一种分离纯化糖基化修饰RNA的试剂盒及其应用的制作方法

文档序号:34447534发布日期:2023-06-13 11:39阅读:148来源:国知局
一种分离纯化糖基化修饰RNA的试剂盒及其应用的制作方法

本发明属于生物,涉及一种分离纯化糖基化修饰rna的试剂盒及其应用。


背景技术:

1、糖可以修饰脂质和蛋白质,调节生命所有领域的分子间和分子内的相互作用。在酶的作用下,蛋白质或脂类附加上糖类形成糖脂和糖蛋白的过程就是糖基化。近期的研究表明糖基化修饰也可以发生在rna,形成糖rna(glycorna)。

2、研究人员通过一系列生物化学方法,发现保守的非编码rna含有唾液酸化多糖,并且存在于多种细胞类型和哺乳动物物种体内。活细胞分析表明,大多数多糖修饰的rna存在于细胞表面。本研究通过对哺乳动物多糖修饰rna的鉴定,揭示了rna生物学和糖生物学之间存在直接的接口,并且rna在细胞外生物学中的作用也得到了扩展,为转录后修饰调控rna定位和功能提供了新的方向。但是目前尚未公开较为简便的分离纯化糖基化修饰rna的方法,以及与非酒精性脂肪肝相关的glycorna。


技术实现思路

1、本发明的目的就是针对现有技术的上述不足,提供一种分离纯化糖基化修饰rna的试剂盒。

2、本发明的另一目的是提供一种分离纯化糖基化修饰rna的方法。

3、本发明的又一目的是提供非酒精性脂肪肝辅助诊断试剂。

4、本发明的目的可通过以下技术方案实现:

5、一种分离纯化糖基化修饰rna的试剂盒,包含凝集素偶联的固相载体;所述的凝集素优选植物来源凝集素;进一步优选刀豆素a(concocnvalina,cona)、麦胚素(wheatgermagglutinin,wga)、花生凝集素(peanutagglutinin,pna)和大豆凝集素(soybeanagglutinin,sba)、siglec-11、siglec-14;所述的固相载体选自磁性固相载体,优选自葡聚糖磁珠、琼脂糖磁珠、树脂或环氧树脂、聚苯乙烯磁珠中的任意一种,或者两种及以上的磁性载体混合物。

6、所述的试剂盒在分离纯化糖基化修饰rna中的应用。

7、一种分离纯化糖基化修饰rna的方法,分离纯化样本中的总rna,向总rna中加入凝集素偶联的固相载体,孵育一段时间后分离凝集素偶联的固相载体捕获的rna,随后将凝集素偶联的固相载体捕获的rna从固相载体上洗脱下来,此即为糖基化修饰的rna。

8、作为本发明的一种优选,所述的凝集素为植物来源凝集素;优选刀豆素a、麦胚素、花生凝集素或大豆凝集素。

9、作为本发明的一种优选,所述的固相载体选自磁性固相载体选自葡聚糖磁珠、琼脂糖磁珠、树脂或环氧树脂、聚苯乙烯磁珠中的任意一种,或者两种及以上的磁性载体混合物。

10、作为本发明的一种优选,所述的固相载体粒径分布范围为1um-200um,优选为10um-200um,更进一步优选为30um-150um。

11、作为本发明的一种优选,孵育温度为20-30℃,孵育时间为50-70分钟。

12、作为本发明的进一步优选,孵育温度为25℃,孵育时间为60分钟。

13、作为本发明的一种优选,洗脱使用的洗脱剂为0.5mn-乙酰半乳糖胺(n-acetyl-d-glucosamine)。

14、一种非酒精性脂肪肝辅助诊断试剂,包含从血浆中分离糖基化修饰rna的试剂,以及检测糖基化rny5的试剂。rny5序列如下所示:

15、agttggtccgagtgttgtgggttattgttaagttgatttaacattgtctccccccacaaccgcgcttgac tagcttgctgtttt(seq id no.1)。

16、作为本发明的一种优选,所述的从血浆中分离糖基化修饰rna的试剂为凝集素偶联的固相载体;所述的检测糖基化rny5的试剂为定量检测糖基化rny5的试剂,包括但不限于northerblotting检测糖基化rny5的探针、定量pcr检测糖基化rny5的逆转录引物和特异性pcr引物对。

17、作为本发明的一种优选,所述的凝集素为刀豆素a、麦胚素、花生凝集素或大豆凝集素、siglec-11、siglec-14;所述的固相载体选自磁性固相载体选自葡聚糖磁珠、琼脂糖磁珠、树脂或环氧树脂、聚苯乙烯磁珠中的任意一种,或者两种及以上的磁性载体混合物。

18、作为本发明的一种优选,所述的固相载体所述固体载体粒径分布范围为1um-200um,优选为10um-200um,更进一步优选为30um-150um。

19、有益效果:

20、本发明人经过广泛而深入的研究,通过大量筛选,开发了一类分离纯化糖基化修饰rna的方法和试剂盒。本发明人设计并构建了能够一类结构独特的糖基化修饰rna捕获载体,所述糖基化修饰rna捕获载体为表面经凝集素修饰的固相载体(如微球(bead)或磁珠等)。以糖基化修饰rna捕获磁珠为例,本发明的糖基化修饰rna捕获载体可以高效、特异性捕获样品中的糖基化修饰rna,配合高通量测序、northernblotting和rt-qpcr技术进行检测,可以快速、简便地、准确地检测样品中的糖基化修饰rna种类和数量。

21、本发明还提供了一种非酒精性脂肪肝辅助诊断试剂盒,使用该试剂盒进行非酒精性脂肪肝辅助诊断,用受试者工作特征曲线(receiveroperating characteristiccurve,简称roc曲线)分析糖基化修饰的rny5区分健康人(normal)和非酒精性脂肪肝(nafld)患者的曲线下面积为0.9955(95%ci:0.9834to1.000),准确率和精确率分别为100%和95.24%。

22、术语解释

23、凝集素

24、如本文所用,术语“凝集素”能够特异性识别糖基化修饰蛋白。凝集素是一类能够结合多糖基团的蛋白质,主要分布在细胞外基质中。细胞外基质中分布大量的糖蛋白和多糖基团,凝集素能够通过结合多糖基团来介导细胞之间的稳固连接。植物来源凝集素,如刀豆素a(concocnvalina,cona)、麦胚素(wheatgerm agglutinin,wga)、花生凝集素(peanutagglutinin,pna)和大豆凝集素(soybean agglutinin,sba)等,能够高效地结合多糖基团。

25、固相载体

26、固相载体是指表面经高分子材料包埋的复合磁珠,主要包括:葡聚糖磁珠、琼脂糖磁珠、树脂或环氧树脂、聚苯乙烯磁珠等复合磁珠中的任意一种,或者两种及以上的磁性载体混合物,所述固体载体粒径分布范围为1um-200um,优选为10um-200um,更进一步优选为30um-150um。在固相载体的生产中,同一批次生产固相载体的粒径也不是均一的,因此固相载体的粒径描述通常既可以采用平均粒径的方式,也可以采用本发明中粒径分布范围的方式。

27、应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。

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