一种捕获不同片段大小的cfDNA的方法与流程

文档序号:36997684发布日期:2024-02-09 12:39阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种捕获不同片段大小的cfdna的方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述体液样本包括血浆、组织间隙液、淋巴液、脑脊液中的任意一种;

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(a)中,所述交联固定用到的试剂为甲醛,所述甲醛的浓度为0.1%-5%;

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(b)中,获得游离的不含核小体的cfdna和/或相邻核小体保护的长度不小于400bp的cfdna片段的方法为酚氯仿提取法。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(a)中,所述获得带有生物素二抗的磁珠的方法包括:将带有亲和素修饰的磁珠与生物素标记的二抗相连;

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(b)中,所述组蛋白一抗包括组蛋白h2a一抗、组蛋白h2b一抗、组蛋白h3一抗和组蛋白h4一抗中的任意一种;

7.一种构建cfdna文库的方法,其特征在于,所述方法包括:

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤(c)中,所述的末端修饰包括对dna片段进行末端补齐后,在5’端加上磷酸化修饰,在3’端加上a碱基;

9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤(d)中,所述酶包括转座酶或内切酶;

10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤(d)包括:利用转座酶,对单核小体保护的cfdna和/或相邻核小体保护的长度在100-400bp之间的中间长度的cfdna进行转座反应,以将所述cfdna进行片段化并添加接头序列,获得包含接头序列的cfdna片段;

11.一种获得个体表观信息的方法,其特征在于,对权利要求7-10任一项所述的方法获得的cfdna文库进行测序和分析,以获得个体表观信息。


技术总结
本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及一种捕获不同片段大小的cfDNA的方法。本发明开发出一套针对不同长度、不同开放特征的体液游离DNA使用不同方案进行分别捕获建库的cfDNA染色质开放性测序方法,最大程度实现了对体液游离DNA染色质开放性的全面展示。

技术研发人员:蓝勋,朱明,巨安基,攸娅娴,许润达
受保护的技术使用者:人科(北京)生物技术有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/2/8
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