用于检测与糖尿病相关的snp位点组合的成套引物及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域，具体涉及用于检测与糖尿病相关的SNP位点组合的成 套引物及其应用，更具体涉及用于检测与东亚人群2型糖尿病、糖尿病肾病、糖尿病视网膜 病变、糖尿病合并冠心病和对药物敏感性相关的SNP位点组合的成套引物及其应用。
【背景技术】
[0002] 糖尿病是一组由胰岛素分泌缺陷和/或胰岛素作用障碍所致的以高血糖为特征 的慢性代谢性疾病。持续的高血糖与长期代谢紊乱可导致全身多器官，特别是眼、肾脏、心 血管及神经系统的严重损害，最终可导致患者失明、中风、心梗、截肢、肾衰等，产生严重的 后果。
[0003] 中国是糖尿病大国，据2010年统计，我国18岁及以上成人的糖尿病患病率 为9.7%，糖尿病患者人数已高达9700万。国际糖尿病联盟（InternationalDiabetes Federation，IDF)认为，如果趋势不变，至2035年中国糖尿病患者将高达1. 43亿。糖尿病及 其并发症不仅严重影响了患者的生活质量，同时亦导致医疗费用的迅猛上升。1993至2007 年，我国糖尿病的医疗费用从2000亿元上升至2216亿元，糖尿病直接医疗费用在卫生总费 用的占比从1. 96%上升至18. 2%。糖尿病带来的生命损失和经济负担已不堪重负。
[0004] 糖尿病的发生是遗传和环境因素相互作用的结果。一方面，生活条件的改善和肥 胖发病率的增加是2型糖尿病发病率增加的重要因素；另一方面，遗传因素同样发挥着不 可或缺的作用。Newman等人在双胞胎中的研究表明2型糖尿病中遗传因素占30% -70%。 糖尿病及并发症的发生是可防可控的，通过预测糖尿病及并发症的易感性，提前进行健康 干预是预防糖尿病发生和控制病情恶化的有效途径。再者，值得注意的是由于遗传背景等 方面的差异，不同糖尿病患者对同种治疗药物的敏感性不同，通过基因检测等方式为患者 选择适宜药物是控制糖尿病病情发展的关键。
[0005] SNP是基因组水平上单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性，人类基因组中平 均每500-1000个碱基对就有1个SNP位点，是可遗传变异中最常见的一种，也是多基因遗 传病研究的优良分子标志物。近些年，得利于高通量基因组测序的发展，众多糖尿病、糖尿 病并发症易感性及糖尿病治疗药物敏感性相关位点相继被发现。通过对这些位点的检测， 可预测个体患糖尿病及并发症的风险，评估患者对各种糖尿病治疗药物的敏感性，为患者 选择耐药性最佳药物。然而SNP的存在与否及等位基因频率存在人种及地域差异，西方国 家或白种人群的糖尿病相关SNP不一定适用于中国人。并且糖尿病是一种复杂的多基因疾 病，只检测单一SNP位点进行判定未免过于片面。因此，要利用SNP预测糖尿病的易感性及 发展趋势等情况，就必须考虑SNP位点的组合评估和人种及地域的差异。目前，尚缺乏针对 东亚人群糖尿病相关SNP位点组合进行检测的方法或产品。
[0006] 综上所述，糖尿病是中国正在并将长期面对的重大医疗难题。预测个体糖尿病及 并发症患病风险，通过"治未病"预防疾病发生；针对患者个体化差异为其选择适宜的治疗 方案是应对糖尿病难题的有效途径。因而，本领域迫切需要开发检测针对东亚人群2型糖 尿病及并发症易感性、药物敏感性相关SNP位点组合的方法和产品。
【发明内容】
[0007] 本发明的一个目的是提供一种用于检测如下SNP位点：rsl0229583、rsl0811661、 rsl0886471、rsllll875、rsl2742393、rsl2779790、rsl3266634、rsl535500、rsl6856187、 rsl6861329、rsl801282、rs2237892、rs340874、rs3786897、rs4430796、rs5219、rs6017317、 rs6467136、rs6815464、rs7041847、rs7172432、rs7612463、rs7651090、rs7756992、 rs780094、rs7903146、rs8050136、rs831571、rs9470794、rs2268388、rs9565164、 rs4668142、rs2380261、rs39059、rsl7756941、rs245955、rs245962、rs266729、rs3811951、 rsl56019、rs6234、rs3856806、rsl0494366、rsll977021、rs2230806、rsll212617 和 rs622342的成套引物。
[0008] 本发明提供的用于检测如下SNP位点：rsl0229583、rsl0811661、rsl0886471、 rsllll875、rsl2742393、rsl2779790、rsl3266634、rsl535500、rsl6856187、rsl6861329、 rsl801282、rs2237892、rs340874、rs3786897、rs4430796、rs5219、rs6017317、rs6467136、 rs6815464、rs7041847、rs7172432、rs7612463、rs7651090、rs7756992、rs780094、 rs7903146、rs8050136、rs831571、rs9470794、rs2268388、rs9565164、rs4668142、 rs2380261、rs39059、rsl7756941、rs245955、rs245962、rs266729、rs3811951、rsl56019、 rs6234、rs3856806、rsl0494366、rsll977021、rs2230806、rsll212617 和rs622342 的成套 引物由引物1)-引物47)组成；
[0009] 所述引物1)包括用于检测rsl0229583的扩增引物1);
[0010] 所述引物2)包括用于检测rsl0811661的扩增引物2);
[0011] 所述引物3)包括用于检测rsl0886471的扩增引物3);
[0012] 所述引物4)包括用于检测rsllll875的扩增引物4);
[0013] 所述引物5)包括用于检测rs12742393的扩增引物5);
[0014] 所述引物6)包括用于检测rs12779790的扩增引物6);
[0015] 所述引物7)包括用于检测rs13266634的扩增引物7);
[0016] 所述引物8)包括用于检测rs1535500的扩增引物8);
[0017] 所述引物9)包括用于检测rsl6856187的扩增引物9);
[0018] 所述引物10)包括用于检测rsl6861329的扩增引物10);
[0019] 所述引物11)包括用于检测rsl801282的扩增引物11);
[0020] 所述引物12)包括用于检测rs2237892的扩增引物12);
[0021] 所述引物13)包括用于检测rs340874的扩增引物13);
[0022] 所述引物14)包括用于检测rs3786897的扩增引物14);
[0023] 所述引物15)包括用于检测rs4430796的扩增引物15);
[0024] 所述引物16)包括用于检测rs5219的扩增引物16);
[0025] 所述引物17)包括用于检测rs6017317的扩增引物17);
[0026] 所述引物18)包括用于检测rs6467136的扩增引物18);
[0027] 所述引物19)包括用于检测rs6815464的扩增引物19);
[0028] 所述引物20)包括用于检测rs7041847的扩增引物20);
[0029] 所述引物21)包括用于检测rs7172432的扩增引物21);
[0030] 所述引物22)包括用于检测rs7612463的扩增引物22);
[0031] 所述引物23)包括用于检测rs7651090的扩增引物23);
[0032] 所述引物24)包括用于检测rs7756992的扩增引物24);
[0033] 所述引物25)包括用于检测rs780094的扩增引物25);
[0034] 所述引物26)包括用于检测rs7903146的扩增引物26);
[0035] 所述引物27)包括用于检测rs8050136的扩增引物27);
[0036] 所述引物28)包括用于检测rs831571的扩增引物28);
[0037] 所述引物29)包括用于检测rs9470794的扩增引物29);
[0038] 所述引物30)包括用于检测rs2268388的扩增引物30);
[0039] 所述引物31)包括用于检测rs9565164的扩增引物31);
[0040] 所述引物32)包括用于检测rs4668142的扩增引物32);
[0041] 所述引物33)包括用于检测rs2380261的扩增引物33);
[0042] 所述引物34)包括用于检测rs39059的扩增引物34);
[0043] 所述引物35)包括用于检测rs17756941的扩增引物35);
[0044] 所述引物36)包括用于检测rs245955的扩增引物36);
[0045] 所述引物37)包括用于检测rs245962的扩增引物37);
[0046] 所述引物38)包括用于检测rs266729的扩增引物38);
[0047] 所述引物39)包括用于检测rs3811951的扩增引物39);
[0048] 所述引物40)包括用于检测rsl56019的扩增引物40);
[0049] 所述引物41)包括用于检测rs6234的扩增引物41);
[0050] 所述引物42)包括用于检测rs3856806的扩增引物42);
[0051] 所述引物43)包括用于检测rsl0494366的扩增引物43);
[0052] 所述引物44)包括用于检测rsll977021的扩增引物44);
[0053] 所述引物45)包括用于检测rs2230806的扩增引物45);
[0054] 所述引物46)包括用于检测rs11212617的扩增引物46);
[0055] 所述引物47)包括用于检测rs622342的扩增引物47);
[0056] 所述用于检测rsl0229583的扩增引物1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子 和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成；
[0057] 所述用于检测rsl0811661的扩增引物2)由序列表中序列3所示的单链DNA分子 和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成；
[0058] 所述用于检测rsl0886471的扩增引物3)由序列表中序列5所示的单链DNA分子 和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成；
[0059] 所述用于检测rsllll875的扩增引物4)由序列表中序列7所示的单链DNA分子 和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成；
[0060] 所述用于检测rsl2742393的扩增引物5)由序列表中序列9所示的单链DNA分子 和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成；
[0061] 所述用于检测rsl2779790的扩增引物6)由序列表中序列11所示的单链DNA分 子和序列表中序列12所示的单链DNA分子组成；
[0062] 所述用于检测rsl3266634的扩增引物7)由序列表中序列13所示的单链DNA分 子和序列表中序列14所示的单链DNA分子组成；
[0063] 所述用于检测rsl535500的扩增引物8)由序列表中序列15所示的单链DNA分子 和序列表中序列16所示的单链DNA分子组成；
[0064] 所述用于检测rsl6856187的扩增引物9)由序列表中序列17所示的单链DNA分 子和序列表中序列18所示的单链DNA分子组成；
[0065] 所述用于检测rsl6861329的扩增引物10)由序列表中序列19所示的单链DNA分 子和序列表中序列20所示的单链DNA分子组成；
[0066] 所述用于检测rsl801282的扩增引物11)由序列表中序列21所示的单链DNA分 子和序列表中序列22所示的单链DNA分子组成；
[0067] 所述用于检测rs2237892的扩增引物12)由序列表中序列23所示的单链DNA分 子和序列表中序列24所示的单链DNA分子组成；
[0068] 所述用于检测rs340874的扩增引物13)