一种寨卡病毒的靶点序列及其应用的制作方法

文档序号:34684095发布日期:2023-07-05 21:57阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种rna病毒的靶点序列,其特征在于,所述靶点序列为rna病毒基因序列中包含20~40个碱基、且与人类基因组序列的相似性不小于95%的核酸序列片段;其中,所述rna病毒包括寨卡病毒,所述寨卡病毒的靶点序列包括seq id no.1~seq id no.3。

2.根据权利要求1所述的一种rna病毒的靶点序列,其特征在于,所述rna病毒还包括新型冠状病毒、严重急性呼吸综合征冠状病毒、中东呼吸综合征冠状病毒、埃博拉病毒、艾滋病病毒中的至少一种。

3.一种用于构建rna病毒的靶点序列的引物组合物,其特征在于,靶点序列seq idno.1的引物为seq id no.4~seq id no.7;和/或,靶点序列seq id no.2的引物为seq idno.8~seq id no.11;和/或,靶点序列seq id no.3的引物为seq id no.12~seq idno.15。

4.一种与权利要求1或权利要求2所述的rna病毒的靶点序列相关的生物材料,其特征在于,所述生物材料选自下述a)~b)中的一种:

5.根据权利要求4所述的生物材料,其特征在于,所述生物材料为重组载体,其构建步骤包括:1)设计引物,pcr扩增所述rna病毒的靶点序列;2)将扩增的序列片段和表达载体酶切,连接目的序列片段和表达载体;3)将连接产物转化大肠杆菌,培养;4)鉴定后提取重组质粒并包装。

6.一种如权利要求1或权利要求2所述的rna病毒的靶点序列的应用,其特征在于,所述应用选自以下应用中的至少一种:在细胞水平上激活相关基因的应用、在筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物中的应用、在筛选或制备用于预防或治疗rna病毒引发的病症的药物中的应用、在制备rna病毒检测或诊断试剂中的应用、在制备针对rna病毒的疫苗中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述应用为rna病毒的靶点序列在在细胞水平上激活相关基因的应用时,所述rna病毒为寨卡病毒,所述相关基因包括片段周围200k以内基因;

8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述应用为rna病毒的靶点序列在筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物中的应用时,所述激活靶基因为如权利要求1所述的rna病毒的靶点序列在细胞水平上激活的相关基因,所述相关基因如权利要求7所述;其中,所述应用为利用所述rna病毒的靶点序列或其反向互补序列来筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物,所述反向互补序列包括反向互补rna序列或反向互补dna序列。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述应用为利用rna病毒靶点序列的反向互补序列来筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物;或者,利用rna病毒靶点序列的3’端进行胆固醇修饰和四个硫代骨架修饰以及5’端进行两个硫代骨架修饰来筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物;或者,利用rna病毒靶点序列的反向互补序列的3’端进行胆固醇修饰和四个硫代骨架修饰以及5’端进行两个硫代骨架修饰来筛选或制备用于抑制激活靶基因表达的药物。

10.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述用于抑制激活靶基因表达的药物为病毒靶点抑制剂antagomir,其将所述rna病毒的靶点序列的反向互补序列的3’端进行胆固醇修饰和四个硫代骨架修饰,5’端进行两个硫代骨架修饰,全链进行甲氧基修饰,得到相对应的病毒靶点抑制剂antagomir。


技术总结
本申请是申请号为CN202010726669.4的分案申请。本发明提供一种寨卡病毒的靶点序列,其为RNA病毒基因序列中含20~40个碱基、且与人类基因组序列相似性不低于95%的核酸序列片段,其包括SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.3所示的靶点序列。本发明还涉及构建上述靶点序列的引物组合物、与上述靶点序列相关的生物材料以及上述靶点序列的应用。本发明构建的上述序列的病毒片段具有与人基因组DNA相互作用的功能,其类似病毒miRNA,同时验证了过表达RNA病毒靶点序列对周围基因表达水平的影响,并提出上述靶点片段是RNA病毒的重要致病物质的全新概念。上述靶点序列对RNA病毒的检测及诊断、药物筛选以及开展RNA病毒引发的病症的治疗等均具有重要应用价值。

技术研发人员:于文强,徐建青,汪海林,李伟,连丞,徐鹏
受保护的技术使用者:上海市公共卫生临床中心
技术研发日:
技术公布日:2024/1/13
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