子宫内膜样腺癌预后相关基因和蛋白及其应用

文档序号:9859222阅读:533来源:国知局
子宫内膜样腺癌预后相关基因和蛋白及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物医学领域,具体涉及子宫内膜样腺癌预后相关基因和蛋白及其应 用。
【背景技术】
[0002] 子宫内膜样腺癌为子宫内膜癌最常见的病理类型,约占子宫内膜癌总发病率的 70 %~80 %,其病因主要与肥胖、无排卵性不孕、绝经延迟等无孕激素拮抗的雌激素长期作 用有关。相对于其他内膜癌病理类型,子宫内膜样腺癌的预后较好。但随着临床研究的不 断发展,人们逐渐发现子宫内膜样腺癌实质上是一种复杂的异质性疾病,常具有多种显著 不同的生物学特点及临床预后表现。
[0003] 子宫内膜癌FIG0分期是由国际妇产科联盟依据子宫内膜癌的手术病理结果所确 定的分类标准,临床沿用至今,其对于预测肿瘤复发转移的价值不可低估,是临床上较成 熟的风险评估指标。但经过多年的临床实践,研究者发现,部分早期子宫内膜样腺癌患者经 过手术治疗后,出现早期复发死亡,而部分晚期患者长期存活。这说明并非所有的子宫内膜 样腺癌均为临床低侵袭性,而肿瘤分期反映的仅为手术当时肿瘤所处的进展状态,代表了 疾病诊断时间的早晚,并不能反映肿瘤细胞其潜在的生物学性能。对于这些恶性程度较高 的子宫内膜样腺癌,则需要更加全面的手术病理分期及类似于非子宫内膜样腺癌的术后辅 助性放化疗。但是目前我们仍然缺乏一种较为可靠的临床或病理指标来对这些高危的子宫 内膜样腺癌提前做出辨别。
[0004] 肿瘤在本质上是一种多基因病,在各种环境的和遗传的致癌因素的协同或序贯方 式的作用下,引起DNA的损害,进而导致原癌基因的激活和(或)抑制基因的失活,再加上 凋亡调苄基因和(或)DNA修复基因的改变,最终引起细胞基因表达水平的异常,使得靶细 胞发生转化。肿瘤细胞分化程度、肿瘤生物学特性从根本上是由其内在编码基因所决定的。 子宫内膜样腺癌作为一种分子异质性疾病,传统的病理形态学诊断已不能适应目前诊治的 需求,而应用分子诊断技术,以肿瘤分子差异表达为基础的研究逐渐受到研究人员的重视。 在过去30年的肿瘤基础研究中人们逐渐发现了一些子宫内膜癌预后相关基因,如PTEN、 K-ras、β _catenin、P53、P16及Her2/neu等,但这些也仅能作为一种经验性的预测基因,不 能做到个体化的预后判别。
[0005] 基因芯片技术的出现和发展,这种一次性分析成百上千个基因的高通量分析技术 使得人们能够更为系统和全面的研究基因水平上的异质性。利用基因芯片技术从分子水平 研究肿瘤的生物学行为,对肿瘤进行分类并指导个体化治疗已成为当前研究的热点。到目 前为止,国内外以微阵列为基础的分类预测研究已在乳腺癌、肾癌、胃癌、结肠癌、黑色素瘤 等癌症中进行了探讨,其中乳腺癌70基因预后预测模型已申请专利(MammaPrintO)并进行 III期临床试验。

【发明内容】

[0006] 本发明的目的是提供一种辅助对子宫内膜样腺癌患者群体分组的试剂盒a、辅助 对子宫内膜样腺癌患者进行分型的试剂盒b、辅助对子宫内膜样腺癌患者进行预后的试剂 盒c和辅助对子宫内膜样腺癌患者进行预后的试剂盒d。
[0007] 本发明提供的辅助对子宫内膜样腺癌患者群体分组的试剂盒a包括检测如下21 种基因的 mRNA 水平表达的物质:PRC1、NUSAP1、MCM6、PIWIL2、TYMS、CCNB2、ESM1、BUB1、 BARD1、MCM7、CDK6、PCNA、NDC80、CCNE2、RFC4、CCNE1、SERPINA1、FOS、DUSP1、CCL20、NR4A1。
[0008] 所述试剂盒a中还包括使用说明书a,使用说明书a上记载如下内容:按照如下方 法将子宫内膜样腺癌患者群体分组:利用所述检测21种基因 mRNA水平表达的物质检测待 分组子宫内膜样腺癌患者群体中每个患者的病变组织内21种基因 mRNA表达水平;根据群 体内所有患者的21种基因 mRNA表达水平将群体分为组I和组II ;
[0009] 所述试剂盒a中,所述根据群体内所有患者的21种基因 mRNA表达水平将群体分 为组I和组II的方法为层次聚类法,具体为无监督聚类法。
[0010] 所述试剂盒a中,组I和组II具有如下特征:与组I相比,在组II中,病理组织的 BARD1、CCNE1、NDC80、MCM7、MCM6、PRC1、CCNB2、BUB1、NUSAP1、PCNA、TYMS、TYMS、RFC4、CCNE2、 ESM1、CDK6和PIWIL2这16个基因的mRNA表达水平上调,病理组织的DUSP1、FOS、NR4A1、 SERPINA1、CCL20这5个基因的mRNA表达水平下调。
[0011] 所述试剂盒a中,所述组I的预后好于组II。
[0012] 所述试剂盒a中,所述组I的预后好于组II是指组I的无瘤生存期高于组II。
[0013] 所述试剂盒a中,所述检测21种基因的mRNA表达水平的物质为用基因芯片法检 测时使用的物质、用荧光定量PCR方法进行检测时使用的物质、或用普通PCR方法检测时使 用的物质;
[0014] 所述试剂盒a中,所述用基因芯片法检测时使用的物质为基因芯片,所述用荧光 定量PCR方法进行检测时使用的物质为荧光定量PCR引物,所述用普通PCR方法检测时使 用的物质为普通PCR引物;
[0015] 所述试剂盒a中,所述基因芯片为连接有SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 21所示探针 的基因芯片。
[0016] 本发明提供的辅助对子宫内膜样腺癌患者进行分型的试剂盒b包括检测如下21 种基因的 mRNA 水平表达的物质:PRC1、NUSAP1、MCM6、PIWIL2、TYMS、CCNB2、ESM1、BUB1、 BARD 1、MCM7、CDK6、PCNA、NDC80、CCNE2、RFC4、CCNE 1、SERPINA1、FOS、DUSP1、CCL20、NR4A1。
[0017] 所述试剂盒b中还包括使用说明书b,使用说明书b上记载如下内容:将子宫内 膜样腺癌患者分为I型和II型,与I型相比,在II型中,病理组织的BARD1、CCNE1、NDC80、 MCM7、MCM6、PRC1、CCNB2、BUB1、NUSAP1、PCNA、TYMS、TYMS、RFC4、CCNE2、ESM1、CDK6 和 PIWIL2 这16个基因的mRNA表达水平上调,病理组织的DUSP1、FOS、NR4A1、SERPINA1、CCL20这5 个基因的mRNA表达水平下调;
[0018] 将子宫内膜样腺癌患者分为I型和II型的方法为:利用层次聚类法,根据群体内 所有患者的21种基因 mRNA表达水平将群体分为I型和II型,具体为无监督聚类法。
[0019] 所述试剂盒b中,所述I型的预后好于II型。
[0020] 所述试剂盒b中,所述I型的预后好于II型是指I型的无瘤生存期高于II型。
[0021] 所述试剂盒b中,所述检测21种基因的mRNA表达水平的物质为用基因芯片法检 测时使用的物质、用荧光定量PCR方法进行检测时使用的物质、或用普通PCR方法检测时使 用的物质;
[0022] 所述试剂盒b中,所述用基因芯片法检测时使用的物质为基因芯片,所述用荧光 定量PCR方法进行检测时使用的物质为荧光定量PCR引物,所述用普通PCR方法检测时使 用的物质为普通PCR引物;
[0023] 所述试剂盒b中,所述基因芯片为连接有SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 21所示探针 的基因芯片。
[0024] 本发明提供的辅助对子宫内膜样腺癌患者进行预后的试剂盒c包括检测如下21 种基因的 mRNA 水平表达的物质:PRC1、NUSAP1、MCM6、PIWIL2、TYMS、CCNB2、ESM1、BUB1、 BARD1、MCM7、CDK6、PCNA、NDC80、CCNE2、RFC4、CCNE1、SERPINA1、FOS、DUSP1、CCL20、NR4A1。
[0025] 所述试剂盒c中还包括使用说明书c,使用说明书c上记载如下内容:按照上述b 试剂盒中所述,将子宫内膜样腺癌患者分为I型和II型,与I型相比,在II型中,病理组织 的 BARD1、CCNE1、NDC80、MCM7、MCM6、PRC1、CCNB2、BUB1、NUSAP1、PCNA、TYMS、TYMS、RFC4、 CCNE2、ESM1、CDK6和PIWIL2这16个基因的mRNA表达水平上调,病理组织的DUSP1、F0S、 NR4A1、SERPINA1、CCL20这5个基因的mRNA表达水平下调;所述I型患者的预后好于II型 患者。
[0026] 所述试剂盒c中,所述I型的预后好于II型是指I型的无瘤生存期高于II型;
[0027] 所述试剂盒c中,所述检测21种基因的mRNA表达水平的物质为用基因芯片法检 测时使用的物质、用荧光定量PCR方法进行检测时使用的物质、或用普通PCR方法检测时使 用的物质;
[0028] 所述试剂盒c中,所述用基因芯片法检测时使用的物质为基因芯片,所述用荧光 定量PCR方法进行检测时使用的物质为荧光定量PCR引物,所述用普通PCR方法检测时使 用的物质为普通PCR引物;
[0029] 所述试剂盒c中,所述基因芯片为连接有SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 21所示探针 的基因芯片
[0030] 本发明提供的d辅助对子宫内膜样腺癌
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