一种FRET校准参数测量数据的预处理方法与系统

文档序号:37257874发布日期:2024-03-12 20:34阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,包括下述步骤:

2.根据权利要求1所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,光谱串扰系数通过单独表达供体蛋白和单独表达受体蛋白的两种细胞样本测量得到,并且进行e-fret校准参数测量的活细胞为供体-受体比为1∶1的标准fret样本,所选取感兴趣区域的三个通道信噪比均大于3。

3.根据权利要求1所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述受体敏化发射强度fc通过下式求得:

4.根据权利要求1所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述将过离散点剔除具体为:

5.根据权利要求1所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述根据xi值大小对数据点(xi,yi)进行排序,并等间隔区间划分数据点,具体为:

6.根据权利要求5所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述根据xi值大小对数据点(xi,yi)进行排序,具体为按xi值的大小从小到大的顺序或按从大到小的顺序进行排序,并且yi值排序是依据对应的xi值进行的。

7.根据权利要求5所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述将数据点进行等间隔划分,得到的数据区间为前开后闭区间。

8.根据权利要求1所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,其特征在于,所述进行线性拟合求得fret测量系统校准参数,具体为:

9.一种fret校准参数测量数据的预处理系统,其特征在于,应用于权利要求1-8中任一项所述的一种fret校准参数测量数据的预处理方法,包括参数获取模块、数据评估模块、区间划分模块、数据平均模块以及线性拟合模块;


技术总结
本发明公开了一种FRET校准参数测量数据的预处理方法与系统。该方法包括:(1)根据供体‑受体比为1:1标准FRET样本的E‑FRET测量数据,计算供体发射串扰强度与受体激发串扰强度之比(x<subgt;i</subgt;)和对应的受体敏化发射强度与受体激发串扰强度之比(y<subgt;i</subgt;),得到所有(x<subgt;i</subgt;,y<subgt;i</subgt;)数据;(2)剔除过离散点后按照x<subgt;i</subgt;值大小排序并等间隔区间划分;(3)计算各区间内(x<subgt;i</subgt;,y<subgt;i</subgt;)的平均值后再对各个区间平均值求平均得到唯一数据点(4)对多种不同种类标准FRET样本重复上述操作;(5)将每种标准FRET样本最后得到的平均数据点以x为横坐标和y为纵坐标线性拟合,通过截距和斜率计算获得FRET测量系统校准参数。该发明可以显著降低随机干扰对测量结果的影响,从而提高定量FRET系统校准参数测量的稳定性和可靠性。

技术研发人员:陈同生,王玥,胡敏
受保护的技术使用者:华南师范大学
技术研发日:
技术公布日:2024/3/11
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