组织切片术相关应用中的面向和质量控制的制作方法

文档序号:33304888发布日期:2023-02-28 23:39阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种用于面向组织块的方法,所述方法包括:对组织块进行成像,以生成所述组织块的成像数据,所述组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;基于所述成像数据,估计所述组织块的深度轮廓,其中所述深度轮廓包括所述包埋材料的要被移除以将所述组织样本暴露于预定标准的的厚度;以及移除所述包埋材料的所述厚度以将所述组织样本暴露于所述预定标准。2.如权利要求1所述的方法,进一步包括:从包括包埋在包埋材料中的组织样本的组织块逐渐移除一个或多个切片;对所述一个或多个切片进行成像,以生成与所述一个或多个切片相关联的成像数据;以及基于所述成像数据,确认所述组织块暴露于所述预定标准。3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述组织块用结构光来进行成像,以确定所述深度轮廓。4.一种用于面向组织块的方法,所述方法包括:从包括包埋在包埋材料中的组织样本的组织块逐渐移除一个或多个切片;对从所述组织块移除的所述一个或多个切片进行成像,以生成与所述一个或多个切片相关联的成像数据;以及基于所述成像数据,确定何时从所述组织块移除了足够数量的所述一个或多个切片,以将所述组织样本暴露于预定标准。5.如权利要求4所述的方法,还包括在移除所述一个或多个切片之前对所述组织块进行成像,以生成所述组织样本的基线成像数据。6.如权利要求5所述的方法,还包括根据所述基线成像数据确定所述组织样本的预期轮廓、大小或形状。7.如权利要求5所述的方法,还包括根据所述基线成像数据确定所述包埋材料的深度轮廓,以移除足够量的所述包埋材料,以将所述组织样本暴露于所述预定标准。8.如权利要求5所述的方法,还包括用uv范围内的结构光照射所述组织块。9.如权利要求5所述的方法,还包括将包括组织样本的所述切片的所述成像数据与所述基线成像数据进行比较,以确定所述组织样本何时已经充分暴露。10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述切片的所述成像数据包括所述组织块上、转移介质上或载玻片上的所述一个或多个切片的成像数据。11.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述一个或多个切片中的所述组织样本的轮廓、大小和形状被与从所述基线成像数据预期的所述组织样本的轮廓、大小或形状进行比较。12.如权利要求4所述的方法,还包括通过视差、焦点或光场成像中的一者或多者来确定深度轮廓。13.如权利要求4所述的方法,还包括增加所述组织样本和所述包埋材料之间的对比度。14.一种用于面向组织块的方法,所述方法包括:从包括包埋在包埋材料中的组织样本的组织块移除一厚度的所述包埋材料,所述包埋
材料的所述厚度被配置成用于将所述组织样本暴露于预定标准;在移除所述厚度之后,从所述组织块逐渐移除一个或多个切片;对从所述组织块移除的所述一个或多个切片进行成像,以生成与所述一个或多个切片相关联的成像数据;以及根据所述成像数据,确认所述组织块已经暴露于所述预定标准。15.一种组织学系统,包括:切片机,所述切片机被配置成用于从组织块逐渐移除一个或多个切片,所述组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;以及视觉系统,所述视觉系统与所述切片机相关联,并且所述视觉系统包括:照明系统,所述照明系统被配置成用于照射所述组织块,所述组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;成像系统,所述成像系统被配置成用于对所述组织块进行成像,以生成与所述组织块相关联的成像数据;以及处理器,所述处理器与所述视觉系统通信,所述处理器被编程以用于接收所述成像数据并基于所述成像数据来确定所述组织块何时已由所述切片机充分面向。16.如权利要求15所述的组织学系统,其特征在于,所述处理器被进一步编程以用于通过识别暴露组织样本的量来确定所述组织块何时已被充分面向。17.如权利要求15所述的组织学系统,其特征在于,所述处理器被进一步编程以用于根据基线成像数据确定所述组织样本的预期轮廓、大小或形状,所述基线成像数据通过在从所述组织块中移除所述一个或多个切片之前用结构光对所述组织块进行成像而生成。18.如权利要求15所述的组织学系统,其特征在于,所述照明系统被配置成用于用结构光照射所述组织块。19.如权利要求17所述的组织学系统,还包括转移介质,所述转移介质用于将包括组织样本的一个或多个切片从所述组织块转移到一个或多个载玻片,并且其中所述处理器被进一步编程以用于将所述组织块上、所述转移介质上、或所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个切片与基线成像数据进行比较,所述基线成像数据通过在从所述组织中移除所述一个或多个切片之前用uv光对所述组织块进行成像而生成。20.一种视觉系统,包括:照明系统,所述照明系统被配置成用于照射组织块,所述组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;成像系统,所述成像系统被配置成用于对所述组织块进行成像,以生成所述组织块的成像数据;以及处理器,所述处理器与所述成像系统通信,所述处理器被编程以用于接收所述成像数据并基于所述成像数据来确定所述组织样本对预定标准的暴露。21.一种用于组织学系统中质量控制的方法,所述方法包括:接收包括包埋在包埋材料中的组织样本的组织块;对所述组织块进行成像,以创建所述组织块的组织切片中的所述组织样本的第一成像数据;从所述组织块移除所述组织切片,所述组织切片包括所述组织样本的一部分;
对所述组织切片进行成像,以创建所述组织切片中的所述组织样本的第二成像数据;以及将所述第一成像数据与所述第二成像数据进行比较,以基于一个或多个质量控制参数确认所述第一成像数据和所述第二成像数据中的所述组织样本的对应。22.如权利要求21所述的方法,其特征在于,如果所述第一成像数据和所述第二成像数据中的所述组织样本中的一个或多个质量控制参数不存在对应,则所述组织切片是非确认的。23.如权利要求22所述的方法,其特征在于,所述一个或多个质量控制参数包括所述组织样本的形状、所述组织样本的大小、或者一个或多个机械损伤中的一者或多者。24.如权利要求21所述的方法,还包括使用转移介质将所述组织切片转移到载玻片上,并且所述第二成像数据包括所述转移介质上的所述组织切片的成像数据或所述载玻片上的所述组织切片的成像数据。25.如权利要求24所述的方法,还包括将所述第一成像数据、所述转移介质上的所述组织切片的所述成像数据或所述载玻片上的所述组织切片的所述成像数据中的至少两者进行比较。26.如权利要求23所述的方法,其特征在于,如果所述第一成像数据和所述第二成像数据中的所述组织样本中的所述形状或所述大小不存在对应,则所述组织切片是非确认的。27.如权利要求23所述的方法,其特征在于,所述一个或多个机械损伤选自由撕裂、切碎、刀痕、起皱、开裂、气泡、组织样本不足、组织样本不完整组成的组。1.如权利要求27所述的方法,还包括如果在所述第二成像数据中的所述组织样本中存在一个或多个机械损伤,但在所述第一成像数据中不存在,则标识为非确认的组织切片。28.如权利要求28所述的方法,还包括调整与移除所述组织切片相关联的一个或多个操作参数,以校正一个或多个机械损伤。29.如权利要求28所述的方法,还包括如果在所述第一成像数据和所述第二成像数据中的所述组织切片中不存在机械损伤,则批准所述组织切片。30.如权利要求28所述的方法,还包括如果在所述第一成像数据和所述第二成像数据两者中都存在一个或多个机械损伤,则拒绝所述组织切片。31.如权利要求21所述的方法,其特征在于,所述成像步骤中的一者或两者包括用uv光照射所述组织样本,并用可见光范围相机对所述组织样本进行成像,以创建所述第一成像数据或所述第二成像数据。32.如权利要求21所述的方法,还包括照射所述组织切片,以增强所述组织样本和所述组织样本中的所述包埋材料之间的对比度。33.如权利要求21所述的方法,其特征在于所述成像步骤中的一者或两者包括:在一个或多个波长范围内对组织切片进行成像;创建所述组织切片的成像数据;基于所述彩色成像数据中的颜色和强度信息从所述包埋材料中分割所述组织切片;以及标识所述组织切片中所述组织样本的大小、形状或边缘。34.如权利要求21所述的方法,还包括在移除所述一个或多个切片之前对所述组织块
进行成像,以生成所述组织样本的基线成像数据。35.如权利要求34所述的方法,还包括用uv光照射所述组织块。36.如权利要求34所述的方法,还包括将所述第一成像数据、所述第二成像数据或两者与所述基线成像数据进行比较。37.如权利要求34所述的方法,还包括将所述第一成像数据、所述第二成像数据或它们两者中的所述组织样本的轮廓、大小或形状与从所述基线成像数据预期的所述组织样本的轮廓、大小或形状进行比较。38.一种视觉系统,所述视觉系统包括:照明系统,所述照明系统被配置成用于照射组织切片;成像系统,所述成像系统被配置成用于创建由所述照明系统照射的所述组织切片的成像数据;以及处理器,所述处理器与所述成像系统通信,以接收所述成像数据并基于所述成像数据执行一个或多个质量控制分析。39.如权利要求38所述的视觉系统,其特征在于,所述一个或多个质量控制分析是以下各项中的一项或多项:组织块和载玻片上的所述组织切片的比较分析;所述组织切片的机械属性的分析;所述组织样本的充足性分析;或者载玻片上样本呈现的分析。40.一种组织学系统,包括:切片机,所述切片机被配置成用于从组织块产生一个或多个组织切片;转移系统,所述转移系统被配置成用于将所述一个或多个组织切片从所述切片机转移到一个或多个载玻片;视觉系统,所述视觉系统包括:照明系统,所述照明系统被配置成用于照射组织样本;成像系统,所述成像系统被配置成用于创建由所述照明系统照射的所述组织切片的成像数据;以及处理器,所述处理器与所述成像系统通信,以接收所述成像数据并基于所述成像数据执行一个或多个质量控制分析。41.如权利要求40所述的组织学系统,其特征在于,所述一个或多个质量控制分析是以下各项中的一项或多项:组织块上的组织切片、所述转移系统上的所述组织切片和载玻片上的所述组织切片中的至少两个的比较分析;所述组织切片的机械属性的分析;所述组织样本的充足性分析;或者载玻片上样本呈现的分析。42.一种系统,所述系统包括:信息读取器,所述信息读取器被配置成用于读取与组织块相关联的标识数据;切片机,所述切片机被配置成用于从所述组织块切割一个或多个组织切片;一个或多个载玻片,所述一个或多个载玻片用于接收所述一个或多个组织切片;以及打印机,所述打印机被配置成用于接收所述标识数据,并在从所述组织块切割所述一个或多个组织切片后打印用于所述一个或多个载玻片的一个或多个标签,所述一个或多个标签包括将所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联的信息。43.如权利要求42所述的系统,还包括转移介质,所述转移介质被配置成用于将所述一
个或多个组织切片从所述切片机转移到所述一个或多个载玻片。44.如权利要求43所述的系统,其特征在于,所述转移介质包括指示所述一个或多个组织切片的所述标识数据的标记,所述标记被配置成用于将所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联。45.如权利要求43所述的系统,还包括转移介质标记设备,所述转移介质标记设备用于使用指示所述一个或多个组织切片的所述标识数据的标记来标记所述转移介质,所述标记被配置成用于将所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联。46.如权利要求42所述的系统,还包括可视化系统,所述可视化系统被配置成用于跟踪从所述切片机到所述一个或多个载玻片的所述一个或多个组织切片。47.如权利要求46所述的系统,其特征在于,所述可视化系统被配置成用于在所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块的一个或多个图像或转移介质上的所述切片的图像之间进行比较。48.如权利要求47所述的系统,其特征在于,所述可视化系统被配置成用于在所述一个或多个载玻片上、所述组织块上或所述转移介质上的所述一个或多个组织切片与所述组织块中的组织样本的基线图像之间进行比较,所述基线图像通过在从所述组织块移除所述一个或多个切片之前用uv光对所述组织块进行成像而生成。49.如权利要求48所述的系统,其特征在于,所述比较基于所述一个或多个组织切片中的所述组织样本的大小、形状和轮廓。50.如权利要求46所述的系统,其特征在于,所述可视化系统被配置成用于读取所述载玻片上的所述一个或多个标签,并确认它们与所述样本块上的所述标识数据的关联。51.如权利要求42所述的系统,其特征在于,所述打印机为所述一个或多个样本独立地打印所述标签。52.一种系统,所述系统包括:信息读取器,所述信息读取器被配置成用于从组织块读取标识数据;切片机,所述切片机被配置成用于从所述组织块切割一个或多个组织切片;转移介质,所述转移介质被配置成用于将所述一个或多个组织切片转移到一个或多个载玻片;打印机;以及处理器,所述处理器被配置成用于接收所述标识数据,使得所述切片机切割所述一个或多个组织切片,然后使得所述打印机打印用于所述一个或多个载玻片的一个或多个标签,所述一个或多个标签包括将所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联的信息。53.如权利要求53所述的系统,其特征在于,所述转移介质包括指示所述一个或多个组织切片的所述标识数据的标记,所述标记被配置成用于将所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联。54.如权利要求53所述的系统,还包括转移介质标记设备,所述转移介质标记设备用于使用指示所述一个或多个组织切片的所述标识数据的标记来标记所述转移介质,所述标记被配置成用于将所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联。55.如权利要求53所述的系统,还包括可视化系统,所述可视化系统被配置成用于跟踪
从所述切片机到所述一个或多个载玻片的所述一个或多个组织切片。56.如权利要求53所述的系统,还包括可视化系统,所述可视化系统被配置成用于在所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块上的所述一个或多个切片之间进行比较。57.如权利要求56所述的系统,其特征在于,所述比较基于所述一个或多个组织切片中的组织的大小和边缘。58.一种用于在组织切片中跟踪样本的方法,所述方法包括:从组织块读取标识数据;从所述组织块切割第一组一个或多个组织切片;在进行切割之后,打印用于一个或多个载玻片的一个或多个标签,所述一个或多个标签包括将所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块相关联的信息;以及将所述一个或多个组织切片转移到一个或多个载玻片,并用所述一个或多个标签标记所述一个或多个载玻片。59.如权利要求58所述的方法,还包括,将所述载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述块上的所述一个或多个组织切片进行比较,以确认所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块的关联。60.如权利要求58所述的方法,还包括,仅在所述第一组一个或多个组织切片被放置在所述一个或多个载玻片上并用所述一个或多个标签标记之后,才切割第二组一个或多个组织切片。61.如权利要求58所述的方法,还包括,将所述一个或多个载玻片上的所述一个或多个组织切片与所述组织块中的组织样本的基线图像进行比较,所述基线图像通过在从所述组织块移除所述一个或多个切片之前用uv光对所述组织块进行成像而生成。

技术总结
本公开涉及一种用于组织切片中面向和质量控制决策的系统和方法。在一些实施例中,提供了一种组织学系统,包括:切片机,切片机被配置成用于从组织块中逐渐移除一个或多个切片,组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;以及视觉系统,视觉系统与切片机相关联并且包括:照明系统,照明系统被配置成用于照射组织块,组织块包括包埋在包埋材料中的组织样本;成像系统,成像系统被配置成用于对组织块进行成像,以生成与组织块相关联的成像数据;以及处理器,处理器与视觉系统通信,该处理器被编程以用于接收成像数据并执行面向和质量控制分析。析。析。


技术研发人员:P
受保护的技术使用者:克拉拉帕斯股份有限公司
技术研发日:2021.02.22
技术公布日:2023/2/27
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