一种微孔芯片与单细胞分析方法与流程

文档序号:36005795发布日期:2023-11-16 21:08阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种微孔芯片,其特征在于,所述微孔芯片上具有若干个双通穿透型微孔,所述微孔内用于加载待测样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠。

2.根据权利要求1所述的微孔芯片,其特征在于,所述微孔芯片还满足下述条件中的至少一种:

3.一种单细胞分析方法,其特征在于,使用权利要求1~2任意一项所述的微孔芯片,包括如下步骤:

4.根据权利要求3所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s1中,还包括如下步骤:使用固定液对单细胞悬液或单细胞核悬液中的单细胞或细胞核进行固定处理。

5.根据权利要求3所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s1中,所述微珠上的已知碱基序列核酸分子与单细胞或单细胞核杂交结合时,单细胞或单细胞核内的原位标记对象为rna或者dna,对应地,所述微珠上的已知碱基序列核酸分子包括核酸;

6.根据权利要求5所述的单细胞分析方法,其特征在于,单细胞或单细胞核内的原位标记对象为rna或蛋白时,所述微珠上的已知碱基序列核酸分子为已知碱基序列的单链寡核苷酸;单细胞或单细胞核内的原位标记对象为dna时,所述微珠上的已知碱基序列核酸分子为已知碱基序列的转座酶接头序列。

7.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s1中,所述微珠上的已知碱基序列核酸分子上包括条件性可断裂位点,其中,所述条件性可断裂位点包括:du碱基修饰、二硫键修饰、光敏断裂photocleavable linker以及限制性内切酶识别序列中的任意一种;

8.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s1中,将待测组织样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠混合后加载到微孔芯片的微孔内时,包括如下步骤:待测组织样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠通过毛细作用随着微孔芯片表面液体吸附到各个所述微孔中,其中,每个所述微孔内能够容纳多个微珠。

9.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s1中,待测组织样本的单细胞悬液或单细胞核悬液通过如下步骤获得:将待测样本的细胞系经过裂解液进行裂解反应,裂解预定时间后终止裂解,获得待测样本的单细胞核。

10.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s2中,将待测组织样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠加载到芯片之后,通过自然蒸发或者抽真空蒸发方式促进微孔芯片表面液体的蒸发。

11.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,步骤s2中,对s1中的所述微孔芯片进行核酸分子聚合与扩增时,包括如下步骤:对微孔芯片采用密封油进行封闭,通过恒温加热使单细胞或单细胞核内的原位标记对象释放出来,以与所述微珠上的已知碱基序列核酸分子杂交反应。

12.根据权利要求3~6任意一项所述的单细胞分析方法,其特征在于,所述单细胞测序文库包括单细胞转录组数据和/或染色质可及性基因组数据。


技术总结
本发明公开了一种微孔芯片以及单细胞分析方法。微孔芯片上具有若干个双通穿透型微孔,微孔内用于加载待测样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠。单细胞分析方法,包括如下步骤:S1、将待测组织样本的单细胞悬液或单细胞核悬液与带有已知碱基序列核酸分子的微珠混合后加载到微孔芯片的微孔内;S2、对S1中的微孔芯片进行核酸分子聚合与扩增,构建单细胞测序文库。本发明的微孔芯片以及单细胞分析方法能够应用于高通量单细胞多组学测序,能够一次性批量获得数十多万至上百万个单细胞的全长转录组、表观基因组、蛋白组等特异性组学信息。

技术研发人员:刘炯,董灵,梁骞
受保护的技术使用者:杭州跃真生物科技有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/1/16
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