基于生物信息学和血清学的T淋巴母细胞白血病/淋巴瘤检测试剂盒

文档序号:37230818发布日期:2024-03-05 15:41阅读:24来源:国知局
基于生物信息学和血清学的T淋巴母细胞白血病/淋巴瘤检测试剂盒

本技术涉及医学检测,具体地,本发明涉及一种基于生物信息学和血清学的t淋巴母细胞白血病/淋巴瘤检测试剂盒。


背景技术:

1、t淋巴母细胞白血病/淋巴瘤是一种恶性淋巴细胞克隆增生性疾病,是相对少见、恶性程度很高的,属于t细胞系的淋巴母细胞肿瘤。大多数病例原发于淋巴结或结外组织部位时,称为t淋巴母细胞淋巴瘤(t-cell lymphoblastic lymphoma,t-lbl);少数侵犯外周血和骨髓,称为t淋巴母细胞白血病(t-cell lymphoblastic leukemia,t-all)。t-lbl和t-all具有相似的临床和实验室特征,包括细胞形态学、免疫表型、基因型、细胞遗传学、临床表现和预后。当临床以肿瘤性病灶起病而无骨髓及外周血浸润,或骨髓中肿瘤性淋巴母细胞小于25%时诊断为t-lbl;当有骨髓和外周血受累,骨髓中淋巴母细胞大于25%时诊断为t-all。

2、t-lbl占淋巴母细胞性淋巴瘤的85%,大多数患者是青少年。t-lbl常表现纵隔肿块,其次伴有周围淋巴结、皮肤、肝脏、脾脏、咽淋巴环、cns或性腺侵犯。t-all是一种高度侵袭性的血液恶性肿瘤,主要发生于青少年,好发于男性,占所有成人all的25%。t-all通常表现白细胞病变和伴有纵隔或其它部位的大的肿块。骨髓造血相对减少。t-all/t-lbl具有高度的侵袭性,复发率高,长期生存率低,预后较差等特点,相关生物信息学和血清学研究亟待开展,选择可靠、简便的生物标志物具有重要的研究意义。


技术实现思路

1、为了弥补现有技术的不足,本发明提供了基于生物信息学和/或血清学建立的t-all/t-lbl的基因标志物和/或外周血生化标志物,并提供了其在预测或检测t-all/t-lbl的产品中的应用。

2、本发明采用如下技术方案:

3、本发明提供了一种检测生物标志物的试剂在制备用于预测或检测t-all/t-lbl的产品中的应用,所述生物标志物包括基因标志物和/或外周血生化标志物;

4、所述基因标志物包括cdk1、ccna2、mki67、top2a、foxm1、exo1、kif11、chek1、bub1b和bub1;

5、所述外周血生化标志物包括:血红蛋白(hgb)、促红细胞生成素(tpo)、凝血酶时间(tt)、d-二聚体定量(dd)和c反应蛋白(crp)。

6、进一步地,所述cdk1、ccna2、mki67、top2a、foxm1、exo1、kif11、chek1、bub1b和bub1在t-all/t-lbl患者中显著高表达。

7、进一步地,t-all/t-lbl患者的外周血血红蛋白(hgb)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的外周血凝血酶时间(tt)水平低于健康对照组,t-all/t-lbl患者的促红细胞生成素(tpo)水平高于健康对照组,t-all/t-lbl患者的外周血d-二聚体定量(dd)水平高于健康对照组,t-all/t-lbl患者的外周血c反应蛋白(crp)水平高于健康对照组。

8、进一步地,所述基因标志物还包括gzma、il7r、gzmk、ccl5、ccr7、prf1、tigit、ctla4、klrb1和klrd1。

9、进一步地,所述gzma、il7r、gzmk、ccl5、ccr7、prf1、tigit、ctla4、klrb1、klrd1在t-all/t-lbl患者中显著低表达。

10、进一步地,所述外周血生化标志物还包括中性粒细胞百分比(neut%)和淋巴细胞百分比(lymph%)。

11、进一步地,t-all/t-lbl患者的外周血中性粒细胞百分比(neut%)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的淋巴细胞百分比(lymph%)水平高于健康对照组。

12、进一步地,所述外周血生化标志物还包括中性粒细胞绝对值(neut)、总蛋白(tp)、球蛋白(glb)、总胆红素(tbil)、钠(na)中的一种或多种。

13、进一步地,t-all/t-lbl患者的外周血中性粒细胞绝对值(neut)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的外周血总蛋白(tp)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的外周血球蛋白(glb)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的外周血总胆红素(tbil)水平低于健康对照组;t-all/t-lbl患者的外周血钠(na)水平低于健康对照组。

14、进一步地,在上述应用中,还包括采用组间标志物区分t-lbl和t-all组,所述组间标志物包括促红细胞生成素(tpo)、低密度脂蛋白(ldl)、叶酸(fa)、球蛋白(glb)、淋巴细胞绝对值(lymph)、肌酐(cr)、总胆固醇(tc)、总蛋白(tp)、凝血酶时间(tt)中一种或多种。

15、进一步地,t-lbl组外周血促红细胞生成素(tpo)水平低于t-all组;t-lbl组外周血低密度脂蛋白(ldl)水平高于t-all组;t-lbl组外周血叶酸(fa)水平高于t-all组;t-lbl组外周血球蛋白(glb)水平高于t-all组;t-lbl组外周血淋巴细胞绝对值(lymph)水平高于t-all组;t-lbl组外周血肌酐(cr)水平高于t-all组;t-lbl组外周血总胆固醇(tc)水平高于t-all组;t-lbl组外周血总蛋白(tp)水平高于t-all组;t-lbl组外周血凝血酶时间(tt)水平高于t-all组。

16、在上述应用中,所述产品为试剂盒、试纸或仪器平台。

17、本发明还提供了一种预测或检测t-all/t-lbl的产品,包括上述的检测生物标志物的试剂。

18、本发明还提供了t-all/t-lbl生物标志物的筛选方法,所述生物标志物包括基因标志物和外周血生化标志物;其中,

19、所述基因标志物的筛选方法,包括如下步骤:a)应用geo数据库的在线分析工具geo2r进行分析,筛选正常t细胞和t-all患者细胞的差异表达基因;b)使用david在线分析工具对差异表达基因开展go功能注释和kegg信号通路富集分析,go功能包括生物学过程、细胞定位和分子功能;c)使用string在线数据库和cytoscape构建差异表达基因的ppi网络,筛选出10个在t-all/t-lbl患者中显著高表达的关键差异表达基因cdk1、ccna2、mki67、top2a、foxm1、exo1、kif11、chek1、bub1b和bub1作为主要基因标志物;

20、所述外周血生化标志物的筛选方法,包括如下步骤:对临床t-all组、t-lbl组、健康对照组的外周血血常规数据和生化数据进行统计学分析,并结合多参数分析,筛选得到血红蛋白(hgb)、促红细胞生成素(tpo)、凝血酶时间(tt)、d-二聚体定量(dd)和c反应蛋白(crp)作为主要外周血生化标志物。

21、本发明具有如下优点和有益效果:

22、(1)本发明筛选了特异性和显著性的基因标志物和/或外周血生化标志物作为生物标志物用于预测或检测t-all/t-lbl,为更好地将临床血清学检测数据用于t-all/t-lbl的鉴别奠定基础。

23、(2)本发明筛选的外周血生化标志物是基于患者的外周血样本,方法简单易行,且检测时间短,为t-all/t-lbl患者的快速诊断和治疗奠定基础。

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