序列。
52.s220、分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列。
53.具体的，在获取到基因序列集合后，将基因序列集合中的每一个第一基因序列通过拆分器的截断器中的欧拉超路算法对第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列。
54.s230、将所有基因子序列输入图构建器中，确定当前基因子序列。
55.其中，图构建器是基于分布式计算框架生成的，例如可以是海杜普hadoop分布式计算框架，本实施例对此不进行限定。
56.具体的，在确定所有基因子序列后，将所有基因子序列输入图构建器中，确定一个当前基因子序列的基因数据和基因编码。
57.s240、根据当前基因子序列的基因数据，确定前置基因子序列和后置基因子序列。
58.其中，前置基因子序列为基因编码在当前基因子序列之前的基因子序列，后置基因子序列为基因编码在当前基因子序列之后的基因子序列。
59.具体的，根据当前基因子序列的基因数据，确定当前基因子序列的前置节点和后置节点；以最新确定的一个前置节点为第一种子节点，确定第一种子节点的前置节点，直至第一种子节点没有前置节点为止，其中，前置基因子序列包括所有前置节点；以最新确定的一个后置节点为第二种子节点，确定第二种子节点的后置节点，直至第二种子节点没有后置节点为止，其中，后置基因子序列包括所有后置节点。这样设置的好处在于，确定当前基因子序列之后，继续寻找当前基因子序列的前置节点和后置节点，直到前置节点没有前置节点，后置节点没有后置节点为止，则确定所有的前置节点和后置节点寻找完成，所有的前置节点确定为当前基因子序列的基因数据对应的前置基因子序列，所有的后置节点确定为当前基因子序列的基因数据对应的后置基因子序列。
60.s250、对当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列进行路径相容性检测，确定是否来自同一第一基因序列。
61.其中，相容性检测即为确定每一个基因子序列是否来自同一第一基因序列。
62.具体的，对当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列进行路径相容性检测，分别确定当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列是否由同一第一基因子序列拆分得到，若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列由同一第一基因子序列拆分得到，则确定来自同一第一基因序列，并执行s270。若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列不是由同一第一基因子序列拆分得到，则执行s260，基因子序列拼接失败。
63.s260，基因子序列拼接失败。
64.具体的，若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列不是由同一第一基因子序列拆分得到，则基因子序列拼接失败。
65.s270、根据当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列分别对应的基因编码进行排序并拼接，确定该第一基因序列对应的基因图信息。
66.具体的，若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列来自同一第一基因序列，则根据当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列分别对应的基因编码进行排序并拼接，确定该第一基因序列对应的基因图信息。
67.s280、根据基因序列构建器和基因图信息，确定每个基因子序列的编号基因数组。
68.具体的，确定基因图信息后，将基因图信息输入基因序列构建器中，确定基因图信息的每一个基因子序列的编号基因数组。
69.s290、对编号基因数组进行转换，确定第二基因序列。
70.具体的，在确定编号基因数组后，对编码数据进行二进制转换，确定编号基因数组对应的二进制值，然后将二进制值转换为字符串确定第二基因序列。
71.本发明实施例的技术方案，通过获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列，分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列；将所有基因子序列输入图构建器中，确定当前基因子序列；根据当前基因子序列的基因数据，确定前置基因子序列和后置基因子序列；对当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子
序列进行路径相容性检测，确定是否来自同一第一基因序列；若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列由同一第一基因子序列拆分得到，则确定来自同一第一基因序列，则根据当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列分别对应的基因编码进行排序并拼接，确定该第一基因序列对应的基因图信息；若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列不是由同一第一基因子序列拆分得到，则基因子序列拼接失败；根据基因序列构建器和基因图信息，确定每个基因子序列的编号基因数组；对编号基因数组进行转换，确定第二基因序列。在上述实施例的基础上，通过确定当前基因子序列的前置基因子序列和后置基因子序列，并基于当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列的基因数据和基因编码的对应关系进行基因拼接确定基因图信息，进一步将基因图信息转化为字符串，确定第二基因序列，避免了拼接过程中基因序列的丢失情况，提升了基因拼接的效率，提高了基因序列拼接的准确率。
72.实施例三
73.图3是本发明实施例三中提供的一种基因拼接装置的结构示意图，该装置包括：集合获取模块310、序列拆分模块320、信息确定模块330和序列确定模块340。其中，
74.集合获取模块310，用于获取基因序列集合；其中，基因序列集合中包含至少一个第一基因序列。
75.序列拆分模块320，用于分别对每个第一基因序列进行截断拆分，确定多个基因子序列。
76.信息确定模块330，用于根据图构建器，对所有基因子序列进行图拼接，确定每个第一基因序列对应的基因图信息。
77.序列确定模块340，用于根据基因序列构建器和基因图信息，确定第二基因序列。
78.可选的，第一基因序列采用位存储的方式存储。
79.可选的，多个基因子序列采用哈希表的形式存储；基因子序列包括基因数据和基因编码，相邻基因子序列的基因编码相差1、相邻基因子序列的基因数据部分重叠。
80.可选的，信息确定模块330，具体用于：将所有基因子序列输入图构建器中，确定当前基因子序列，其中，图构建器是基于分布式计算框架生成的；根据当前基因子序列的基因数据，确定前置基因子序列和后置基因子序列；对当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列进行路径相容性检测，确定是否来自同一第一基因序列；若当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列来自同一第一基因序列，则根据当前基因子序列、前置基因子序列和后置基因子序列分别对应的基因编码进行排序并拼接，确定该第一基因序列对应的基因图信息。
81.可选的，信息确定模块330，具体用于：根据当前基因子序列的基因数据，确定当前基因子序列的前置节点和后置节点；以最新确定的一个前置节点为第一种子节点，确定第一种子节点的前置节点，直至第一种子节点没有前置节点为止，其中，前置基因子序列包括所有前置节点；以最新确定的一个后置节点为第二种子节点，确定第二种子节点的后置节点，直至第二种子节点没有后置节点为止，其中，后置基因子序列包括所有后置节点。
82.可选的，序列确定模块340，具体用于：根据基因序列构建器和基因图信息，确定每个基因子序列的编号基因数组；对编号基因数组进行转换，确定第二基因序列。
83.可选的，该装置还包括，存储模块，用于在对第一基因序列进行截断拆分，确定多
个基因子序列后，存储第一基因序列与基因子序列的对应关系。
84.本发明实施例所提供的基因拼接装置可执行本发明任意实施例所提供的基因拼接方法，具备执行方法相应的功能模块和有益效果。
85.实施例四
86.图4是本发明实施例四中提供的一种电子设备的结构示意图，电子设备旨在表示各种形式的数字计算机，诸如，膝上型计算机、台式计算机、工作台、个人数字助理、服务器、刀片式服务器、大型计算机、和其它适合的计算机。电子设备还可以表示各种形式的移动装置，诸如，个人数字处理、蜂窝电话、智能电话、可穿戴设备(如头盔、眼镜、手表等)和其它类似的计算装置。本文所示的部件、它们的连接和关系、以及它们的功能仅仅作为示例，并且不意在限制本文中描述的和/或者要求的本发明的实现。
87.如图4所示，电子设备10包括至少一个处理器11，以及与至少一个处理器11通信连接的存储器，如只读存储器(rom)12、随机访问存储器(ram)13等，其中，存储器存储有可被至少一个处理器执行的计算机程序，处理器11可以根据存储在只读存储器(rom)12中的计算机程序或者从存储单元18加载到随机访问存储器(ram)13中的计算机程序，来执行各种适当的动作和处理。在ram 13中，还可存储电子设备10操作所需的各种程序和数据。处理器11、rom 12以及ram 13通过总线14彼此相连。输入/输出(i/o)接口15也连接至总线14。
88.电子设备10中的多个部件连接至i/o接口15，包括：输入单元16，例如键盘、鼠标等；输出单元17，例如各种类型的显示器、扬声器等；存储单元18，例如磁盘、光盘等；以及通信单元19，例如网卡、调制解调器、无线通信收发机等。通信单元19允许电子设备10通过诸如因特网的计算机网络和/或各种电信网络与其他设备交换信息/数据。
89.处理器11可以是各种具有处理和计算能力的通用和/或专用处理组件。处理器11的一些示例包括但不限于中央处理单元(cpu)、图形处理单元(gpu)、各种专用的人工智能(ai)计算芯片、各种运行机器学习模型算法的处理器、数字信号处理器(dsp)、以及任何适当的处理器、控制器、微控制器等。处理器11执行上文所描述的各个方法和处理，例如方法基因拼接方法。
90.在一些实施例中，方法基因拼接方法可被实现为计算机程序，其被有形地包含于计算机可读存储介质，例如存储单元18。在一些实施例中，计算机程序的部分或者全部可以经由rom 12和/或通信单元19而被载入和/或安装到电子设备10上。当计算机程序加载到ram 13并由处理器11执行时，可以执行上文描述的方法基因拼接方法的一个或多个步骤。备选地，在其他实施例中，处理器11可以通过其他任何适当的方式(例如，借助于固件)而被配置为执行方法基因拼接方法。
91.本文中以上描述的系统和技术的各种实施方式可以在数字电子电路系统、集成电路系统、场可编程门阵列(fpga)、专用集成电路(asic)、专用标准产品(assp)、芯片上系统的系统(soc)、负载可编程逻辑设备(cpld)、计算机硬件、固件、软件、和/或它们的组合中实现。这些各种实施方式可以包括：实施在一个或者多个计算机程序中，该一个或者多个计算机程序可在包括至少一个可编程处理器的可编程系统上执行和/或解释，该可编程处理器可以是专用或者通用可编程处理器，可以从存储系统、至少一个输入装置、和至少一个输出装置接收数据和指令，并且将数据和指令传输至该存储系统、该至少一个输入装置、和该至少一个输出装置。
92.用于实施本发明的方法的计算机程序可以采用一个或多个编程语言的任何组合来编写。这些计算机程序可以提供给通用计算机、专用计算机或其他可编程数据处理装置的处理器，使得计算机程序当由处理器执行时使流程图和/或框图中所规定的功能/操作被实施。计算机程序可以完全在机器上执行、部分地在机器上执行，作为独立软件包部分地在机器上执行且部分地在远程机器上执行或完全在远程机器或服务器上执行。
93.在本发明的上下文中，计算机可读存储介质可以是有形的介质，其可以包含或存储以供指令执行系统、装置或设备使用或与指令执行系统、装置或设备结合地使用的计算机程序。计算机可读存储介质可以包括但不限于电子的、磁性的、光学的、电磁的、红外的、或半导体系统、装置或设备，或者上述内容的任何合适组合。备选地，计算机可读存储介质可以是机器可读信号介质。机器可读存储介质的更具体示例会包括基于一个或多个线的电气连接、便携式计算机盘、硬盘、随机存取存储器(ram)、只读存储器(rom)、可擦除可编程只读存储器(eprom或快闪存储器)、光纤、便捷式紧凑盘只读存储器(cd-rom)、光学储存设备、磁储存设备、或上述内容的任何合适组合。
94.为了提供与用户的交互，可以在电子设备上实施此处描述的系统和技术，该电子设备具有：用于向用户显示信息的显示装置(例如，crt(阴极射线管)或者lcd(液晶显示器)监视器)；以及键盘和指向装置(例如，鼠标或者轨迹球)，用户可以通过该键盘和该指向装置来将输入提供给电子设备。其它种类的装置还可以用于提供与用户的交互；例如，提供给用户的反馈可以是任何形式的传感反馈(例如，视觉反馈、听觉反馈、或者触觉反馈)；并且可以用任何形式(包括声输入、语音输入或者、触觉输入)来接收来自用户的输入。
95.可以将此处描述的系统和技术实施在包括后台部件的计算系统(例如，作为数据服务器)、或者包括中间件部件的计算系统(例如，应用服务器)、或者包括前端部件的计算系统(例如，具有图形用户界面或者网络浏览器的用户计算机，用户可以通过该图形用户界面或者该网络浏览器来与此处描述的系统和技术的实施方式交互)、或者包括这种后台部件、中间件部件、或者前端部件的任何组合的计算系统中。可以通过任何形式或者介质的数字数据通信(例如，通信网络)来将系统的部件相互连接。通信网络的示例包括：局域网(lan)、广域网(wan)、区块链网络和互联网。
96.计算系统可以包括客户端和服务器。客户端和服务器一般远离彼此并且通常通过通信网络进行交互。通过在相应的计算机上运行并且彼此具有客户端-服务器关系的计算机程序来产生客户端和服务器的关系。服务器可以是云服务器，又称为云计算服务器或云主机，是云计算服务体系中的一项主机产品，以解决了传统物理主机与vps服务中，存在的管理难度大，业务扩展性弱的缺陷。
97.应该理解，可以使用上面所示的各种形式的流程，重新排序、增加或删除步骤。例如，本发明中记载的各步骤可以并行地执行也可以顺序地执行也可以不同的次序执行，只要能够实现本发明的技术方案所期望的结果，本文在此不进行限制。
98.上述具体实施方式，并不构成对本发明保护范围的限制。本领域技术人员应该明白的是，根据设计要求和其他因素，可以进行各种修改、组合、子组合和替代。任何在本发明的精神和原则之内所作的修改、等同替换和改进等，均应包含在本发明保护范围之内。