本发明涉及一种s-腺苷蛋氨酸合成酶突变体及其应用,属于生物酶工程。
背景技术:
1、s-腺苷蛋氨酸(s-adenosyl-l-methionine,sam)是一种重要的代谢中间体,存在于所有已知生物体中,是生物正常进行生理活动所必需的。sam在细胞中的重要性主要体现在其参与细胞的转甲基反应、转硫基反应和转氨丙基反应,它不仅是生物体内甲基的主要供体,同样也是多胺生物合成中使用的氨基、丙基的前体。所以,在各种sam作为辅因子的反应中,它的重要性可能仅次于atp。在临床研究中,sam已被广泛应用于肝脏疾病、抑郁症、骨关节炎、神经系统疾病和其他疾病的治疗。随着sam市场需求的不断扩大,为工业生产提供一种低成本、高效的sam制造技术是必要的。
2、sam的生产可以通过化学合成、生物酶催化和微生物发酵来实现。由于纯在严格的反应条件、低生产率、环境污染严重和纯化困难等问题,目前化学合成的方法生产sam已被放弃。微生物发酵法生产sam因其条件易控、产量高、底物廉价、便于放大等优点而得到广泛应用。酿酒酵母具有高活性的s-腺苷甲硫氨酸合成酶(mat,ec2.5.1.6),具有独特的液泡sam存储机制,因此广泛应用于sam生产,但该方法同时也存在着分离纯化成本高、生产周期长等问题。与前两种方法相比,生物酶催化法具有环境污染小、产品纯度高、纯化简单、生产周期短等优点。此外,酶工程和固定化酶的发展也使得酶法生产sam得到越来越多的关注。然而,酶促合成sam的主要挑战仍然是atp的昂贵以及mat的低催化效率。近年来,全细胞催化引起了广泛关注。与固定化酶相比,全细胞催化不需要酶的分离纯化,回收率高,降低了下游分离纯化成本,且细胞可以重复利用,有利于提高工业化生产sam的强度。但是全细胞催化法同时也需要高催化活性的s-腺苷蛋氨酸合成酶,所以目前有许多研究集中在尝试通过提高sam合成酶活性来工业生产sam。sam合成酶广泛存在于生物体中,包括细菌、真菌、昆虫、植物和哺乳动物等。近年来,来自大肠杆菌和酿酒酵母的sam合成酶已经得到了很好的工业应用特性。
3、甲硫氨酸腺苷转移酶(methionine adenosyltransferase,简称mat或者adomat,ec 2.5.1.6)是一种可以通过反应催化atp和l-甲硫氨酸合成s-腺苷甲硫氨酸的酶,是sam生物合成过程中的限速酶。目前,大肠杆菌和酿酒酵母来源的mat研究较多。通过酶学特性比较,大肠杆菌的mat具有较高的比活性和较好的可溶性表达。并且,从大肠杆菌中提取的mat的晶体结构和与amppnp和l-蛋氨酸络合的mat的晶体结构已经被报道,这使得基于其结构的理性或半理性重新设计获得高效的mat突变体成为可能。但是该酶的主要缺点是底物与产物的抑制严重限制了sam的合成。为了克服产物的抑制作用,需要在反应体系中加入高浓度的对甲苯磺酸钠,但是这也进一步增加了成本,且sam对甲苯磺酸盐作为药物的生物利用度较低。酿酒酵母中有两种mat,分别由sam1和sam2独立编码,并且他们的序列具有较高的同源性。但是和两种酶的结构与调控方式有所不同,sam合成酶1具有底物抑制性,在l-met过量时,细胞会下调sam1基因的表达,同时上调sam2基因的表达。sam2编码的sam合成酶2不受底物的抑制,并且大多数来源的sam合成酶均存在sam负反馈作用,即sam积累会抑制sam合成酶的酶活性,导致sam积累量不高,而酿酒酵母sam2编码的蛋白没有sam负反馈作用,因此常被用来进行sam积累。相关研究中指出,sam2合成酶基因的过表达在毕赤酵母、酿酒酵母和大肠杆菌中具有积极作用,但mat的活性极大的限制了sam的合成。因此,增加sam的产量需要提高mat的活性。
技术实现思路
1、针对目前工业生产s-腺苷蛋氨酸存在合成酶催化效率低,稳定性差的问题,为了克服现有技术存在的缺陷,本发明的目的在于提供一种s-腺苷蛋氨酸合成酶活性提高的突变体,并提高其全细胞催化法合成s-腺苷蛋氨酸的产量,对于促进s-腺苷蛋氨酸的合成具有普遍的意义。
2、本发明采用的技术方案如下:
3、克隆了酿酒酵母来源的sam2基因编码的s-腺苷蛋氨酸合成酶mat,采用swiss-model建立蛋白模型,分析其蛋白质结构,将蛋白质与底物进行分子对接,选择位点进行定点突变,对突变后带的酶进行活性测定,确定对酶活性有重要影响的位点,然后进行组合突变,迭加突变优势,获得相比野生型活性及稳定性提高的突变体。
4、本发明提供一种s-腺苷蛋氨酸合成酶突变体,在seq id no.1所示氨基酸序列的基础上,具有189位、200位、234位、371位的一个或多个位点突变。
5、在本发明的一种实施方式中,所述突变包括以下至少一种:
6、(1)将第189位异亮氨酸突变为缬氨酸;
7、(2)将第234位谷氨酰胺突变为天冬酰胺;
8、(3)将第266位缬氨酸突变为组氨酸;
9、(4)将第371位天冬酰胺突变为精氨酸、组氨酸、谷氨酰胺、半胱氨酸或赖氨酸。
10、在本发明的一种实施方式中,所述突变包括以下任一种:
11、(1)将第371位天冬酰胺突变为精氨酸(n371r);
12、(2)将第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并将第200位天冬氨酸突变为谷氨酸(n371r/d200e);
13、(3)将第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并将第234位谷氨酰胺突变为天冬酰胺(n371r/q234n);
14、(4)将第189位异亮氨酸突变为缬氨酸,第266位缬氨酸突变为组氨酸,第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并第234位谷氨酰胺突变为天冬酰胺(i189v/v266h/n371r/q234n)。
15、本发明还提供了编码所述突变体的基因。
16、本发明还提供了携带所述基因的表达载体。
17、本发明还提供了表达所述突变体,或携带所述表达载体的微生物细胞。
18、本发明还提供了一种重组大肠杆菌,以pet28a为载体,表达所述突变体。
19、本发明还提供了生产s-腺苷蛋氨酸的方法,以所述突变体或所述微生物细胞,或所述重组大肠杆菌为催化剂进行反应。
20、在本发明的一种实施方式中,将所述微生物细胞,或所述重组大肠杆菌在培养体系中培养至od600为0.6~0.8,加入诱导剂25℃诱导12-24h,收集菌体;将菌体添加至含有底物的反应体系中反应2h。
21、在本发明的一种实施方式中,将重组微生物细胞接种到含有卡那的10ml lb液体培养基中,37℃220rpm培养10-12h,再将2%的培养液转接新的含卡那的50ml lb液体培养基中培养,培养约2-3h使od=0.6-0.8,加入过滤除菌的诱导剂iptg到终浓度为0.1mm,然后25℃220rpm培养12-24h,离心收集菌体。
22、在本发明的一种实施方式中,所述底物包括l-蛋氨酸(20~60mm)、腺苷-5’-三磷酸二钠盐(20~60mm)、氯化钾(20~60mm)、氯化镁(20~60mm)、谷胱甘肽(5-8mm),控制菌株od600=(3.2)±0.2,在ph8±1、37~60℃下反应。
23、本发明还提供了所述突变体或所述微生物细胞在制备s-腺苷蛋氨酸或含s-腺苷蛋氨酸的产品中的应用。
24、在本发明的一种实施方式中,所述产品包括食品、药品或日化用品。
25、有益效果:
26、(1)对s-腺苷蛋氨酸合成酶mat的189位、200位、234位、371位的一个或多个位点突变,得到了酶活提高的一系列突变体,将第371位天冬酰胺突变为精氨酸(n371r),其比酶活较亲本分别提高了391.81%;将第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并将第200位天冬氨酸突变为谷氨酸(n371r/d200e),其比酶活较亲本分别提高了239.90%;将第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并将第234位谷氨酰胺突变为天冬酰胺(n371r/q234n),其比酶活较亲本分别提高了401.05%;将第189位异亮氨酸突变为缬氨酸,第266位缬氨酸突变为组氨酸,第371位天冬酰胺突变为精氨酸,并第234位谷氨酰胺突变为天冬酰胺(i189v/v266h/n371r/q234n),其比酶活较亲本分别提高了294.57%,且189位、200位、234位、371位的单点突变其比酶活较亲本都有不同程度的提高,说明该突变体的酶活得到大大提升。
27、(2)通过全细胞催化比较催化性能,在催化2h,e.coli bl21-pet28a-sam2-n371r催化合成s-腺苷蛋氨酸的浓度为415.36mg/l,e.coli bl21-pet28a-sam2-n371r/d200e催化合成s-腺苷蛋氨酸的浓度为582.68mg/l,e.coli bl21-pet28a-sam2-n371r/q234n催化合成s-腺苷蛋氨酸的浓度为465.54mg/l,e.coli bl21-pet28a-sam2-i189v/v266h/n371r/q234n催化合成s-腺苷蛋氨酸的浓度为1749.40mg/l,而野生型e.coli bl21-pet28a-sam2在催化2h,合成sam浓度为276.32mg/l。