用于排出至少一种反应液体的至少一个通道，
[0040] 用于导入和排出反应液体的通道与用于导入和排出流体的导管在模块水平处被 定位如下：
[0041] ?用于导入和排出流体的导管面对彼此并同时封闭模块，以便最大化流体和珠子 之间的接触，
[0042] ?用于一种或多种反应液体的通道分别被定位在模块的两个相反端处，并且
[0043] ?用于一种或多种反应液体的通道被定位在一个平面中，且用于导入和排出流体 的导管被沿着一轴线定位，所述轴线粗略地垂直于所述平面。
[0044] 根据第一实施方式，根据本发明的装置包括将所述流体和所述反应液体与外部隔 离的气密限制外壳。
[0045] 根据该装置的第一实施方式，如果所述流体为气体，那么所述一组珠子包括涂覆 有甘油的珠子。
[0046] 根据该装置的第二实施方式，如果所述流体为液体，那么所述模块包含大体在由 用于所述一种或多种反应液体的通道形成的平面中延伸的过滤器，导入通道（一个或多 个）被定位在过滤器的具有所述一组珠子的一侧上，并且排出通道（一个或多个）被定位 在所述过滤器的没有珠子的另一侧上。这种布置因此允许流体与珠子形成接触并且然后循 环通过过滤器，以便分离例如不感兴趣的任何细胞残渣或抑制剂，诸如蛋白质、膜。
[0047] 在特别的实施方式中，如果按以下方式被切开的话：
[0048] ?沿着由用于导入和排出反应液体的通道形成的平面，以及
[0049] ?垂直于由用于导入和排出流体的导管形成的轴线，
[0050] 所述模块的形状包括至少一个直线的部分和/或至少一个弧形的部分，它们被包 括在两个端部之间。用于导入反应液体的通道（一个或多个）位于模块的一个端部处并且 用于排出反应液体的通道（一个或多个）位于模块的另一个端部处，使得反应液体在当其 被导入至反应液体导入通道（一个或多个）中的时刻和当其经由反应液体排出通道（一个 或多个）被排出的时刻之间完全通过该珠子堆。根据该最后提到的实施方式或变型，模块 具有四边形截面，如果其沿着以下平面被切开的话：所述平面与由用于导入和排出反应液 体的通道形成的平面垂直、并沿着由用于导入和排出流体的导管形成的轴线经过。
[0051] 在特别的实施方式中，如果按以下方式被切开的话，所述模块具有"C"形状：
[0052] ?沿着由用于导入和排出反应液体的通道形成的平面，以及
[0053] ?垂直于由用于导入和排出流体的导管形成的轴线。
[0054] "C"形状包括至少一个弧形的部分，其对应于圆的圆周的一部分或连接两个点的 抛物线的一部分。所述"C"的端部是所述模块的两个端部区域，使得用于导入反应液体的通 道（一个或多个）位于模块的一个端部处并且用于排出反应液体的通道（一个或多个）位 于模块的另一个端部处，反应液体在当其被导入至反应液体导入通道（一个或多个）中的 时刻和当其经由反应液体排出通道（一个或多个）被排出的时刻之间完全通过该珠子堆。
[0055] 根据该最后提到的实施方式或变型，如果沿着穿过所述"C"的中心并切穿所述 "C"的半径被切开的话，所述模块具有四边形形状。
[0056] 仍根据该最后提到的实施方式或变型，反应液体的导入通道（一个或多个）位于 所述模块的形状"C"的一个端部处，并且反应液体的排出通道（一个或多个）位于所述"C" 的另一端处。
[0057] 不管该实施方式或变型如何，所述珠子具有在200和600 ii m之间的直径，并且用 于将所述珠子保持在所述模块内的装置包括栅格，所述栅格的孔具有小于所述珠子且在从 100到500 ii m的范围内的直径。
[0058] 不管该实施方式或变型如何，其包括用于处理所收集的微生物的另一反应模块， 所述模块包含 ：
[0059] ?用于分离不感兴趣的细胞残渣或抑制剂诸如蛋白质、膜的装置，和/或
[0060] ?用于扩增所收集的并与所述抑制剂分离的核酸的装置，和/或
[0061] ?用于检测这样产生的扩增子的装置。
[0062] 本发明还涉及用于收集包含在流体中的微生物的方法，其包括：
[0063] ?经由至少一个流体导入导管引入被怀疑包含微生物的流体，
[0064] ?穿过珠子堆，微生物在所述珠子堆被固定住，
[0065] ?经由用于排出所述流体的至少一个导管排出已从中去除所述微生物的流体，
[0066] ?经由至少一个反应液体导入通道引入至少一种反应液体，
[0067] ?穿过微生物在那里被固定住的珠子堆，以便使所述微生物处于悬浮，以及
[0068] ?经由用于排出反应液体（一种或多种）的至少一个通道排出运输微生物的该液 体，
[0069] 用于导入和排出流体的导管面对彼此并同时封闭所述珠子堆，用于导入和去除反 应液体（一种或多种）的通道被定位以便到达所有的珠子。
[0070] 根据一个实施方式，当流体为气体时，珠子被涂覆有甘油。
[0071] 根据一个实施方式，当流体为液体时，珠子被涂覆有聚合物涂层。
[0072] 根据一个实施方式，当反应液体通过珠子堆时，所述珠子通过外部搅动装置被搅 动并形成接触，这使得毁掉或破坏微生物的膜成为可能，从而使核酸可获取并易于被排出。
[0073] 根据一个实施方式，在溶解期间规定的量的反应液体被导入至反应液体导入通道 (一个或多个）中并且未经由反应液体排出通道（一个或多个）被排出，使得微生物在规定 的量的反应液体存在的情况下被溶解持续规定的时间。该时间优选在5和30分钟之间并 且液体的该量优选在1〇〇 U 1和lml之间，并且更优选为500 ill。
[0074] 根据该实施方式的变型，珠子被利用超声波进行搅动。
[0075] 不管该实施方式或变型如何，载有微生物中的一些或全部的液体被排出到所述装 置的另一反应模块，以允许对所收集的微生物进行处理，所述处理包括：
[0076] ?分离不感兴趣的细胞残渣或抑制剂，诸如蛋白质、膜，和/或
[0077] ?扩增所收集的核酸，和/或
[0078] ?检测这样产生的扩增子。
[0079] 不管该实施方式或变型如何，该方法的第一可能性的特征在于：
[0080] ?所测试的流体包括气体（例如空气），
[0081] ?气体穿过珠子堆，所述珠子被涂覆有甘油，在该珠子堆处微生物被固定住，并且
[0082] ?至少一种反应液体被引入以便溶解甘油并使所述微生物处于悬浮。
[0083] 不管该实施方式或变型如何，该方法的第二可能性的特征在于：
[0084] ?所测试的流体包括液体，
[0085] ?所测试的液体穿过珠子堆并且然后在被排出之前、在去除其包含的微生物之后 穿过过滤器；微生物被固定住，以及
[0086] ?至少一种反应液体被引入以便使所述微生物处于悬浮。
[0087] 根据这两个可能性中的任一个，液体在经由用于排出反应液体的至少一个通道的 排出的部位和用于除去抑制剂和/或用于扩增和/或用于检测的模块之间被过滤。
[0088] 流体样品意思是可能包含微生物的任何气态或液态样品。其可以是人类或动物来 源的样品。该样品可以是，例如，尿，全血，血浆或任何其它体液或呼出的空气。该样品可以 是食物来源，诸如饮料。其还可以是环境来源，诸如水或受限制的空气。此外，液体样品还 可以是所谓的传递液体，其中包含在拭子型的（诸如由C0PAN公司以"flocked SWABS"为 名称销售的那些）表面采样装置上的任何微生物通过在所述传递液体中搅动所述拭子而 被再悬浮。
[0089] 微生物来自包括细菌、病毒、酵母、霉菌、寄生虫的群。
[0090] 从中隔离出微生物的样品为环境来源的。因此，其可以是空气的或液体（诸如水） 的样品；表面样品。样品也可以是临床来源的（即人类或动物来源的任何样品），适合作为 用于检测其并识别微生物（任选为致病的）的分析的目标。
[0091] 目标核酸的存在可以通过杂交反应的可视化而被检测到。杂交反应意思是在捕获 的核酸和通过转录、逆转录或扩增步骤，例如NASBA型（为核酸序列依赖性扩增）或PCR，隔 离的或产生的目标核酸之间的任何反应。
[0092] 核酸意思是寡核苷酸、脱氧核糖核酸和核糖核酸、以及它们的衍生物。术语寡核苷 酸表示至少两个核苷酸（脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸，或它们两者）、优选至少五个、优 选至少八个、以及甚至更优选至少十四个的序列，而无论它们是天然的还是改性的，其在合 适的杂交条件下能够与至少部分互补的另一种寡核苷酸杂交。
[0093] 改性的核苷酸意思是例如包括改性基和/或包括在核苷酸间键的水平上和/或在 骨架的水平上的改性的核苷酸。作为改性基的实例，我们可以提到肌苷、甲基-5-脱氧胞 苷、二甲氨基 _5_脱氧尿苷、二氨基-2, 6-噪呤以及溴基_5_脱氧尿苷。
[0094] 为说明改性的核苷酸间键，我们可以提到硫代磷酸、N-氨基烷基磷酸酯、膦酸烷基 酯以及烷基磷酸二酯键。
[0095] 阿尔法-寡核苷酸诸如在专利申请FR-A-2, 607, 507中描述的那些，LNA诸如 在"Bioorganic&Medicinal Chemistry Letters，第 8 卷，第 16 期，1998 年 8 月 18 日， 第2219-2222页"中描述的硫代磷酸-LNA和2' -硫醇-LNA，以及作为^111.〇16111.5〇(3. (1992)，114,1895-1897"M. Egholm等的论文的主题的PNA，都是包括骨架已被改性的核苷 酸的寡核苷酸的实例