种公牛冻精总RNA的提取方法及不同活力精子piRNA检测和应用

文档序号:37436259发布日期:2024-03-25 19:34阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种种公牛冻精总rna的提取方法,其特征在于:包括以下步骤,

2.根据权利要求1所述的一种种公牛冻精总rna的提取方法,其特征在于:所述体细胞裂解液包括0.1%sds和1m tris-hcl,ph为7.3。

3.一种种公牛不同活力精子pirna检测方法,其特征在于:利用pirna转录组测序为基础的荧光定量分析来检测影响精子活力中的10种功能性pirna,主要包括以下步骤,

4.根据权利要求3所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法,其特征在于:通过分析od260/280比值判断nanodrop检测rna的纯度。

5.根据权利要求3所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法,其特征在于:所述pirna数据库网址为http://pirnabank.ibab.ac.in/。

6.根据权利要求3所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法,其特征在于:使用茎环法逆转录合成pirna的cdna,通用茎环序列为:gtcgtatccagtgcagggtccgaggtattcgcactggatacgac;pirna的逆转录引物如下所示:

7.一种种公牛不同活力精子pirna检测方法的应用,其特征在于:包括用于评价公牛精子活力的功能性差异表达pirna以及分析不同活力精子中pirna组合表达。

8.根据权利要求7所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法的应用,其特征在于:采用实时荧光定量pcr分析不同活力精子中pirna组合表达,实时荧光定量pcr 20μl反应体系为:10μl的2×real-time pcr master mix,正、反向引物各0.5μl,cdna 1μl,8μlh2o;反应条件为:95℃3min;95℃,15s,57℃,15s,72℃,20s,40个循环。

9.根据权利要求8所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法的应用,其特征在于:所述实时荧光定量pcr检测中所使用的上游引物为的特异性引物,下游引物为根据茎环序列设计的通用下游引物:5’—agtgcagggtccgaggtatt--3'。

10.根据权利要求9所述的一种种公牛不同活力精子pirna检测方法的应用,其特征在于:所述特异性荧光定量引物序列如下:


技术总结
本发明公开了一种种公牛冻精总RNA的提取方法及不同活力精子piRNA检测和应用,基于此方法对提取的精子RNA进行高通量转录组测序,鉴定出能够用于评估不同活力精子的piRNA标记物,建立了一种利用piRNA转录组测序为基础的荧光定量分析来检测影响精子活力中的10种功能性piRNA的方法,这些piRNA可以调节睾丸中精子的发生和精子活力形成原理,能够对公牛精子活力进行分子评价,填充公牛精液品质分子标记,对于奶牛种公牛的分子选育具有重要的参考意义。

技术研发人员:丁强,王慧利,赵芳,陈坤琳,夏淑雯,沈阳阳,崔兆康,钱勇,仲跻峰
受保护的技术使用者:江苏省农业科学院
技术研发日:
技术公布日:2024/3/24
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